Doublet Group distance statistics: 48910

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.003, 0.005, 0.008, 0.008 max_d=0.008 avg_d=0.005 std_dev=0.003
C6	A	0, 0.004, 0.010, 0.017, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.010 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.005, 0.012, 0.019, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.005, 0.015, 0.025, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.015 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.006, 0.017, 0.027, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.017 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.005, 0.016, 0.028, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.016 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.008, 0.024, 0.039, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.024 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.010, 0.027, 0.045, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.027 std_dev=0.018
N6	A	0, 0.011, 0.031, 0.051, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.031 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.009, 0.029, 0.049, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.029 std_dev=0.020
C8	A	0, 0.013, 0.042, 0.071, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.042 std_dev=0.029
O4'	A	0, 0.056, 0.164, 0.272, 0.332 max_d=0.332 avg_d=0.164 std_dev=0.108
C2'	A	0, 0.074, 0.196, 0.317, 0.361 max_d=0.361 avg_d=0.196 std_dev=0.121
N6	B	0, 0.114, 0.262, 0.410, 0.407 max_d=0.407 avg_d=0.262 std_dev=0.148
C4'	A	0, 0.083, 0.233, 0.382, 0.429 max_d=0.429 avg_d=0.233 std_dev=0.150
C6	B	0, 0.114, 0.271, 0.429, 0.486 max_d=0.486 avg_d=0.271 std_dev=0.158
C5	B	0, 0.066, 0.226, 0.385, 0.462 max_d=0.462 avg_d=0.226 std_dev=0.160
N7	B	0, 0.151, 0.318, 0.485, 0.464 max_d=0.464 avg_d=0.318 std_dev=0.167
O2'	A	0, 0.110, 0.277, 0.445, 0.454 max_d=0.454 avg_d=0.277 std_dev=0.167
C3'	A	0, 0.116, 0.297, 0.478, 0.541 max_d=0.541 avg_d=0.297 std_dev=0.181
C8	B	0, 0.194, 0.426, 0.658, 0.679 max_d=0.679 avg_d=0.426 std_dev=0.232
C5'	A	0, 0.148, 0.404, 0.660, 0.802 max_d=0.802 avg_d=0.404 std_dev=0.256
N1	B	0, 0.239, 0.502, 0.765, 0.753 max_d=0.753 avg_d=0.502 std_dev=0.263
O3'	A	0, 0.172, 0.462, 0.752, 0.852 max_d=0.852 avg_d=0.462 std_dev=0.290
N9	B	0, 0.155, 0.446, 0.736, 0.811 max_d=0.811 avg_d=0.446 std_dev=0.291
C4	B	0, 0.065, 0.361, 0.656, 0.714 max_d=0.714 avg_d=0.361 std_dev=0.295
C2	B	0, 0.262, 0.610, 0.958, 1.002 max_d=1.002 avg_d=0.610 std_dev=0.348
N3	B	0, 0.172, 0.552, 0.932, 1.015 max_d=1.015 avg_d=0.552 std_dev=0.380
P	B	0, 0.227, 0.616, 1.006, 1.198 max_d=1.198 avg_d=0.616 std_dev=0.389
C4'	B	0, 0.317, 0.789, 1.260, 1.360 max_d=1.360 avg_d=0.789 std_dev=0.472
C5'	B	0, 0.378, 0.857, 1.337, 1.366 max_d=1.366 avg_d=0.857 std_dev=0.479
C3'	B	0, 0.298, 0.777, 1.257, 1.298 max_d=1.298 avg_d=0.777 std_dev=0.479
O4'	B	0, 0.258, 0.746, 1.234, 1.302 max_d=1.302 avg_d=0.746 std_dev=0.488
C1'	B	0, 0.099, 0.605, 1.111, 1.268 max_d=1.268 avg_d=0.605 std_dev=0.506
O5'	B	0, 0.279, 0.813, 1.348, 1.428 max_d=1.428 avg_d=0.813 std_dev=0.535
O3'	B	0, 0.332, 0.899, 1.465, 1.714 max_d=1.714 avg_d=0.899 std_dev=0.567
O5'	A	0, 0.122, 0.769, 1.417, 1.872 max_d=1.872 avg_d=0.769 std_dev=0.648
C2'	B	0, 0.064, 0.783, 1.502, 1.857 max_d=1.857 avg_d=0.783 std_dev=0.719
P	A	0, 0.182, 0.929, 1.676, 2.079 max_d=2.079 avg_d=0.929 std_dev=0.747
OP2	A	0, 0.261, 1.047, 1.833, 2.230 max_d=2.230 avg_d=1.047 std_dev=0.786
OP1	A	0, 0.167, 1.089, 2.010, 2.597 max_d=2.597 avg_d=1.089 std_dev=0.922
OP2	B	0, 0.079, 1.103, 2.127, 2.938 max_d=2.938 avg_d=1.103 std_dev=1.024
OP1	B	0, 0.154, 1.221, 2.289, 3.222 max_d=3.222 avg_d=1.221 std_dev=1.068
O2'	B	0, 0.024, 1.175, 2.326, 2.724 max_d=2.724 avg_d=1.175 std_dev=1.151

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.11	0.06	0.33	0.09
C2	0.01	0.00	0.11	0.11	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.08	0.16	0.05	0.11	0.09	0.38	0.12
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.06	0.00	0.04	0.02	0.06	0.05	0.09	0.10	0.06	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.06	0.32	0.10
C3'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.06	0.00	0.06	0.02	0.09	0.07	0.11	0.10	0.09	0.06	0.03	0.02	0.00	0.00	0.06	0.09	0.27	0.10
C4	0.00	0.00	0.06	0.06	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.08	0.02	0.14	0.07	0.37	0.10
C4'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.03	0.03	0.03	0.02	0.04	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.14	0.23	0.05
C5	0.00	0.01	0.04	0.06	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.08	0.01	0.16	0.12	0.35	0.11
C5'	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.04	0.00	0.04	0.06	0.02	0.02	0.05	0.06	0.04	0.02	0.03	0.02	0.00	0.20	0.09	0.01
C6	0.00	0.00	0.06	0.09	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.11	0.02	0.15	0.16	0.35	0.12
C8	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.08	0.03	0.21	0.07	0.34	0.09
N1	0.00	0.00	0.09	0.11	0.00	0.03	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.15	0.04	0.12	0.14	0.37	0.12
N3	0.01	0.00	0.10	0.10	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.08	0.14	0.04	0.11	0.06	0.38	0.11
N6	0.00	0.00	0.06	0.09	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.12	0.01	0.16	0.20	0.32	0.12
N7	0.00	0.01	0.03	0.06	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.07	0.02	0.20	0.13	0.33	0.10
N9	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.16	0.03	0.35	0.09
O2'	0.02	0.08	0.00	0.02	0.03	0.02	0.02	0.02	0.03	0.04	0.06	0.08	0.03	0.02	0.01	0.00	0.05	0.02	0.03	0.10	0.31	0.09
O3'	0.01	0.16	0.02	0.00	0.08	0.01	0.08	0.03	0.11	0.08	0.15	0.14	0.12	0.07	0.03	0.05	0.00	0.01	0.11	0.17	0.22	0.09
O4'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.04	0.04	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.12	0.10	0.28	0.08
O5'	0.11	0.11	0.04	0.06	0.14	0.01	0.16	0.00	0.15	0.21	0.12	0.11	0.16	0.20	0.16	0.03	0.11	0.12	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.06	0.09	0.06	0.09	0.07	0.14	0.12	0.20	0.16	0.07	0.14	0.06	0.20	0.13	0.03	0.10	0.17	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.33	0.38	0.32	0.27	0.37	0.23	0.35	0.09	0.35	0.34	0.37	0.38	0.32	0.33	0.35	0.31	0.22	0.28	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.09	0.12	0.10	0.10	0.10	0.05	0.11	0.01	0.12	0.09	0.12	0.11	0.12	0.10	0.09	0.09	0.09	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.24	0.21	0.31	0.42	0.20	0.24	0.17	0.31	0.14	0.19	0.16	0.23	0.15	0.18	0.20	0.12	0.30	0.18	0.48	0.95	0.97	0.18
C2	0.23	0.20	0.26	0.43	0.19	0.25	0.17	0.32	0.14	0.20	0.16	0.21	0.13	0.19	0.20	0.11	0.35	0.19	0.48	0.94	1.00	0.19
C2'	0.26	0.25	0.32	0.47	0.23	0.28	0.20	0.35	0.18	0.21	0.21	0.26	0.15	0.20	0.23	0.08	0.38	0.21	0.52	0.85	1.10	0.25
C3'	0.27	0.25	0.35	0.48	0.24	0.29	0.21	0.35	0.20	0.22	0.22	0.26	0.19	0.21	0.24	0.11	0.38	0.21	0.52	0.83	1.12	0.26
C4	0.23	0.21	0.30	0.42	0.20	0.24	0.17	0.31	0.14	0.19	0.16	0.22	0.16	0.18	0.20	0.10	0.32	0.17	0.48	0.93	0.99	0.18
C4'	0.24	0.21	0.33	0.42	0.20	0.24	0.18	0.30	0.16	0.19	0.17	0.22	0.16	0.19	0.21	0.14	0.29	0.18	0.48	0.92	1.00	0.19
C5	0.22	0.21	0.31	0.42	0.19	0.23	0.16	0.30	0.14	0.17	0.16	0.21	0.17	0.17	0.19	0.09	0.31	0.16	0.47	0.90	0.98	0.17
C5'	0.20	0.17	0.32	0.37	0.16	0.20	0.15	0.26	0.14	0.16	0.14	0.18	0.16	0.16	0.17	0.17	0.22	0.15	0.43	0.96	0.95	0.15
C6	0.20	0.20	0.28	0.41	0.18	0.23	0.16	0.30	0.14	0.17	0.16	0.20	0.16	0.17	0.18	0.08	0.32	0.15	0.47	0.90	0.98	0.17
C8	0.23	0.21	0.34	0.41	0.19	0.24	0.16	0.30	0.14	0.17	0.15	0.23	0.17	0.17	0.19	0.11	0.29	0.17	0.47	0.90	0.97	0.17
N1	0.21	0.19	0.25	0.42	0.18	0.24	0.17	0.31	0.14	0.19	0.16	0.19	0.14	0.18	0.19	0.11	0.34	0.17	0.48	0.92	1.00	0.18
N3	0.24	0.21	0.28	0.43	0.20	0.25	0.17	0.32	0.14	0.20	0.16	0.22	0.14	0.19	0.21	0.11	0.34	0.19	0.49	0.94	0.99	0.19
N6	0.17	0.18	0.28	0.40	0.15	0.22	0.14	0.29	0.13	0.15	0.14	0.17	0.17	0.15	0.16	0.07	0.32	0.13	0.45	0.86	0.97	0.16
N7	0.22	0.20	0.33	0.41	0.18	0.23	0.15	0.29	0.14	0.16	0.15	0.22	0.17	0.16	0.18	0.09	0.29	0.16	0.46	0.88	0.96	0.17
N9	0.24	0.22	0.32	0.42	0.20	0.24	0.17	0.31	0.14	0.19	0.16	0.23	0.16	0.18	0.20	0.11	0.30	0.18	0.48	0.93	0.98	0.18
O2'	0.24	0.23	0.28	0.45	0.21	0.26	0.17	0.34	0.14	0.19	0.18	0.24	0.11	0.17	0.21	0.07	0.36	0.19	0.52	0.88	1.06	0.23
O3'	0.29	0.28	0.37	0.53	0.27	0.33	0.25	0.39	0.24	0.26	0.25	0.28	0.22	0.25	0.27	0.09	0.43	0.24	0.56	0.76	1.21	0.31
O4'	0.23	0.19	0.32	0.39	0.18	0.21	0.16	0.29	0.14	0.18	0.14	0.21	0.18	0.18	0.19	0.15	0.26	0.17	0.46	0.98	0.92	0.16
O5'	0.18	0.16	0.27	0.29	0.14	0.17	0.13	0.19	0.14	0.14	0.14	0.17	0.17	0.14	0.14	0.28	0.12	0.19	0.32	1.04	0.86	0.13
OP1	0.36	0.34	0.54	0.57	0.33	0.37	0.30	0.44	0.29	0.31	0.30	0.35	0.28	0.29	0.33	0.25	0.46	0.29	0.61	0.68	1.15	0.33
OP2	0.38	0.36	0.52	0.56	0.37	0.40	0.38	0.49	0.38	0.38	0.37	0.37	0.40	0.39	0.38	0.20	0.43	0.34	0.67	0.56	1.25	0.42
P	0.25	0.23	0.41	0.44	0.22	0.26	0.21	0.33	0.20	0.22	0.20	0.24	0.21	0.21	0.23	0.17	0.30	0.20	0.51	0.79	1.05	0.24

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.00	0.00	0.03	0.13	0.00	0.12	0.75	0.14	0.19
C2	0.03	0.00	0.21	0.22	0.01	0.04	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.17	0.13	0.08	0.28	0.91	0.64	0.09
C2'	0.00	0.21	0.00	0.01	0.11	0.02	0.08	0.14	0.12	0.14	0.17	0.21	0.11	0.11	0.04	0.00	0.06	0.01	0.31	0.50	0.20	0.29
C3'	0.01	0.22	0.01	0.00	0.22	0.00	0.30	0.03	0.32	0.28	0.28	0.18	0.36	0.32	0.19	0.03	0.01	0.02	0.07	0.23	0.15	0.09
C4	0.02	0.01	0.11	0.22	0.00	0.07	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.16	0.14	0.05	0.29	0.89	0.57	0.09
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.07	0.00	0.12	0.01	0.11	0.16	0.08	0.03	0.14	0.16	0.08	0.25	0.02	0.00	0.02	0.26	0.17	0.10
C5	0.01	0.00	0.08	0.30	0.00	0.12	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.23	0.25	0.03	0.38	0.90	0.79	0.12
C5'	0.05	0.13	0.14	0.03	0.15	0.01	0.23	0.00	0.23	0.26	0.18	0.10	0.27	0.28	0.15	0.11	0.17	0.02	0.01	0.13	0.32	0.02
C6	0.02	0.00	0.12	0.32	0.01	0.11	0.01	0.23	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.22	0.27	0.04	0.39	0.91	0.88	0.14
C8	0.01	0.01	0.14	0.28	0.00	0.16	0.00	0.26	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.26	0.26	0.05	0.38	0.86	0.62	0.09
N1	0.03	0.00	0.17	0.28	0.01	0.08	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.18	0.20	0.07	0.35	0.92	0.79	0.11
N3	0.03	0.00	0.21	0.18	0.00	0.03	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.18	0.10	0.07	0.23	0.88	0.50	0.10
N6	0.02	0.00	0.11	0.36	0.01	0.14	0.01	0.27	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.25	0.34	0.04	0.44	0.88	1.01	0.20
N7	0.00	0.00	0.11	0.32	0.00	0.16	0.00	0.28	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.28	0.32	0.02	0.43	0.87	0.86	0.15
N9	0.00	0.01	0.04	0.19	0.00	0.08	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.15	0.13	0.01	0.25	0.85	0.42	0.11
O2'	0.03	0.17	0.00	0.03	0.16	0.25	0.23	0.11	0.22	0.26	0.18	0.18	0.25	0.28	0.15	0.00	0.09	0.17	0.24	0.41	0.12	0.23
O3'	0.13	0.13	0.06	0.01	0.14	0.02	0.25	0.17	0.27	0.26	0.20	0.10	0.34	0.32	0.13	0.09	0.00	0.09	0.20	0.46	0.23	0.27
O4'	0.00	0.08	0.01	0.02	0.05	0.00	0.03	0.02	0.04	0.05	0.07	0.07	0.04	0.02	0.01	0.17	0.09	0.00	0.07	0.72	0.22	0.27
O5'	0.12	0.28	0.31	0.07	0.29	0.02	0.38	0.01	0.39	0.38	0.35	0.23	0.44	0.43	0.25	0.24	0.20	0.07	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.75	0.91	0.50	0.23	0.89	0.26	0.90	0.13	0.91	0.86	0.92	0.88	0.88	0.87	0.85	0.41	0.46	0.72	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.14	0.64	0.20	0.15	0.57	0.17	0.79	0.32	0.88	0.62	0.79	0.50	1.01	0.86	0.42	0.12	0.23	0.22	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.19	0.09	0.29	0.09	0.09	0.10	0.12	0.02	0.14	0.09	0.11	0.10	0.20	0.15	0.11	0.23	0.27	0.27	0.01	0.01	0.01	0.00