Doublet Group distance statistics: 48913

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.015, 0.030, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.015 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.006, 0.022, 0.038, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.022 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.004, 0.022, 0.040, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.022 std_dev=0.018
C2	A	0, -0.003, 0.015, 0.034, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.015 std_dev=0.018
N1	A	0, 0.008, 0.026, 0.045, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.026 std_dev=0.019
C5	A	0, 0.005, 0.024, 0.043, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.024 std_dev=0.019
C4	A	0, 0.008, 0.029, 0.049, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.029 std_dev=0.020
N9	A	0, 0.012, 0.044, 0.076, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.044 std_dev=0.032
C8	A	0, 0.015, 0.054, 0.093, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.054 std_dev=0.039
N7	A	0, 0.007, 0.049, 0.092, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.049 std_dev=0.042
N6	A	0, 0.004, 0.056, 0.108, 0.125 max_d=0.125 avg_d=0.056 std_dev=0.052
O4'	A	0, 0.053, 0.181, 0.308, 0.281 max_d=0.281 avg_d=0.181 std_dev=0.128
C2'	A	0, 0.064, 0.247, 0.431, 0.439 max_d=0.439 avg_d=0.247 std_dev=0.183
C4'	A	0, 0.076, 0.304, 0.532, 0.548 max_d=0.548 avg_d=0.304 std_dev=0.228
C3'	A	0, 0.091, 0.381, 0.671, 0.703 max_d=0.703 avg_d=0.381 std_dev=0.290
O2'	A	0, 0.057, 0.367, 0.678, 0.760 max_d=0.760 avg_d=0.367 std_dev=0.311
O5'	A	0, -0.021, 0.290, 0.601, 0.721 max_d=0.721 avg_d=0.290 std_dev=0.311
C6	B	0, 0.043, 0.390, 0.736, 0.843 max_d=0.843 avg_d=0.390 std_dev=0.347
N6	B	0, 0.099, 0.454, 0.810, 0.867 max_d=0.867 avg_d=0.454 std_dev=0.355
N1	B	0, 0.044, 0.400, 0.755, 0.864 max_d=0.864 avg_d=0.400 std_dev=0.356
N3	B	0, 0.008, 0.366, 0.724, 0.852 max_d=0.852 avg_d=0.366 std_dev=0.358
C5	B	0, 0.006, 0.368, 0.730, 0.861 max_d=0.861 avg_d=0.368 std_dev=0.362
N7	B	0, 0.041, 0.409, 0.778, 0.893 max_d=0.893 avg_d=0.409 std_dev=0.368
C4	B	0, 0.021, 0.391, 0.761, 0.888 max_d=0.888 avg_d=0.391 std_dev=0.370
C2	B	0, -0.049, 0.334, 0.717, 0.870 max_d=0.870 avg_d=0.334 std_dev=0.383
C8	B	0, 0.091, 0.477, 0.862, 0.945 max_d=0.945 avg_d=0.477 std_dev=0.386
C5'	A	0, 0.154, 0.541, 0.927, 0.878 max_d=0.878 avg_d=0.541 std_dev=0.386
N9	B	0, 0.096, 0.485, 0.874, 0.952 max_d=0.952 avg_d=0.485 std_dev=0.389
P	A	0, 0.008, 0.432, 0.857, 1.009 max_d=1.009 avg_d=0.432 std_dev=0.425
OP2	A	0, 0.099, 0.529, 0.960, 1.055 max_d=1.055 avg_d=0.529 std_dev=0.431
C1'	B	0, 0.190, 0.649, 1.108, 0.993 max_d=0.993 avg_d=0.649 std_dev=0.459
O3'	A	0, 0.109, 0.582, 1.056, 1.160 max_d=1.160 avg_d=0.582 std_dev=0.474
OP1	A	0, 0.076, 0.568, 1.059, 1.198 max_d=1.198 avg_d=0.568 std_dev=0.491
C2'	B	0, 0.207, 0.709, 1.211, 1.100 max_d=1.100 avg_d=0.709 std_dev=0.502
O4'	B	0, 0.223, 0.771, 1.320, 1.228 max_d=1.228 avg_d=0.771 std_dev=0.548
C4'	B	0, 0.269, 1.013, 1.757, 1.765 max_d=1.765 avg_d=1.013 std_dev=0.744
C5'	B	0, 0.328, 1.217, 2.105, 2.097 max_d=2.097 avg_d=1.217 std_dev=0.889
C3'	B	0, 0.269, 1.186, 2.103, 2.234 max_d=2.234 avg_d=1.186 std_dev=0.917
O2'	B	0, 0.135, 1.132, 2.130, 2.427 max_d=2.427 avg_d=1.132 std_dev=0.997
O5'	B	0, 0.175, 1.558, 2.940, 3.360 max_d=3.360 avg_d=1.558 std_dev=1.382
O3'	B	0, 0.218, 1.645, 3.071, 3.479 max_d=3.479 avg_d=1.645 std_dev=1.426
OP1	B	0, -0.011, 1.997, 4.004, 4.742 max_d=4.742 avg_d=1.997 std_dev=2.007
P	B	0, -0.142, 2.064, 4.270, 5.122 max_d=5.122 avg_d=2.064 std_dev=2.206
OP2	B	0, -0.430, 2.663, 5.755, 6.999 max_d=6.999 avg_d=2.663 std_dev=3.092

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.05	0.07	0.06	0.04
C2	0.03	0.00	0.09	0.06	0.02	0.03	0.03	0.06	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.04	0.02	0.21	0.09	0.00	0.08	0.10	0.07	0.05
C2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.04	0.02	0.01	0.03	0.03	0.05	0.07	0.09	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.07	0.05	0.04
C3'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.04	0.01	0.09	0.03	0.09	0.13	0.06	0.06	0.13	0.13	0.06	0.02	0.01	0.00	0.09	0.08	0.08	0.07
C4	0.02	0.02	0.04	0.04	0.00	0.03	0.01	0.08	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.12	0.04	0.01	0.09	0.09	0.05	0.04
C4'	0.00	0.03	0.02	0.01	0.03	0.00	0.08	0.01	0.09	0.12	0.04	0.03	0.14	0.12	0.04	0.05	0.01	0.00	0.02	0.09	0.01	0.01
C5	0.00	0.03	0.01	0.09	0.01	0.08	0.00	0.15	0.02	0.03	0.03	0.01	0.04	0.02	0.02	0.09	0.09	0.05	0.16	0.16	0.12	0.13
C5'	0.01	0.06	0.03	0.03	0.08	0.01	0.15	0.00	0.17	0.17	0.11	0.04	0.24	0.19	0.07	0.06	0.05	0.00	0.01	0.09	0.06	0.01
C6	0.01	0.01	0.03	0.09	0.01	0.09	0.02	0.17	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.05	0.03	0.13	0.08	0.06	0.18	0.19	0.17	0.16
C8	0.02	0.04	0.05	0.13	0.02	0.12	0.03	0.17	0.05	0.00	0.04	0.02	0.09	0.00	0.00	0.03	0.14	0.07	0.17	0.13	0.07	0.10
N1	0.03	0.00	0.07	0.06	0.01	0.04	0.03	0.11	0.01	0.04	0.00	0.01	0.01	0.05	0.02	0.19	0.06	0.02	0.13	0.14	0.13	0.11
N3	0.03	0.01	0.09	0.06	0.01	0.03	0.01	0.04	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.19	0.09	0.01	0.05	0.07	0.03	0.01
N6	0.04	0.00	0.01	0.13	0.03	0.14	0.04	0.24	0.00	0.09	0.01	0.00	0.00	0.09	0.05	0.10	0.13	0.10	0.26	0.27	0.27	0.26
N7	0.01	0.04	0.03	0.13	0.01	0.12	0.02	0.19	0.05	0.00	0.05	0.01	0.09	0.00	0.00	0.04	0.14	0.06	0.21	0.18	0.14	0.16
N9	0.00	0.02	0.01	0.06	0.01	0.04	0.02	0.07	0.03	0.00	0.02	0.01	0.05	0.00	0.00	0.04	0.05	0.02	0.08	0.07	0.04	0.01
O2'	0.02	0.21	0.00	0.02	0.12	0.05	0.09	0.06	0.13	0.03	0.19	0.19	0.10	0.04	0.04	0.00	0.02	0.03	0.05	0.14	0.04	0.04
O3'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.04	0.01	0.09	0.05	0.08	0.14	0.06	0.09	0.13	0.14	0.05	0.02	0.00	0.00	0.12	0.15	0.16	0.12
O4'	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.07	0.02	0.01	0.10	0.06	0.02	0.03	0.00	0.00	0.09	0.10	0.09	0.07
O5'	0.05	0.08	0.04	0.09	0.09	0.02	0.16	0.01	0.18	0.17	0.13	0.05	0.26	0.21	0.08	0.05	0.12	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01
OP1	0.07	0.10	0.07	0.08	0.09	0.09	0.16	0.09	0.19	0.13	0.14	0.07	0.27	0.18	0.07	0.14	0.15	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.06	0.07	0.05	0.08	0.05	0.01	0.12	0.06	0.17	0.07	0.13	0.03	0.27	0.14	0.04	0.04	0.16	0.09	0.01	0.00	0.00	0.01
P	0.04	0.05	0.04	0.07	0.04	0.01	0.13	0.01	0.16	0.10	0.11	0.01	0.26	0.16	0.01	0.04	0.12	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.10	0.09	0.40	0.05	0.31	0.08	0.44	0.02	0.14	0.09	0.06	0.05	0.14	0.09	0.24	0.11	0.24	0.92	1.44	2.25	1.63
C2	0.06	0.18	0.04	0.24	0.07	0.16	0.07	0.24	0.06	0.10	0.15	0.13	0.11	0.12	0.05	0.39	0.09	0.12	0.62	1.06	1.66	1.23
C2'	0.02	0.14	0.03	0.26	0.03	0.19	0.01	0.32	0.03	0.06	0.12	0.10	0.04	0.06	0.00	0.39	0.06	0.14	0.78	1.32	2.05	1.49
C3'	0.16	0.05	0.11	0.38	0.12	0.33	0.14	0.48	0.11	0.17	0.05	0.07	0.16	0.18	0.14	0.23	0.05	0.29	0.95	1.56	2.27	1.71
C4	0.12	0.10	0.10	0.36	0.07	0.27	0.11	0.38	0.06	0.17	0.08	0.06	0.13	0.18	0.11	0.22	0.05	0.22	0.85	1.36	2.09	1.55
C4'	0.20	0.06	0.16	0.47	0.13	0.41	0.14	0.56	0.10	0.19	0.04	0.09	0.12	0.18	0.17	0.15	0.16	0.35	1.05	1.65	2.44	1.81
C5	0.16	0.06	0.14	0.38	0.11	0.29	0.16	0.41	0.12	0.21	0.02	0.04	0.20	0.22	0.15	0.12	0.05	0.25	0.91	1.45	2.16	1.64
C5'	0.34	0.18	0.30	0.60	0.26	0.55	0.26	0.72	0.21	0.31	0.16	0.22	0.22	0.29	0.29	0.04	0.28	0.49	1.23	1.88	2.67	2.03
C6	0.12	0.10	0.10	0.30	0.08	0.23	0.15	0.33	0.12	0.18	0.05	0.06	0.24	0.21	0.12	0.16	0.04	0.20	0.80	1.32	1.94	1.51
C8	0.24	0.02	0.22	0.49	0.16	0.41	0.20	0.55	0.14	0.26	0.03	0.08	0.20	0.26	0.21	0.04	0.18	0.35	1.08	1.66	2.46	1.86
N1	0.06	0.16	0.04	0.24	0.05	0.16	0.10	0.24	0.08	0.13	0.12	0.11	0.20	0.16	0.06	0.30	0.10	0.13	0.65	1.11	1.68	1.28
N3	0.06	0.17	0.04	0.29	0.06	0.20	0.07	0.29	0.05	0.11	0.14	0.12	0.08	0.13	0.06	0.35	0.04	0.15	0.71	1.16	1.85	1.35
N6	0.13	0.07	0.12	0.28	0.10	0.22	0.17	0.33	0.16	0.19	0.02	0.04	0.28	0.22	0.13	0.08	0.09	0.20	0.82	1.39	1.95	1.56
N7	0.25	0.03	0.24	0.46	0.18	0.39	0.22	0.53	0.18	0.28	0.06	0.09	0.24	0.28	0.22	0.05	0.15	0.35	1.06	1.65	2.40	1.85
N9	0.17	0.07	0.15	0.43	0.10	0.34	0.14	0.47	0.08	0.20	0.04	0.05	0.13	0.20	0.15	0.15	0.12	0.28	0.96	1.49	2.29	1.69
O2'	0.17	0.29	0.21	0.11	0.20	0.05	0.18	0.16	0.22	0.13	0.28	0.25	0.18	0.13	0.17	0.61	0.18	0.04	0.59	1.09	1.82	1.25
O3'	0.09	0.03	0.05	0.29	0.07	0.27	0.09	0.41	0.08	0.11	0.03	0.03	0.12	0.11	0.08	0.33	0.07	0.23	0.86	1.49	2.14	1.61
O4'	0.22	0.05	0.19	0.51	0.13	0.43	0.15	0.57	0.08	0.22	0.04	0.08	0.10	0.20	0.18	0.11	0.22	0.35	1.08	1.64	2.49	1.83
O5'	0.45	0.23	0.41	0.70	0.35	0.66	0.35	0.85	0.29	0.42	0.23	0.29	0.31	0.39	0.39	0.17	0.37	0.59	1.38	2.07	2.86	2.22
OP1	0.48	0.27	0.44	0.72	0.36	0.69	0.35	0.89	0.30	0.42	0.25	0.33	0.31	0.38	0.41	0.23	0.39	0.62	1.43	2.15	2.95	2.29
OP2	0.53	0.33	0.50	0.74	0.41	0.71	0.39	0.91	0.34	0.45	0.30	0.38	0.33	0.41	0.45	0.36	0.40	0.66	1.47	2.21	2.96	2.34
P	0.49	0.27	0.45	0.73	0.37	0.70	0.35	0.89	0.29	0.42	0.25	0.33	0.29	0.38	0.41	0.26	0.41	0.63	1.44	2.16	2.96	2.30

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.01	0.03	0.04	0.06	0.01	0.02	0.01	0.00	0.22	0.00	0.08	0.22	0.05	0.20
C2	0.06	0.00	0.05	0.07	0.01	0.05	0.02	0.08	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.05	0.30	0.06	0.40	0.89	1.08	0.99
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.14	0.02	0.07	0.02	0.06	0.05	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.40	0.21	0.58	0.32
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.11	0.00	0.18	0.01	0.17	0.24	0.12	0.05	0.19	0.24	0.14	0.03	0.01	0.03	0.17	0.15	0.44	0.18
C4	0.02	0.01	0.01	0.11	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.16	0.16	0.02	0.22	0.52	0.67	0.62
C4'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.07	0.06	0.06	0.04	0.08	0.07	0.03	0.29	0.02	0.00	0.02	0.08	0.10	0.09
C5	0.01	0.02	0.03	0.18	0.00	0.05	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.30	0.05	0.02	0.22	0.46	0.76	0.59
C5'	0.06	0.08	0.14	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.10	0.07	0.04	0.07	0.07	0.07	0.16	0.16	0.01	0.01	0.07	0.09	0.01
C6	0.01	0.02	0.02	0.17	0.01	0.07	0.01	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.28	0.10	0.04	0.33	0.65	1.02	0.80
C8	0.03	0.02	0.07	0.24	0.01	0.06	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.00	0.38	0.13	0.01	0.11	0.06	0.19	0.11
N1	0.04	0.00	0.02	0.12	0.01	0.06	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.17	0.21	0.06	0.40	0.85	1.16	0.98
N3	0.06	0.01	0.06	0.05	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.31	0.04	0.31	0.75	0.84	0.83
N6	0.01	0.02	0.05	0.19	0.01	0.08	0.02	0.07	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.04	0.02	0.36	0.06	0.04	0.32	0.61	1.07	0.77
N7	0.02	0.02	0.06	0.24	0.01	0.07	0.00	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.41	0.11	0.01	0.11	0.18	0.48	0.30
N9	0.01	0.02	0.01	0.14	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.20	0.06	0.01	0.08	0.24	0.30	0.30
O2'	0.00	0.05	0.00	0.03	0.16	0.29	0.30	0.16	0.28	0.38	0.17	0.01	0.36	0.41	0.20	0.00	0.05	0.16	0.24	0.12	0.58	0.17
O3'	0.22	0.30	0.01	0.01	0.16	0.02	0.05	0.16	0.10	0.13	0.21	0.31	0.06	0.11	0.06	0.05	0.00	0.14	0.05	0.04	0.37	0.08
O4'	0.00	0.06	0.02	0.03	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.06	0.04	0.04	0.01	0.01	0.16	0.14	0.00	0.16	0.36	0.30	0.42
O5'	0.08	0.40	0.40	0.17	0.22	0.02	0.22	0.01	0.33	0.11	0.40	0.31	0.32	0.11	0.08	0.24	0.05	0.16	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.22	0.89	0.21	0.15	0.52	0.08	0.46	0.07	0.65	0.06	0.85	0.75	0.61	0.18	0.24	0.12	0.04	0.36	0.02	0.00	0.02	0.02
OP2	0.05	1.08	0.58	0.44	0.67	0.10	0.76	0.09	1.02	0.19	1.16	0.84	1.07	0.48	0.30	0.58	0.37	0.30	0.01	0.02	0.00	0.00
P	0.20	0.99	0.32	0.18	0.62	0.09	0.59	0.01	0.80	0.11	0.98	0.83	0.77	0.30	0.30	0.17	0.08	0.42	0.01	0.02	0.00	0.00