Doublet Group distance statistics: 48915

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N6	B	0, 0.000, 1.580, 3.160, 3.160 max_d=3.160 avg_d=1.580 std_dev=1.580
N6	A	0, 0.000, 1.597, 3.194, 3.194 max_d=3.194 avg_d=1.597 std_dev=1.597
C6	B	0, 0.000, 2.146, 4.293, 4.293 max_d=4.293 avg_d=2.146 std_dev=2.146
N1	B	0, 0.000, 2.148, 4.295, 4.295 max_d=4.295 avg_d=2.148 std_dev=2.148
C6	A	0, 0.000, 2.287, 4.575, 4.575 max_d=4.575 avg_d=2.287 std_dev=2.287
N1	A	0, 0.000, 2.312, 4.625, 4.625 max_d=4.625 avg_d=2.312 std_dev=2.312
C2	B	0, 0.000, 3.411, 6.823, 6.823 max_d=6.823 avg_d=3.411 std_dev=3.411
C5	B	0, 0.000, 3.503, 7.005, 7.005 max_d=7.005 avg_d=3.503 std_dev=3.503
C2	A	0, 0.000, 3.600, 7.199, 7.199 max_d=7.199 avg_d=3.600 std_dev=3.600
C5	A	0, 0.000, 3.662, 7.325, 7.325 max_d=7.325 avg_d=3.662 std_dev=3.662
C4	B	0, 0.000, 4.354, 8.709, 8.709 max_d=8.709 avg_d=4.354 std_dev=4.354
N3	B	0, 0.000, 4.415, 8.831, 8.831 max_d=8.831 avg_d=4.415 std_dev=4.415
N7	B	0, 0.000, 4.483, 8.965, 8.965 max_d=8.965 avg_d=4.483 std_dev=4.483
C4	A	0, 0.000, 4.575, 9.151, 9.151 max_d=9.151 avg_d=4.575 std_dev=4.575
N7	A	0, 0.000, 4.576, 9.151, 9.151 max_d=9.151 avg_d=4.576 std_dev=4.576
N3	A	0, 0.000, 4.651, 9.302, 9.302 max_d=9.302 avg_d=4.651 std_dev=4.651
N9	B	0, 0.000, 5.553, 11.106, 11.106 max_d=11.106 avg_d=5.553 std_dev=5.553
C8	B	0, 0.000, 5.555, 11.110, 11.110 max_d=11.110 avg_d=5.555 std_dev=5.555
C8	A	0, 0.000, 5.705, 11.410, 11.410 max_d=11.410 avg_d=5.705 std_dev=5.705
N9	A	0, 0.000, 5.765, 11.531, 11.531 max_d=11.531 avg_d=5.765 std_dev=5.765
C1'	B	0, 0.000, 6.811, 13.622, 13.622 max_d=13.622 avg_d=6.811 std_dev=6.811
C1'	A	0, 0.000, 7.061, 14.122, 14.122 max_d=14.122 avg_d=7.061 std_dev=7.061
C2'	B	0, 0.000, 7.520, 15.040, 15.040 max_d=15.040 avg_d=7.520 std_dev=7.520
O4'	B	0, 0.000, 7.687, 15.373, 15.373 max_d=15.373 avg_d=7.687 std_dev=7.687
O4'	A	0, 0.000, 7.734, 15.468, 15.468 max_d=15.468 avg_d=7.734 std_dev=7.734
C2'	A	0, 0.000, 7.973, 15.946, 15.946 max_d=15.946 avg_d=7.973 std_dev=7.973
O2'	B	0, 0.000, 8.029, 16.058, 16.058 max_d=16.058 avg_d=8.029 std_dev=8.029
O2'	A	0, 0.000, 8.355, 16.710, 16.710 max_d=16.710 avg_d=8.355 std_dev=8.355
C3'	B	0, 0.000, 8.589, 17.177, 17.177 max_d=17.177 avg_d=8.589 std_dev=8.589
C4'	B	0, 0.000, 8.891, 17.782, 17.782 max_d=17.782 avg_d=8.891 std_dev=8.891
O5'	B	0, 0.000, 8.902, 17.803, 17.803 max_d=17.803 avg_d=8.902 std_dev=8.902
C3'	A	0, 0.000, 9.042, 18.084, 18.084 max_d=18.084 avg_d=9.042 std_dev=9.042
C4'	A	0, 0.000, 9.092, 18.185, 18.185 max_d=18.185 avg_d=9.092 std_dev=9.092
P	B	0, 0.000, 9.160, 18.320, 18.320 max_d=18.320 avg_d=9.160 std_dev=9.160
OP1	B	0, 0.000, 9.265, 18.529, 18.529 max_d=18.529 avg_d=9.265 std_dev=9.265
OP2	B	0, 0.000, 9.324, 18.647, 18.647 max_d=18.647 avg_d=9.324 std_dev=9.324
O5'	A	0, 0.000, 9.360, 18.719, 18.719 max_d=18.719 avg_d=9.360 std_dev=9.360
O3'	B	0, 0.000, 9.375, 18.749, 18.749 max_d=18.749 avg_d=9.375 std_dev=9.375
C5'	B	0, 0.000, 9.595, 19.190, 19.190 max_d=19.190 avg_d=9.595 std_dev=9.595
O3'	A	0, 0.000, 9.692, 19.384, 19.384 max_d=19.384 avg_d=9.692 std_dev=9.692
C5'	A	0, 0.000, 9.743, 19.486, 19.486 max_d=19.486 avg_d=9.743 std_dev=9.743
P	A	0, 0.000, 9.749, 19.498, 19.498 max_d=19.498 avg_d=9.749 std_dev=9.749
OP1	A	0, 0.000, 9.888, 19.775, 19.775 max_d=19.775 avg_d=9.888 std_dev=9.888
OP2	A	0, 0.000, 10.088, 20.176, 20.176 max_d=20.176 avg_d=10.088 std_dev=10.088

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.08	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.32	0.00	0.11	0.71	0.02	0.27
C2	0.02	0.00	0.05	0.02	0.01	0.05	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.14	0.49	0.07	0.00	0.98	0.26	0.22
C2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.21	0.02	0.04	0.04	0.05	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.02	0.43	0.75	0.33	0.56
C3'	0.02	0.02	0.01	0.00	0.08	0.00	0.17	0.00	0.14	0.28	0.05	0.04	0.18	0.28	0.14	0.01	0.00	0.01	0.06	0.10	0.00	0.08
C4	0.01	0.01	0.03	0.08	0.00	0.00	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.19	0.29	0.04	0.00	0.99	0.23	0.25
C4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.08	0.03	0.05	0.00	0.06	0.03	0.23	0.02	0.00	0.00	0.14	0.10	0.03
C5	0.02	0.01	0.01	0.17	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.26	0.13	0.04	0.05	1.11	0.33	0.26
C5'	0.08	0.08	0.21	0.00	0.07	0.00	0.06	0.00	0.07	0.05	0.08	0.08	0.08	0.05	0.06	0.02	0.19	0.00	0.00	0.05	0.23	0.00
C6	0.02	0.00	0.02	0.14	0.01	0.00	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.27	0.20	0.06	0.06	1.13	0.37	0.24
C8	0.02	0.01	0.04	0.28	0.00	0.08	0.01	0.05	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.25	0.11	0.00	0.04	1.09	0.23	0.32
N1	0.02	0.00	0.04	0.05	0.01	0.03	0.01	0.08	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.22	0.37	0.07	0.03	1.07	0.34	0.23
N3	0.01	0.00	0.05	0.04	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.11	0.51	0.06	0.03	0.92	0.20	0.23
N6	0.03	0.01	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.08	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.31	0.12	0.06	0.07	1.19	0.42	0.26
N7	0.02	0.01	0.02	0.28	0.00	0.06	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.29	0.09	0.02	0.08	1.16	0.34	0.29
N9	0.01	0.02	0.00	0.14	0.01	0.03	0.01	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.17	0.15	0.01	0.02	0.93	0.15	0.28
O2'	0.01	0.14	0.01	0.01	0.19	0.23	0.26	0.02	0.27	0.25	0.22	0.11	0.31	0.29	0.17	0.00	0.00	0.15	0.36	0.65	0.34	0.52
O3'	0.32	0.49	0.03	0.00	0.29	0.02	0.13	0.19	0.20	0.11	0.37	0.51	0.12	0.09	0.15	0.00	0.00	0.23	0.13	0.23	0.19	0.17
O4'	0.00	0.07	0.02	0.01	0.04	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.07	0.06	0.06	0.02	0.01	0.15	0.23	0.00	0.08	0.47	0.05	0.05
O5'	0.11	0.00	0.43	0.06	0.00	0.00	0.05	0.00	0.06	0.04	0.03	0.03	0.07	0.08	0.02	0.36	0.13	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00
OP1	0.71	0.98	0.75	0.10	0.99	0.14	1.11	0.05	1.13	1.09	1.07	0.92	1.19	1.16	0.93	0.65	0.23	0.47	0.00	0.00	0.01	0.01
OP2	0.02	0.26	0.33	0.00	0.23	0.10	0.33	0.23	0.37	0.23	0.34	0.20	0.42	0.34	0.15	0.34	0.19	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00
P	0.27	0.22	0.56	0.08	0.25	0.03	0.26	0.00	0.24	0.32	0.23	0.23	0.26	0.29	0.28	0.52	0.17	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.09	0.33	0.55	0.19	0.30	0.23	0.25	0.20	0.26	0.12	0.13	0.25	0.28	0.22	0.08	0.40	0.17	0.25	0.71	1.07	0.17
C2	0.25	0.11	0.38	0.64	0.23	0.34	0.27	0.30	0.23	0.31	0.13	0.16	0.29	0.32	0.26	0.01	0.52	0.19	0.31	0.68	1.11	0.21
C2'	0.10	0.02	0.21	0.45	0.08	0.20	0.10	0.14	0.08	0.12	0.03	0.04	0.11	0.13	0.09	0.22	0.35	0.06	0.12	0.82	0.95	0.03
C3'	0.01	0.14	0.08	0.32	0.02	0.11	0.04	0.09	0.01	0.10	0.10	0.10	0.08	0.12	0.03	0.38	0.16	0.00	0.08	0.80	0.97	0.04
C4	0.18	0.07	0.31	0.54	0.16	0.27	0.19	0.22	0.17	0.22	0.09	0.10	0.22	0.23	0.18	0.09	0.41	0.12	0.22	0.75	1.02	0.12
C4'	0.23	0.09	0.33	0.52	0.20	0.30	0.25	0.27	0.22	0.30	0.13	0.13	0.27	0.31	0.24	0.09	0.33	0.20	0.25	0.69	1.10	0.20
C5	0.10	0.02	0.25	0.47	0.08	0.20	0.11	0.15	0.10	0.12	0.04	0.04	0.15	0.13	0.10	0.16	0.35	0.05	0.13	0.82	0.92	0.03
C5'	0.23	0.11	0.35	0.51	0.21	0.30	0.26	0.26	0.24	0.30	0.16	0.14	0.30	0.32	0.24	0.07	0.31	0.19	0.25	0.69	1.08	0.19
C6	0.10	0.02	0.27	0.49	0.08	0.21	0.10	0.15	0.08	0.11	0.04	0.04	0.13	0.11	0.09	0.14	0.38	0.04	0.14	0.84	0.90	0.02
C8	0.08	0.01	0.23	0.42	0.07	0.18	0.10	0.13	0.09	0.11	0.04	0.03	0.14	0.12	0.08	0.21	0.28	0.04	0.10	0.83	0.90	0.02
N1	0.19	0.08	0.34	0.59	0.17	0.29	0.20	0.23	0.17	0.22	0.10	0.12	0.23	0.23	0.19	0.04	0.48	0.12	0.24	0.76	1.01	0.12
N3	0.24	0.10	0.36	0.61	0.22	0.33	0.26	0.29	0.22	0.30	0.13	0.15	0.27	0.31	0.25	0.02	0.48	0.19	0.30	0.69	1.10	0.20
N6	0.02	0.06	0.19	0.40	0.04	0.11	0.04	0.05	0.05	0.04	0.07	0.05	0.03	0.04	0.04	0.23	0.31	0.07	0.02	0.93	0.75	0.10
N7	0.04	0.02	0.20	0.39	0.02	0.15	0.05	0.09	0.05	0.05	0.01	0.01	0.10	0.06	0.03	0.24	0.26	0.01	0.06	0.87	0.84	0.03
N9	0.16	0.06	0.29	0.51	0.14	0.25	0.18	0.21	0.16	0.20	0.09	0.09	0.21	0.22	0.17	0.12	0.37	0.11	0.19	0.76	1.01	0.11
O2'	0.37	0.29	0.51	0.79	0.35	0.50	0.37	0.45	0.35	0.40	0.30	0.31	0.38	0.40	0.37	0.09	0.72	0.33	0.45	0.50	1.26	0.33
O3'	0.42	0.20	0.44	0.71	0.39	0.54	0.47	0.54	0.41	0.55	0.26	0.26	0.50	0.58	0.45	0.04	0.54	0.45	0.53	0.30	1.48	0.52
O4'	0.31	0.17	0.42	0.60	0.28	0.37	0.32	0.33	0.29	0.37	0.20	0.21	0.35	0.38	0.32	0.02	0.41	0.26	0.32	0.64	1.14	0.25
O5'	0.07	0.17	0.07	0.24	0.07	0.02	0.01	0.00	0.00	0.03	0.10	0.16	0.10	0.07	0.04	0.38	0.04	0.11	0.01	0.89	0.86	0.03
OP1	1.16	1.10	1.33	1.45	1.17	1.24	1.22	1.21	1.23	1.23	1.17	1.10	1.29	1.25	1.18	0.89	1.23	1.11	1.20	0.27	1.98	1.13
OP2	0.56	0.62	0.41	0.30	0.54	0.49	0.44	0.50	0.42	0.44	0.53	0.62	0.30	0.38	0.52	0.86	0.53	0.60	0.50	1.35	0.34	0.52
P	0.16	0.09	0.33	0.47	0.17	0.24	0.25	0.23	0.26	0.26	0.17	0.09	0.36	0.30	0.19	0.11	0.25	0.10	0.24	0.67	1.06	0.18

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.05	0.03	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.18	0.00	0.16	0.66	0.17	0.14
C2	0.03	0.00	0.26	0.31	0.00	0.11	0.01	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.09	0.11	0.03	0.02	0.87	0.54	0.11
C2'	0.00	0.26	0.00	0.01	0.14	0.02	0.08	0.14	0.14	0.09	0.22	0.26	0.11	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00	0.29	0.59	0.01	0.28
C3'	0.02	0.31	0.01	0.00	0.28	0.00	0.32	0.00	0.36	0.21	0.35	0.27	0.37	0.28	0.20	0.02	0.01	0.03	0.07	0.06	0.16	0.08
C4	0.02	0.00	0.14	0.28	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.15	0.09	0.02	0.06	0.88	0.50	0.12
C4'	0.01	0.11	0.02	0.00	0.09	0.00	0.09	0.00	0.11	0.06	0.11	0.10	0.11	0.07	0.06	0.27	0.00	0.00	0.01	0.18	0.08	0.01
C5	0.01	0.01	0.08	0.32	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.21	0.19	0.02	0.05	0.96	0.62	0.13
C5'	0.05	0.04	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.03	0.04	0.03	0.02	0.01	0.01	0.12	0.18	0.00	0.00	0.05	0.29	0.00
C6	0.03	0.01	0.14	0.36	0.01	0.11	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.20	0.23	0.02	0.02	0.97	0.67	0.13
C8	0.01	0.00	0.09	0.21	0.00	0.06	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.21	0.13	0.01	0.11	0.95	0.51	0.16
N1	0.03	0.00	0.22	0.35	0.01	0.11	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.19	0.03	0.01	0.93	0.63	0.11
N3	0.03	0.00	0.26	0.27	0.00	0.10	0.00	0.03	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.06	0.04	0.03	0.04	0.82	0.47	0.10
N6	0.02	0.02	0.11	0.37	0.02	0.11	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.22	0.28	0.02	0.02	1.00	0.72	0.14
N7	0.01	0.01	0.03	0.28	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.24	0.20	0.01	0.07	1.01	0.65	0.15
N9	0.00	0.00	0.01	0.20	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.15	0.03	0.00	0.10	0.83	0.40	0.13
O2'	0.02	0.09	0.00	0.02	0.15	0.27	0.21	0.12	0.20	0.21	0.15	0.06	0.22	0.24	0.15	0.00	0.02	0.19	0.15	0.45	0.05	0.16
O3'	0.18	0.11	0.00	0.01	0.09	0.00	0.19	0.18	0.23	0.13	0.19	0.04	0.28	0.20	0.03	0.02	0.00	0.13	0.29	0.22	0.27	0.28
O4'	0.00	0.03	0.00	0.03	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.19	0.13	0.00	0.07	0.52	0.08	0.05
O5'	0.16	0.02	0.29	0.07	0.06	0.01	0.05	0.00	0.02	0.11	0.01	0.04	0.02	0.07	0.10	0.15	0.29	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00
OP1	0.66	0.87	0.59	0.06	0.88	0.18	0.96	0.05	0.97	0.95	0.93	0.82	1.00	1.01	0.83	0.45	0.22	0.52	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.17	0.54	0.01	0.16	0.50	0.08	0.62	0.29	0.67	0.51	0.63	0.47	0.72	0.65	0.40	0.05	0.27	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.14	0.11	0.28	0.08	0.12	0.01	0.13	0.00	0.13	0.16	0.11	0.10	0.14	0.15	0.13	0.16	0.28	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00