Doublet Group distance statistics: 48920

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 9, 22, 16, 10, 2, 2, 4, 0, 4, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.009, 0.016, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.009 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.001, 0.010, 0.020, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.010 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.004, 0.014, 0.023, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.014 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.003, 0.013, 0.023, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.013 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.003, 0.014, 0.026, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.014 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.003, 0.016, 0.028, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.016 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.001, 0.014, 0.027, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.014 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.002, 0.019, 0.036, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.019 std_dev=0.017
N6	A	0, 0.009, 0.029, 0.050, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.029 std_dev=0.021
N7	A	0, 0.006, 0.027, 0.048, 0.108 max_d=0.108 avg_d=0.027 std_dev=0.021
C8	A	0, 0.007, 0.033, 0.059, 0.127 max_d=0.127 avg_d=0.033 std_dev=0.026
C5	B	0, 0.315, 0.504, 0.694, 1.123 max_d=1.123 avg_d=0.504 std_dev=0.189
C4	B	0, 0.265, 0.472, 0.679, 1.194 max_d=1.194 avg_d=0.472 std_dev=0.207
C6	B	0, 0.268, 0.479, 0.691, 1.069 max_d=1.069 avg_d=0.479 std_dev=0.211
N4	B	0, 0.309, 0.537, 0.764, 1.293 max_d=1.293 avg_d=0.537 std_dev=0.227
N3	B	0, 0.206, 0.464, 0.722, 1.216 max_d=1.216 avg_d=0.464 std_dev=0.258
N1	B	0, 0.197, 0.474, 0.751, 1.276 max_d=1.276 avg_d=0.474 std_dev=0.277
C2	B	0, 0.185, 0.491, 0.796, 1.473 max_d=1.473 avg_d=0.491 std_dev=0.305
P	B	0, 0.257, 0.609, 0.960, 2.585 max_d=2.585 avg_d=0.609 std_dev=0.352
O4'	A	0, -0.221, 0.158, 0.536, 2.412 max_d=2.412 avg_d=0.158 std_dev=0.378
C1'	B	0, 0.150, 0.532, 0.914, 1.920 max_d=1.920 avg_d=0.532 std_dev=0.382
O5'	B	0, 0.294, 0.682, 1.070, 2.415 max_d=2.415 avg_d=0.682 std_dev=0.388
C2'	A	0, -0.225, 0.174, 0.574, 2.537 max_d=2.537 avg_d=0.174 std_dev=0.400
O2	B	0, 0.194, 0.596, 0.998, 2.426 max_d=2.426 avg_d=0.596 std_dev=0.402
O4'	B	0, 0.107, 0.565, 1.024, 2.594 max_d=2.594 avg_d=0.565 std_dev=0.458
O2'	A	0, -0.234, 0.233, 0.700, 2.953 max_d=2.953 avg_d=0.233 std_dev=0.467
C2'	B	0, 0.193, 0.672, 1.150, 2.685 max_d=2.685 avg_d=0.672 std_dev=0.479
C4'	A	0, -0.279, 0.259, 0.797, 3.427 max_d=3.427 avg_d=0.259 std_dev=0.538
O2'	B	0, 0.233, 0.774, 1.315, 3.009 max_d=3.009 avg_d=0.774 std_dev=0.541
OP2	B	0, 0.193, 0.742, 1.291, 3.388 max_d=3.388 avg_d=0.742 std_dev=0.549
C5'	B	0, 0.152, 0.723, 1.295, 3.498 max_d=3.498 avg_d=0.723 std_dev=0.572
C4'	B	0, 0.059, 0.664, 1.269, 3.716 max_d=3.716 avg_d=0.664 std_dev=0.605
C3'	A	0, -0.332, 0.281, 0.893, 3.899 max_d=3.899 avg_d=0.281 std_dev=0.612
OP1	B	0, 0.066, 0.702, 1.339, 3.687 max_d=3.687 avg_d=0.702 std_dev=0.636
C3'	B	0, 0.042, 0.724, 1.406, 4.185 max_d=4.185 avg_d=0.724 std_dev=0.682
O3'	A	0, -0.458, 0.402, 1.262, 5.477 max_d=5.477 avg_d=0.402 std_dev=0.860
C5'	A	0, -0.498, 0.446, 1.391, 6.019 max_d=6.019 avg_d=0.446 std_dev=0.944
O5'	A	0, -0.432, 0.521, 1.474, 6.028 max_d=6.028 avg_d=0.521 std_dev=0.953
O3'	B	0, -0.155, 0.839, 1.832, 5.903 max_d=5.903 avg_d=0.839 std_dev=0.993
P	A	0, -0.504, 0.659, 1.821, 7.307 max_d=7.307 avg_d=0.659 std_dev=1.163
OP2	A	0, -0.466, 0.762, 1.990, 7.459 max_d=7.459 avg_d=0.762 std_dev=1.228
OP1	A	0, -0.532, 0.931, 2.395, 8.991 max_d=8.991 avg_d=0.931 std_dev=1.464

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.07	0.14	0.16	0.14
C2	0.03	0.00	0.09	0.24	0.01	0.27	0.01	0.41	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.24	0.20	0.45	0.44	0.49	0.44
C2'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.05	0.05	0.07	0.09	0.05	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.12	0.30	0.22	0.09
C3'	0.01	0.24	0.00	0.00	0.11	0.00	0.08	0.02	0.11	0.14	0.18	0.23	0.10	0.11	0.05	0.02	0.01	0.01	0.17	0.37	0.23	0.14
C4	0.02	0.01	0.05	0.11	0.00	0.12	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.07	0.11	0.10	0.19	0.20	0.30	0.24
C4'	0.01	0.27	0.01	0.00	0.12	0.00	0.07	0.01	0.11	0.19	0.20	0.27	0.09	0.14	0.04	0.04	0.02	0.00	0.02	0.18	0.05	0.07
C5	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.07	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.09	0.04	0.18	0.21	0.37	0.27
C5'	0.03	0.41	0.02	0.02	0.16	0.01	0.13	0.00	0.17	0.33	0.30	0.39	0.16	0.28	0.10	0.04	0.04	0.01	0.02	0.06	0.04	0.02
C6	0.02	0.01	0.05	0.11	0.01	0.11	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.13	0.08	0.20	0.23	0.38	0.27
C8	0.01	0.02	0.05	0.14	0.01	0.19	0.01	0.33	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.08	0.13	0.13	0.40	0.38	0.50	0.43
N1	0.02	0.00	0.07	0.18	0.01	0.20	0.01	0.30	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.20	0.15	0.33	0.32	0.42	0.35
N3	0.03	0.00	0.09	0.23	0.01	0.27	0.01	0.39	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.22	0.21	0.42	0.41	0.43	0.41
N6	0.02	0.01	0.05	0.10	0.02	0.09	0.02	0.16	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.05	0.13	0.06	0.20	0.27	0.43	0.31
N7	0.01	0.01	0.04	0.11	0.00	0.14	0.00	0.28	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.06	0.11	0.08	0.36	0.40	0.54	0.44
N9	0.00	0.01	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.15	0.14	0.27	0.20
O2'	0.01	0.17	0.01	0.02	0.07	0.04	0.04	0.04	0.07	0.08	0.13	0.17	0.05	0.06	0.02	0.00	0.04	0.05	0.06	0.34	0.12	0.08
O3'	0.02	0.24	0.02	0.01	0.11	0.02	0.09	0.04	0.13	0.13	0.20	0.22	0.13	0.11	0.05	0.04	0.00	0.02	0.19	0.51	0.22	0.19
O4'	0.01	0.20	0.01	0.01	0.10	0.00	0.04	0.01	0.08	0.13	0.15	0.21	0.06	0.08	0.01	0.05	0.02	0.00	0.10	0.21	0.16	0.22
O5'	0.07	0.45	0.12	0.17	0.19	0.02	0.18	0.02	0.20	0.40	0.33	0.42	0.20	0.36	0.15	0.06	0.19	0.10	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.14	0.44	0.30	0.37	0.20	0.18	0.21	0.06	0.23	0.38	0.32	0.41	0.27	0.40	0.14	0.34	0.51	0.21	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.16	0.49	0.22	0.23	0.30	0.05	0.37	0.04	0.38	0.50	0.42	0.43	0.43	0.54	0.27	0.12	0.22	0.16	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.14	0.44	0.09	0.14	0.24	0.07	0.27	0.02	0.27	0.43	0.35	0.41	0.31	0.44	0.20	0.08	0.19	0.22	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.11	0.25	0.27	0.10	0.12	0.10	0.12	0.09	0.10	0.09	0.12	0.15	0.20	0.24	0.12	0.22	0.48	0.36	0.16
C2	0.15	0.15	0.21	0.27	0.12	0.13	0.11	0.15	0.11	0.13	0.14	0.14	0.19	0.19	0.26	0.13	0.24	0.50	0.39	0.17
C2'	0.16	0.15	0.25	0.29	0.11	0.15	0.11	0.14	0.11	0.13	0.13	0.12	0.20	0.22	0.26	0.13	0.23	0.51	0.38	0.19
C3'	0.25	0.23	0.32	0.39	0.21	0.25	0.22	0.21	0.22	0.23	0.22	0.22	0.26	0.26	0.34	0.21	0.30	0.37	0.56	0.23
C4	0.14	0.12	0.24	0.27	0.09	0.13	0.09	0.11	0.09	0.11	0.10	0.12	0.17	0.19	0.25	0.11	0.22	0.47	0.36	0.15
C4'	0.22	0.20	0.33	0.39	0.22	0.24	0.23	0.21	0.22	0.20	0.20	0.25	0.21	0.24	0.33	0.18	0.31	0.30	0.59	0.24
C5	0.14	0.12	0.25	0.28	0.09	0.14	0.09	0.11	0.09	0.11	0.08	0.13	0.17	0.20	0.25	0.12	0.21	0.45	0.33	0.14
C5'	0.30	0.27	0.38	0.46	0.33	0.34	0.35	0.32	0.32	0.29	0.27	0.38	0.27	0.30	0.41	0.28	0.41	0.21	0.73	0.35
C6	0.15	0.13	0.24	0.28	0.08	0.14	0.09	0.11	0.09	0.11	0.09	0.14	0.18	0.19	0.25	0.12	0.21	0.45	0.33	0.14
C8	0.15	0.11	0.28	0.29	0.09	0.16	0.10	0.11	0.09	0.11	0.09	0.13	0.16	0.22	0.25	0.13	0.21	0.44	0.32	0.14
N1	0.15	0.15	0.22	0.27	0.10	0.13	0.10	0.13	0.10	0.13	0.13	0.13	0.19	0.19	0.26	0.12	0.23	0.48	0.37	0.16
N3	0.14	0.14	0.22	0.27	0.11	0.13	0.11	0.14	0.10	0.12	0.12	0.13	0.17	0.18	0.25	0.13	0.23	0.49	0.39	0.17
N6	0.16	0.13	0.25	0.29	0.11	0.17	0.11	0.12	0.10	0.12	0.09	0.18	0.19	0.20	0.25	0.14	0.21	0.43	0.30	0.14
N7	0.16	0.12	0.29	0.30	0.10	0.17	0.10	0.12	0.10	0.12	0.09	0.14	0.16	0.22	0.25	0.14	0.21	0.43	0.31	0.14
N9	0.14	0.12	0.26	0.28	0.09	0.13	0.09	0.11	0.09	0.11	0.09	0.12	0.16	0.20	0.25	0.12	0.21	0.46	0.35	0.15
O2'	0.14	0.14	0.22	0.24	0.15	0.13	0.17	0.19	0.14	0.12	0.13	0.19	0.18	0.20	0.23	0.14	0.25	0.62	0.34	0.26
O3'	0.29	0.27	0.35	0.41	0.25	0.29	0.25	0.24	0.25	0.27	0.26	0.25	0.31	0.30	0.37	0.25	0.32	0.38	0.59	0.26
O4'	0.18	0.16	0.31	0.35	0.17	0.19	0.18	0.16	0.17	0.16	0.15	0.20	0.17	0.23	0.30	0.13	0.28	0.33	0.51	0.20
O5'	0.31	0.29	0.39	0.49	0.36	0.37	0.38	0.35	0.34	0.31	0.30	0.42	0.29	0.30	0.44	0.31	0.42	0.23	0.74	0.36
OP1	0.22	0.23	0.28	0.34	0.36	0.24	0.38	0.30	0.32	0.25	0.27	0.45	0.23	0.34	0.27	0.22	0.40	0.33	0.72	0.37
OP2	0.34	0.36	0.41	0.45	0.47	0.34	0.48	0.39	0.42	0.37	0.40	0.54	0.36	0.46	0.40	0.32	0.48	0.51	0.78	0.49
P	0.22	0.24	0.29	0.35	0.36	0.23	0.38	0.30	0.31	0.25	0.28	0.43	0.22	0.32	0.28	0.21	0.41	0.42	0.73	0.41

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.17	0.00	0.14	0.34	0.08	0.11
C2	0.02	0.00	0.10	0.14	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.11	0.13	0.05	0.17	0.41	0.20	0.11
C2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.05	0.01	0.09	0.13	0.11	0.02	0.08	0.05	0.18	0.01	0.03	0.02	0.32	0.33	0.24	0.28
C3'	0.02	0.14	0.01	0.00	0.16	0.01	0.15	0.02	0.12	0.10	0.16	0.17	0.15	0.02	0.01	0.01	0.14	0.16	0.14	0.07
C4	0.02	0.01	0.05	0.16	0.00	0.05	0.01	0.14	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.17	0.12	0.03	0.22	0.49	0.33	0.15
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.06	0.03	0.04	0.06	0.05	0.16	0.03	0.00	0.01	0.18	0.10	0.07
C5	0.01	0.01	0.09	0.15	0.01	0.07	0.00	0.16	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.19	0.12	0.03	0.24	0.51	0.33	0.16
C5'	0.05	0.09	0.13	0.02	0.14	0.01	0.16	0.00	0.14	0.09	0.11	0.15	0.07	0.07	0.11	0.01	0.01	0.11	0.17	0.02
C6	0.01	0.01	0.11	0.12	0.01	0.06	0.00	0.14	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.16	0.09	0.05	0.22	0.45	0.24	0.13
N1	0.01	0.01	0.02	0.10	0.02	0.03	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.10	0.10	0.01	0.18	0.40	0.17	0.11
N3	0.02	0.01	0.08	0.16	0.01	0.04	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.14	0.12	0.05	0.20	0.46	0.28	0.13
N4	0.02	0.02	0.05	0.17	0.01	0.06	0.01	0.15	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.19	0.13	0.04	0.23	0.52	0.38	0.17
O2	0.03	0.01	0.18	0.15	0.02	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.13	0.19	0.07	0.15	0.38	0.16	0.10
O2'	0.02	0.11	0.01	0.02	0.17	0.16	0.19	0.07	0.16	0.10	0.14	0.19	0.13	0.00	0.05	0.12	0.24	0.31	0.20	0.24
O3'	0.17	0.13	0.03	0.01	0.12	0.03	0.12	0.11	0.09	0.10	0.12	0.13	0.19	0.05	0.00	0.14	0.11	0.25	0.14	0.12
O4'	0.00	0.05	0.02	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.05	0.04	0.07	0.12	0.14	0.00	0.09	0.33	0.13	0.17
O5'	0.14	0.17	0.32	0.14	0.22	0.01	0.24	0.01	0.22	0.18	0.20	0.23	0.15	0.24	0.11	0.09	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.34	0.41	0.33	0.16	0.49	0.18	0.51	0.11	0.45	0.40	0.46	0.52	0.38	0.31	0.25	0.33	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.08	0.20	0.24	0.14	0.33	0.10	0.33	0.17	0.24	0.17	0.28	0.38	0.16	0.20	0.14	0.13	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.11	0.11	0.28	0.07	0.15	0.07	0.16	0.02	0.13	0.11	0.13	0.17	0.10	0.24	0.12	0.17	0.01	0.01	0.01	0.00