Doublet Group distance statistics: 48921

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 5, 2, 0, 1, 2, 3, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.011, 0.020, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.011 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.004, 0.014, 0.023, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.014 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.005, 0.015, 0.025, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.015 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.001, 0.013, 0.024, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.013 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.004, 0.017, 0.030, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.017 std_dev=0.013
C8	A	0, 0.011, 0.025, 0.040, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.025 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.002, 0.018, 0.033, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.018 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.006, 0.022, 0.037, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.022 std_dev=0.016
N3	A	0, 0.001, 0.017, 0.034, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.017 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.002, 0.019, 0.035, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.019 std_dev=0.016
N6	A	0, 0.000, 0.035, 0.069, 0.168 max_d=0.168 avg_d=0.035 std_dev=0.035
C2'	A	0, 0.037, 0.161, 0.285, 0.441 max_d=0.441 avg_d=0.161 std_dev=0.124
O4'	A	0, 0.028, 0.153, 0.277, 0.430 max_d=0.430 avg_d=0.153 std_dev=0.125
O2'	A	0, 0.071, 0.229, 0.387, 0.570 max_d=0.570 avg_d=0.229 std_dev=0.158
C4'	A	0, 0.047, 0.258, 0.469, 0.662 max_d=0.662 avg_d=0.258 std_dev=0.211
C3'	A	0, 0.070, 0.283, 0.497, 0.703 max_d=0.703 avg_d=0.283 std_dev=0.214
N4	B	0, 0.201, 0.459, 0.716, 0.948 max_d=0.948 avg_d=0.459 std_dev=0.258
C4	B	0, 0.211, 0.478, 0.744, 0.915 max_d=0.915 avg_d=0.478 std_dev=0.267
N3	B	0, 0.214, 0.495, 0.775, 1.047 max_d=1.047 avg_d=0.495 std_dev=0.281
O3'	A	0, 0.118, 0.428, 0.739, 1.049 max_d=1.049 avg_d=0.428 std_dev=0.310
C5'	A	0, 0.080, 0.449, 0.819, 1.088 max_d=1.088 avg_d=0.449 std_dev=0.369
C2	B	0, 0.202, 0.596, 0.990, 1.323 max_d=1.323 avg_d=0.596 std_dev=0.394
C5	B	0, 0.195, 0.626, 1.057, 1.306 max_d=1.306 avg_d=0.626 std_dev=0.431
O2	B	0, 0.340, 0.792, 1.244, 1.833 max_d=1.833 avg_d=0.792 std_dev=0.452
N1	B	0, 0.180, 0.634, 1.088, 1.634 max_d=1.634 avg_d=0.634 std_dev=0.454
O5'	A	0, 0.111, 0.581, 1.050, 1.526 max_d=1.526 avg_d=0.581 std_dev=0.470
C6	B	0, 0.203, 0.680, 1.158, 1.611 max_d=1.611 avg_d=0.680 std_dev=0.478
C1'	B	0, 0.173, 0.759, 1.344, 2.069 max_d=2.069 avg_d=0.759 std_dev=0.586
P	A	0, 0.108, 0.724, 1.340, 2.055 max_d=2.055 avg_d=0.724 std_dev=0.616
C2'	B	0, 0.191, 0.812, 1.433, 2.273 max_d=2.273 avg_d=0.812 std_dev=0.621
O4'	B	0, 0.246, 0.920, 1.595, 2.321 max_d=2.321 avg_d=0.920 std_dev=0.674
OP2	A	0, 0.157, 0.839, 1.520, 2.130 max_d=2.130 avg_d=0.839 std_dev=0.682
OP1	A	0, 0.162, 0.851, 1.539, 2.290 max_d=2.290 avg_d=0.851 std_dev=0.689
O2'	B	0, 0.188, 0.893, 1.598, 2.324 max_d=2.324 avg_d=0.893 std_dev=0.705
C3'	B	0, 0.195, 0.930, 1.664, 2.572 max_d=2.572 avg_d=0.930 std_dev=0.734
C4'	B	0, 0.219, 0.980, 1.741, 2.565 max_d=2.565 avg_d=0.980 std_dev=0.761
C5'	B	0, 0.339, 1.128, 1.917, 2.710 max_d=2.710 avg_d=1.128 std_dev=0.789
O3'	B	0, 0.220, 1.033, 1.847, 2.623 max_d=2.623 avg_d=1.033 std_dev=0.813
O5'	B	0, 0.423, 1.313, 2.203, 2.905 max_d=2.905 avg_d=1.313 std_dev=0.890
OP1	B	0, 0.471, 1.591, 2.710, 3.667 max_d=3.667 avg_d=1.591 std_dev=1.120
P	B	0, 0.362, 1.522, 2.682, 3.742 max_d=3.742 avg_d=1.522 std_dev=1.160
OP2	B	0, 0.256, 1.687, 3.118, 4.308 max_d=4.308 avg_d=1.687 std_dev=1.431

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.03	0.04	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.11	0.08	0.30	0.11
C2	0.04	0.00	0.13	0.14	0.00	0.05	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.17	0.05	0.28	0.20	0.32	0.21
C2'	0.00	0.13	0.00	0.01	0.07	0.01	0.04	0.02	0.07	0.07	0.10	0.13	0.06	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.05	0.15	0.28	0.11
C3'	0.02	0.14	0.01	0.00	0.09	0.00	0.11	0.01	0.12	0.14	0.13	0.13	0.13	0.13	0.07	0.02	0.01	0.01	0.07	0.19	0.25	0.11
C4	0.02	0.00	0.07	0.09	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.07	0.10	0.03	0.27	0.16	0.31	0.18
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.08	0.09	0.06	0.05	0.11	0.10	0.05	0.06	0.02	0.00	0.01	0.17	0.21	0.07
C5	0.02	0.01	0.04	0.11	0.00	0.08	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.12	0.03	0.33	0.22	0.33	0.24
C5'	0.03	0.12	0.02	0.01	0.12	0.01	0.17	0.00	0.18	0.16	0.15	0.10	0.22	0.19	0.10	0.06	0.04	0.01	0.01	0.19	0.10	0.02
C6	0.02	0.00	0.07	0.12	0.01	0.08	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.14	0.04	0.35	0.25	0.34	0.27
C8	0.02	0.01	0.07	0.14	0.01	0.09	0.01	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.05	0.16	0.05	0.31	0.19	0.35	0.20
N1	0.03	0.00	0.10	0.13	0.01	0.06	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.15	0.05	0.33	0.23	0.33	0.25
N3	0.04	0.00	0.13	0.13	0.00	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.15	0.05	0.25	0.17	0.31	0.18
N6	0.03	0.01	0.06	0.13	0.01	0.11	0.02	0.22	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.07	0.16	0.05	0.40	0.30	0.38	0.31
N7	0.02	0.01	0.05	0.13	0.01	0.10	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.16	0.05	0.35	0.25	0.36	0.26
N9	0.01	0.01	0.02	0.07	0.00	0.05	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.06	0.01	0.23	0.12	0.31	0.15
O2'	0.01	0.16	0.00	0.02	0.07	0.06	0.05	0.06	0.08	0.05	0.13	0.15	0.07	0.03	0.02	0.00	0.07	0.06	0.05	0.19	0.27	0.10
O3'	0.02	0.17	0.02	0.01	0.10	0.02	0.12	0.04	0.14	0.16	0.15	0.15	0.16	0.16	0.06	0.07	0.00	0.03	0.16	0.27	0.25	0.15
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.05	0.05	0.05	0.05	0.05	0.01	0.06	0.03	0.00	0.10	0.08	0.31	0.12
O5'	0.11	0.28	0.05	0.07	0.27	0.01	0.33	0.01	0.35	0.31	0.33	0.25	0.40	0.35	0.23	0.05	0.16	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.08	0.20	0.15	0.19	0.16	0.17	0.22	0.19	0.25	0.19	0.23	0.17	0.30	0.25	0.12	0.19	0.27	0.08	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.30	0.32	0.28	0.25	0.31	0.21	0.33	0.10	0.34	0.35	0.33	0.31	0.38	0.36	0.31	0.27	0.25	0.31	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.11	0.21	0.11	0.11	0.18	0.07	0.24	0.02	0.27	0.20	0.25	0.18	0.31	0.26	0.15	0.10	0.15	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.20	0.27	0.23	0.17	0.20	0.18	0.25	0.17	0.18	0.18	0.23	0.28	0.38	0.38	0.20	0.19	0.24	0.23	0.17
C2	0.25	0.24	0.26	0.23	0.23	0.21	0.24	0.23	0.23	0.23	0.23	0.26	0.28	0.30	0.29	0.20	0.18	0.29	0.37	0.22
C2'	0.23	0.22	0.26	0.25	0.19	0.23	0.20	0.26	0.19	0.20	0.20	0.24	0.28	0.36	0.41	0.22	0.19	0.28	0.22	0.17
C3'	0.24	0.21	0.29	0.26	0.20	0.24	0.20	0.28	0.19	0.20	0.18	0.25	0.27	0.40	0.41	0.23	0.21	0.25	0.22	0.18
C4	0.22	0.20	0.26	0.22	0.17	0.20	0.17	0.23	0.16	0.18	0.18	0.22	0.27	0.35	0.36	0.19	0.15	0.22	0.23	0.14
C4'	0.24	0.20	0.31	0.25	0.19	0.21	0.19	0.26	0.18	0.19	0.17	0.24	0.26	0.45	0.40	0.21	0.21	0.23	0.27	0.21
C5	0.23	0.22	0.28	0.26	0.14	0.24	0.14	0.26	0.15	0.19	0.17	0.19	0.29	0.36	0.40	0.23	0.20	0.23	0.23	0.17
C5'	0.26	0.22	0.36	0.28	0.24	0.24	0.24	0.29	0.23	0.23	0.21	0.29	0.27	0.50	0.41	0.24	0.25	0.23	0.28	0.23
C6	0.23	0.23	0.27	0.25	0.15	0.22	0.14	0.22	0.15	0.20	0.19	0.18	0.29	0.32	0.36	0.20	0.16	0.22	0.23	0.13
C8	0.26	0.21	0.31	0.30	0.14	0.29	0.13	0.33	0.15	0.20	0.16	0.19	0.30	0.42	0.47	0.29	0.30	0.30	0.29	0.27
N1	0.23	0.23	0.25	0.23	0.19	0.20	0.19	0.19	0.20	0.22	0.22	0.21	0.27	0.29	0.30	0.18	0.12	0.23	0.30	0.14
N3	0.23	0.22	0.25	0.22	0.21	0.20	0.23	0.23	0.21	0.21	0.21	0.26	0.28	0.31	0.31	0.19	0.16	0.27	0.33	0.20
N6	0.26	0.28	0.31	0.30	0.18	0.28	0.19	0.27	0.20	0.24	0.24	0.19	0.36	0.34	0.41	0.27	0.26	0.27	0.30	0.23
N7	0.28	0.24	0.33	0.32	0.14	0.32	0.13	0.34	0.16	0.22	0.18	0.18	0.33	0.42	0.48	0.31	0.33	0.31	0.32	0.30
N9	0.22	0.20	0.27	0.24	0.16	0.22	0.16	0.26	0.15	0.18	0.16	0.22	0.28	0.38	0.40	0.22	0.20	0.24	0.21	0.17
O2'	0.23	0.23	0.25	0.23	0.21	0.21	0.20	0.24	0.19	0.20	0.22	0.25	0.30	0.36	0.40	0.20	0.17	0.30	0.26	0.19
O3'	0.24	0.21	0.28	0.26	0.20	0.24	0.21	0.28	0.19	0.21	0.19	0.25	0.27	0.38	0.41	0.24	0.20	0.25	0.21	0.16
O4'	0.23	0.20	0.31	0.24	0.19	0.20	0.19	0.26	0.18	0.19	0.19	0.25	0.28	0.45	0.38	0.20	0.22	0.23	0.28	0.22
O5'	0.40	0.38	0.47	0.43	0.38	0.40	0.38	0.42	0.37	0.38	0.37	0.41	0.40	0.58	0.55	0.40	0.38	0.33	0.20	0.28
OP1	0.25	0.22	0.32	0.27	0.24	0.27	0.23	0.35	0.22	0.22	0.22	0.29	0.26	0.44	0.42	0.31	0.34	0.32	0.42	0.36
OP2	0.29	0.30	0.31	0.29	0.30	0.33	0.28	0.41	0.27	0.28	0.31	0.33	0.34	0.38	0.45	0.39	0.42	0.43	0.52	0.45
P	0.23	0.22	0.30	0.24	0.25	0.26	0.24	0.35	0.22	0.22	0.23	0.30	0.24	0.43	0.41	0.31	0.34	0.32	0.38	0.34

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.03	0.02	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.16	0.00	0.10	0.23	0.26	0.12
C2	0.01	0.00	0.08	0.03	0.01	0.07	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.21	0.11	0.21	0.36	0.38	0.26
C2'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.04	0.01	0.07	0.11	0.09	0.03	0.07	0.05	0.14	0.00	0.04	0.02	0.10	0.34	0.18	0.09
C3'	0.03	0.03	0.01	0.00	0.05	0.00	0.08	0.02	0.08	0.02	0.02	0.05	0.07	0.02	0.00	0.01	0.02	0.25	0.20	0.06
C4	0.02	0.01	0.04	0.05	0.00	0.05	0.00	0.18	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.11	0.15	0.03	0.19	0.37	0.35	0.22
C4'	0.02	0.07	0.01	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.13	0.03	0.05	0.06	0.16	0.06	0.03	0.01	0.01	0.14	0.21	0.07
C5	0.01	0.01	0.07	0.08	0.00	0.12	0.00	0.25	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.21	0.10	0.10	0.25	0.37	0.31	0.23
C5'	0.04	0.13	0.11	0.02	0.18	0.01	0.25	0.00	0.24	0.12	0.14	0.19	0.20	0.05	0.11	0.01	0.01	0.18	0.13	0.01
C6	0.01	0.01	0.09	0.08	0.01	0.13	0.00	0.24	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.22	0.09	0.13	0.24	0.34	0.27	0.21
N1	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.01	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.06	0.15	0.02	0.15	0.30	0.26	0.16
N3	0.01	0.00	0.07	0.02	0.00	0.05	0.00	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.20	0.08	0.21	0.38	0.40	0.27
N4	0.02	0.01	0.05	0.05	0.00	0.06	0.01	0.19	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.12	0.15	0.04	0.20	0.39	0.38	0.25
O2	0.02	0.01	0.14	0.07	0.01	0.16	0.01	0.20	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.29	0.26	0.21	0.32	0.41	0.49	0.36
O2'	0.01	0.14	0.00	0.02	0.11	0.06	0.21	0.05	0.22	0.06	0.10	0.12	0.29	0.00	0.05	0.02	0.08	0.29	0.29	0.09
O3'	0.16	0.21	0.04	0.00	0.15	0.03	0.10	0.11	0.09	0.15	0.20	0.15	0.26	0.05	0.00	0.10	0.10	0.26	0.36	0.22
O4'	0.00	0.11	0.02	0.01	0.03	0.01	0.10	0.01	0.13	0.02	0.08	0.04	0.21	0.02	0.10	0.00	0.10	0.19	0.24	0.13
O5'	0.10	0.21	0.10	0.02	0.19	0.01	0.25	0.01	0.24	0.15	0.21	0.20	0.32	0.08	0.10	0.10	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.23	0.36	0.34	0.25	0.37	0.14	0.37	0.18	0.34	0.30	0.38	0.39	0.41	0.29	0.26	0.19	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.26	0.38	0.18	0.20	0.35	0.21	0.31	0.13	0.27	0.26	0.40	0.38	0.49	0.29	0.36	0.24	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.12	0.26	0.09	0.06	0.22	0.07	0.23	0.01	0.21	0.16	0.27	0.25	0.36	0.09	0.22	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00