Doublet Group distance statistics: 48924

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.014, 0.028, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.014
N6	A	0, 0.000, 0.019, 0.038, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.019 std_dev=0.019
C5	A	0, 0.000, 0.023, 0.045, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.023 std_dev=0.023
C4	A	0, 0.000, 0.031, 0.062, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.031 std_dev=0.031
N7	A	0, 0.000, 0.041, 0.081, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.041 std_dev=0.041
N1	A	0, 0.000, 0.050, 0.099, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.050 std_dev=0.050
N3	A	0, 0.000, 0.050, 0.100, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.050 std_dev=0.050
C2	A	0, 0.000, 0.052, 0.105, 0.105 max_d=0.105 avg_d=0.052 std_dev=0.052
C8	A	0, 0.000, 0.053, 0.106, 0.106 max_d=0.106 avg_d=0.053 std_dev=0.053
N9	A	0, 0.000, 0.054, 0.108, 0.108 max_d=0.108 avg_d=0.054 std_dev=0.054
C1'	A	0, 0.000, 0.072, 0.144, 0.144 max_d=0.144 avg_d=0.072 std_dev=0.072
O4'	A	0, 0.000, 0.206, 0.411, 0.411 max_d=0.411 avg_d=0.206 std_dev=0.206
OP2	A	0, 0.000, 0.244, 0.488, 0.488 max_d=0.488 avg_d=0.244 std_dev=0.244
N4	B	0, 0.000, 0.321, 0.642, 0.642 max_d=0.642 avg_d=0.321 std_dev=0.321
C3'	A	0, 0.000, 0.370, 0.739, 0.739 max_d=0.739 avg_d=0.370 std_dev=0.370
C2'	A	0, 0.000, 0.405, 0.810, 0.810 max_d=0.810 avg_d=0.405 std_dev=0.405
C4'	A	0, 0.000, 0.410, 0.820, 0.820 max_d=0.820 avg_d=0.410 std_dev=0.410
C4	B	0, 0.000, 0.500, 0.999, 0.999 max_d=0.999 avg_d=0.500 std_dev=0.500
O3'	A	0, 0.000, 0.559, 1.118, 1.118 max_d=1.118 avg_d=0.559 std_dev=0.559
O5'	A	0, 0.000, 0.565, 1.130, 1.130 max_d=1.130 avg_d=0.565 std_dev=0.565
C5	B	0, 0.000, 0.592, 1.185, 1.185 max_d=1.185 avg_d=0.592 std_dev=0.592
N3	B	0, 0.000, 0.633, 1.266, 1.266 max_d=1.266 avg_d=0.633 std_dev=0.633
O2'	A	0, 0.000, 0.671, 1.343, 1.343 max_d=1.343 avg_d=0.671 std_dev=0.671
P	B	0, 0.000, 0.672, 1.343, 1.343 max_d=1.343 avg_d=0.672 std_dev=0.672
C5'	A	0, 0.000, 0.717, 1.435, 1.435 max_d=1.435 avg_d=0.717 std_dev=0.717
C6	B	0, 0.000, 0.807, 1.615, 1.615 max_d=1.615 avg_d=0.807 std_dev=0.807
O5'	B	0, 0.000, 0.834, 1.668, 1.668 max_d=1.668 avg_d=0.834 std_dev=0.834
C2	B	0, 0.000, 0.862, 1.724, 1.724 max_d=1.724 avg_d=0.862 std_dev=0.862
N1	B	0, 0.000, 0.931, 1.862, 1.862 max_d=1.862 avg_d=0.931 std_dev=0.931
O2	B	0, 0.000, 1.018, 2.035, 2.035 max_d=2.035 avg_d=1.018 std_dev=1.018
C5'	B	0, 0.000, 1.066, 2.132, 2.132 max_d=2.132 avg_d=1.066 std_dev=1.066
C4'	B	0, 0.000, 1.102, 2.203, 2.203 max_d=2.203 avg_d=1.102 std_dev=1.102
C3'	B	0, 0.000, 1.129, 2.258, 2.258 max_d=2.258 avg_d=1.129 std_dev=1.129
O4'	B	0, 0.000, 1.138, 2.276, 2.276 max_d=2.276 avg_d=1.138 std_dev=1.138
P	A	0, 0.000, 1.139, 2.277, 2.277 max_d=2.277 avg_d=1.139 std_dev=1.139
O3'	B	0, 0.000, 1.159, 2.318, 2.318 max_d=2.318 avg_d=1.159 std_dev=1.159
C1'	B	0, 0.000, 1.226, 2.453, 2.453 max_d=2.453 avg_d=1.226 std_dev=1.226
C2'	B	0, 0.000, 1.321, 2.641, 2.641 max_d=2.641 avg_d=1.321 std_dev=1.321
OP1	B	0, 0.000, 1.454, 2.908, 2.908 max_d=2.908 avg_d=1.454 std_dev=1.454
OP2	B	0, 0.000, 1.596, 3.193, 3.193 max_d=3.193 avg_d=1.596 std_dev=1.596
O2'	B	0, 0.000, 2.123, 4.246, 4.246 max_d=4.246 avg_d=2.123 std_dev=2.123
OP1	A	0, 0.000, 2.381, 4.761, 4.761 max_d=4.761 avg_d=2.381 std_dev=2.381

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.09	0.00	0.02	0.04	0.02	0.03	0.07	0.05	0.02	0.08	0.09	0.05	0.01	0.00	0.02	0.21	0.01	0.10	0.60	0.12	0.16
C2	0.09	0.00	0.23	0.13	0.01	0.09	0.01	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.31	0.08	0.01	0.10	0.99	0.16	0.28
C2'	0.00	0.23	0.00	0.01	0.11	0.02	0.06	0.16	0.12	0.08	0.20	0.22	0.10	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.32	0.61	0.13	0.38
C3'	0.02	0.13	0.01	0.00	0.06	0.00	0.04	0.01	0.08	0.02	0.12	0.12	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.09	0.01	0.06
C4	0.04	0.01	0.11	0.06	0.00	0.02	0.00	0.14	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.11	0.13	0.02	0.16	1.03	0.15	0.32
C4'	0.02	0.09	0.02	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.01	0.11	0.06	0.10	0.03	0.11	0.02	0.10	0.00	0.00	0.02	0.12	0.05	0.02
C5	0.03	0.01	0.06	0.04	0.00	0.04	0.00	0.24	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.12	0.04	0.24	1.28	0.11	0.46
C5'	0.07	0.05	0.16	0.01	0.14	0.00	0.24	0.00	0.21	0.31	0.12	0.02	0.26	0.33	0.17	0.05	0.16	0.00	0.01	0.02	0.23	0.02
C6	0.05	0.01	0.12	0.08	0.02	0.01	0.01	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.12	0.10	0.03	0.22	1.32	0.11	0.46
C8	0.02	0.00	0.08	0.02	0.01	0.11	0.00	0.31	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.14	0.15	0.03	0.27	1.25	0.12	0.47
N1	0.08	0.00	0.20	0.12	0.02	0.06	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.24	0.08	0.01	0.16	1.17	0.14	0.37
N3	0.09	0.00	0.22	0.12	0.00	0.10	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.29	0.10	0.00	0.08	0.86	0.18	0.22
N6	0.05	0.01	0.10	0.07	0.02	0.03	0.01	0.26	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.03	0.09	0.09	0.04	0.26	1.45	0.09	0.54
N7	0.01	0.00	0.04	0.01	0.00	0.11	0.00	0.33	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.09	0.13	0.04	0.31	1.43	0.09	0.56
N9	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.17	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.16	0.01	0.16	0.94	0.15	0.30
O2'	0.02	0.31	0.00	0.00	0.11	0.10	0.04	0.05	0.12	0.14	0.24	0.29	0.09	0.09	0.03	0.00	0.01	0.05	0.32	0.59	0.18	0.41
O3'	0.21	0.08	0.03	0.00	0.13	0.00	0.12	0.16	0.10	0.15	0.08	0.10	0.09	0.13	0.16	0.01	0.00	0.17	0.07	0.17	0.06	0.10
O4'	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.03	0.03	0.01	0.00	0.04	0.04	0.01	0.05	0.17	0.00	0.11	0.36	0.22	0.08
O5'	0.10	0.10	0.32	0.06	0.16	0.02	0.24	0.01	0.22	0.27	0.16	0.08	0.26	0.31	0.16	0.32	0.07	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01
OP1	0.60	0.99	0.61	0.09	1.03	0.12	1.28	0.02	1.32	1.25	1.17	0.86	1.45	1.43	0.94	0.59	0.17	0.36	0.00	0.00	0.01	0.01
OP2	0.12	0.16	0.13	0.01	0.15	0.05	0.11	0.23	0.11	0.12	0.14	0.18	0.09	0.09	0.15	0.18	0.06	0.22	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.16	0.28	0.38	0.06	0.32	0.02	0.46	0.02	0.46	0.47	0.37	0.22	0.54	0.56	0.30	0.41	0.10	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.02	0.01	0.05	0.19	0.05	0.04	0.07	0.04	0.04	0.00	0.01	0.08	0.05	0.35	0.07	0.04	0.03	1.00	0.67	0.12
C2	0.14	0.14	0.19	0.37	0.18	0.20	0.19	0.19	0.17	0.15	0.15	0.20	0.11	0.16	0.15	0.11	0.16	0.91	0.76	0.01
C2'	0.17	0.17	0.12	0.05	0.12	0.10	0.11	0.10	0.13	0.16	0.15	0.10	0.19	0.54	0.17	0.18	0.13	1.11	0.56	0.26
C3'	0.08	0.08	0.05	0.11	0.03	0.02	0.01	0.02	0.04	0.06	0.06	0.01	0.11	0.46	0.13	0.09	0.05	1.04	0.64	0.18
C4	0.01	0.02	0.09	0.23	0.10	0.07	0.10	0.07	0.07	0.03	0.05	0.14	0.02	0.30	0.02	0.02	0.06	0.95	0.67	0.09
C4'	0.07	0.07	0.14	0.25	0.08	0.10	0.09	0.09	0.08	0.07	0.07	0.08	0.06	0.23	0.02	0.03	0.05	1.00	0.66	0.11
C5	0.07	0.03	0.05	0.17	0.05	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.01	0.11	0.08	0.35	0.08	0.10	0.00	0.95	0.59	0.14
C5'	0.26	0.27	0.37	0.45	0.25	0.29	0.26	0.27	0.26	0.26	0.26	0.24	0.27	0.01	0.17	0.21	0.23	0.82	0.80	0.06
C6	0.04	0.02	0.09	0.22	0.06	0.03	0.05	0.03	0.01	0.02	0.02	0.10	0.05	0.31	0.02	0.08	0.02	0.95	0.58	0.14
C8	0.09	0.05	0.02	0.12	0.05	0.03	0.05	0.02	0.00	0.05	0.00	0.11	0.10	0.40	0.16	0.12	0.02	0.94	0.60	0.14
N1	0.08	0.09	0.17	0.33	0.14	0.14	0.13	0.13	0.11	0.10	0.12	0.16	0.07	0.19	0.11	0.04	0.11	0.93	0.67	0.06
N3	0.11	0.11	0.16	0.33	0.16	0.17	0.18	0.17	0.15	0.12	0.12	0.18	0.07	0.21	0.10	0.09	0.15	0.91	0.76	0.01
N6	0.13	0.10	0.05	0.15	0.01	0.05	0.02	0.05	0.07	0.10	0.05	0.05	0.14	0.35	0.08	0.18	0.05	0.94	0.47	0.20
N7	0.14	0.09	0.00	0.09	0.02	0.07	0.01	0.06	0.04	0.09	0.03	0.09	0.14	0.43	0.18	0.17	0.05	0.95	0.54	0.18
N9	0.03	0.01	0.05	0.18	0.08	0.03	0.09	0.04	0.04	0.00	0.03	0.13	0.05	0.35	0.08	0.05	0.03	0.95	0.66	0.10
O2'	0.21	0.21	0.16	0.06	0.18	0.12	0.16	0.12	0.18	0.20	0.20	0.16	0.22	0.58	0.12	0.22	0.14	1.14	0.57	0.29
O3'	0.14	0.13	0.14	0.32	0.17	0.21	0.20	0.22	0.19	0.15	0.14	0.18	0.09	0.28	0.08	0.15	0.17	0.84	0.87	0.04
O4'	0.12	0.12	0.19	0.28	0.16	0.15	0.18	0.15	0.16	0.13	0.14	0.18	0.10	0.18	0.00	0.08	0.12	0.92	0.72	0.03
O5'	0.19	0.22	0.31	0.40	0.27	0.24	0.27	0.24	0.24	0.22	0.25	0.30	0.19	0.10	0.12	0.15	0.24	0.74	0.86	0.09
OP1	1.40	1.41	1.58	1.62	1.36	1.44	1.36	1.42	1.38	1.40	1.39	1.31	1.43	1.20	1.35	1.33	1.39	0.39	1.90	1.20
OP2	0.19	0.14	0.05	0.02	0.06	0.16	0.07	0.15	0.11	0.15	0.10	0.01	0.18	0.46	0.32	0.24	0.14	1.05	0.45	0.26
P	0.44	0.48	0.61	0.66	0.51	0.48	0.51	0.48	0.48	0.47	0.50	0.53	0.46	0.21	0.38	0.37	0.49	0.48	1.06	0.33

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.19	0.00	0.15	0.65	0.00	0.22
C2	0.01	0.00	0.06	0.17	0.00	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.22	0.05	0.03	0.07	0.88	0.29	0.22
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.02	0.01	0.08	0.13	0.09	0.00	0.03	0.02	0.12	0.00	0.01	0.01	0.26	0.50	0.12	0.31
C3'	0.01	0.17	0.00	0.00	0.26	0.00	0.25	0.01	0.21	0.17	0.22	0.28	0.11	0.02	0.00	0.02	0.07	0.04	0.07	0.06
C4	0.00	0.00	0.02	0.26	0.00	0.10	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.29	0.13	0.01	0.00	1.00	0.54	0.18
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.10	0.00	0.10	0.00	0.09	0.06	0.07	0.11	0.01	0.25	0.01	0.01	0.00	0.12	0.17	0.04
C5	0.01	0.01	0.08	0.25	0.00	0.10	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.26	0.16	0.03	0.01	1.03	0.51	0.20
C5'	0.04	0.00	0.13	0.01	0.06	0.00	0.06	0.00	0.05	0.01	0.03	0.08	0.03	0.11	0.15	0.00	0.00	0.10	0.30	0.00
C6	0.00	0.02	0.09	0.21	0.00	0.09	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.19	0.11	0.04	0.06	0.95	0.32	0.22
N1	0.00	0.01	0.00	0.17	0.00	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.16	0.02	0.01	0.09	0.84	0.22	0.22
N3	0.01	0.00	0.03	0.22	0.00	0.07	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.28	0.03	0.02	0.03	0.96	0.44	0.20
N4	0.01	0.01	0.02	0.28	0.01	0.11	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.32	0.17	0.02	0.03	1.01	0.64	0.16
O2	0.02	0.00	0.12	0.11	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.18	0.17	0.06	0.10	0.82	0.22	0.22
O2'	0.02	0.22	0.00	0.02	0.29	0.25	0.26	0.11	0.19	0.16	0.28	0.32	0.18	0.00	0.01	0.17	0.13	0.35	0.05	0.18
O3'	0.19	0.05	0.01	0.00	0.13	0.01	0.16	0.15	0.11	0.02	0.03	0.17	0.17	0.01	0.00	0.13	0.27	0.38	0.20	0.29
O4'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.06	0.17	0.13	0.00	0.08	0.56	0.10	0.16
O5'	0.15	0.07	0.26	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00	0.06	0.09	0.03	0.03	0.10	0.13	0.27	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00
OP1	0.65	0.88	0.50	0.04	1.00	0.12	1.03	0.10	0.95	0.84	0.96	1.01	0.82	0.35	0.38	0.56	0.01	0.00	0.00	0.01
OP2	0.00	0.29	0.12	0.07	0.54	0.17	0.51	0.30	0.32	0.22	0.44	0.64	0.22	0.05	0.20	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.22	0.22	0.31	0.06	0.18	0.04	0.20	0.00	0.22	0.22	0.20	0.16	0.22	0.18	0.29	0.16	0.00	0.01	0.00	0.00