Doublet Group distance statistics: 48932

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 3, 1, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.009, 0.013, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.009 std_dev=0.004
C4	A	0, 0.002, 0.006, 0.011, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.006 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C8	A	0, 0.004, 0.010, 0.016, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.010 std_dev=0.006
N7	A	0, 0.005, 0.012, 0.019, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.012 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.005, 0.012, 0.019, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.012 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.004, 0.012, 0.020, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.012 std_dev=0.008
N6	A	0, 0.012, 0.022, 0.032, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.022 std_dev=0.010
N9	A	0, 0.015, 0.026, 0.036, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.026 std_dev=0.011
C1'	A	0, -0.001, 0.011, 0.023, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.011 std_dev=0.012
O2'	A	0, 0.172, 0.278, 0.384, 0.394 max_d=0.394 avg_d=0.278 std_dev=0.106
C2'	A	0, 0.193, 0.333, 0.472, 0.489 max_d=0.489 avg_d=0.333 std_dev=0.139
O4'	A	0, 0.198, 0.343, 0.489, 0.500 max_d=0.500 avg_d=0.343 std_dev=0.145
C4'	A	0, 0.330, 0.577, 0.825, 0.831 max_d=0.831 avg_d=0.577 std_dev=0.247
C3'	A	0, 0.331, 0.583, 0.834, 0.852 max_d=0.852 avg_d=0.583 std_dev=0.252
N1	B	0, 0.488, 0.767, 1.047, 1.017 max_d=1.017 avg_d=0.767 std_dev=0.279
C1'	B	0, 0.510, 0.791, 1.071, 1.003 max_d=1.003 avg_d=0.791 std_dev=0.281
C2	B	0, 0.504, 0.788, 1.071, 1.003 max_d=1.003 avg_d=0.788 std_dev=0.284
N3	B	0, 0.528, 0.831, 1.133, 1.144 max_d=1.144 avg_d=0.831 std_dev=0.303
O2	B	0, 0.506, 0.816, 1.126, 1.029 max_d=1.029 avg_d=0.816 std_dev=0.310
C6	B	0, 0.462, 0.780, 1.098, 1.098 max_d=1.098 avg_d=0.780 std_dev=0.318
C4	B	0, 0.554, 0.873, 1.193, 1.212 max_d=1.212 avg_d=0.873 std_dev=0.320
O4'	B	0, 0.490, 0.815, 1.140, 1.148 max_d=1.148 avg_d=0.815 std_dev=0.325
C5	B	0, 0.483, 0.812, 1.141, 1.112 max_d=1.112 avg_d=0.812 std_dev=0.329
C2'	B	0, 0.633, 0.992, 1.350, 1.257 max_d=1.257 avg_d=0.992 std_dev=0.359
O2'	B	0, 0.177, 0.538, 0.899, 1.438 max_d=1.438 avg_d=0.538 std_dev=0.361
O4	B	0, 0.628, 0.990, 1.353, 1.417 max_d=1.417 avg_d=0.990 std_dev=0.362
O3'	A	0, 0.462, 0.829, 1.197, 1.228 max_d=1.228 avg_d=0.829 std_dev=0.367
C5'	A	0, 0.555, 0.955, 1.355, 1.362 max_d=1.362 avg_d=0.955 std_dev=0.400
P	B	0, 0.749, 1.189, 1.629, 1.523 max_d=1.523 avg_d=1.189 std_dev=0.440
O5'	B	0, 0.879, 1.362, 1.845, 1.712 max_d=1.712 avg_d=1.362 std_dev=0.483
O5'	A	0, 0.620, 1.106, 1.592, 1.577 max_d=1.577 avg_d=1.106 std_dev=0.486
C5'	B	0, 0.680, 1.180, 1.680, 2.002 max_d=2.002 avg_d=1.180 std_dev=0.500
C4'	B	0, 0.813, 1.331, 1.848, 1.811 max_d=1.811 avg_d=1.331 std_dev=0.518
OP1	B	0, 1.330, 2.090, 2.850, 2.935 max_d=2.935 avg_d=2.090 std_dev=0.760
OP2	B	0, 1.084, 1.849, 2.614, 2.768 max_d=2.768 avg_d=1.849 std_dev=0.765
C3'	B	0, 1.450, 2.229, 3.008, 2.741 max_d=2.741 avg_d=2.229 std_dev=0.779
P	A	0, 1.541, 2.462, 3.383, 3.182 max_d=3.182 avg_d=2.462 std_dev=0.921
OP2	A	0, 1.919, 2.924, 3.930, 3.457 max_d=3.457 avg_d=2.924 std_dev=1.006
OP1	A	0, 2.129, 3.300, 4.470, 4.157 max_d=4.157 avg_d=3.300 std_dev=1.170
O3'	B	0, 2.309, 3.512, 4.714, 4.213 max_d=4.213 avg_d=3.512 std_dev=1.203

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.19	0.18	0.09
C2	0.02	0.00	0.07	0.07	0.01	0.13	0.01	0.21	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.08	0.06	0.23	0.25	0.23	0.14
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.02	0.03	0.01	0.05	0.03	0.07	0.07	0.04	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.17	0.14	0.05
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.07	0.06	0.07	0.07	0.07	0.07	0.04	0.02	0.01	0.01	0.02	0.16	0.12	0.03
C4	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.08	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.05	0.03	0.12	0.19	0.23	0.06
C4'	0.01	0.13	0.02	0.00	0.08	0.00	0.07	0.00	0.09	0.02	0.11	0.12	0.09	0.04	0.03	0.07	0.02	0.00	0.01	0.11	0.10	0.03
C5	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.07	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.07	0.02	0.11	0.18	0.27	0.07
C5'	0.01	0.21	0.01	0.01	0.13	0.00	0.13	0.00	0.16	0.06	0.20	0.19	0.16	0.09	0.06	0.06	0.03	0.01	0.01	0.10	0.10	0.01
C6	0.02	0.01	0.05	0.07	0.01	0.09	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.08	0.03	0.15	0.20	0.26	0.07
C8	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.06	0.03	0.04	0.20	0.27	0.13
N1	0.02	0.00	0.07	0.07	0.01	0.11	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.09	0.04	0.20	0.23	0.25	0.11
N3	0.02	0.00	0.07	0.07	0.00	0.12	0.01	0.19	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.07	0.06	0.19	0.21	0.21	0.10
N6	0.02	0.01	0.04	0.07	0.01	0.09	0.01	0.16	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.06	0.09	0.02	0.15	0.19	0.28	0.08
N7	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.04	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.08	0.02	0.07	0.19	0.29	0.11
N9	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.05	0.19	0.23	0.09
O2'	0.01	0.06	0.01	0.02	0.04	0.07	0.04	0.06	0.06	0.02	0.06	0.05	0.06	0.03	0.02	0.00	0.03	0.05	0.09	0.16	0.11	0.09
O3'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.05	0.02	0.07	0.03	0.08	0.06	0.09	0.07	0.09	0.08	0.04	0.03	0.00	0.01	0.04	0.12	0.10	0.04
O4'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.04	0.06	0.02	0.02	0.01	0.05	0.01	0.00	0.03	0.19	0.17	0.10
O5'	0.03	0.23	0.02	0.02	0.12	0.01	0.11	0.01	0.15	0.04	0.20	0.19	0.15	0.07	0.05	0.09	0.04	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.19	0.25	0.17	0.16	0.19	0.11	0.18	0.10	0.20	0.20	0.23	0.21	0.19	0.19	0.19	0.16	0.12	0.19	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.18	0.23	0.14	0.12	0.23	0.10	0.27	0.10	0.26	0.27	0.25	0.21	0.28	0.29	0.23	0.11	0.10	0.17	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.09	0.14	0.05	0.03	0.06	0.03	0.07	0.01	0.07	0.13	0.11	0.10	0.08	0.11	0.09	0.09	0.04	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.11	0.11	0.13	0.20	0.09	0.18	0.11	0.11	0.10	0.11	0.18	0.12	0.09	0.30	0.12	0.33	0.29	0.05	0.18
C2	0.15	0.15	0.15	0.17	0.21	0.13	0.19	0.13	0.14	0.13	0.15	0.21	0.14	0.12	0.31	0.12	0.36	0.30	0.07	0.20
C2'	0.10	0.08	0.09	0.14	0.22	0.08	0.22	0.13	0.13	0.08	0.11	0.16	0.07	0.11	0.32	0.08	0.29	0.25	0.06	0.13
C3'	0.13	0.12	0.11	0.15	0.17	0.11	0.19	0.16	0.12	0.09	0.09	0.20	0.09	0.10	0.26	0.10	0.31	0.25	0.06	0.14
C4	0.16	0.12	0.11	0.12	0.19	0.10	0.16	0.09	0.10	0.11	0.11	0.19	0.12	0.08	0.29	0.13	0.34	0.30	0.05	0.19
C4'	0.17	0.14	0.15	0.17	0.17	0.14	0.18	0.20	0.14	0.13	0.10	0.21	0.15	0.13	0.24	0.14	0.33	0.28	0.10	0.18
C5	0.17	0.10	0.10	0.10	0.17	0.10	0.13	0.08	0.08	0.10	0.10	0.19	0.10	0.08	0.27	0.16	0.33	0.30	0.08	0.19
C5'	0.23	0.19	0.21	0.23	0.19	0.21	0.22	0.28	0.21	0.19	0.16	0.24	0.20	0.19	0.23	0.20	0.34	0.30	0.16	0.21
C6	0.16	0.11	0.10	0.11	0.16	0.10	0.13	0.08	0.08	0.11	0.10	0.20	0.10	0.07	0.26	0.15	0.33	0.30	0.09	0.20
C8	0.17	0.09	0.09	0.09	0.17	0.10	0.14	0.08	0.08	0.10	0.10	0.17	0.10	0.09	0.27	0.17	0.32	0.30	0.07	0.19
N1	0.16	0.14	0.13	0.15	0.18	0.11	0.16	0.11	0.11	0.12	0.13	0.21	0.13	0.09	0.28	0.12	0.35	0.30	0.06	0.20
N3	0.15	0.14	0.14	0.16	0.20	0.12	0.19	0.13	0.13	0.12	0.13	0.20	0.14	0.11	0.30	0.12	0.35	0.30	0.07	0.19
N6	0.18	0.10	0.09	0.09	0.14	0.11	0.10	0.10	0.08	0.11	0.09	0.19	0.08	0.08	0.22	0.19	0.32	0.31	0.13	0.21
N7	0.18	0.09	0.09	0.08	0.16	0.10	0.12	0.09	0.07	0.10	0.09	0.17	0.09	0.10	0.26	0.19	0.32	0.30	0.10	0.20
N9	0.16	0.11	0.11	0.11	0.18	0.09	0.16	0.09	0.10	0.10	0.10	0.18	0.11	0.08	0.29	0.14	0.33	0.30	0.05	0.19
O2'	0.09	0.07	0.09	0.14	0.22	0.08	0.22	0.13	0.14	0.08	0.11	0.14	0.07	0.11	0.31	0.07	0.28	0.25	0.06	0.13
O3'	0.14	0.15	0.12	0.16	0.14	0.12	0.17	0.17	0.12	0.11	0.10	0.24	0.10	0.10	0.21	0.11	0.32	0.25	0.10	0.16
O4'	0.16	0.12	0.13	0.15	0.18	0.11	0.17	0.15	0.12	0.12	0.11	0.19	0.15	0.11	0.27	0.12	0.34	0.29	0.07	0.19
O5'	0.27	0.21	0.26	0.27	0.21	0.25	0.25	0.31	0.25	0.24	0.18	0.24	0.26	0.24	0.23	0.24	0.37	0.33	0.22	0.25
OP1	0.28	0.28	0.29	0.37	0.30	0.34	0.33	0.40	0.31	0.29	0.28	0.29	0.18	0.36	0.31	0.29	0.40	0.22	0.35	0.28
OP2	0.23	0.23	0.21	0.14	0.19	0.17	0.19	0.30	0.19	0.20	0.21	0.27	0.37	0.15	0.21	0.19	0.40	0.45	0.16	0.31
P	0.14	0.10	0.14	0.18	0.12	0.16	0.18	0.28	0.16	0.12	0.08	0.15	0.19	0.16	0.16	0.11	0.32	0.27	0.16	0.19

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.08	0.01	0.00	0.11	0.15	0.21	0.09
C2	0.01	0.00	0.11	0.11	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.14	0.14	0.01	0.03	0.26	0.26	0.14	0.17
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.03	0.02	0.06	0.06	0.08	0.02	0.09	0.19	0.00	0.01	0.03	0.01	0.21	0.28	0.11	0.16
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.10	0.00	0.14	0.01	0.16	0.05	0.11	0.16	0.02	0.01	0.11	0.01	0.25	0.35	0.05	0.21
C4	0.01	0.01	0.03	0.10	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.09	0.07	0.00	0.01	0.41	0.38	0.22	0.30
C4'	0.01	0.03	0.02	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.06	0.02	0.04	0.05	0.08	0.02	0.05	0.00	0.02	0.13	0.23	0.03
C5	0.01	0.01	0.06	0.14	0.00	0.06	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.15	0.01	0.04	0.44	0.39	0.21	0.31
C5'	0.03	0.06	0.06	0.01	0.10	0.00	0.10	0.00	0.09	0.06	0.08	0.06	0.05	0.06	0.11	0.01	0.00	0.16	0.27	0.01
C6	0.01	0.01	0.08	0.16	0.00	0.06	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.16	0.01	0.05	0.38	0.32	0.15	0.23
N1	0.00	0.01	0.02	0.05	0.01	0.02	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.03	0.01	0.01	0.26	0.25	0.15	0.16
N3	0.01	0.00	0.09	0.11	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.13	0.11	0.01	0.02	0.34	0.33	0.17	0.24
O2	0.03	0.00	0.19	0.16	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.21	0.25	0.02	0.07	0.20	0.23	0.15	0.14
O2'	0.02	0.14	0.00	0.02	0.09	0.08	0.08	0.05	0.08	0.05	0.13	0.21	0.00	0.02	0.11	0.06	0.10	0.24	0.12	0.10
O3'	0.08	0.14	0.01	0.01	0.07	0.02	0.15	0.06	0.16	0.03	0.11	0.25	0.02	0.00	0.08	0.06	0.24	0.47	0.14	0.29
O4	0.01	0.01	0.03	0.11	0.00	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.02	0.11	0.08	0.00	0.01	0.44	0.42	0.28	0.35
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.02	0.07	0.06	0.06	0.01	0.00	0.06	0.07	0.33	0.14
O5'	0.11	0.26	0.21	0.25	0.41	0.02	0.44	0.00	0.38	0.26	0.34	0.20	0.10	0.24	0.44	0.06	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.15	0.26	0.28	0.35	0.38	0.13	0.39	0.16	0.32	0.25	0.33	0.23	0.24	0.47	0.42	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.21	0.14	0.11	0.05	0.22	0.23	0.21	0.27	0.15	0.15	0.17	0.15	0.12	0.14	0.28	0.33	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.09	0.17	0.16	0.21	0.30	0.03	0.31	0.01	0.23	0.16	0.24	0.14	0.10	0.29	0.35	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00