Doublet Group distance statistics: 48938

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 2, 11, 14, 10, 5, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.006, 0.010, 0.015, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.010 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.007 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.006, 0.013, 0.021, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.013 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.007, 0.016, 0.025, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.016 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.006, 0.015, 0.024, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.015 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.009, 0.019, 0.028, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.019 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.007, 0.017, 0.027, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.017 std_dev=0.010
O2	A	0, 0.014, 0.038, 0.063, 0.111 max_d=0.111 avg_d=0.038 std_dev=0.024
O4	A	0, 0.030, 0.077, 0.124, 0.222 max_d=0.222 avg_d=0.077 std_dev=0.047
O4'	A	0, 0.235, 0.354, 0.473, 0.614 max_d=0.614 avg_d=0.354 std_dev=0.119
C2'	A	0, 0.221, 0.359, 0.497, 0.737 max_d=0.737 avg_d=0.359 std_dev=0.138
N3	B	0, 0.286, 0.441, 0.597, 0.786 max_d=0.786 avg_d=0.441 std_dev=0.155
C2	B	0, 0.295, 0.455, 0.614, 0.976 max_d=0.976 avg_d=0.455 std_dev=0.159
C4	B	0, 0.249, 0.417, 0.585, 0.865 max_d=0.865 avg_d=0.417 std_dev=0.168
C4'	A	0, 0.371, 0.544, 0.717, 0.958 max_d=0.958 avg_d=0.544 std_dev=0.173
N2	B	0, 0.366, 0.544, 0.721, 1.114 max_d=1.114 avg_d=0.544 std_dev=0.177
O2'	A	0, 0.203, 0.386, 0.570, 0.941 max_d=0.941 avg_d=0.386 std_dev=0.184
N9	B	0, 0.278, 0.467, 0.656, 0.947 max_d=0.947 avg_d=0.467 std_dev=0.189
C5	B	0, 0.231, 0.427, 0.623, 1.124 max_d=1.124 avg_d=0.427 std_dev=0.196
C3'	A	0, 0.380, 0.577, 0.775, 1.007 max_d=1.007 avg_d=0.577 std_dev=0.198
N1	B	0, 0.240, 0.439, 0.637, 1.063 max_d=1.063 avg_d=0.439 std_dev=0.199
C8	B	0, 0.321, 0.520, 0.720, 1.238 max_d=1.238 avg_d=0.520 std_dev=0.200
N7	B	0, 0.289, 0.506, 0.722, 1.345 max_d=1.345 avg_d=0.506 std_dev=0.216
O5'	A	0, 0.565, 0.782, 0.999, 1.181 max_d=1.181 avg_d=0.782 std_dev=0.217
P	A	0, 0.248, 0.469, 0.690, 1.075 max_d=1.075 avg_d=0.469 std_dev=0.221
C6	B	0, 0.210, 0.433, 0.656, 1.140 max_d=1.140 avg_d=0.433 std_dev=0.223
C1'	B	0, 0.268, 0.509, 0.749, 0.888 max_d=0.888 avg_d=0.509 std_dev=0.240
O4'	B	0, 0.121, 0.377, 0.634, 1.289 max_d=1.289 avg_d=0.377 std_dev=0.257
O3'	A	0, 0.445, 0.719, 0.993, 1.261 max_d=1.261 avg_d=0.719 std_dev=0.274
O6	B	0, 0.215, 0.492, 0.769, 1.341 max_d=1.341 avg_d=0.492 std_dev=0.277
C5'	A	0, 0.809, 1.104, 1.398, 1.674 max_d=1.674 avg_d=1.104 std_dev=0.294
C4'	B	0, 0.368, 0.745, 1.123, 2.028 max_d=2.028 avg_d=0.745 std_dev=0.378
P	B	0, 0.363, 0.748, 1.132, 1.903 max_d=1.903 avg_d=0.748 std_dev=0.385
C2'	B	0, 0.438, 0.826, 1.214, 1.470 max_d=1.470 avg_d=0.826 std_dev=0.388
O5'	B	0, 0.501, 0.922, 1.344, 2.033 max_d=2.033 avg_d=0.922 std_dev=0.422
C5'	B	0, 0.393, 0.815, 1.237, 2.152 max_d=2.152 avg_d=0.815 std_dev=0.422
OP2	B	0, 0.369, 0.853, 1.338, 2.810 max_d=2.810 avg_d=0.853 std_dev=0.484
OP1	B	0, 0.133, 0.662, 1.191, 3.390 max_d=3.390 avg_d=0.662 std_dev=0.529
C3'	B	0, 0.496, 1.030, 1.565, 2.418 max_d=2.418 avg_d=1.030 std_dev=0.535
OP2	A	0, 0.454, 1.046, 1.639, 3.017 max_d=3.017 avg_d=1.046 std_dev=0.593
OP1	A	0, 0.129, 0.764, 1.399, 2.726 max_d=2.726 avg_d=0.764 std_dev=0.635
O2'	B	0, 0.579, 1.392, 2.204, 2.717 max_d=2.717 avg_d=1.392 std_dev=0.812
O3'	B	0, 0.680, 1.649, 2.618, 3.634 max_d=3.634 avg_d=1.649 std_dev=0.969

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.00	0.05	0.20	0.17	0.07
C2	0.02	0.00	0.04	0.06	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.06	0.01	0.03	0.10	0.34	0.40	0.13
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.06	0.02	0.03	0.09	0.00	0.02	0.05	0.01	0.04	0.08	0.11	0.05
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.09	0.05	0.06	0.09	0.02	0.00	0.08	0.01	0.05	0.15	0.09	0.05
C4	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.08	0.00	0.03	0.16	0.47	0.62	0.20
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.06	0.03	0.03	0.04	0.06	0.02	0.05	0.00	0.02	0.06	0.15	0.02
C5	0.01	0.01	0.06	0.09	0.00	0.07	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.11	0.01	0.03	0.17	0.47	0.61	0.20
C5'	0.02	0.05	0.01	0.01	0.10	0.01	0.11	0.00	0.10	0.06	0.07	0.04	0.06	0.03	0.11	0.01	0.01	0.11	0.26	0.02
C6	0.01	0.01	0.06	0.09	0.01	0.06	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.09	0.01	0.03	0.15	0.39	0.46	0.16
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.10	0.31	0.35	0.12
N3	0.02	0.01	0.03	0.06	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.07	0.01	0.03	0.13	0.41	0.52	0.16
O2	0.03	0.01	0.09	0.09	0.02	0.04	0.02	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.10	0.10	0.02	0.04	0.08	0.29	0.34	0.11
O2'	0.02	0.06	0.00	0.02	0.04	0.06	0.04	0.06	0.04	0.02	0.05	0.10	0.00	0.04	0.05	0.05	0.05	0.10	0.09	0.05
O3'	0.01	0.06	0.02	0.00	0.08	0.02	0.11	0.03	0.09	0.04	0.07	0.10	0.04	0.00	0.10	0.01	0.07	0.30	0.22	0.08
O4	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.10	0.00	0.03	0.16	0.52	0.68	0.22
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.04	0.05	0.01	0.03	0.00	0.04	0.21	0.10	0.08
O5'	0.05	0.10	0.04	0.05	0.16	0.02	0.17	0.01	0.15	0.10	0.13	0.08	0.05	0.07	0.16	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.20	0.34	0.08	0.15	0.47	0.06	0.47	0.11	0.39	0.31	0.41	0.29	0.10	0.30	0.52	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.17	0.40	0.11	0.09	0.62	0.15	0.61	0.26	0.46	0.35	0.52	0.34	0.09	0.22	0.68	0.10	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.13	0.05	0.05	0.20	0.02	0.20	0.02	0.16	0.12	0.16	0.11	0.05	0.08	0.22	0.08	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.26	0.24	0.21	0.18	0.19	0.15	0.28	0.18	0.22	0.23	0.31	0.24	0.19	0.19	0.28	0.23	0.18	0.28	0.19	0.31	0.15	0.23
C2	0.25	0.25	0.24	0.21	0.16	0.21	0.13	0.29	0.13	0.24	0.19	0.32	0.23	0.22	0.21	0.34	0.40	0.19	0.28	0.16	0.31	0.17	0.20
C2'	0.21	0.25	0.27	0.20	0.20	0.18	0.18	0.27	0.19	0.22	0.22	0.29	0.25	0.20	0.20	0.25	0.19	0.19	0.28	0.19	0.25	0.17	0.22
C3'	0.18	0.25	0.36	0.16	0.21	0.12	0.21	0.17	0.23	0.21	0.25	0.28	0.24	0.22	0.19	0.24	0.15	0.17	0.18	0.24	0.30	0.12	0.23
C4	0.21	0.23	0.23	0.27	0.17	0.17	0.19	0.24	0.15	0.27	0.17	0.32	0.20	0.29	0.21	0.19	0.30	0.16	0.29	0.21	0.37	0.21	0.20
C4'	0.18	0.26	0.34	0.16	0.20	0.14	0.21	0.19	0.24	0.20	0.26	0.29	0.24	0.22	0.18	0.23	0.14	0.17	0.18	0.26	0.32	0.16	0.21
C5	0.18	0.24	0.21	0.31	0.14	0.17	0.14	0.23	0.12	0.27	0.21	0.31	0.19	0.27	0.18	0.22	0.20	0.14	0.30	0.17	0.41	0.22	0.21
C5'	0.18	0.27	0.39	0.18	0.22	0.12	0.23	0.16	0.26	0.21	0.28	0.29	0.24	0.23	0.19	0.34	0.19	0.16	0.14	0.29	0.39	0.18	0.18
C6	0.18	0.25	0.22	0.28	0.15	0.16	0.13	0.23	0.16	0.24	0.23	0.31	0.21	0.23	0.17	0.22	0.17	0.14	0.30	0.19	0.40	0.17	0.21
N1	0.21	0.25	0.22	0.22	0.16	0.17	0.13	0.26	0.15	0.23	0.21	0.31	0.23	0.20	0.18	0.24	0.25	0.16	0.29	0.17	0.34	0.13	0.21
N3	0.24	0.24	0.25	0.23	0.17	0.19	0.17	0.26	0.15	0.25	0.18	0.33	0.23	0.25	0.22	0.29	0.40	0.18	0.27	0.19	0.33	0.18	0.19
O2	0.30	0.24	0.29	0.25	0.17	0.28	0.14	0.34	0.14	0.25	0.18	0.32	0.24	0.21	0.23	0.50	0.54	0.24	0.29	0.16	0.27	0.22	0.22
O2'	0.28	0.27	0.30	0.26	0.22	0.25	0.18	0.32	0.18	0.24	0.23	0.32	0.27	0.20	0.24	0.40	0.26	0.27	0.28	0.18	0.19	0.29	0.22
O3'	0.21	0.25	0.41	0.15	0.22	0.13	0.23	0.14	0.24	0.22	0.25	0.26	0.24	0.24	0.21	0.25	0.23	0.20	0.06	0.26	0.10	0.22	0.13
O4	0.23	0.24	0.28	0.31	0.22	0.19	0.26	0.24	0.24	0.29	0.19	0.33	0.23	0.32	0.24	0.21	0.34	0.18	0.29	0.30	0.38	0.24	0.20
O4'	0.19	0.27	0.27	0.19	0.19	0.16	0.18	0.24	0.22	0.20	0.25	0.31	0.24	0.20	0.18	0.22	0.16	0.17	0.24	0.24	0.34	0.15	0.23
O5'	0.18	0.28	0.39	0.22	0.22	0.11	0.24	0.15	0.28	0.21	0.29	0.30	0.25	0.23	0.19	0.44	0.21	0.15	0.18	0.31	0.48	0.24	0.20
OP1	0.29	0.34	0.60	0.31	0.25	0.23	0.27	0.31	0.35	0.33	0.38	0.37	0.27	0.29	0.27	0.74	0.38	0.20	0.34	0.40	0.66	0.55	0.44
OP2	0.39	0.70	0.54	0.35	0.58	0.18	0.64	0.17	0.75	0.48	0.75	0.72	0.62	0.58	0.48	0.73	0.31	0.25	0.24	0.80	0.55	0.38	0.25
P	0.19	0.29	0.43	0.24	0.22	0.10	0.24	0.15	0.29	0.23	0.31	0.31	0.24	0.24	0.20	0.57	0.25	0.14	0.18	0.33	0.48	0.29	0.18

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.03	0.33	0.01	0.19	0.02	0.21	0.36	0.22
C2	0.02	0.00	0.19	0.15	0.01	0.08	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.21	0.42	0.16	0.15	0.01	0.26	0.39	0.21
C2'	0.01	0.19	0.00	0.00	0.10	0.01	0.06	0.23	0.10	0.12	0.15	0.23	0.18	0.08	0.03	0.00	0.03	0.02	0.45	0.09	0.48	0.61	0.49
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.22	0.01	0.34	0.03	0.33	0.42	0.24	0.10	0.11	0.44	0.25	0.02	0.01	0.02	0.14	0.38	0.18	0.17	0.12
C4	0.01	0.01	0.10	0.22	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.25	0.20	0.08	0.15	0.01	0.25	0.39	0.21
C4'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.05	0.00	0.10	0.01	0.09	0.21	0.05	0.13	0.08	0.19	0.09	0.34	0.02	0.00	0.02	0.12	0.12	0.16	0.03
C5	0.01	0.01	0.06	0.34	0.00	0.10	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.36	0.11	0.04	0.19	0.01	0.30	0.45	0.23
C5'	0.08	0.12	0.23	0.03	0.08	0.01	0.10	0.00	0.10	0.16	0.10	0.16	0.12	0.17	0.06	0.11	0.24	0.01	0.01	0.13	0.16	0.19	0.02
C6	0.01	0.01	0.10	0.33	0.01	0.09	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.37	0.13	0.07	0.19	0.00	0.32	0.46	0.23
C8	0.01	0.01	0.12	0.42	0.01	0.21	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.37	0.26	0.10	0.21	0.02	0.29	0.43	0.22
N1	0.02	0.00	0.15	0.24	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.29	0.26	0.12	0.16	0.01	0.29	0.43	0.22
N2	0.03	0.00	0.23	0.10	0.01	0.13	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.19	0.56	0.19	0.15	0.01	0.26	0.38	0.22
N3	0.02	0.01	0.18	0.11	0.00	0.08	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.18	0.45	0.15	0.15	0.01	0.24	0.38	0.21
N7	0.01	0.01	0.08	0.44	0.00	0.19	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.42	0.28	0.06	0.25	0.02	0.33	0.48	0.25
N9	0.00	0.01	0.03	0.25	0.00	0.09	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.24	0.09	0.01	0.15	0.02	0.23	0.38	0.20
O2'	0.03	0.21	0.00	0.02	0.25	0.34	0.36	0.11	0.37	0.37	0.29	0.19	0.18	0.42	0.24	0.00	0.05	0.24	0.33	0.42	0.36	0.67	0.40
O3'	0.33	0.42	0.03	0.01	0.20	0.02	0.11	0.24	0.13	0.26	0.26	0.56	0.45	0.28	0.09	0.05	0.00	0.25	0.32	0.16	0.57	0.40	0.39
O4'	0.01	0.16	0.02	0.02	0.08	0.00	0.04	0.01	0.07	0.10	0.12	0.19	0.15	0.06	0.01	0.24	0.25	0.00	0.07	0.06	0.10	0.24	0.13
O5'	0.19	0.15	0.45	0.14	0.15	0.02	0.19	0.01	0.19	0.21	0.16	0.15	0.15	0.25	0.15	0.33	0.32	0.07	0.00	0.23	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.09	0.38	0.01	0.12	0.01	0.13	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.42	0.16	0.06	0.23	0.00	0.36	0.50	0.26
OP1	0.21	0.26	0.48	0.18	0.25	0.12	0.30	0.16	0.32	0.29	0.29	0.26	0.24	0.33	0.23	0.36	0.57	0.10	0.02	0.36	0.00	0.01	0.01
OP2	0.36	0.39	0.61	0.17	0.39	0.16	0.45	0.19	0.46	0.43	0.43	0.38	0.38	0.48	0.38	0.67	0.40	0.24	0.02	0.50	0.01	0.00	0.01
P	0.22	0.21	0.49	0.12	0.21	0.03	0.23	0.02	0.23	0.22	0.22	0.22	0.21	0.25	0.20	0.40	0.39	0.13	0.01	0.26	0.01	0.01	0.00