Doublet Group distance statistics: 48939

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 2, 5, 5, 6, 11, 5, 1, 1, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.009, 0.016, 0.022, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.016 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.011 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.014, 0.024, 0.034, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.024 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.020, 0.034, 0.048, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.034 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.014, 0.028, 0.042, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.028 std_dev=0.014
C6	A	0, 0.014, 0.028, 0.042, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.028 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.016, 0.030, 0.044, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.030 std_dev=0.014
O2	A	0, 0.044, 0.080, 0.117, 0.223 max_d=0.223 avg_d=0.080 std_dev=0.036
O4	A	0, 0.017, 0.076, 0.135, 0.278 max_d=0.278 avg_d=0.076 std_dev=0.059
C2'	A	0, 0.110, 0.241, 0.372, 0.560 max_d=0.560 avg_d=0.241 std_dev=0.131
O4'	A	0, 0.072, 0.205, 0.338, 0.512 max_d=0.512 avg_d=0.205 std_dev=0.133
C2	B	0, 0.205, 0.338, 0.472, 0.604 max_d=0.604 avg_d=0.338 std_dev=0.134
C4'	A	0, 0.242, 0.397, 0.553, 0.746 max_d=0.746 avg_d=0.397 std_dev=0.155
N3	B	0, 0.238, 0.426, 0.614, 0.848 max_d=0.848 avg_d=0.426 std_dev=0.188
O2'	A	0, 0.254, 0.448, 0.642, 0.924 max_d=0.924 avg_d=0.448 std_dev=0.194
N2	B	0, 0.302, 0.497, 0.692, 0.964 max_d=0.964 avg_d=0.497 std_dev=0.195
C4	B	0, 0.234, 0.440, 0.646, 0.822 max_d=0.822 avg_d=0.440 std_dev=0.206
C3'	A	0, 0.131, 0.360, 0.589, 0.910 max_d=0.910 avg_d=0.360 std_dev=0.229
C5'	A	0, 0.460, 0.704, 0.948, 1.263 max_d=1.263 avg_d=0.704 std_dev=0.244
N1	B	0, 0.283, 0.537, 0.792, 1.106 max_d=1.106 avg_d=0.537 std_dev=0.255
C5	B	0, 0.298, 0.568, 0.838, 1.174 max_d=1.174 avg_d=0.568 std_dev=0.270
C6	B	0, 0.463, 0.736, 1.010, 1.434 max_d=1.434 avg_d=0.736 std_dev=0.274
N9	B	0, 0.399, 0.689, 0.980, 1.459 max_d=1.459 avg_d=0.689 std_dev=0.290
O5'	A	0, 0.447, 0.741, 1.035, 1.458 max_d=1.458 avg_d=0.741 std_dev=0.294
P	A	0, 0.863, 1.193, 1.523, 1.718 max_d=1.718 avg_d=1.193 std_dev=0.330
O3'	A	0, 0.202, 0.576, 0.949, 1.462 max_d=1.462 avg_d=0.576 std_dev=0.374
O6	B	0, 0.744, 1.119, 1.493, 2.059 max_d=2.059 avg_d=1.119 std_dev=0.375
C8	B	0, 0.398, 0.773, 1.148, 1.795 max_d=1.795 avg_d=0.773 std_dev=0.375
O4'	B	0, 0.471, 0.847, 1.222, 1.623 max_d=1.623 avg_d=0.847 std_dev=0.376
N7	B	0, 0.410, 0.788, 1.166, 1.732 max_d=1.732 avg_d=0.788 std_dev=0.378
C1'	B	0, 0.596, 0.985, 1.374, 2.051 max_d=2.051 avg_d=0.985 std_dev=0.389
OP2	A	0, 0.959, 1.418, 1.877, 2.106 max_d=2.106 avg_d=1.418 std_dev=0.459
O5'	B	0, 0.381, 0.883, 1.385, 2.207 max_d=2.207 avg_d=0.883 std_dev=0.502
C5'	B	0, 0.441, 0.957, 1.473, 2.317 max_d=2.317 avg_d=0.957 std_dev=0.516
P	B	0, 0.354, 0.873, 1.392, 2.276 max_d=2.276 avg_d=0.873 std_dev=0.519
C4'	B	0, 0.513, 1.033, 1.552, 2.276 max_d=2.276 avg_d=1.033 std_dev=0.520
OP2	B	0, 0.452, 0.989, 1.526, 2.435 max_d=2.435 avg_d=0.989 std_dev=0.537
O3'	B	0, 1.206, 1.754, 2.303, 3.374 max_d=3.374 avg_d=1.754 std_dev=0.549
C3'	B	0, 0.595, 1.182, 1.768, 2.561 max_d=2.561 avg_d=1.182 std_dev=0.587
C2'	B	0, 0.842, 1.432, 2.022, 3.109 max_d=3.109 avg_d=1.432 std_dev=0.590
OP1	B	0, 0.424, 1.092, 1.760, 3.096 max_d=3.096 avg_d=1.092 std_dev=0.668
O2'	B	0, 1.001, 2.098, 3.195, 4.961 max_d=4.961 avg_d=2.098 std_dev=1.097
OP1	A	0, 0.844, 2.244, 3.644, 4.444 max_d=4.444 avg_d=2.244 std_dev=1.400

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.02	0.03	0.01	0.09	0.69	0.26	0.16
C2	0.02	0.00	0.07	0.06	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.09	0.07	0.02	0.04	0.18	0.96	0.54	0.20
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.05	0.01	0.07	0.02	0.08	0.02	0.06	0.13	0.00	0.02	0.06	0.01	0.11	0.35	0.22	0.09
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.08	0.01	0.12	0.02	0.12	0.05	0.06	0.11	0.02	0.01	0.09	0.01	0.14	0.22	0.14	0.11
C4	0.02	0.01	0.05	0.08	0.00	0.06	0.01	0.10	0.01	0.02	0.01	0.02	0.06	0.09	0.01	0.04	0.27	1.14	0.82	0.28
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.06	0.00	0.07	0.00	0.07	0.03	0.04	0.05	0.05	0.02	0.06	0.00	0.01	0.19	0.24	0.07
C5	0.02	0.01	0.07	0.12	0.01	0.07	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.14	0.01	0.05	0.28	1.11	0.80	0.28
C5'	0.02	0.06	0.02	0.02	0.10	0.00	0.12	0.00	0.10	0.06	0.08	0.06	0.05	0.04	0.11	0.01	0.01	0.17	0.40	0.01
C6	0.02	0.01	0.08	0.12	0.01	0.07	0.01	0.10	0.00	0.01	0.01	0.02	0.06	0.13	0.02	0.05	0.24	1.00	0.61	0.24
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.02	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.04	0.02	0.02	0.18	0.90	0.47	0.19
N3	0.02	0.00	0.06	0.06	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.07	0.02	0.03	0.23	1.08	0.70	0.24
O2	0.04	0.00	0.13	0.11	0.02	0.05	0.01	0.06	0.02	0.02	0.01	0.00	0.15	0.14	0.03	0.07	0.15	0.89	0.47	0.18
O2'	0.02	0.09	0.00	0.02	0.06	0.05	0.06	0.05	0.06	0.03	0.08	0.15	0.00	0.05	0.07	0.04	0.05	0.29	0.16	0.08
O3'	0.02	0.07	0.02	0.01	0.09	0.02	0.14	0.04	0.13	0.04	0.07	0.14	0.05	0.00	0.11	0.02	0.12	0.43	0.17	0.15
O4	0.03	0.02	0.06	0.09	0.01	0.06	0.01	0.11	0.02	0.02	0.02	0.03	0.07	0.11	0.00	0.05	0.28	1.18	0.90	0.30
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.03	0.07	0.04	0.02	0.05	0.00	0.06	0.69	0.25	0.20
O5'	0.09	0.18	0.11	0.14	0.27	0.01	0.28	0.01	0.24	0.18	0.23	0.15	0.05	0.12	0.28	0.06	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.69	0.96	0.35	0.22	1.14	0.19	1.11	0.17	1.00	0.90	1.08	0.89	0.29	0.43	1.18	0.69	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.26	0.54	0.22	0.14	0.82	0.24	0.80	0.40	0.61	0.47	0.70	0.47	0.16	0.17	0.90	0.25	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.16	0.20	0.09	0.11	0.28	0.07	0.28	0.01	0.24	0.19	0.24	0.18	0.08	0.15	0.30	0.20	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.13	0.21	0.15	0.13	0.17	0.21	0.17	0.22	0.28	0.16	0.16	0.13	0.29	0.19	0.23	0.23	0.18	0.18	0.30	0.08	0.10	0.05
C2	0.22	0.15	0.21	0.21	0.12	0.28	0.16	0.27	0.18	0.23	0.14	0.20	0.16	0.23	0.19	0.29	0.53	0.23	0.22	0.24	0.15	0.15	0.11
C2'	0.19	0.13	0.19	0.14	0.17	0.14	0.27	0.16	0.28	0.36	0.19	0.15	0.12	0.38	0.21	0.21	0.16	0.17	0.20	0.35	0.12	0.09	0.09
C3'	0.12	0.14	0.33	0.09	0.12	0.11	0.23	0.11	0.27	0.23	0.20	0.16	0.13	0.32	0.11	0.18	0.12	0.15	0.08	0.36	0.03	0.08	0.02
C4	0.18	0.17	0.20	0.18	0.15	0.22	0.16	0.19	0.17	0.21	0.15	0.22	0.18	0.22	0.18	0.20	0.49	0.23	0.17	0.24	0.13	0.28	0.14
C4'	0.13	0.15	0.33	0.09	0.11	0.10	0.19	0.10	0.24	0.17	0.19	0.18	0.14	0.24	0.11	0.19	0.11	0.15	0.07	0.33	0.07	0.16	0.07
C5	0.19	0.14	0.23	0.21	0.14	0.18	0.16	0.16	0.18	0.25	0.16	0.19	0.15	0.24	0.20	0.26	0.32	0.21	0.18	0.28	0.19	0.34	0.21
C5'	0.22	0.20	0.47	0.18	0.17	0.16	0.18	0.14	0.24	0.17	0.22	0.22	0.20	0.20	0.19	0.43	0.20	0.20	0.12	0.33	0.17	0.27	0.15
C6	0.19	0.13	0.23	0.20	0.12	0.17	0.16	0.15	0.21	0.24	0.16	0.17	0.14	0.25	0.18	0.23	0.25	0.19	0.19	0.30	0.17	0.30	0.19
N1	0.19	0.13	0.20	0.15	0.12	0.18	0.18	0.18	0.20	0.24	0.15	0.17	0.13	0.26	0.18	0.20	0.32	0.18	0.17	0.28	0.08	0.17	0.08
N3	0.20	0.17	0.20	0.20	0.13	0.28	0.14	0.25	0.16	0.19	0.15	0.23	0.18	0.19	0.17	0.24	0.60	0.24	0.21	0.23	0.13	0.20	0.11
O2	0.27	0.16	0.26	0.31	0.15	0.37	0.17	0.36	0.18	0.26	0.15	0.22	0.17	0.24	0.22	0.45	0.66	0.28	0.30	0.23	0.25	0.14	0.19
O2'	0.29	0.16	0.23	0.24	0.22	0.23	0.31	0.22	0.29	0.41	0.21	0.17	0.16	0.41	0.29	0.44	0.23	0.28	0.25	0.35	0.20	0.09	0.15
O3'	0.11	0.14	0.33	0.11	0.15	0.12	0.28	0.11	0.31	0.28	0.22	0.15	0.12	0.38	0.13	0.17	0.26	0.15	0.02	0.40	0.03	0.02	0.01
O4	0.20	0.23	0.22	0.21	0.21	0.24	0.22	0.20	0.22	0.23	0.20	0.27	0.23	0.25	0.21	0.23	0.55	0.25	0.18	0.27	0.15	0.31	0.17
O4'	0.15	0.15	0.26	0.09	0.12	0.13	0.17	0.12	0.22	0.20	0.18	0.18	0.14	0.23	0.14	0.16	0.14	0.16	0.11	0.31	0.04	0.15	0.04
O5'	0.40	0.34	0.62	0.33	0.37	0.30	0.39	0.25	0.41	0.42	0.37	0.34	0.36	0.42	0.40	0.66	0.32	0.35	0.25	0.48	0.21	0.33	0.22
OP1	0.50	0.73	0.80	0.50	0.54	0.42	0.57	0.44	0.74	0.52	0.81	0.80	0.60	0.49	0.49	0.91	0.52	0.42	0.53	0.84	0.78	0.81	0.66
OP2	0.97	1.09	1.16	0.66	1.09	0.59	1.12	0.38	1.11	1.07	1.10	1.08	1.08	1.12	1.05	1.35	0.65	0.75	0.38	1.10	0.32	0.35	0.25
P	0.45	0.33	0.71	0.37	0.38	0.33	0.40	0.27	0.40	0.50	0.37	0.32	0.35	0.46	0.44	0.83	0.37	0.38	0.28	0.48	0.27	0.34	0.25

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.06	0.02	0.01	0.04	0.06	0.05	0.01	0.01	0.02	0.36	0.01	0.16	0.02	0.15	0.22	0.15
C2	0.05	0.00	0.20	0.12	0.01	0.12	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.18	0.51	0.18	0.16	0.01	0.15	0.28	0.17
C2'	0.01	0.20	0.00	0.00	0.11	0.01	0.07	0.21	0.10	0.13	0.15	0.25	0.20	0.10	0.03	0.00	0.04	0.03	0.43	0.09	0.45	0.56	0.46
C3'	0.02	0.12	0.00	0.00	0.20	0.01	0.32	0.02	0.30	0.41	0.21	0.10	0.09	0.42	0.23	0.03	0.01	0.02	0.07	0.36	0.12	0.10	0.07
C4	0.02	0.01	0.11	0.20	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.23	0.28	0.09	0.19	0.01	0.19	0.26	0.19
C4'	0.01	0.12	0.01	0.01	0.04	0.00	0.13	0.01	0.10	0.27	0.05	0.19	0.13	0.26	0.10	0.31	0.04	0.01	0.02	0.15	0.08	0.06	0.03
C5	0.02	0.01	0.07	0.32	0.00	0.13	0.00	0.20	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.39	0.17	0.04	0.31	0.01	0.34	0.41	0.34
C5'	0.06	0.11	0.21	0.02	0.09	0.01	0.20	0.00	0.19	0.31	0.11	0.17	0.12	0.33	0.12	0.11	0.22	0.01	0.01	0.26	0.08	0.03	0.02
C6	0.02	0.01	0.10	0.30	0.01	0.10	0.01	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.39	0.22	0.06	0.32	0.01	0.37	0.48	0.38
C8	0.01	0.01	0.13	0.41	0.01	0.27	0.01	0.31	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.43	0.23	0.13	0.35	0.02	0.35	0.32	0.33
N1	0.04	0.01	0.15	0.21	0.01	0.05	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.29	0.37	0.12	0.23	0.01	0.26	0.39	0.28
N2	0.06	0.01	0.25	0.10	0.02	0.19	0.01	0.17	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.19	0.65	0.22	0.14	0.02	0.13	0.25	0.14
N3	0.05	0.01	0.20	0.09	0.00	0.13	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.15	0.52	0.18	0.14	0.01	0.13	0.22	0.13
N7	0.01	0.01	0.10	0.42	0.01	0.26	0.00	0.33	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.48	0.24	0.10	0.42	0.03	0.45	0.48	0.44
N9	0.01	0.02	0.03	0.23	0.01	0.10	0.01	0.12	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.25	0.16	0.02	0.18	0.02	0.17	0.21	0.17
O2'	0.02	0.18	0.00	0.03	0.23	0.31	0.39	0.11	0.39	0.43	0.29	0.19	0.15	0.48	0.25	0.00	0.05	0.23	0.30	0.46	0.34	0.64	0.38
O3'	0.36	0.51	0.04	0.01	0.28	0.04	0.17	0.22	0.22	0.23	0.37	0.65	0.52	0.24	0.16	0.05	0.00	0.23	0.28	0.21	0.44	0.33	0.33
O4'	0.01	0.18	0.03	0.02	0.09	0.01	0.04	0.01	0.06	0.13	0.12	0.22	0.18	0.10	0.02	0.23	0.23	0.00	0.07	0.05	0.07	0.14	0.08
O5'	0.16	0.16	0.43	0.07	0.19	0.02	0.31	0.01	0.32	0.35	0.23	0.14	0.14	0.42	0.18	0.30	0.28	0.07	0.00	0.40	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.09	0.36	0.01	0.15	0.01	0.26	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.46	0.21	0.05	0.40	0.00	0.48	0.59	0.47
OP1	0.15	0.15	0.45	0.12	0.19	0.08	0.34	0.08	0.37	0.35	0.26	0.13	0.13	0.45	0.17	0.34	0.44	0.07	0.02	0.48	0.00	0.01	0.01
OP2	0.22	0.28	0.56	0.10	0.26	0.06	0.41	0.03	0.48	0.32	0.39	0.25	0.22	0.48	0.21	0.64	0.33	0.14	0.02	0.59	0.01	0.00	0.01
P	0.15	0.17	0.46	0.07	0.19	0.03	0.34	0.02	0.38	0.33	0.28	0.14	0.13	0.44	0.17	0.38	0.33	0.08	0.01	0.47	0.01	0.01	0.00