Doublet Group distance statistics: 48940

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 4, 8, 7, 7, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.004, 0.010, 0.016, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.010 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.009, 0.018, 0.027, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.018 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.004, 0.014, 0.024, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.014 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.009, 0.019, 0.029, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.019 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.007, 0.018, 0.029, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.018 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.003, 0.017, 0.031, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.017 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.007, 0.021, 0.035, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.021 std_dev=0.014
O2	A	0, 0.014, 0.043, 0.073, 0.128 max_d=0.128 avg_d=0.043 std_dev=0.029
O4	A	0, 0.034, 0.078, 0.121, 0.162 max_d=0.162 avg_d=0.078 std_dev=0.044
O4'	A	0, 0.061, 0.156, 0.252, 0.390 max_d=0.390 avg_d=0.156 std_dev=0.095
C4'	A	0, 0.119, 0.242, 0.365, 0.452 max_d=0.452 avg_d=0.242 std_dev=0.123
C4	B	0, 0.189, 0.317, 0.445, 0.567 max_d=0.567 avg_d=0.317 std_dev=0.128
C2'	A	0, 0.050, 0.180, 0.309, 0.643 max_d=0.643 avg_d=0.180 std_dev=0.129
C3'	A	0, 0.121, 0.261, 0.402, 0.612 max_d=0.612 avg_d=0.261 std_dev=0.141
C5	B	0, 0.145, 0.296, 0.448, 0.670 max_d=0.670 avg_d=0.296 std_dev=0.151
N3	B	0, 0.264, 0.426, 0.588, 0.821 max_d=0.821 avg_d=0.426 std_dev=0.162
N9	B	0, 0.234, 0.402, 0.569, 0.772 max_d=0.772 avg_d=0.402 std_dev=0.167
C2	B	0, 0.286, 0.468, 0.649, 0.824 max_d=0.824 avg_d=0.468 std_dev=0.181
C8	B	0, 0.207, 0.411, 0.615, 0.947 max_d=0.947 avg_d=0.411 std_dev=0.204
C5'	A	0, 0.192, 0.411, 0.631, 0.928 max_d=0.928 avg_d=0.411 std_dev=0.219
N7	B	0, 0.146, 0.366, 0.586, 0.930 max_d=0.930 avg_d=0.366 std_dev=0.220
O3'	A	0, 0.167, 0.390, 0.612, 0.874 max_d=0.874 avg_d=0.390 std_dev=0.222
N1	B	0, 0.218, 0.442, 0.666, 1.039 max_d=1.039 avg_d=0.442 std_dev=0.224
C6	B	0, 0.149, 0.381, 0.614, 1.051 max_d=1.051 avg_d=0.381 std_dev=0.232
O5'	A	0, 0.241, 0.475, 0.709, 0.968 max_d=0.968 avg_d=0.475 std_dev=0.234
C1'	B	0, 0.320, 0.579, 0.837, 1.255 max_d=1.255 avg_d=0.579 std_dev=0.259
O2'	A	0, -0.001, 0.274, 0.550, 1.581 max_d=1.581 avg_d=0.274 std_dev=0.275
O4'	B	0, 0.320, 0.612, 0.905, 1.364 max_d=1.364 avg_d=0.612 std_dev=0.292
N2	B	0, 0.337, 0.630, 0.923, 1.353 max_d=1.353 avg_d=0.630 std_dev=0.293
P	A	0, 0.285, 0.605, 0.925, 1.622 max_d=1.622 avg_d=0.605 std_dev=0.320
P	B	0, 0.193, 0.536, 0.879, 1.541 max_d=1.541 avg_d=0.536 std_dev=0.343
C2'	B	0, 0.379, 0.736, 1.093, 1.583 max_d=1.583 avg_d=0.736 std_dev=0.357
O6	B	0, 0.135, 0.496, 0.858, 1.450 max_d=1.450 avg_d=0.496 std_dev=0.361
O5'	B	0, 0.265, 0.630, 0.995, 1.587 max_d=1.587 avg_d=0.630 std_dev=0.365
C5'	B	0, 0.291, 0.715, 1.138, 1.829 max_d=1.829 avg_d=0.715 std_dev=0.423
OP2	B	0, 0.208, 0.638, 1.068, 1.838 max_d=1.838 avg_d=0.638 std_dev=0.430
C4'	B	0, 0.343, 0.785, 1.228, 2.157 max_d=2.157 avg_d=0.785 std_dev=0.443
OP1	B	0, 0.222, 0.687, 1.153, 2.141 max_d=2.141 avg_d=0.687 std_dev=0.465
O2'	B	0, 0.427, 0.901, 1.375, 1.982 max_d=1.982 avg_d=0.901 std_dev=0.474
C3'	B	0, 0.354, 0.905, 1.455, 2.907 max_d=2.907 avg_d=0.905 std_dev=0.551
O3'	B	0, 0.320, 1.218, 2.116, 4.505 max_d=4.505 avg_d=1.218 std_dev=0.898
OP1	A	0, 0.767, 1.892, 3.018, 4.187 max_d=4.187 avg_d=1.892 std_dev=1.126
OP2	A	0, 0.860, 2.058, 3.256, 3.618 max_d=3.618 avg_d=2.058 std_dev=1.198

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.05	0.02	0.01	0.10	0.39	0.37	0.09
C2	0.02	0.00	0.07	0.07	0.01	0.03	0.02	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.15	0.08	0.01	0.03	0.18	0.59	0.70	0.18
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.08	0.02	0.10	0.04	0.10	0.04	0.07	0.13	0.01	0.02	0.09	0.01	0.10	0.16	0.34	0.14
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.09	0.01	0.12	0.01	0.12	0.06	0.07	0.12	0.02	0.01	0.10	0.02	0.08	0.21	0.23	0.12
C4	0.02	0.01	0.08	0.09	0.00	0.07	0.01	0.14	0.01	0.02	0.01	0.01	0.16	0.08	0.01	0.04	0.27	0.80	1.02	0.30
C4'	0.01	0.03	0.02	0.01	0.07	0.00	0.09	0.01	0.09	0.04	0.04	0.06	0.11	0.02	0.08	0.01	0.01	0.12	0.24	0.05
C5	0.02	0.02	0.10	0.12	0.01	0.09	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01	0.02	0.14	0.13	0.01	0.06	0.29	0.81	1.02	0.31
C5'	0.02	0.07	0.04	0.01	0.14	0.01	0.17	0.00	0.14	0.08	0.10	0.05	0.08	0.07	0.16	0.01	0.01	0.18	0.38	0.02
C6	0.02	0.01	0.10	0.12	0.01	0.09	0.01	0.14	0.00	0.01	0.01	0.02	0.11	0.12	0.02	0.06	0.25	0.69	0.80	0.24
N1	0.01	0.01	0.04	0.06	0.02	0.04	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.09	0.04	0.02	0.02	0.18	0.56	0.62	0.17
N3	0.02	0.00	0.07	0.07	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.17	0.07	0.01	0.03	0.23	0.70	0.88	0.24
O2	0.04	0.01	0.13	0.12	0.01	0.06	0.02	0.05	0.02	0.02	0.01	0.00	0.17	0.15	0.02	0.05	0.15	0.52	0.59	0.14
O2'	0.02	0.15	0.01	0.02	0.16	0.11	0.14	0.08	0.11	0.09	0.17	0.17	0.00	0.05	0.18	0.08	0.06	0.15	0.26	0.10
O3'	0.05	0.08	0.02	0.01	0.08	0.02	0.13	0.07	0.12	0.04	0.07	0.15	0.05	0.00	0.10	0.03	0.14	0.44	0.33	0.15
O4	0.02	0.01	0.09	0.10	0.01	0.08	0.01	0.16	0.02	0.02	0.01	0.02	0.18	0.10	0.00	0.05	0.29	0.86	1.11	0.34
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.01	0.06	0.01	0.06	0.02	0.03	0.05	0.08	0.03	0.05	0.00	0.11	0.42	0.25	0.11
O5'	0.10	0.18	0.10	0.08	0.27	0.01	0.29	0.01	0.25	0.18	0.23	0.15	0.06	0.14	0.29	0.11	0.00	0.02	0.03	0.00
OP1	0.39	0.59	0.16	0.21	0.80	0.12	0.81	0.18	0.69	0.56	0.70	0.52	0.15	0.44	0.86	0.42	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.37	0.70	0.34	0.23	1.02	0.24	1.02	0.38	0.80	0.62	0.88	0.59	0.26	0.33	1.11	0.25	0.03	0.02	0.00	0.01
P	0.09	0.18	0.14	0.12	0.30	0.05	0.31	0.02	0.24	0.17	0.24	0.14	0.10	0.15	0.34	0.11	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.21	0.17	0.16	0.14	0.19	0.12	0.21	0.15	0.20	0.18	0.26	0.20	0.19	0.16	0.20	0.21	0.18	0.21	0.20	0.16	0.13	0.08
C2	0.18	0.24	0.17	0.17	0.14	0.21	0.15	0.22	0.19	0.20	0.20	0.30	0.23	0.22	0.15	0.22	0.31	0.19	0.19	0.24	0.13	0.16	0.08
C2'	0.16	0.18	0.16	0.15	0.15	0.17	0.17	0.21	0.17	0.23	0.17	0.22	0.18	0.23	0.16	0.16	0.18	0.16	0.24	0.21	0.18	0.13	0.12
C3'	0.15	0.20	0.22	0.13	0.15	0.15	0.16	0.16	0.19	0.14	0.20	0.23	0.19	0.17	0.13	0.16	0.14	0.17	0.08	0.22	0.05	0.13	0.02
C4	0.17	0.29	0.18	0.20	0.18	0.15	0.21	0.17	0.25	0.22	0.25	0.37	0.26	0.28	0.17	0.17	0.25	0.16	0.18	0.33	0.13	0.23	0.12
C4'	0.14	0.23	0.19	0.12	0.16	0.14	0.17	0.16	0.22	0.14	0.23	0.26	0.20	0.18	0.13	0.14	0.14	0.16	0.08	0.26	0.11	0.20	0.07
C5	0.18	0.28	0.19	0.24	0.18	0.16	0.20	0.17	0.21	0.25	0.24	0.34	0.25	0.29	0.18	0.18	0.22	0.16	0.21	0.28	0.17	0.27	0.16
C5'	0.17	0.28	0.26	0.17	0.22	0.16	0.24	0.18	0.29	0.18	0.30	0.31	0.25	0.23	0.18	0.22	0.19	0.18	0.09	0.34	0.19	0.33	0.17
C6	0.18	0.25	0.18	0.22	0.17	0.16	0.16	0.18	0.18	0.24	0.22	0.31	0.23	0.25	0.18	0.18	0.20	0.17	0.22	0.23	0.16	0.24	0.15
N1	0.18	0.23	0.16	0.17	0.15	0.17	0.14	0.19	0.17	0.21	0.20	0.29	0.22	0.22	0.16	0.18	0.22	0.17	0.19	0.22	0.13	0.17	0.08
N3	0.18	0.27	0.18	0.17	0.16	0.18	0.19	0.19	0.23	0.20	0.23	0.34	0.25	0.24	0.15	0.20	0.31	0.18	0.17	0.30	0.12	0.18	0.08
O2	0.20	0.23	0.20	0.22	0.14	0.28	0.15	0.29	0.19	0.18	0.20	0.29	0.22	0.20	0.14	0.30	0.42	0.24	0.22	0.23	0.19	0.17	0.13
O2'	0.38	0.31	0.35	0.33	0.34	0.31	0.33	0.30	0.30	0.41	0.30	0.32	0.33	0.37	0.38	0.39	0.32	0.35	0.38	0.30	0.30	0.20	0.23
O3'	0.17	0.18	0.26	0.13	0.14	0.18	0.15	0.18	0.18	0.12	0.18	0.19	0.17	0.17	0.13	0.18	0.18	0.20	0.02	0.22	0.02	0.02	0.01
O4	0.19	0.31	0.22	0.24	0.21	0.16	0.26	0.17	0.31	0.24	0.28	0.41	0.28	0.30	0.19	0.19	0.28	0.16	0.19	0.41	0.15	0.25	0.14
O4'	0.15	0.24	0.16	0.12	0.15	0.15	0.16	0.17	0.21	0.16	0.23	0.29	0.22	0.18	0.13	0.15	0.15	0.16	0.14	0.26	0.13	0.20	0.05
O5'	0.21	0.37	0.28	0.20	0.30	0.16	0.32	0.16	0.38	0.22	0.39	0.39	0.33	0.28	0.24	0.29	0.21	0.19	0.13	0.41	0.25	0.41	0.22
OP1	0.29	0.58	0.42	0.28	0.41	0.27	0.44	0.37	0.58	0.30	0.63	0.64	0.48	0.34	0.31	0.48	0.35	0.25	0.40	0.64	0.65	0.62	0.54
OP2	0.57	1.06	0.56	0.33	0.87	0.28	0.94	0.25	1.10	0.63	1.13	1.10	0.93	0.79	0.69	0.64	0.31	0.41	0.26	1.18	0.63	0.59	0.44
P	0.22	0.40	0.31	0.19	0.31	0.17	0.33	0.17	0.41	0.24	0.43	0.43	0.35	0.28	0.25	0.36	0.21	0.20	0.16	0.45	0.30	0.44	0.25

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.03	0.01	0.04	0.05	0.04	0.02	0.01	0.02	0.19	0.01	0.12	0.03	0.11	0.22	0.14
C2	0.05	0.00	0.15	0.14	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.15	0.25	0.11	0.11	0.01	0.13	0.23	0.15
C2'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.08	0.01	0.07	0.13	0.10	0.09	0.13	0.18	0.14	0.07	0.03	0.01	0.02	0.01	0.28	0.10	0.28	0.36	0.29
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.16	0.00	0.23	0.02	0.23	0.26	0.19	0.12	0.11	0.28	0.16	0.02	0.01	0.01	0.11	0.26	0.13	0.16	0.09
C4	0.02	0.01	0.08	0.16	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.15	0.14	0.05	0.10	0.02	0.12	0.23	0.14
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.07	0.13	0.05	0.08	0.06	0.13	0.06	0.20	0.03	0.00	0.02	0.09	0.07	0.09	0.03
C5	0.02	0.01	0.07	0.23	0.01	0.08	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.21	0.15	0.04	0.12	0.01	0.15	0.24	0.15
C5'	0.05	0.08	0.13	0.02	0.07	0.01	0.10	0.00	0.11	0.12	0.09	0.10	0.08	0.14	0.07	0.07	0.15	0.02	0.01	0.13	0.08	0.10	0.02
C6	0.03	0.01	0.10	0.23	0.01	0.07	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.22	0.17	0.06	0.13	0.01	0.16	0.25	0.17
C8	0.01	0.02	0.09	0.26	0.01	0.13	0.01	0.12	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.21	0.19	0.07	0.12	0.02	0.13	0.22	0.13
N1	0.04	0.01	0.13	0.19	0.02	0.05	0.01	0.09	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.19	0.19	0.09	0.12	0.01	0.15	0.24	0.16
N2	0.05	0.01	0.18	0.12	0.02	0.08	0.01	0.10	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.16	0.32	0.13	0.11	0.02	0.12	0.23	0.15
N3	0.04	0.01	0.14	0.11	0.01	0.06	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.13	0.25	0.10	0.11	0.02	0.12	0.23	0.14
N7	0.02	0.01	0.07	0.28	0.01	0.13	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.24	0.22	0.05	0.15	0.02	0.16	0.24	0.16
N9	0.01	0.02	0.03	0.16	0.01	0.06	0.01	0.07	0.02	0.00	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.13	0.08	0.01	0.10	0.03	0.11	0.22	0.13
O2'	0.02	0.15	0.01	0.02	0.15	0.20	0.21	0.07	0.22	0.21	0.19	0.16	0.13	0.24	0.13	0.00	0.06	0.15	0.19	0.25	0.19	0.39	0.23
O3'	0.19	0.25	0.02	0.01	0.14	0.03	0.15	0.15	0.17	0.19	0.19	0.32	0.25	0.22	0.08	0.06	0.00	0.15	0.21	0.20	0.34	0.30	0.24
O4'	0.01	0.11	0.01	0.01	0.05	0.00	0.04	0.02	0.06	0.07	0.09	0.13	0.10	0.05	0.01	0.15	0.15	0.00	0.09	0.06	0.09	0.14	0.10
O5'	0.12	0.11	0.28	0.11	0.10	0.02	0.12	0.01	0.13	0.12	0.12	0.11	0.11	0.15	0.10	0.19	0.21	0.09	0.00	0.15	0.02	0.02	0.01
O6	0.03	0.01	0.10	0.26	0.02	0.09	0.01	0.13	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.25	0.20	0.06	0.15	0.00	0.19	0.27	0.19
OP1	0.11	0.13	0.28	0.13	0.12	0.07	0.15	0.08	0.16	0.13	0.15	0.12	0.12	0.16	0.11	0.19	0.34	0.09	0.02	0.19	0.00	0.02	0.01
OP2	0.22	0.23	0.36	0.16	0.23	0.09	0.24	0.10	0.25	0.22	0.24	0.23	0.23	0.24	0.22	0.39	0.30	0.14	0.02	0.27	0.02	0.00	0.01
P	0.14	0.15	0.29	0.09	0.14	0.03	0.15	0.02	0.17	0.13	0.16	0.15	0.14	0.16	0.13	0.23	0.24	0.10	0.01	0.19	0.01	0.01	0.00