Doublet Group distance statistics: 48943

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 1, 4, 7, 2, 4, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.003, 0.008, 0.013, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C4	A	0, 0.008, 0.015, 0.023, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.015 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.009, 0.017, 0.025, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.017 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.008, 0.016, 0.024, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.016 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.005, 0.013, 0.021, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.008, 0.017, 0.026, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.017 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.006, 0.016, 0.026, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.016 std_dev=0.010
O2	A	0, 0.016, 0.035, 0.054, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.035 std_dev=0.019
O4	A	0, 0.029, 0.079, 0.129, 0.156 max_d=0.156 avg_d=0.079 std_dev=0.050
C4	B	0, 0.168, 0.300, 0.432, 0.624 max_d=0.624 avg_d=0.300 std_dev=0.132
N9	B	0, 0.160, 0.310, 0.460, 0.631 max_d=0.631 avg_d=0.310 std_dev=0.150
C5	B	0, 0.147, 0.306, 0.465, 0.663 max_d=0.663 avg_d=0.306 std_dev=0.159
N7	B	0, 0.153, 0.331, 0.509, 0.739 max_d=0.739 avg_d=0.331 std_dev=0.178
C8	B	0, 0.146, 0.328, 0.511, 0.798 max_d=0.798 avg_d=0.328 std_dev=0.182
O4'	A	0, 0.033, 0.221, 0.410, 0.620 max_d=0.620 avg_d=0.221 std_dev=0.188
N3	B	0, 0.180, 0.375, 0.571, 0.784 max_d=0.784 avg_d=0.375 std_dev=0.196
C1'	B	0, 0.176, 0.395, 0.614, 0.756 max_d=0.756 avg_d=0.395 std_dev=0.219
C2'	A	0, 0.036, 0.255, 0.474, 0.710 max_d=0.710 avg_d=0.255 std_dev=0.219
C6	B	0, 0.175, 0.399, 0.623, 0.842 max_d=0.842 avg_d=0.399 std_dev=0.224
C2	B	0, 0.193, 0.443, 0.693, 0.936 max_d=0.936 avg_d=0.443 std_dev=0.250
O4'	B	0, 0.120, 0.376, 0.632, 1.025 max_d=1.025 avg_d=0.376 std_dev=0.256
C4'	A	0, 0.070, 0.329, 0.589, 0.917 max_d=0.917 avg_d=0.329 std_dev=0.259
N1	B	0, 0.197, 0.457, 0.717, 0.982 max_d=0.982 avg_d=0.457 std_dev=0.260
O6	B	0, 0.204, 0.490, 0.775, 1.135 max_d=1.135 avg_d=0.490 std_dev=0.285
O2'	A	0, 0.087, 0.391, 0.694, 1.073 max_d=1.073 avg_d=0.391 std_dev=0.304
N2	B	0, 0.243, 0.571, 0.900, 1.229 max_d=1.229 avg_d=0.571 std_dev=0.328
C3'	A	0, 0.071, 0.409, 0.747, 1.085 max_d=1.085 avg_d=0.409 std_dev=0.338
C2'	B	0, 0.205, 0.552, 0.898, 1.343 max_d=1.343 avg_d=0.552 std_dev=0.347
C4'	B	0, 0.163, 0.547, 0.931, 1.424 max_d=1.424 avg_d=0.547 std_dev=0.384
O5'	B	0, 0.155, 0.597, 1.039, 1.668 max_d=1.668 avg_d=0.597 std_dev=0.442
C5'	A	0, 0.137, 0.603, 1.069, 1.554 max_d=1.554 avg_d=0.603 std_dev=0.466
C5'	B	0, 0.195, 0.664, 1.133, 1.787 max_d=1.787 avg_d=0.664 std_dev=0.469
C3'	B	0, 0.177, 0.649, 1.122, 1.549 max_d=1.549 avg_d=0.649 std_dev=0.472
O3'	A	0, 0.122, 0.623, 1.124, 1.644 max_d=1.644 avg_d=0.623 std_dev=0.501
P	B	0, 0.118, 0.684, 1.251, 2.088 max_d=2.088 avg_d=0.684 std_dev=0.566
O5'	A	0, 0.187, 0.781, 1.376, 2.111 max_d=2.111 avg_d=0.781 std_dev=0.595
P	A	0, 0.310, 0.911, 1.511, 2.123 max_d=2.123 avg_d=0.911 std_dev=0.601
OP2	B	0, 0.126, 0.744, 1.362, 2.324 max_d=2.324 avg_d=0.744 std_dev=0.618
OP2	A	0, 0.379, 1.007, 1.634, 2.493 max_d=2.493 avg_d=1.007 std_dev=0.627
O2'	B	0, 0.218, 0.896, 1.575, 2.437 max_d=2.437 avg_d=0.896 std_dev=0.679
OP1	A	0, 0.379, 1.084, 1.789, 2.610 max_d=2.610 avg_d=1.084 std_dev=0.705
OP1	B	0, 0.112, 0.863, 1.614, 2.768 max_d=2.768 avg_d=0.863 std_dev=0.751
O3'	B	0, 0.215, 0.981, 1.748, 2.640 max_d=2.640 avg_d=0.981 std_dev=0.767

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.01	0.09	0.13	0.25	0.15
C2	0.02	0.00	0.08	0.08	0.01	0.03	0.02	0.07	0.02	0.01	0.00	0.01	0.09	0.09	0.02	0.02	0.17	0.33	0.36	0.24
C2'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.06	0.01	0.09	0.01	0.09	0.03	0.06	0.16	0.01	0.02	0.07	0.01	0.04	0.15	0.12	0.06
C3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.12	0.00	0.17	0.02	0.17	0.07	0.08	0.15	0.02	0.01	0.13	0.01	0.06	0.20	0.11	0.08
C4	0.02	0.01	0.06	0.12	0.00	0.08	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.14	0.00	0.03	0.25	0.52	0.46	0.32
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.08	0.00	0.11	0.01	0.10	0.04	0.05	0.07	0.05	0.03	0.09	0.00	0.02	0.15	0.13	0.05
C5	0.01	0.02	0.09	0.17	0.01	0.11	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.20	0.01	0.04	0.30	0.51	0.46	0.33
C5'	0.02	0.07	0.01	0.02	0.15	0.01	0.19	0.00	0.17	0.09	0.11	0.07	0.05	0.04	0.17	0.02	0.01	0.19	0.12	0.02
C6	0.02	0.02	0.09	0.17	0.01	0.10	0.01	0.17	0.00	0.01	0.01	0.03	0.05	0.19	0.02	0.05	0.27	0.38	0.37	0.26
N1	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.07	0.02	0.01	0.18	0.28	0.33	0.21
N3	0.01	0.00	0.06	0.08	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.10	0.02	0.02	0.20	0.43	0.42	0.28
O2	0.03	0.01	0.16	0.15	0.01	0.07	0.02	0.07	0.03	0.02	0.01	0.00	0.16	0.18	0.02	0.03	0.15	0.28	0.35	0.23
O2'	0.01	0.09	0.01	0.02	0.05	0.05	0.05	0.05	0.05	0.02	0.07	0.16	0.00	0.06	0.05	0.05	0.03	0.18	0.11	0.05
O3'	0.03	0.09	0.02	0.01	0.14	0.03	0.20	0.04	0.19	0.07	0.10	0.18	0.06	0.00	0.16	0.02	0.10	0.35	0.20	0.16
O4	0.02	0.02	0.07	0.13	0.00	0.09	0.01	0.17	0.02	0.02	0.02	0.02	0.05	0.16	0.00	0.04	0.27	0.58	0.49	0.35
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.02	0.05	0.01	0.02	0.03	0.05	0.02	0.04	0.00	0.10	0.09	0.30	0.18
O5'	0.09	0.17	0.04	0.06	0.25	0.02	0.30	0.01	0.27	0.18	0.20	0.15	0.03	0.10	0.27	0.10	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.13	0.33	0.15	0.20	0.52	0.15	0.51	0.19	0.38	0.28	0.43	0.28	0.18	0.35	0.58	0.09	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.25	0.36	0.12	0.11	0.46	0.13	0.46	0.12	0.37	0.33	0.42	0.35	0.11	0.20	0.49	0.30	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.15	0.24	0.06	0.08	0.32	0.05	0.33	0.02	0.26	0.21	0.28	0.23	0.05	0.16	0.35	0.18	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.27	0.21	0.14	0.19	0.14	0.15	0.16	0.25	0.23	0.23	0.25	0.23	0.16	0.18	0.19	0.29	0.13	0.22	0.19	0.28	0.05	0.10	0.05
C2	0.29	0.23	0.24	0.20	0.14	0.15	0.12	0.24	0.19	0.25	0.25	0.27	0.19	0.18	0.22	0.36	0.13	0.17	0.17	0.23	0.07	0.17	0.09
C2'	0.28	0.21	0.15	0.17	0.16	0.14	0.16	0.26	0.19	0.27	0.21	0.23	0.18	0.21	0.21	0.29	0.14	0.24	0.22	0.22	0.08	0.09	0.10
C3'	0.27	0.26	0.28	0.14	0.23	0.13	0.22	0.12	0.25	0.24	0.26	0.28	0.25	0.22	0.23	0.27	0.14	0.27	0.08	0.26	0.03	0.08	0.03
C4	0.23	0.30	0.21	0.28	0.16	0.14	0.11	0.18	0.19	0.25	0.30	0.36	0.23	0.22	0.20	0.23	0.08	0.14	0.23	0.24	0.21	0.35	0.23
C4'	0.25	0.26	0.25	0.13	0.23	0.12	0.25	0.11	0.30	0.24	0.29	0.27	0.23	0.25	0.22	0.25	0.14	0.25	0.06	0.34	0.13	0.20	0.10
C5	0.21	0.29	0.15	0.31	0.16	0.17	0.14	0.22	0.25	0.24	0.33	0.34	0.22	0.19	0.18	0.16	0.17	0.16	0.29	0.31	0.28	0.40	0.29
C5'	0.28	0.32	0.39	0.20	0.30	0.18	0.34	0.12	0.37	0.31	0.36	0.32	0.30	0.34	0.28	0.38	0.20	0.28	0.15	0.42	0.23	0.33	0.19
C6	0.22	0.27	0.13	0.29	0.15	0.18	0.16	0.24	0.27	0.23	0.31	0.30	0.20	0.17	0.18	0.16	0.18	0.18	0.27	0.32	0.24	0.33	0.26
N1	0.26	0.23	0.16	0.22	0.15	0.15	0.15	0.23	0.23	0.24	0.27	0.27	0.18	0.18	0.20	0.26	0.10	0.18	0.20	0.28	0.10	0.19	0.12
N3	0.27	0.26	0.26	0.23	0.16	0.14	0.12	0.20	0.17	0.26	0.26	0.32	0.22	0.21	0.22	0.34	0.12	0.16	0.18	0.22	0.11	0.24	0.14
O2	0.32	0.21	0.30	0.19	0.14	0.22	0.12	0.32	0.17	0.25	0.22	0.25	0.17	0.17	0.23	0.49	0.25	0.20	0.21	0.21	0.16	0.14	0.13
O2'	0.36	0.20	0.22	0.24	0.17	0.24	0.17	0.34	0.19	0.31	0.21	0.23	0.18	0.23	0.26	0.47	0.23	0.33	0.28	0.21	0.14	0.10	0.13
O3'	0.30	0.26	0.31	0.13	0.25	0.19	0.23	0.06	0.24	0.27	0.25	0.28	0.27	0.25	0.26	0.30	0.18	0.35	0.02	0.24	0.02	0.03	0.01
O4	0.23	0.31	0.25	0.30	0.17	0.13	0.13	0.16	0.13	0.26	0.29	0.40	0.25	0.25	0.20	0.24	0.09	0.13	0.24	0.19	0.24	0.38	0.26
O4'	0.23	0.26	0.18	0.15	0.20	0.11	0.24	0.17	0.31	0.22	0.31	0.27	0.21	0.23	0.19	0.23	0.12	0.21	0.10	0.37	0.09	0.18	0.06
O5'	0.31	0.39	0.47	0.24	0.37	0.20	0.41	0.17	0.44	0.36	0.43	0.39	0.37	0.40	0.34	0.51	0.23	0.26	0.18	0.48	0.22	0.31	0.19
OP1	0.36	0.58	0.54	0.31	0.51	0.24	0.59	0.25	0.67	0.46	0.65	0.58	0.51	0.56	0.44	0.64	0.36	0.28	0.24	0.75	0.49	0.33	0.34
OP2	0.42	0.66	0.53	0.31	0.57	0.27	0.64	0.27	0.73	0.47	0.73	0.67	0.59	0.58	0.47	0.67	0.33	0.31	0.30	0.80	0.39	0.45	0.33
P	0.33	0.50	0.48	0.23	0.44	0.19	0.49	0.17	0.56	0.38	0.55	0.51	0.44	0.46	0.37	0.57	0.25	0.25	0.19	0.62	0.30	0.31	0.23

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.06	0.03	0.02	0.05	0.08	0.06	0.02	0.01	0.02	0.22	0.00	0.14	0.03	0.15	0.22	0.18
C2	0.06	0.00	0.27	0.21	0.01	0.11	0.02	0.17	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.19	0.24	0.21	0.16	0.02	0.18	0.26	0.20
C2'	0.00	0.27	0.00	0.01	0.14	0.01	0.08	0.15	0.13	0.15	0.21	0.34	0.26	0.09	0.02	0.01	0.03	0.01	0.34	0.11	0.37	0.46	0.37
C3'	0.01	0.21	0.01	0.00	0.19	0.01	0.24	0.02	0.26	0.25	0.23	0.22	0.18	0.27	0.16	0.02	0.01	0.02	0.11	0.28	0.18	0.17	0.11
C4	0.02	0.01	0.14	0.19	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.09	0.12	0.11	0.14	0.02	0.17	0.25	0.20
C4'	0.01	0.11	0.01	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.04	0.16	0.07	0.16	0.11	0.14	0.06	0.22	0.03	0.00	0.02	0.06	0.05	0.05	0.06
C5	0.02	0.02	0.08	0.24	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.18	0.09	0.06	0.17	0.01	0.21	0.30	0.23
C5'	0.06	0.17	0.15	0.02	0.10	0.01	0.10	0.00	0.11	0.14	0.14	0.21	0.16	0.15	0.07	0.08	0.16	0.02	0.01	0.12	0.05	0.02	0.02
C6	0.03	0.01	0.13	0.26	0.01	0.04	0.01	0.11	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.15	0.11	0.10	0.17	0.00	0.23	0.32	0.24
C8	0.02	0.02	0.15	0.25	0.01	0.16	0.01	0.14	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.31	0.15	0.13	0.18	0.02	0.21	0.26	0.23
N1	0.05	0.01	0.21	0.23	0.01	0.07	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.12	0.16	0.17	0.16	0.01	0.20	0.30	0.22
N2	0.08	0.01	0.34	0.22	0.02	0.16	0.02	0.21	0.02	0.03	0.01	0.00	0.02	0.03	0.03	0.29	0.33	0.25	0.17	0.02	0.19	0.26	0.21
N3	0.06	0.01	0.26	0.18	0.01	0.11	0.01	0.16	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.19	0.25	0.21	0.15	0.02	0.17	0.24	0.20
N7	0.02	0.02	0.09	0.27	0.01	0.14	0.01	0.15	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.30	0.17	0.08	0.21	0.02	0.26	0.32	0.26
N9	0.01	0.02	0.02	0.16	0.01	0.06	0.01	0.07	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.14	0.07	0.01	0.13	0.02	0.16	0.23	0.18
O2'	0.02	0.19	0.01	0.02	0.09	0.22	0.18	0.08	0.15	0.31	0.12	0.29	0.19	0.30	0.14	0.00	0.06	0.15	0.26	0.19	0.29	0.51	0.31
O3'	0.22	0.24	0.03	0.01	0.12	0.03	0.09	0.16	0.11	0.15	0.16	0.33	0.25	0.17	0.07	0.06	0.00	0.17	0.19	0.14	0.30	0.27	0.22
O4'	0.00	0.21	0.01	0.02	0.11	0.00	0.06	0.02	0.10	0.13	0.17	0.25	0.21	0.08	0.01	0.15	0.17	0.00	0.11	0.08	0.16	0.19	0.20
O5'	0.14	0.16	0.34	0.11	0.14	0.02	0.17	0.01	0.17	0.18	0.16	0.17	0.15	0.21	0.13	0.26	0.19	0.11	0.00	0.20	0.02	0.02	0.01
O6	0.03	0.02	0.11	0.28	0.02	0.06	0.01	0.12	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.19	0.14	0.08	0.20	0.00	0.27	0.37	0.27
OP1	0.15	0.18	0.37	0.18	0.17	0.05	0.21	0.05	0.23	0.21	0.20	0.19	0.17	0.26	0.16	0.29	0.30	0.16	0.02	0.27	0.00	0.01	0.01
OP2	0.22	0.26	0.46	0.17	0.25	0.05	0.30	0.02	0.32	0.26	0.30	0.26	0.24	0.32	0.23	0.51	0.27	0.19	0.02	0.37	0.01	0.00	0.01
P	0.18	0.20	0.37	0.11	0.20	0.06	0.23	0.02	0.24	0.23	0.22	0.21	0.20	0.26	0.18	0.31	0.22	0.20	0.01	0.27	0.01	0.01	0.00