Doublet Group distance statistics: 48947

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 6, 3, 3, 0, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.006, 0.012, 0.017, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.012 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.004, 0.011, 0.018, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.011 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.003, 0.016, 0.029, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.016 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.003, 0.018, 0.033, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.018 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.010, 0.025, 0.041, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.025 std_dev=0.015
C6	A	0, 0.002, 0.018, 0.033, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.018 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.009, 0.025, 0.040, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.025 std_dev=0.015
O2	A	0, 0.017, 0.052, 0.087, 0.160 max_d=0.160 avg_d=0.052 std_dev=0.035
O4	A	0, 0.009, 0.088, 0.166, 0.323 max_d=0.323 avg_d=0.088 std_dev=0.079
C2'	A	0, 0.139, 0.257, 0.375, 0.416 max_d=0.416 avg_d=0.257 std_dev=0.118
C5	B	0, 0.195, 0.313, 0.431, 0.506 max_d=0.506 avg_d=0.313 std_dev=0.118
O4'	B	0, 0.186, 0.311, 0.436, 0.559 max_d=0.559 avg_d=0.311 std_dev=0.125
O2'	A	0, 0.155, 0.289, 0.422, 0.497 max_d=0.497 avg_d=0.289 std_dev=0.133
O4'	A	0, 0.130, 0.267, 0.405, 0.422 max_d=0.422 avg_d=0.267 std_dev=0.138
C4	B	0, 0.121, 0.267, 0.413, 0.586 max_d=0.586 avg_d=0.267 std_dev=0.146
N7	B	0, 0.225, 0.373, 0.520, 0.576 max_d=0.576 avg_d=0.373 std_dev=0.148
C8	B	0, 0.186, 0.334, 0.482, 0.548 max_d=0.548 avg_d=0.334 std_dev=0.148
N9	B	0, 0.156, 0.312, 0.468, 0.630 max_d=0.630 avg_d=0.312 std_dev=0.156
C6	B	0, 0.246, 0.405, 0.564, 0.630 max_d=0.630 avg_d=0.405 std_dev=0.159
C3'	A	0, 0.227, 0.413, 0.599, 0.645 max_d=0.645 avg_d=0.413 std_dev=0.186
C4'	B	0, 0.221, 0.408, 0.594, 0.718 max_d=0.718 avg_d=0.408 std_dev=0.187
C4'	A	0, 0.207, 0.396, 0.585, 0.614 max_d=0.614 avg_d=0.396 std_dev=0.189
N1	B	0, 0.193, 0.384, 0.575, 0.750 max_d=0.750 avg_d=0.384 std_dev=0.191
OP1	B	0, 0.289, 0.498, 0.707, 0.835 max_d=0.835 avg_d=0.498 std_dev=0.209
C5'	B	0, 0.268, 0.478, 0.688, 0.983 max_d=0.983 avg_d=0.478 std_dev=0.210
P	B	0, 0.249, 0.463, 0.678, 0.862 max_d=0.862 avg_d=0.463 std_dev=0.215
O3'	A	0, 0.286, 0.504, 0.722, 0.791 max_d=0.791 avg_d=0.504 std_dev=0.218
O6	B	0, 0.322, 0.551, 0.781, 1.026 max_d=1.026 avg_d=0.551 std_dev=0.230
C2	B	0, 0.101, 0.344, 0.588, 0.895 max_d=0.895 avg_d=0.344 std_dev=0.243
N3	B	0, 0.065, 0.311, 0.557, 0.863 max_d=0.863 avg_d=0.311 std_dev=0.246
O5'	B	0, 0.330, 0.579, 0.827, 1.212 max_d=1.212 avg_d=0.579 std_dev=0.248
OP2	B	0, 0.240, 0.516, 0.791, 1.196 max_d=1.196 avg_d=0.516 std_dev=0.275
C1'	B	0, 0.133, 0.442, 0.751, 1.087 max_d=1.087 avg_d=0.442 std_dev=0.309
C3'	B	0, 0.258, 0.581, 0.905, 1.186 max_d=1.186 avg_d=0.581 std_dev=0.323
N2	B	0, 0.113, 0.447, 0.782, 1.164 max_d=1.164 avg_d=0.447 std_dev=0.334
C5'	A	0, 0.362, 0.757, 1.153, 1.236 max_d=1.236 avg_d=0.757 std_dev=0.396
O5'	A	0, 0.364, 0.764, 1.164, 1.732 max_d=1.732 avg_d=0.764 std_dev=0.400
O3'	B	0, 0.209, 0.707, 1.205, 1.920 max_d=1.920 avg_d=0.707 std_dev=0.498
P	A	0, 0.264, 0.891, 1.519, 2.094 max_d=2.094 avg_d=0.891 std_dev=0.627
C2'	B	0, 0.130, 0.761, 1.391, 2.242 max_d=2.242 avg_d=0.761 std_dev=0.630
OP2	A	0, 0.526, 1.279, 2.032, 2.830 max_d=2.830 avg_d=1.279 std_dev=0.753
O2'	B	0, 0.036, 1.230, 2.423, 3.794 max_d=3.794 avg_d=1.230 std_dev=1.194
OP1	A	0, -0.158, 1.411, 2.980, 4.828 max_d=4.828 avg_d=1.411 std_dev=1.569

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.00	0.16	1.04	0.36	0.36
C2	0.02	0.00	0.07	0.09	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.09	0.01	0.04	0.30	1.31	0.39	0.51
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.02	0.06	0.03	0.07	0.02	0.05	0.12	0.00	0.02	0.06	0.01	0.25	0.74	0.33	0.28
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.06	0.01	0.06	0.04	0.06	0.03	0.08	0.13	0.01	0.01	0.08	0.02	0.34	0.44	0.31	0.25
C4	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.06	0.00	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.07	0.00	0.03	0.42	1.20	0.47	0.52
C4'	0.01	0.03	0.02	0.01	0.06	0.00	0.08	0.01	0.07	0.03	0.04	0.04	0.06	0.04	0.07	0.00	0.02	0.46	0.30	0.13
C5	0.02	0.01	0.06	0.06	0.00	0.08	0.00	0.16	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.06	0.01	0.06	0.43	1.03	0.52	0.47
C5'	0.02	0.08	0.03	0.04	0.15	0.01	0.16	0.00	0.13	0.08	0.11	0.05	0.06	0.07	0.16	0.02	0.01	0.15	0.30	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.06	0.01	0.07	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.06	0.01	0.06	0.38	1.03	0.50	0.43
N1	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.29	1.18	0.41	0.45
N3	0.01	0.00	0.05	0.08	0.00	0.04	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.09	0.01	0.02	0.37	1.32	0.42	0.54
O2	0.04	0.01	0.12	0.13	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.14	0.01	0.07	0.25	1.34	0.36	0.50
O2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.04	0.06	0.05	0.06	0.04	0.02	0.05	0.09	0.00	0.03	0.06	0.03	0.11	0.70	0.31	0.22
O3'	0.02	0.09	0.02	0.01	0.07	0.04	0.06	0.07	0.06	0.03	0.09	0.14	0.03	0.00	0.09	0.03	0.34	0.35	0.33	0.28
O4	0.01	0.01	0.06	0.08	0.00	0.07	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.09	0.00	0.04	0.43	1.17	0.47	0.53
O4'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.03	0.00	0.06	0.02	0.06	0.01	0.02	0.07	0.03	0.03	0.04	0.00	0.16	0.96	0.38	0.33
O5'	0.16	0.30	0.25	0.34	0.42	0.02	0.43	0.01	0.38	0.29	0.37	0.25	0.11	0.34	0.43	0.16	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	1.04	1.31	0.74	0.44	1.20	0.46	1.03	0.15	1.03	1.18	1.32	1.34	0.70	0.35	1.17	0.96	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.36	0.39	0.33	0.31	0.47	0.30	0.52	0.30	0.50	0.41	0.42	0.36	0.31	0.33	0.47	0.38	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.36	0.51	0.28	0.25	0.52	0.13	0.47	0.02	0.43	0.45	0.54	0.50	0.22	0.28	0.53	0.33	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.13	0.14	0.21	0.08	0.20	0.13	0.19	0.20	0.06	0.17	0.14	0.12	0.14	0.08	0.33	0.16	0.22	0.34	0.25	0.14	0.12	0.09
C2	0.32	0.11	0.31	0.24	0.08	0.22	0.10	0.18	0.18	0.11	0.16	0.15	0.14	0.11	0.17	0.54	0.31	0.23	0.32	0.25	0.14	0.20	0.11
C2'	0.14	0.14	0.11	0.18	0.10	0.16	0.14	0.19	0.17	0.11	0.17	0.14	0.11	0.14	0.08	0.25	0.14	0.16	0.39	0.20	0.21	0.10	0.17
C3'	0.24	0.21	0.40	0.22	0.23	0.22	0.22	0.23	0.21	0.23	0.21	0.21	0.22	0.22	0.24	0.30	0.21	0.23	0.11	0.21	0.03	0.12	0.02
C4	0.33	0.17	0.34	0.30	0.18	0.22	0.08	0.17	0.12	0.16	0.09	0.21	0.25	0.11	0.23	0.40	0.24	0.22	0.29	0.23	0.12	0.22	0.11
C4'	0.21	0.21	0.38	0.21	0.24	0.19	0.29	0.22	0.28	0.32	0.24	0.19	0.20	0.34	0.25	0.29	0.18	0.18	0.08	0.31	0.14	0.32	0.14
C5	0.28	0.17	0.22	0.30	0.16	0.22	0.08	0.18	0.14	0.14	0.13	0.20	0.21	0.11	0.20	0.24	0.16	0.23	0.30	0.25	0.11	0.19	0.10
C5'	0.40	0.34	0.62	0.36	0.42	0.30	0.47	0.32	0.42	0.55	0.36	0.31	0.36	0.57	0.45	0.61	0.33	0.31	0.18	0.43	0.33	0.56	0.32
C6	0.25	0.15	0.18	0.28	0.13	0.22	0.10	0.19	0.18	0.10	0.15	0.17	0.18	0.12	0.16	0.23	0.15	0.24	0.32	0.26	0.10	0.16	0.09
N1	0.27	0.13	0.21	0.24	0.09	0.22	0.11	0.19	0.19	0.09	0.16	0.15	0.14	0.12	0.14	0.35	0.20	0.24	0.33	0.25	0.12	0.16	0.09
N3	0.35	0.11	0.38	0.27	0.13	0.22	0.08	0.17	0.15	0.14	0.12	0.16	0.20	0.11	0.22	0.55	0.32	0.22	0.30	0.23	0.13	0.22	0.11
O2	0.32	0.12	0.34	0.24	0.08	0.24	0.12	0.19	0.19	0.11	0.18	0.15	0.12	0.13	0.15	0.68	0.41	0.21	0.33	0.25	0.17	0.21	0.13
O2'	0.24	0.14	0.18	0.25	0.13	0.25	0.15	0.27	0.17	0.16	0.17	0.14	0.13	0.15	0.16	0.46	0.23	0.25	0.48	0.20	0.33	0.13	0.25
O3'	0.28	0.22	0.48	0.26	0.23	0.26	0.20	0.28	0.19	0.22	0.19	0.22	0.23	0.19	0.25	0.37	0.25	0.25	0.03	0.18	0.03	0.02	0.01
O4	0.37	0.26	0.42	0.35	0.26	0.24	0.17	0.18	0.13	0.22	0.12	0.30	0.33	0.17	0.29	0.46	0.24	0.23	0.30	0.20	0.15	0.24	0.14
O4'	0.14	0.14	0.18	0.16	0.13	0.15	0.22	0.17	0.25	0.20	0.19	0.15	0.12	0.28	0.12	0.18	0.12	0.17	0.20	0.32	0.07	0.25	0.05
O5'	0.39	0.42	0.29	0.40	0.39	0.35	0.37	0.28	0.36	0.38	0.40	0.45	0.42	0.38	0.38	0.31	0.36	0.41	0.41	0.33	0.35	0.41	0.34
OP1	0.47	0.74	0.23	0.41	0.44	0.46	0.21	0.35	0.26	0.22	0.55	0.92	0.70	0.27	0.33	0.30	0.38	0.59	0.34	0.18	0.63	0.84	0.49
OP2	0.69	0.67	0.89	0.57	0.80	0.53	0.95	0.50	0.93	0.96	0.76	0.57	0.68	1.09	0.81	0.99	0.66	0.55	0.45	1.02	0.57	0.82	0.56
P	0.21	0.32	0.22	0.25	0.18	0.22	0.14	0.19	0.12	0.28	0.23	0.43	0.30	0.32	0.17	0.27	0.19	0.28	0.28	0.18	0.46	0.60	0.38

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.08	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.32	0.00	0.16	0.02	0.15	0.35	0.22
C2	0.02	0.00	0.17	0.07	0.01	0.07	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.17	0.43	0.13	0.09	0.01	0.13	0.32	0.17
C2'	0.00	0.17	0.00	0.01	0.08	0.01	0.04	0.23	0.06	0.14	0.12	0.22	0.18	0.10	0.03	0.00	0.03	0.02	0.48	0.05	0.44	0.59	0.50
C3'	0.02	0.07	0.01	0.00	0.15	0.01	0.24	0.02	0.23	0.33	0.14	0.06	0.06	0.34	0.18	0.02	0.01	0.01	0.17	0.27	0.11	0.10	0.09
C4	0.01	0.01	0.08	0.15	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.18	0.25	0.07	0.09	0.01	0.14	0.33	0.18
C4'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.03	0.00	0.08	0.01	0.06	0.17	0.04	0.11	0.07	0.15	0.07	0.27	0.03	0.01	0.02	0.09	0.10	0.14	0.04
C5	0.01	0.01	0.04	0.24	0.00	0.08	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.30	0.13	0.03	0.12	0.01	0.16	0.32	0.17
C5'	0.08	0.10	0.23	0.02	0.07	0.01	0.08	0.00	0.09	0.12	0.08	0.12	0.10	0.13	0.06	0.05	0.19	0.02	0.02	0.11	0.12	0.13	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.23	0.01	0.06	0.01	0.09	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.30	0.17	0.05	0.13	0.00	0.16	0.31	0.17
C8	0.01	0.01	0.14	0.33	0.00	0.17	0.01	0.12	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.36	0.19	0.07	0.13	0.02	0.17	0.35	0.20
N1	0.02	0.00	0.12	0.14	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.22	0.31	0.10	0.11	0.01	0.15	0.31	0.17
N2	0.03	0.00	0.22	0.06	0.01	0.11	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.21	0.55	0.15	0.10	0.01	0.13	0.32	0.17
N3	0.02	0.00	0.18	0.06	0.01	0.07	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.16	0.44	0.12	0.10	0.01	0.13	0.33	0.18
N7	0.01	0.01	0.10	0.34	0.00	0.15	0.00	0.13	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.39	0.18	0.04	0.16	0.02	0.18	0.32	0.18
N9	0.01	0.02	0.03	0.18	0.01	0.07	0.01	0.06	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.20	0.15	0.01	0.10	0.02	0.14	0.35	0.20
O2'	0.02	0.17	0.00	0.02	0.18	0.27	0.30	0.05	0.30	0.36	0.22	0.21	0.16	0.39	0.20	0.00	0.04	0.20	0.40	0.35	0.35	0.66	0.44
O3'	0.32	0.43	0.03	0.01	0.25	0.03	0.13	0.19	0.17	0.19	0.31	0.55	0.44	0.18	0.15	0.04	0.00	0.23	0.21	0.14	0.40	0.24	0.24
O4'	0.00	0.13	0.02	0.01	0.07	0.01	0.03	0.02	0.05	0.07	0.10	0.15	0.12	0.04	0.01	0.20	0.23	0.00	0.11	0.04	0.09	0.24	0.13
O5'	0.16	0.09	0.48	0.17	0.09	0.02	0.12	0.02	0.13	0.13	0.11	0.10	0.10	0.16	0.10	0.40	0.21	0.11	0.00	0.16	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.05	0.27	0.01	0.09	0.01	0.11	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.35	0.14	0.04	0.16	0.00	0.19	0.30	0.18
OP1	0.15	0.13	0.44	0.11	0.14	0.10	0.16	0.12	0.16	0.17	0.15	0.13	0.13	0.18	0.14	0.35	0.40	0.09	0.02	0.19	0.00	0.01	0.00
OP2	0.35	0.32	0.59	0.10	0.33	0.14	0.32	0.13	0.31	0.35	0.31	0.32	0.33	0.32	0.35	0.66	0.24	0.24	0.02	0.30	0.01	0.00	0.00
P	0.22	0.17	0.50	0.09	0.18	0.04	0.17	0.02	0.17	0.20	0.17	0.17	0.18	0.18	0.20	0.44	0.24	0.13	0.01	0.18	0.00	0.00	0.00