Doublet Group distance statistics: 48948

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 3, 5, 3, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.002, 0.011, 0.020, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.011 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.004, 0.015, 0.026, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.015 std_dev=0.011
C5	A	0, -0.001, 0.011, 0.023, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.011 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.003, 0.015, 0.028, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.015 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.002, 0.015, 0.028, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.015 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.005, 0.020, 0.035, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.020 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.002, 0.017, 0.033, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.017 std_dev=0.015
O2	A	0, 0.011, 0.038, 0.064, 0.114 max_d=0.114 avg_d=0.038 std_dev=0.026
O4	A	0, 0.008, 0.061, 0.113, 0.230 max_d=0.230 avg_d=0.061 std_dev=0.052
O4'	A	0, 0.157, 0.304, 0.451, 0.579 max_d=0.579 avg_d=0.304 std_dev=0.147
C2'	A	0, 0.141, 0.290, 0.440, 0.584 max_d=0.584 avg_d=0.290 std_dev=0.150
O2'	A	0, 0.120, 0.274, 0.428, 0.574 max_d=0.574 avg_d=0.274 std_dev=0.154
C4	B	0, 0.253, 0.410, 0.566, 0.700 max_d=0.700 avg_d=0.410 std_dev=0.156
C5	B	0, 0.243, 0.430, 0.618, 0.685 max_d=0.685 avg_d=0.430 std_dev=0.187
N9	B	0, 0.328, 0.517, 0.707, 0.882 max_d=0.882 avg_d=0.517 std_dev=0.189
C4'	A	0, 0.291, 0.513, 0.736, 0.934 max_d=0.934 avg_d=0.513 std_dev=0.223
C3'	A	0, 0.268, 0.502, 0.736, 0.964 max_d=0.964 avg_d=0.502 std_dev=0.234
C8	B	0, 0.321, 0.590, 0.858, 1.194 max_d=1.194 avg_d=0.590 std_dev=0.268
N7	B	0, 0.280, 0.550, 0.821, 1.143 max_d=1.143 avg_d=0.550 std_dev=0.271
N3	B	0, 0.239, 0.511, 0.783, 1.119 max_d=1.119 avg_d=0.511 std_dev=0.272
C6	B	0, 0.257, 0.542, 0.826, 1.390 max_d=1.390 avg_d=0.542 std_dev=0.285
O3'	A	0, 0.362, 0.659, 0.955, 1.299 max_d=1.299 avg_d=0.659 std_dev=0.297
OP2	B	0, 0.500, 0.803, 1.106, 1.430 max_d=1.430 avg_d=0.803 std_dev=0.303
P	A	0, 0.314, 0.627, 0.939, 1.234 max_d=1.234 avg_d=0.627 std_dev=0.312
C1'	B	0, 0.340, 0.676, 1.011, 1.664 max_d=1.664 avg_d=0.676 std_dev=0.335
P	B	0, 0.381, 0.729, 1.076, 1.765 max_d=1.765 avg_d=0.729 std_dev=0.347
N1	B	0, 0.252, 0.602, 0.952, 1.647 max_d=1.647 avg_d=0.602 std_dev=0.350
C2	B	0, 0.231, 0.588, 0.945, 1.524 max_d=1.524 avg_d=0.588 std_dev=0.357
O5'	A	0, 0.344, 0.713, 1.081, 1.545 max_d=1.545 avg_d=0.713 std_dev=0.368
O5'	B	0, 0.355, 0.740, 1.126, 1.979 max_d=1.979 avg_d=0.740 std_dev=0.386
C2'	B	0, 0.417, 0.809, 1.201, 1.810 max_d=1.810 avg_d=0.809 std_dev=0.392
O6	B	0, 0.295, 0.701, 1.107, 2.048 max_d=2.048 avg_d=0.701 std_dev=0.406
C5'	A	0, 0.563, 0.989, 1.415, 1.700 max_d=1.700 avg_d=0.989 std_dev=0.426
C3'	B	0, 0.354, 0.792, 1.230, 2.069 max_d=2.069 avg_d=0.792 std_dev=0.438
O3'	B	0, 0.449, 0.899, 1.349, 2.137 max_d=2.137 avg_d=0.899 std_dev=0.450
O4'	B	0, 0.218, 0.679, 1.139, 2.235 max_d=2.235 avg_d=0.679 std_dev=0.461
O2'	B	0, 0.433, 0.901, 1.368, 2.140 max_d=2.140 avg_d=0.901 std_dev=0.468
N2	B	0, 0.302, 0.803, 1.304, 2.234 max_d=2.234 avg_d=0.803 std_dev=0.501
C4'	B	0, 0.232, 0.743, 1.255, 2.511 max_d=2.511 avg_d=0.743 std_dev=0.512
OP1	B	0, 0.359, 0.882, 1.406, 2.632 max_d=2.632 avg_d=0.882 std_dev=0.524
C5'	B	0, 0.180, 0.761, 1.342, 2.843 max_d=2.843 avg_d=0.761 std_dev=0.581
OP2	A	0, 1.056, 1.796, 2.536, 3.039 max_d=3.039 avg_d=1.796 std_dev=0.740
OP1	A	0, 1.392, 2.273, 3.154, 3.027 max_d=3.027 avg_d=2.273 std_dev=0.881

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.05	0.02	0.01	0.02	0.05	0.01	0.01	0.03	0.01	0.10	0.31	0.14	0.07
C2	0.03	0.00	0.06	0.10	0.01	0.07	0.02	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.10	0.02	0.02	0.20	0.51	0.17	0.11
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.06	0.01	0.07	0.03	0.07	0.03	0.06	0.11	0.01	0.01	0.07	0.02	0.16	0.19	0.16	0.11
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.07	0.00	0.07	0.03	0.07	0.04	0.10	0.15	0.02	0.01	0.09	0.01	0.26	0.16	0.23	0.18
C4	0.02	0.01	0.06	0.07	0.00	0.10	0.00	0.26	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.08	0.01	0.04	0.27	0.70	0.32	0.18
C4'	0.00	0.07	0.01	0.00	0.10	0.00	0.10	0.01	0.08	0.05	0.09	0.07	0.04	0.03	0.11	0.00	0.02	0.23	0.17	0.05
C5	0.02	0.02	0.07	0.07	0.00	0.10	0.00	0.25	0.00	0.02	0.01	0.03	0.06	0.08	0.02	0.05	0.27	0.66	0.30	0.17
C5'	0.05	0.18	0.03	0.03	0.26	0.01	0.25	0.00	0.19	0.15	0.23	0.16	0.04	0.04	0.28	0.01	0.01	0.26	0.26	0.03
C6	0.02	0.01	0.07	0.07	0.01	0.08	0.00	0.19	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.08	0.02	0.05	0.23	0.54	0.19	0.12
N1	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.05	0.02	0.15	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.03	0.02	0.02	0.18	0.45	0.13	0.09
N3	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.09	0.01	0.23	0.01	0.01	0.00	0.02	0.08	0.10	0.01	0.02	0.24	0.62	0.25	0.15
O2	0.05	0.01	0.11	0.15	0.02	0.07	0.03	0.16	0.02	0.02	0.02	0.00	0.12	0.16	0.02	0.04	0.17	0.46	0.14	0.10
O2'	0.01	0.08	0.01	0.02	0.07	0.04	0.06	0.04	0.05	0.04	0.08	0.12	0.00	0.02	0.09	0.05	0.07	0.17	0.13	0.05
O3'	0.01	0.10	0.01	0.01	0.08	0.03	0.08	0.04	0.08	0.03	0.10	0.16	0.02	0.00	0.11	0.03	0.26	0.24	0.29	0.22
O4	0.03	0.02	0.07	0.09	0.01	0.11	0.02	0.28	0.02	0.02	0.01	0.02	0.09	0.11	0.00	0.05	0.29	0.76	0.38	0.22
O4'	0.01	0.02	0.02	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.02	0.04	0.05	0.03	0.05	0.00	0.13	0.32	0.25	0.13
O5'	0.10	0.20	0.16	0.26	0.27	0.02	0.27	0.01	0.23	0.18	0.24	0.17	0.07	0.26	0.29	0.13	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.31	0.51	0.19	0.16	0.70	0.23	0.66	0.26	0.54	0.45	0.62	0.46	0.17	0.24	0.76	0.32	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.17	0.16	0.23	0.32	0.17	0.30	0.26	0.19	0.13	0.25	0.14	0.13	0.29	0.38	0.25	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.07	0.11	0.11	0.18	0.18	0.05	0.17	0.03	0.12	0.09	0.15	0.10	0.05	0.22	0.22	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.13	0.16	0.19	0.09	0.21	0.14	0.28	0.16	0.19	0.14	0.17	0.12	0.20	0.12	0.22	0.21	0.20	0.21	0.22	0.05	0.12	0.06
C2	0.18	0.16	0.17	0.21	0.08	0.25	0.12	0.29	0.17	0.14	0.17	0.19	0.13	0.15	0.11	0.24	0.22	0.23	0.29	0.22	0.15	0.16	0.13
C2'	0.16	0.12	0.15	0.20	0.11	0.20	0.18	0.30	0.18	0.25	0.13	0.15	0.12	0.27	0.14	0.18	0.22	0.18	0.25	0.24	0.10	0.15	0.12
C3'	0.16	0.20	0.11	0.13	0.18	0.09	0.23	0.13	0.26	0.21	0.22	0.21	0.19	0.29	0.15	0.12	0.14	0.18	0.09	0.31	0.03	0.08	0.02
C4	0.24	0.21	0.22	0.19	0.18	0.23	0.12	0.20	0.15	0.18	0.19	0.24	0.22	0.14	0.20	0.28	0.19	0.25	0.26	0.19	0.12	0.23	0.13
C4'	0.14	0.21	0.10	0.13	0.19	0.07	0.25	0.15	0.29	0.21	0.25	0.23	0.19	0.29	0.15	0.11	0.13	0.15	0.08	0.35	0.13	0.22	0.11
C5	0.25	0.19	0.22	0.18	0.17	0.23	0.13	0.20	0.16	0.21	0.18	0.22	0.19	0.15	0.21	0.26	0.18	0.27	0.22	0.21	0.13	0.25	0.13
C5'	0.27	0.40	0.27	0.26	0.38	0.17	0.44	0.14	0.49	0.36	0.45	0.40	0.37	0.46	0.32	0.22	0.26	0.24	0.20	0.55	0.20	0.35	0.20
C6	0.23	0.15	0.19	0.17	0.13	0.22	0.12	0.20	0.16	0.18	0.15	0.18	0.15	0.15	0.17	0.24	0.18	0.26	0.20	0.22	0.11	0.22	0.12
N1	0.19	0.14	0.16	0.17	0.10	0.21	0.12	0.23	0.16	0.16	0.15	0.17	0.13	0.17	0.13	0.22	0.19	0.22	0.23	0.22	0.06	0.16	0.08
N3	0.22	0.18	0.20	0.21	0.12	0.24	0.10	0.24	0.17	0.12	0.17	0.21	0.18	0.11	0.15	0.27	0.21	0.25	0.29	0.22	0.15	0.19	0.14
O2	0.16	0.20	0.18	0.27	0.10	0.32	0.16	0.40	0.21	0.19	0.22	0.24	0.14	0.20	0.11	0.23	0.27	0.29	0.33	0.25	0.24	0.15	0.18
O2'	0.25	0.15	0.27	0.33	0.16	0.34	0.20	0.45	0.18	0.30	0.14	0.19	0.17	0.29	0.22	0.31	0.36	0.27	0.30	0.23	0.15	0.12	0.13
O3'	0.16	0.18	0.10	0.12	0.18	0.09	0.25	0.13	0.26	0.25	0.21	0.19	0.17	0.32	0.16	0.12	0.13	0.19	0.03	0.32	0.02	0.02	0.01
O4	0.28	0.29	0.26	0.22	0.24	0.25	0.18	0.22	0.17	0.23	0.24	0.32	0.29	0.21	0.25	0.32	0.22	0.27	0.28	0.19	0.16	0.27	0.17
O4'	0.15	0.15	0.10	0.13	0.11	0.14	0.16	0.20	0.19	0.15	0.17	0.18	0.13	0.20	0.10	0.16	0.14	0.16	0.12	0.26	0.09	0.15	0.05
O5'	0.46	0.42	0.45	0.41	0.44	0.41	0.48	0.35	0.49	0.48	0.45	0.41	0.43	0.50	0.46	0.43	0.39	0.47	0.36	0.53	0.41	0.46	0.37
OP1	0.56	0.85	0.63	0.57	0.76	0.43	0.85	0.33	0.95	0.68	0.93	0.86	0.77	0.81	0.66	0.56	0.57	0.46	0.37	1.04	0.42	0.46	0.32
OP2	0.59	0.50	0.60	0.54	0.55	0.55	0.60	0.49	0.60	0.65	0.54	0.47	0.51	0.67	0.59	0.58	0.51	0.59	0.49	0.67	0.56	0.71	0.53
P	0.43	0.40	0.45	0.42	0.41	0.40	0.44	0.35	0.47	0.44	0.44	0.39	0.39	0.46	0.42	0.43	0.41	0.44	0.35	0.53	0.42	0.50	0.37

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.14	0.03	0.13	0.20	0.09
C2	0.03	0.00	0.09	0.06	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.16	0.08	0.04	0.27	0.01	0.24	0.25	0.19
C2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.05	0.01	0.05	0.02	0.06	0.08	0.07	0.11	0.09	0.07	0.03	0.00	0.02	0.01	0.16	0.07	0.23	0.13	0.10
C3'	0.02	0.06	0.01	0.00	0.05	0.01	0.09	0.02	0.08	0.14	0.06	0.08	0.06	0.14	0.07	0.02	0.01	0.01	0.19	0.10	0.30	0.14	0.16
C4	0.02	0.01	0.05	0.05	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.05	0.03	0.31	0.02	0.26	0.23	0.21
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.09	0.04	0.04	0.03	0.09	0.04	0.05	0.03	0.00	0.03	0.08	0.12	0.23	0.05
C5	0.02	0.01	0.05	0.09	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.07	0.10	0.04	0.41	0.02	0.34	0.31	0.31
C5'	0.02	0.06	0.02	0.02	0.08	0.01	0.12	0.00	0.12	0.13	0.09	0.05	0.05	0.15	0.08	0.05	0.04	0.02	0.01	0.14	0.14	0.25	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.08	0.01	0.06	0.01	0.12	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.09	0.10	0.04	0.41	0.01	0.36	0.34	0.33
C8	0.01	0.02	0.08	0.14	0.01	0.09	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.05	0.17	0.05	0.44	0.02	0.34	0.25	0.30
N1	0.02	0.00	0.07	0.06	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.13	0.07	0.04	0.35	0.01	0.30	0.30	0.26
N2	0.04	0.00	0.11	0.08	0.01	0.04	0.01	0.05	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.19	0.12	0.05	0.24	0.02	0.21	0.24	0.17
N3	0.03	0.01	0.09	0.06	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.15	0.08	0.04	0.23	0.02	0.20	0.22	0.16
N7	0.02	0.01	0.07	0.14	0.01	0.09	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.17	0.05	0.48	0.03	0.40	0.35	0.37
N9	0.01	0.02	0.03	0.07	0.01	0.04	0.02	0.08	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.07	0.02	0.30	0.03	0.24	0.20	0.19
O2'	0.02	0.16	0.00	0.02	0.08	0.05	0.07	0.05	0.09	0.05	0.13	0.19	0.15	0.05	0.03	0.00	0.03	0.05	0.07	0.09	0.20	0.16	0.07
O3'	0.01	0.08	0.02	0.01	0.05	0.03	0.10	0.04	0.10	0.17	0.07	0.12	0.08	0.17	0.07	0.03	0.00	0.02	0.15	0.13	0.36	0.24	0.21
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.02	0.04	0.05	0.04	0.05	0.04	0.05	0.02	0.05	0.02	0.00	0.09	0.05	0.07	0.30	0.13
O5'	0.14	0.27	0.16	0.19	0.31	0.03	0.41	0.01	0.41	0.44	0.35	0.24	0.23	0.48	0.30	0.07	0.15	0.09	0.00	0.46	0.02	0.02	0.01
O6	0.03	0.01	0.07	0.10	0.02	0.08	0.02	0.14	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.09	0.13	0.05	0.46	0.00	0.40	0.39	0.38
OP1	0.13	0.24	0.23	0.30	0.26	0.12	0.34	0.14	0.36	0.34	0.30	0.21	0.20	0.40	0.24	0.20	0.36	0.07	0.02	0.40	0.00	0.01	0.01
OP2	0.20	0.25	0.13	0.14	0.23	0.23	0.31	0.25	0.34	0.25	0.30	0.24	0.22	0.35	0.20	0.16	0.24	0.30	0.02	0.39	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.19	0.10	0.16	0.21	0.05	0.31	0.02	0.33	0.30	0.26	0.17	0.16	0.37	0.19	0.07	0.21	0.13	0.01	0.38	0.01	0.01	0.00