Doublet Group distance statistics: 48949

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 6, 2, 0, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, -0.001, 0.007, 0.015, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.007 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.000, 0.008, 0.016, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.008 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.000, 0.012, 0.024, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.012 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.001, 0.016, 0.031, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.016 std_dev=0.015
C6	A	0, -0.001, 0.016, 0.033, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.016 std_dev=0.017
C1'	A	0, 0.001, 0.018, 0.035, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.018 std_dev=0.017
C2	A	0, -0.001, 0.017, 0.035, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.017 std_dev=0.018
O2	A	0, 0.000, 0.039, 0.077, 0.118 max_d=0.118 avg_d=0.039 std_dev=0.039
O4'	A	0, 0.029, 0.081, 0.133, 0.174 max_d=0.174 avg_d=0.081 std_dev=0.052
O4	A	0, 0.007, 0.091, 0.175, 0.250 max_d=0.250 avg_d=0.091 std_dev=0.084
C2'	A	0, 0.022, 0.115, 0.207, 0.337 max_d=0.337 avg_d=0.115 std_dev=0.093
C3'	A	0, 0.029, 0.146, 0.264, 0.431 max_d=0.431 avg_d=0.146 std_dev=0.117
C4'	A	0, 0.024, 0.164, 0.305, 0.509 max_d=0.509 avg_d=0.164 std_dev=0.140
O6	B	0, 0.136, 0.279, 0.423, 0.547 max_d=0.547 avg_d=0.279 std_dev=0.143
C6	B	0, 0.129, 0.282, 0.434, 0.586 max_d=0.586 avg_d=0.282 std_dev=0.152
N7	B	0, 0.117, 0.275, 0.434, 0.585 max_d=0.585 avg_d=0.275 std_dev=0.159
O3'	A	0, 0.066, 0.225, 0.385, 0.527 max_d=0.527 avg_d=0.225 std_dev=0.159
C5	B	0, 0.108, 0.272, 0.436, 0.588 max_d=0.588 avg_d=0.272 std_dev=0.164
N1	B	0, 0.145, 0.320, 0.494, 0.714 max_d=0.714 avg_d=0.320 std_dev=0.175
O2'	A	0, -0.007, 0.179, 0.365, 0.648 max_d=0.648 avg_d=0.179 std_dev=0.186
C8	B	0, 0.108, 0.299, 0.490, 0.705 max_d=0.705 avg_d=0.299 std_dev=0.191
C4	B	0, 0.108, 0.299, 0.491, 0.700 max_d=0.700 avg_d=0.299 std_dev=0.192
C2	B	0, 0.142, 0.346, 0.549, 0.808 max_d=0.808 avg_d=0.346 std_dev=0.203
N9	B	0, 0.108, 0.314, 0.519, 0.769 max_d=0.769 avg_d=0.314 std_dev=0.205
N3	B	0, 0.128, 0.335, 0.543, 0.785 max_d=0.785 avg_d=0.335 std_dev=0.207
C2'	B	0, 0.107, 0.342, 0.577, 0.904 max_d=0.904 avg_d=0.342 std_dev=0.235
N2	B	0, 0.164, 0.400, 0.637, 0.944 max_d=0.944 avg_d=0.400 std_dev=0.236
C1'	B	0, 0.105, 0.360, 0.614, 0.985 max_d=0.985 avg_d=0.360 std_dev=0.255
OP1	B	0, 0.041, 0.309, 0.577, 1.072 max_d=1.072 avg_d=0.309 std_dev=0.268
O5'	A	0, 0.004, 0.290, 0.575, 1.037 max_d=1.037 avg_d=0.290 std_dev=0.286
P	B	0, 0.011, 0.319, 0.628, 1.091 max_d=1.091 avg_d=0.319 std_dev=0.308
C5'	A	0, -0.034, 0.291, 0.616, 1.303 max_d=1.303 avg_d=0.291 std_dev=0.325
C3'	B	0, 0.015, 0.461, 0.907, 1.813 max_d=1.813 avg_d=0.461 std_dev=0.446
O5'	B	0, -0.084, 0.388, 0.860, 1.879 max_d=1.879 avg_d=0.388 std_dev=0.472
O4'	B	0, -0.069, 0.411, 0.892, 1.921 max_d=1.921 avg_d=0.411 std_dev=0.480
O2'	B	0, 0.008, 0.510, 1.013, 1.773 max_d=1.773 avg_d=0.510 std_dev=0.503
P	A	0, -0.154, 0.383, 0.920, 2.123 max_d=2.123 avg_d=0.383 std_dev=0.537
OP2	B	0, -0.134, 0.437, 1.008, 2.218 max_d=2.218 avg_d=0.437 std_dev=0.571
C4'	B	0, -0.142, 0.470, 1.082, 2.480 max_d=2.480 avg_d=0.470 std_dev=0.612
O3'	B	0, -0.099, 0.583, 1.265, 2.778 max_d=2.778 avg_d=0.583 std_dev=0.682
C5'	B	0, -0.282, 0.515, 1.313, 3.151 max_d=3.151 avg_d=0.515 std_dev=0.797
OP1	A	0, -0.394, 0.517, 1.428, 3.568 max_d=3.568 avg_d=0.517 std_dev=0.911
OP2	A	0, -0.502, 0.509, 1.519, 3.972 max_d=3.972 avg_d=0.509 std_dev=1.011

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.05	0.01	0.00	0.23	0.27	0.33	0.08
C2	0.02	0.00	0.05	0.04	0.00	0.05	0.01	0.21	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.05	0.01	0.01	0.26	0.14	0.59	0.20
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.05	0.02	0.05	0.06	0.05	0.02	0.05	0.09	0.00	0.03	0.06	0.01	0.18	0.19	0.27	0.08
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.05	0.00	0.07	0.02	0.06	0.02	0.04	0.09	0.02	0.01	0.07	0.01	0.15	0.13	0.17	0.07
C4	0.01	0.00	0.05	0.05	0.00	0.09	0.01	0.30	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.06	0.00	0.03	0.29	0.11	0.82	0.34
C4'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.09	0.00	0.11	0.01	0.10	0.05	0.06	0.05	0.13	0.01	0.10	0.00	0.03	0.34	0.05	0.13
C5	0.01	0.01	0.05	0.07	0.01	0.11	0.00	0.32	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.04	0.29	0.13	0.80	0.34
C5'	0.09	0.21	0.06	0.02	0.30	0.01	0.32	0.00	0.28	0.21	0.26	0.17	0.07	0.11	0.31	0.02	0.01	0.06	0.02	0.02
C6	0.02	0.01	0.05	0.06	0.00	0.10	0.00	0.28	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.04	0.28	0.09	0.66	0.26
N1	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.05	0.00	0.21	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.26	0.15	0.54	0.18
N3	0.02	0.00	0.05	0.04	0.00	0.06	0.01	0.26	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.05	0.00	0.01	0.27	0.08	0.72	0.27
O2	0.04	0.00	0.09	0.09	0.01	0.05	0.01	0.17	0.01	0.01	0.01	0.00	0.13	0.10	0.01	0.03	0.24	0.20	0.51	0.15
O2'	0.02	0.08	0.00	0.02	0.05	0.13	0.03	0.07	0.03	0.02	0.08	0.13	0.00	0.07	0.06	0.05	0.19	0.24	0.20	0.06
O3'	0.05	0.05	0.03	0.01	0.06	0.01	0.07	0.11	0.06	0.03	0.05	0.10	0.07	0.00	0.08	0.06	0.08	0.19	0.07	0.06
O4	0.01	0.01	0.06	0.07	0.00	0.10	0.01	0.31	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.08	0.00	0.04	0.29	0.17	0.89	0.38
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.02	0.04	0.01	0.01	0.03	0.05	0.06	0.04	0.00	0.21	0.35	0.22	0.06
O5'	0.23	0.26	0.18	0.15	0.29	0.03	0.29	0.01	0.28	0.26	0.27	0.24	0.19	0.08	0.29	0.21	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.27	0.14	0.19	0.13	0.11	0.34	0.13	0.06	0.09	0.15	0.08	0.20	0.24	0.19	0.17	0.35	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.33	0.59	0.27	0.17	0.82	0.05	0.80	0.02	0.66	0.54	0.72	0.51	0.20	0.07	0.89	0.22	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.20	0.08	0.07	0.34	0.13	0.34	0.02	0.26	0.18	0.27	0.15	0.06	0.06	0.38	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.14	0.11	0.10	0.12	0.12	0.12	0.29	0.13	0.12	0.13	0.15	0.13	0.12	0.12	0.10	0.12	0.09	0.08	0.15	0.05	0.06	0.02
C2	0.05	0.10	0.09	0.16	0.05	0.27	0.08	0.37	0.12	0.08	0.12	0.12	0.07	0.09	0.05	0.06	0.28	0.22	0.13	0.15	0.05	0.20	0.09
C2'	0.21	0.20	0.09	0.08	0.21	0.09	0.22	0.32	0.22	0.22	0.21	0.20	0.20	0.22	0.21	0.15	0.08	0.15	0.09	0.23	0.04	0.11	0.05
C3'	0.20	0.17	0.12	0.09	0.17	0.13	0.19	0.11	0.19	0.20	0.18	0.17	0.17	0.20	0.19	0.10	0.10	0.26	0.14	0.21	0.04	0.08	0.03
C4	0.10	0.08	0.10	0.11	0.09	0.19	0.05	0.20	0.05	0.07	0.06	0.09	0.10	0.05	0.09	0.09	0.23	0.21	0.07	0.10	0.05	0.27	0.10
C4'	0.21	0.19	0.11	0.10	0.20	0.14	0.23	0.08	0.23	0.24	0.21	0.19	0.19	0.25	0.21	0.11	0.11	0.25	0.23	0.26	0.03	0.16	0.09
C5	0.10	0.08	0.15	0.12	0.09	0.14	0.06	0.16	0.05	0.08	0.06	0.08	0.10	0.06	0.10	0.16	0.17	0.15	0.11	0.09	0.08	0.23	0.09
C5'	0.31	0.37	0.14	0.24	0.37	0.28	0.41	0.21	0.43	0.38	0.40	0.36	0.35	0.42	0.35	0.17	0.25	0.35	0.33	0.47	0.11	0.10	0.04
C6	0.10	0.08	0.16	0.13	0.08	0.14	0.06	0.18	0.07	0.08	0.08	0.09	0.10	0.06	0.09	0.15	0.15	0.12	0.13	0.11	0.07	0.17	0.07
N1	0.07	0.11	0.12	0.12	0.07	0.17	0.08	0.27	0.11	0.06	0.11	0.12	0.09	0.08	0.06	0.07	0.18	0.11	0.09	0.14	0.03	0.14	0.04
N3	0.10	0.08	0.09	0.15	0.07	0.27	0.06	0.32	0.09	0.08	0.09	0.09	0.08	0.08	0.08	0.07	0.30	0.26	0.12	0.13	0.04	0.25	0.10
O2	0.08	0.13	0.10	0.23	0.09	0.37	0.12	0.51	0.14	0.12	0.15	0.16	0.09	0.13	0.09	0.14	0.36	0.28	0.22	0.16	0.11	0.20	0.13
O2'	0.35	0.28	0.16	0.12	0.29	0.14	0.27	0.42	0.26	0.28	0.26	0.28	0.30	0.26	0.31	0.36	0.13	0.26	0.12	0.25	0.09	0.10	0.07
O3'	0.18	0.17	0.18	0.08	0.17	0.12	0.18	0.16	0.19	0.19	0.18	0.17	0.17	0.20	0.17	0.10	0.07	0.30	0.02	0.20	0.01	0.02	0.01
O4	0.12	0.12	0.10	0.10	0.11	0.18	0.09	0.17	0.09	0.09	0.10	0.12	0.13	0.07	0.11	0.12	0.24	0.22	0.07	0.12	0.08	0.31	0.13
O4'	0.14	0.12	0.13	0.08	0.10	0.07	0.10	0.17	0.11	0.11	0.11	0.13	0.11	0.11	0.11	0.11	0.06	0.13	0.15	0.13	0.06	0.11	0.08
O5'	0.07	0.19	0.29	0.16	0.15	0.18	0.16	0.24	0.20	0.07	0.21	0.21	0.17	0.13	0.10	0.37	0.15	0.11	0.30	0.21	0.05	0.15	0.10
OP1	0.15	0.19	0.46	0.22	0.21	0.21	0.27	0.21	0.28	0.25	0.24	0.17	0.18	0.31	0.19	0.56	0.19	0.21	0.24	0.32	0.10	0.13	0.14
OP2	0.43	0.79	0.61	0.21	0.70	0.11	0.78	0.24	0.87	0.57	0.86	0.79	0.71	0.73	0.57	0.77	0.17	0.18	0.23	0.92	0.18	0.24	0.17
P	0.17	0.34	0.42	0.17	0.30	0.16	0.35	0.22	0.39	0.26	0.38	0.33	0.30	0.34	0.25	0.54	0.14	0.10	0.26	0.42	0.07	0.15	0.12

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.04	0.04	0.00	0.00	0.01	0.17	0.00	0.13	0.01	0.19	0.27	0.08
C2	0.04	0.00	0.19	0.08	0.01	0.11	0.01	0.08	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.21	0.21	0.19	0.10	0.01	0.16	0.35	0.14
C2'	0.00	0.19	0.00	0.01	0.10	0.03	0.04	0.11	0.08	0.11	0.14	0.22	0.18	0.06	0.01	0.00	0.02	0.02	0.40	0.06	0.16	0.60	0.34
C3'	0.02	0.08	0.01	0.00	0.09	0.00	0.14	0.02	0.15	0.14	0.11	0.06	0.06	0.17	0.09	0.02	0.00	0.00	0.22	0.18	0.09	0.27	0.15
C4	0.01	0.01	0.10	0.09	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.13	0.10	0.10	0.01	0.17	0.36	0.15
C4'	0.01	0.11	0.03	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.05	0.18	0.05	0.17	0.11	0.17	0.06	0.06	0.01	0.00	0.01	0.10	0.29	0.05	0.13
C5	0.01	0.01	0.04	0.14	0.00	0.08	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.12	0.06	0.03	0.13	0.01	0.19	0.38	0.18
C5'	0.02	0.08	0.11	0.02	0.06	0.00	0.16	0.00	0.15	0.25	0.08	0.13	0.09	0.26	0.09	0.06	0.08	0.02	0.01	0.21	0.06	0.07	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.15	0.01	0.05	0.01	0.15	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.09	0.08	0.06	0.14	0.00	0.19	0.38	0.18
C8	0.01	0.02	0.11	0.14	0.01	0.18	0.01	0.25	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.27	0.04	0.12	0.16	0.03	0.20	0.39	0.19
N1	0.03	0.00	0.14	0.11	0.01	0.05	0.01	0.08	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.11	0.15	0.14	0.11	0.01	0.17	0.37	0.16
N2	0.04	0.00	0.22	0.06	0.01	0.17	0.02	0.13	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.29	0.27	0.24	0.12	0.01	0.16	0.34	0.14
N3	0.04	0.00	0.18	0.06	0.00	0.11	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.22	0.22	0.19	0.12	0.01	0.16	0.34	0.13
N7	0.00	0.01	0.06	0.17	0.01	0.17	0.00	0.26	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.25	0.04	0.07	0.19	0.03	0.21	0.41	0.20
N9	0.00	0.02	0.01	0.09	0.00	0.06	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.10	0.09	0.01	0.10	0.01	0.17	0.35	0.14
O2'	0.01	0.21	0.00	0.02	0.07	0.06	0.12	0.06	0.09	0.27	0.11	0.29	0.22	0.25	0.10	0.00	0.05	0.08	0.37	0.13	0.13	0.63	0.30
O3'	0.17	0.21	0.02	0.00	0.13	0.01	0.06	0.08	0.08	0.04	0.15	0.27	0.22	0.04	0.09	0.05	0.00	0.10	0.12	0.04	0.26	0.12	0.07
O4'	0.00	0.19	0.02	0.00	0.10	0.00	0.03	0.02	0.06	0.12	0.14	0.24	0.19	0.07	0.01	0.08	0.10	0.00	0.10	0.03	0.39	0.13	0.22
O5'	0.13	0.10	0.40	0.22	0.10	0.01	0.13	0.01	0.14	0.16	0.11	0.12	0.12	0.19	0.10	0.37	0.12	0.10	0.00	0.19	0.02	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.06	0.18	0.01	0.10	0.01	0.21	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.13	0.04	0.03	0.19	0.00	0.21	0.37	0.20
OP1	0.19	0.16	0.16	0.09	0.17	0.29	0.19	0.06	0.19	0.20	0.17	0.16	0.16	0.21	0.17	0.13	0.26	0.39	0.02	0.21	0.00	0.01	0.00
OP2	0.27	0.35	0.60	0.27	0.36	0.05	0.38	0.07	0.38	0.39	0.37	0.34	0.34	0.41	0.35	0.63	0.12	0.13	0.01	0.37	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.14	0.34	0.15	0.15	0.13	0.18	0.02	0.18	0.19	0.16	0.14	0.13	0.20	0.14	0.30	0.07	0.22	0.00	0.20	0.00	0.00	0.00