Doublet Group distance statistics: 48957

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C1'	A	0, 0.004, 0.013, 0.022, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.004, 0.014, 0.023, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.014 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.001, 0.011, 0.021, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.011 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.004, 0.015, 0.025, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.015 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.002, 0.014, 0.025, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.014 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.005, 0.019, 0.034, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.019 std_dev=0.014
O2	A	0, 0.005, 0.023, 0.041, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.023 std_dev=0.018
N3	A	0, 0.007, 0.026, 0.045, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.026 std_dev=0.019
O4	A	0, 0.005, 0.025, 0.046, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.025 std_dev=0.020
C2'	A	0, -0.009, 0.172, 0.354, 0.423 max_d=0.423 avg_d=0.172 std_dev=0.182
O4'	A	0, -0.022, 0.168, 0.358, 0.433 max_d=0.433 avg_d=0.168 std_dev=0.190
N1	B	0, 0.008, 0.251, 0.495, 0.581 max_d=0.581 avg_d=0.251 std_dev=0.244
C4'	A	0, -0.018, 0.229, 0.476, 0.572 max_d=0.572 avg_d=0.229 std_dev=0.247
O6	B	0, -0.012, 0.242, 0.497, 0.594 max_d=0.594 avg_d=0.242 std_dev=0.255
O2'	A	0, -0.025, 0.234, 0.494, 0.596 max_d=0.596 avg_d=0.234 std_dev=0.260
C6	B	0, -0.008, 0.254, 0.516, 0.615 max_d=0.615 avg_d=0.254 std_dev=0.262
N2	B	0, 0.034, 0.299, 0.564, 0.643 max_d=0.643 avg_d=0.299 std_dev=0.265
C2	B	0, 0.021, 0.285, 0.550, 0.638 max_d=0.638 avg_d=0.285 std_dev=0.265
N3	B	0, 0.020, 0.306, 0.593, 0.689 max_d=0.689 avg_d=0.306 std_dev=0.287
C5	B	0, 0.001, 0.293, 0.586, 0.693 max_d=0.693 avg_d=0.293 std_dev=0.293
C4	B	0, 0.011, 0.307, 0.603, 0.707 max_d=0.707 avg_d=0.307 std_dev=0.296
C3'	A	0, -0.027, 0.276, 0.578, 0.697 max_d=0.697 avg_d=0.276 std_dev=0.302
O4'	B	0, 0.007, 0.318, 0.629, 0.740 max_d=0.740 avg_d=0.318 std_dev=0.311
N7	B	0, 0.007, 0.325, 0.643, 0.756 max_d=0.756 avg_d=0.325 std_dev=0.318
N9	B	0, 0.010, 0.330, 0.650, 0.764 max_d=0.764 avg_d=0.330 std_dev=0.320
C8	B	0, 0.007, 0.341, 0.675, 0.795 max_d=0.795 avg_d=0.341 std_dev=0.334
C1'	B	0, 0.018, 0.353, 0.688, 0.803 max_d=0.803 avg_d=0.353 std_dev=0.335
OP2	A	0, 0.051, 0.402, 0.752, 0.854 max_d=0.854 avg_d=0.402 std_dev=0.350
C4'	B	0, 0.015, 0.407, 0.799, 0.936 max_d=0.936 avg_d=0.407 std_dev=0.392
C2'	B	0, 0.031, 0.444, 0.858, 0.995 max_d=0.995 avg_d=0.444 std_dev=0.413
OP2	B	0, 0.011, 0.428, 0.845, 0.993 max_d=0.993 avg_d=0.428 std_dev=0.417
C5'	B	0, -0.004, 0.417, 0.839, 0.995 max_d=0.995 avg_d=0.417 std_dev=0.422
O5'	B	0, 0.004, 0.429, 0.853, 1.007 max_d=1.007 avg_d=0.429 std_dev=0.425
O5'	A	0, 0.020, 0.456, 0.891, 1.042 max_d=1.042 avg_d=0.456 std_dev=0.435
O3'	A	0, -0.047, 0.396, 0.840, 1.015 max_d=1.015 avg_d=0.396 std_dev=0.444
P	A	0, 0.019, 0.468, 0.916, 1.072 max_d=1.072 avg_d=0.468 std_dev=0.448
P	B	0, -0.011, 0.438, 0.887, 1.055 max_d=1.055 avg_d=0.438 std_dev=0.449
C5'	A	0, -0.043, 0.407, 0.856, 1.033 max_d=1.033 avg_d=0.407 std_dev=0.449
OP1	B	0, -0.001, 0.457, 0.916, 1.084 max_d=1.084 avg_d=0.457 std_dev=0.459
O2'	B	0, 0.042, 0.505, 0.968, 1.118 max_d=1.118 avg_d=0.505 std_dev=0.463
C3'	B	0, 0.029, 0.494, 0.959, 1.117 max_d=1.117 avg_d=0.494 std_dev=0.465
OP1	A	0, -0.017, 0.530, 1.077, 1.283 max_d=1.283 avg_d=0.530 std_dev=0.547
O3'	B	0, 0.041, 0.598, 1.154, 1.340 max_d=1.340 avg_d=0.598 std_dev=0.557

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.03	0.09	0.07
C2	0.01	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.03	0.00	0.02	0.02	0.03	0.08	0.04
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.05	0.11	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.07	0.02	0.01
C3'	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.00	0.11	0.01	0.12	0.04	0.02	0.07	0.02	0.00	0.06	0.01	0.03	0.12	0.09	0.06
C4	0.01	0.00	0.02	0.07	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.06	0.00	0.02	0.08	0.05	0.07	0.04
C4'	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.06	0.03	0.03	0.02	0.03	0.02	0.05	0.00	0.02	0.07	0.02	0.02
C5	0.02	0.01	0.02	0.11	0.01	0.06	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.01	0.05	0.10	0.07	0.05	0.05
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.09	0.01	0.10	0.00	0.09	0.05	0.07	0.01	0.01	0.00	0.09	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.03	0.12	0.01	0.06	0.00	0.09	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.12	0.01	0.06	0.08	0.07	0.05	0.03
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.03	0.00	0.01	0.02	0.04	0.07	0.03
N3	0.01	0.00	0.05	0.02	0.00	0.03	0.01	0.07	0.02	0.01	0.00	0.01	0.09	0.01	0.00	0.02	0.05	0.04	0.08	0.03
O2	0.00	0.01	0.11	0.07	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.15	0.10	0.00	0.03	0.03	0.02	0.10	0.06
O2'	0.00	0.09	0.00	0.02	0.05	0.03	0.01	0.01	0.01	0.04	0.09	0.15	0.00	0.01	0.06	0.04	0.00	0.12	0.03	0.02
O3'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.06	0.02	0.12	0.00	0.12	0.03	0.01	0.10	0.01	0.00	0.06	0.01	0.06	0.20	0.18	0.13
O4	0.01	0.00	0.03	0.06	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.06	0.00	0.03	0.08	0.05	0.08	0.04
O4'	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.05	0.02	0.06	0.01	0.02	0.03	0.04	0.01	0.03	0.00	0.10	0.04	0.16	0.13
O5'	0.04	0.02	0.02	0.03	0.08	0.02	0.10	0.01	0.08	0.02	0.05	0.03	0.00	0.06	0.08	0.10	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.03	0.03	0.07	0.12	0.05	0.07	0.07	0.03	0.07	0.04	0.04	0.02	0.12	0.20	0.05	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.08	0.02	0.09	0.07	0.02	0.05	0.02	0.05	0.07	0.08	0.10	0.03	0.18	0.08	0.16	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.04	0.01	0.06	0.04	0.02	0.05	0.01	0.03	0.03	0.03	0.06	0.02	0.13	0.04	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.09	0.14	0.09	0.11	0.04	0.14	0.08	0.15	0.08	0.12	0.03	0.21	0.15	0.18	0.02	0.12	0.12	0.13	0.14	0.15	0.04	0.05	0.04
C2	0.04	0.12	0.03	0.05	0.02	0.07	0.13	0.09	0.13	0.15	0.01	0.21	0.12	0.21	0.03	0.04	0.04	0.06	0.10	0.19	0.03	0.02	0.03
C2'	0.02	0.06	0.05	0.09	0.01	0.10	0.09	0.15	0.08	0.13	0.01	0.10	0.07	0.16	0.02	0.06	0.10	0.07	0.15	0.13	0.08	0.01	0.07
C3'	0.03	0.10	0.02	0.01	0.02	0.00	0.04	0.03	0.01	0.13	0.06	0.14	0.08	0.13	0.03	0.02	0.01	0.02	0.04	0.04	0.01	0.07	0.00
C4	0.07	0.15	0.05	0.08	0.05	0.09	0.06	0.13	0.08	0.07	0.05	0.23	0.14	0.13	0.03	0.05	0.07	0.09	0.16	0.17	0.10	0.08	0.11
C4'	0.00	0.12	0.01	0.02	0.02	0.03	0.07	0.06	0.05	0.15	0.05	0.18	0.11	0.18	0.03	0.03	0.03	0.02	0.03	0.11	0.05	0.14	0.03
C5	0.11	0.19	0.10	0.13	0.11	0.14	0.02	0.17	0.01	0.03	0.11	0.24	0.18	0.08	0.08	0.10	0.13	0.13	0.21	0.10	0.14	0.12	0.16
C5'	0.04	0.12	0.06	0.05	0.01	0.03	0.08	0.02	0.04	0.19	0.06	0.19	0.10	0.21	0.06	0.04	0.06	0.02	0.05	0.09	0.14	0.23	0.10
C6	0.12	0.19	0.12	0.15	0.11	0.16	0.02	0.19	0.02	0.04	0.10	0.24	0.19	0.10	0.09	0.12	0.15	0.15	0.21	0.10	0.13	0.09	0.15
N1	0.08	0.14	0.07	0.09	0.04	0.11	0.08	0.14	0.08	0.11	0.04	0.21	0.15	0.18	0.02	0.08	0.09	0.11	0.15	0.16	0.07	0.01	0.07
N3	0.03	0.11	0.02	0.04	0.02	0.06	0.13	0.09	0.14	0.13	0.02	0.21	0.11	0.19	0.03	0.02	0.03	0.06	0.11	0.20	0.05	0.02	0.06
O2	0.03	0.07	0.03	0.02	0.07	0.03	0.17	0.04	0.16	0.20	0.04	0.17	0.07	0.24	0.09	0.02	0.01	0.02	0.05	0.20	0.03	0.08	0.04
O2'	0.01	0.01	0.04	0.09	0.04	0.11	0.10	0.17	0.10	0.12	0.05	0.05	0.02	0.15	0.05	0.05	0.12	0.04	0.14	0.14	0.10	0.01	0.07
O3'	0.08	0.06	0.06	0.04	0.01	0.07	0.02	0.04	0.01	0.10	0.05	0.09	0.04	0.07	0.05	0.06	0.03	0.09	0.02	0.01	0.00	0.03	0.01
O4	0.06	0.14	0.04	0.06	0.04	0.08	0.05	0.11	0.07	0.06	0.05	0.22	0.12	0.11	0.02	0.04	0.06	0.08	0.15	0.16	0.10	0.08	0.11
O4'	0.04	0.11	0.04	0.06	0.01	0.09	0.13	0.11	0.12	0.18	0.01	0.19	0.12	0.25	0.03	0.07	0.07	0.08	0.07	0.21	0.02	0.14	0.02
O5'	0.03	0.12	0.04	0.03	0.01	0.02	0.06	0.03	0.03	0.16	0.07	0.18	0.09	0.19	0.04	0.02	0.03	0.01	0.02	0.08	0.05	0.13	0.03
OP1	0.02	0.10	0.03	0.03	0.04	0.05	0.06	0.08	0.04	0.10	0.05	0.14	0.09	0.13	0.03	0.03	0.04	0.04	0.05	0.09	0.05	0.06	0.07
OP2	0.02	0.07	0.02	0.06	0.03	0.07	0.03	0.12	0.03	0.06	0.04	0.10	0.06	0.09	0.01	0.02	0.07	0.04	0.13	0.08	0.15	0.11	0.16
P	0.01	0.10	0.03	0.01	0.02	0.02	0.05	0.06	0.03	0.12	0.05	0.14	0.08	0.14	0.03	0.02	0.02	0.01	0.05	0.08	0.04	0.04	0.06

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.04	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.01	0.06	0.03	0.02
C2	0.03	0.00	0.02	0.02	0.02	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.06	0.15	0.02	0.14	0.14	0.13
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.06	0.01	0.03	0.03	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.08	0.04	0.02
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.04	0.08	0.03	0.01	0.01	0.08	0.04	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.09	0.05	0.03
C4	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.12	0.02	0.11	0.10	0.09
C4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.04	0.06	0.04	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01
C5	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.11	0.11	0.09
C5'	0.02	0.10	0.02	0.01	0.06	0.00	0.06	0.00	0.06	0.03	0.08	0.11	0.09	0.04	0.05	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.03	0.00	0.01
C6	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.02	0.00	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.12	0.01	0.11	0.12	0.10
C8	0.00	0.01	0.06	0.08	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.05	0.09	0.04	0.09	0.02	0.08	0.05	0.03
N1	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.02	0.04	0.14	0.01	0.13	0.14	0.12
N2	0.04	0.00	0.03	0.01	0.02	0.06	0.01	0.11	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.07	0.03	0.08	0.16	0.02	0.16	0.16	0.15
N3	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.04	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.02	0.06	0.14	0.02	0.13	0.12	0.11
N7	0.00	0.01	0.05	0.08	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.09	0.03	0.10	0.02	0.09	0.08	0.06
N9	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.10	0.02	0.09	0.07	0.05
O2'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.05	0.03	0.07	0.06	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.08	0.04	0.02
O3'	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.03	0.09	0.02	0.03	0.02	0.09	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.10	0.05	0.03
O4'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.04	0.08	0.06	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.01
O5'	0.05	0.15	0.04	0.02	0.12	0.01	0.12	0.01	0.12	0.09	0.14	0.16	0.14	0.10	0.10	0.03	0.01	0.04	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.01	0.01	0.05	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.04	0.01	0.10	0.00	0.10	0.11	0.09
OP1	0.06	0.14	0.08	0.09	0.11	0.04	0.11	0.03	0.11	0.08	0.13	0.16	0.13	0.09	0.09	0.08	0.10	0.03	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00
OP2	0.03	0.14	0.04	0.05	0.10	0.00	0.11	0.00	0.12	0.05	0.14	0.16	0.12	0.08	0.07	0.04	0.05	0.01	0.01	0.11	0.01	0.00	0.00
P	0.02	0.13	0.02	0.03	0.09	0.01	0.09	0.01	0.10	0.03	0.12	0.15	0.11	0.06	0.05	0.02	0.03	0.01	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00