Doublet Group distance statistics: 48962

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 10, 26, 25, 19, 19, 4, 6, 4, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.004, 0.009, 0.014, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.009 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.009, 0.017, 0.025, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.017 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.001, 0.010, 0.020, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.010 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.012, 0.022, 0.032, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.022 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.013, 0.023, 0.033, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.023 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.014, 0.024, 0.034, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.024 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.012, 0.022, 0.033, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.022 std_dev=0.010
O2	A	0, 0.032, 0.056, 0.080, 0.124 max_d=0.124 avg_d=0.056 std_dev=0.024
O4	A	0, 0.057, 0.109, 0.161, 0.239 max_d=0.239 avg_d=0.109 std_dev=0.052
O4'	A	0, 0.221, 0.360, 0.499, 0.612 max_d=0.612 avg_d=0.360 std_dev=0.139
C2'	A	0, 0.270, 0.431, 0.592, 0.770 max_d=0.770 avg_d=0.431 std_dev=0.161
N3	B	0, 0.219, 0.383, 0.547, 0.880 max_d=0.880 avg_d=0.383 std_dev=0.164
C4	B	0, 0.211, 0.378, 0.546, 0.866 max_d=0.866 avg_d=0.378 std_dev=0.167
C6	B	0, 0.290, 0.467, 0.644, 0.917 max_d=0.917 avg_d=0.467 std_dev=0.177
C5	B	0, 0.276, 0.456, 0.635, 0.922 max_d=0.922 avg_d=0.456 std_dev=0.179
C4'	A	0, 0.357, 0.554, 0.751, 0.940 max_d=0.940 avg_d=0.554 std_dev=0.197
O2'	A	0, 0.329, 0.534, 0.739, 1.019 max_d=1.019 avg_d=0.534 std_dev=0.205
C2	B	0, 0.198, 0.412, 0.625, 0.994 max_d=0.994 avg_d=0.412 std_dev=0.213
N1	B	0, 0.216, 0.430, 0.643, 1.041 max_d=1.041 avg_d=0.430 std_dev=0.214
C3'	A	0, 0.413, 0.656, 0.899, 1.161 max_d=1.161 avg_d=0.656 std_dev=0.243
N4	B	0, 0.291, 0.554, 0.817, 1.294 max_d=1.294 avg_d=0.554 std_dev=0.263
O2	B	0, 0.309, 0.620, 0.931, 1.439 max_d=1.439 avg_d=0.620 std_dev=0.311
C1'	B	0, 0.338, 0.659, 0.981, 1.665 max_d=1.665 avg_d=0.659 std_dev=0.322
O4'	B	0, 0.418, 0.749, 1.080, 1.780 max_d=1.780 avg_d=0.749 std_dev=0.331
C5'	A	0, 0.758, 1.112, 1.466, 1.735 max_d=1.735 avg_d=1.112 std_dev=0.354
O3'	A	0, 0.559, 0.916, 1.273, 1.741 max_d=1.741 avg_d=0.916 std_dev=0.357
O5'	B	0, 0.533, 0.907, 1.282, 1.813 max_d=1.813 avg_d=0.907 std_dev=0.375
OP2	B	0, 0.585, 0.996, 1.407, 1.999 max_d=1.999 avg_d=0.996 std_dev=0.411
C4'	B	0, 0.494, 0.906, 1.317, 2.061 max_d=2.061 avg_d=0.906 std_dev=0.412
C2'	B	0, 0.382, 0.797, 1.213, 2.055 max_d=2.055 avg_d=0.797 std_dev=0.415
P	B	0, 0.564, 0.984, 1.404, 2.061 max_d=2.061 avg_d=0.984 std_dev=0.420
C5'	B	0, 0.569, 0.992, 1.415, 2.035 max_d=2.035 avg_d=0.992 std_dev=0.423
C3'	B	0, 0.433, 0.888, 1.344, 2.210 max_d=2.210 avg_d=0.888 std_dev=0.455
O5'	A	0, 1.041, 1.517, 1.993, 3.104 max_d=3.104 avg_d=1.517 std_dev=0.476
O2'	B	0, 0.516, 1.026, 1.536, 2.491 max_d=2.491 avg_d=1.026 std_dev=0.510
OP1	B	0, 0.726, 1.271, 1.816, 2.898 max_d=2.898 avg_d=1.271 std_dev=0.545
O3'	B	0, 0.535, 1.151, 1.767, 2.740 max_d=2.740 avg_d=1.151 std_dev=0.616
P	A	0, 1.332, 1.978, 2.624, 3.848 max_d=3.848 avg_d=1.978 std_dev=0.646
OP1	A	0, 1.061, 1.791, 2.522, 4.070 max_d=4.070 avg_d=1.791 std_dev=0.730
OP2	A	0, 1.721, 2.463, 3.204, 5.046 max_d=5.046 avg_d=2.463 std_dev=0.742

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.02	0.01	0.10	0.13	0.20	0.12
C2	0.02	0.00	0.06	0.06	0.01	0.04	0.02	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.08	0.02	0.02	0.17	0.16	0.23	0.16
C2'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.04	0.01	0.06	0.02	0.07	0.02	0.05	0.12	0.00	0.02	0.05	0.01	0.10	0.19	0.18	0.10
C3'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.08	0.00	0.11	0.02	0.11	0.04	0.07	0.11	0.02	0.01	0.09	0.01	0.12	0.23	0.19	0.12
C4	0.02	0.01	0.04	0.08	0.00	0.08	0.01	0.18	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.10	0.01	0.04	0.22	0.22	0.30	0.23
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.08	0.00	0.10	0.01	0.09	0.04	0.05	0.05	0.05	0.02	0.09	0.00	0.02	0.12	0.17	0.06
C5	0.02	0.02	0.06	0.11	0.01	0.10	0.00	0.20	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.14	0.01	0.05	0.23	0.21	0.30	0.22
C5'	0.03	0.10	0.02	0.02	0.18	0.01	0.20	0.00	0.17	0.10	0.14	0.08	0.05	0.04	0.20	0.01	0.01	0.11	0.15	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.11	0.01	0.09	0.00	0.17	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.13	0.01	0.05	0.20	0.16	0.24	0.17
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.02	0.15	0.14	0.21	0.14
N3	0.02	0.00	0.05	0.07	0.01	0.05	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.08	0.01	0.03	0.20	0.19	0.27	0.19
O2	0.03	0.01	0.12	0.11	0.02	0.05	0.02	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.13	0.14	0.02	0.04	0.15	0.16	0.23	0.15
O2'	0.02	0.07	0.00	0.02	0.04	0.05	0.04	0.05	0.05	0.02	0.06	0.13	0.00	0.04	0.05	0.03	0.06	0.20	0.19	0.10
O3'	0.02	0.08	0.02	0.01	0.10	0.02	0.14	0.04	0.13	0.05	0.08	0.14	0.04	0.00	0.12	0.02	0.13	0.32	0.27	0.19
O4	0.02	0.02	0.05	0.09	0.01	0.09	0.01	0.20	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.12	0.00	0.04	0.24	0.25	0.34	0.25
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.03	0.04	0.03	0.02	0.04	0.00	0.10	0.13	0.25	0.16
O5'	0.10	0.17	0.10	0.12	0.22	0.02	0.23	0.01	0.20	0.15	0.20	0.15	0.06	0.13	0.24	0.10	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.13	0.16	0.19	0.23	0.22	0.12	0.21	0.11	0.16	0.14	0.19	0.16	0.20	0.32	0.25	0.13	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.20	0.23	0.18	0.19	0.30	0.17	0.30	0.15	0.24	0.21	0.27	0.23	0.19	0.27	0.34	0.25	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.16	0.10	0.12	0.23	0.06	0.22	0.02	0.17	0.14	0.19	0.15	0.10	0.19	0.25	0.16	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.19	0.17	0.14	0.20	0.18	0.21	0.20	0.18	0.16	0.20	0.25	0.22	0.24	0.15	0.20	0.16	0.04	0.09	0.05
C2	0.24	0.20	0.22	0.18	0.17	0.21	0.18	0.21	0.18	0.18	0.19	0.24	0.25	0.27	0.18	0.23	0.17	0.10	0.16	0.10
C2'	0.17	0.18	0.14	0.13	0.21	0.16	0.22	0.20	0.18	0.16	0.20	0.24	0.19	0.19	0.15	0.17	0.18	0.07	0.11	0.09
C3'	0.15	0.18	0.11	0.12	0.23	0.11	0.24	0.14	0.19	0.16	0.21	0.26	0.17	0.13	0.14	0.15	0.05	0.03	0.06	0.02
C4	0.22	0.20	0.19	0.18	0.14	0.20	0.17	0.21	0.19	0.19	0.19	0.20	0.24	0.22	0.18	0.22	0.20	0.17	0.25	0.17
C4'	0.15	0.18	0.10	0.11	0.24	0.12	0.24	0.16	0.19	0.15	0.21	0.29	0.18	0.15	0.14	0.16	0.05	0.08	0.12	0.05
C5	0.20	0.18	0.16	0.17	0.16	0.19	0.16	0.21	0.18	0.17	0.19	0.23	0.21	0.19	0.18	0.21	0.22	0.20	0.27	0.20
C5'	0.17	0.24	0.14	0.15	0.32	0.12	0.31	0.14	0.24	0.20	0.29	0.38	0.23	0.15	0.18	0.16	0.07	0.16	0.23	0.13
C6	0.19	0.18	0.16	0.16	0.18	0.19	0.18	0.21	0.17	0.16	0.19	0.24	0.20	0.19	0.17	0.21	0.20	0.17	0.22	0.17
N1	0.21	0.18	0.17	0.14	0.19	0.18	0.19	0.19	0.17	0.16	0.19	0.25	0.22	0.22	0.14	0.21	0.16	0.08	0.14	0.09
N3	0.25	0.21	0.22	0.19	0.15	0.22	0.17	0.21	0.20	0.20	0.19	0.22	0.26	0.27	0.19	0.24	0.19	0.13	0.20	0.13
O2	0.28	0.21	0.27	0.23	0.19	0.26	0.19	0.25	0.20	0.19	0.21	0.24	0.27	0.34	0.24	0.27	0.20	0.15	0.17	0.14
O2'	0.22	0.21	0.21	0.21	0.22	0.23	0.22	0.27	0.21	0.20	0.22	0.24	0.24	0.26	0.23	0.22	0.24	0.12	0.12	0.12
O3'	0.16	0.18	0.14	0.16	0.22	0.13	0.23	0.16	0.20	0.17	0.20	0.25	0.17	0.15	0.19	0.17	0.01	0.02	0.02	0.01
O4	0.24	0.23	0.21	0.20	0.16	0.22	0.20	0.22	0.21	0.22	0.22	0.19	0.27	0.24	0.21	0.23	0.22	0.21	0.28	0.20
O4'	0.18	0.18	0.14	0.11	0.21	0.15	0.21	0.18	0.17	0.15	0.20	0.27	0.21	0.21	0.13	0.18	0.10	0.05	0.10	0.03
O5'	0.26	0.33	0.25	0.24	0.41	0.19	0.41	0.18	0.34	0.31	0.37	0.46	0.31	0.23	0.25	0.23	0.20	0.20	0.29	0.20
OP1	0.36	0.41	0.40	0.41	0.49	0.36	0.47	0.36	0.42	0.39	0.45	0.54	0.39	0.37	0.44	0.34	0.38	0.44	0.49	0.41
OP2	0.37	0.45	0.40	0.40	0.53	0.34	0.49	0.33	0.42	0.41	0.50	0.60	0.44	0.37	0.42	0.33	0.36	0.42	0.46	0.38
P	0.29	0.37	0.31	0.31	0.47	0.24	0.44	0.24	0.37	0.34	0.43	0.53	0.35	0.27	0.32	0.26	0.26	0.31	0.39	0.28

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.02	0.01	0.07	0.07	0.17	0.08
C2	0.02	0.00	0.08	0.10	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.08	0.11	0.03	0.15	0.14	0.24	0.15
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.05	0.01	0.06	0.02	0.07	0.02	0.07	0.06	0.14	0.00	0.02	0.01	0.11	0.13	0.12	0.08
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.10	0.00	0.11	0.02	0.11	0.06	0.11	0.11	0.14	0.02	0.01	0.02	0.16	0.18	0.11	0.13
C4	0.02	0.01	0.05	0.10	0.00	0.07	0.00	0.15	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.05	0.12	0.04	0.20	0.22	0.30	0.22
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.08	0.04	0.06	0.08	0.05	0.05	0.02	0.00	0.02	0.07	0.13	0.02
C5	0.02	0.01	0.06	0.11	0.00	0.08	0.00	0.16	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.14	0.04	0.21	0.22	0.29	0.22
C5'	0.02	0.09	0.02	0.02	0.15	0.01	0.16	0.00	0.14	0.09	0.12	0.17	0.07	0.06	0.04	0.01	0.01	0.08	0.15	0.01
C6	0.02	0.01	0.07	0.11	0.01	0.08	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.13	0.04	0.17	0.16	0.23	0.17
N1	0.01	0.01	0.02	0.06	0.02	0.04	0.01	0.09	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.06	0.02	0.13	0.12	0.21	0.13
N3	0.02	0.01	0.07	0.11	0.00	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.12	0.03	0.18	0.19	0.28	0.19
N4	0.03	0.02	0.06	0.11	0.01	0.08	0.01	0.17	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.06	0.14	0.04	0.22	0.26	0.33	0.25
O2	0.03	0.01	0.14	0.14	0.02	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.14	0.17	0.05	0.13	0.13	0.22	0.13
O2'	0.01	0.08	0.00	0.02	0.05	0.05	0.05	0.06	0.05	0.03	0.08	0.06	0.14	0.00	0.05	0.05	0.07	0.13	0.11	0.06
O3'	0.02	0.11	0.02	0.01	0.12	0.02	0.14	0.04	0.13	0.06	0.12	0.14	0.17	0.05	0.00	0.02	0.17	0.25	0.16	0.18
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.03	0.04	0.05	0.05	0.02	0.00	0.08	0.08	0.19	0.11
O5'	0.07	0.15	0.11	0.16	0.20	0.02	0.21	0.01	0.17	0.13	0.18	0.22	0.13	0.07	0.17	0.08	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.07	0.14	0.13	0.18	0.22	0.07	0.22	0.08	0.16	0.12	0.19	0.26	0.13	0.13	0.25	0.08	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.17	0.24	0.12	0.11	0.30	0.13	0.29	0.15	0.23	0.21	0.28	0.33	0.22	0.11	0.16	0.19	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.15	0.08	0.13	0.22	0.02	0.22	0.01	0.17	0.13	0.19	0.25	0.13	0.06	0.18	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00