Doublet Group distance statistics: 48965

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 3, 1, 2, 8, 7, 6, 0, 2, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, -0.001, 0.009, 0.019, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.009 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.000, 0.010, 0.021, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.010 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.003, 0.014, 0.024, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.014 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.006, 0.018, 0.029, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.018 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.006, 0.019, 0.031, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.019 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.004, 0.019, 0.034, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.019 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.001, 0.018, 0.034, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.018 std_dev=0.016
O4	A	0, 0.034, 0.097, 0.160, 0.277 max_d=0.277 avg_d=0.097 std_dev=0.063
O2	A	0, -0.022, 0.048, 0.118, 0.420 max_d=0.420 avg_d=0.048 std_dev=0.070
C2'	A	0, 0.029, 0.130, 0.231, 0.494 max_d=0.494 avg_d=0.130 std_dev=0.101
O4'	A	0, 0.025, 0.126, 0.226, 0.503 max_d=0.503 avg_d=0.126 std_dev=0.101
O2'	A	0, 0.046, 0.186, 0.325, 0.690 max_d=0.690 avg_d=0.186 std_dev=0.140
C3'	A	0, 0.059, 0.219, 0.378, 0.827 max_d=0.827 avg_d=0.219 std_dev=0.159
C4'	A	0, 0.037, 0.209, 0.381, 0.827 max_d=0.827 avg_d=0.209 std_dev=0.172
O3'	A	0, 0.127, 0.335, 0.543, 0.985 max_d=0.985 avg_d=0.335 std_dev=0.208
N1	B	0, 0.269, 0.500, 0.731, 1.161 max_d=1.161 avg_d=0.500 std_dev=0.231
C2	B	0, 0.326, 0.557, 0.789, 1.136 max_d=1.136 avg_d=0.557 std_dev=0.232
N3	B	0, 0.300, 0.536, 0.771, 1.113 max_d=1.113 avg_d=0.536 std_dev=0.235
C4	B	0, 0.191, 0.443, 0.695, 1.116 max_d=1.116 avg_d=0.443 std_dev=0.252
C6	B	0, 0.184, 0.449, 0.714, 1.152 max_d=1.152 avg_d=0.449 std_dev=0.265
C1'	B	0, 0.359, 0.627, 0.895, 1.217 max_d=1.217 avg_d=0.627 std_dev=0.268
C5	B	0, 0.145, 0.421, 0.698, 1.141 max_d=1.141 avg_d=0.421 std_dev=0.276
O2	B	0, 0.430, 0.708, 0.987, 1.131 max_d=1.131 avg_d=0.708 std_dev=0.279
C2'	B	0, 0.336, 0.630, 0.924, 1.377 max_d=1.377 avg_d=0.630 std_dev=0.294
C5'	A	0, 0.018, 0.338, 0.659, 1.388 max_d=1.388 avg_d=0.338 std_dev=0.321
N4	B	0, 0.178, 0.502, 0.825, 1.585 max_d=1.585 avg_d=0.502 std_dev=0.323
P	B	0, 0.195, 0.521, 0.847, 1.581 max_d=1.581 avg_d=0.521 std_dev=0.326
O5'	B	0, 0.198, 0.542, 0.887, 1.636 max_d=1.636 avg_d=0.542 std_dev=0.344
C3'	B	0, 0.177, 0.528, 0.880, 1.395 max_d=1.395 avg_d=0.528 std_dev=0.352
O2'	B	0, 0.435, 0.787, 1.139, 1.605 max_d=1.605 avg_d=0.787 std_dev=0.352
O4'	B	0, 0.310, 0.663, 1.016, 1.953 max_d=1.953 avg_d=0.663 std_dev=0.353
C4'	B	0, 0.232, 0.591, 0.950, 1.814 max_d=1.814 avg_d=0.591 std_dev=0.359
O3'	B	0, 0.228, 0.599, 0.970, 1.448 max_d=1.448 avg_d=0.599 std_dev=0.371
OP2	B	0, 0.192, 0.586, 0.981, 1.999 max_d=1.999 avg_d=0.586 std_dev=0.395
C5'	B	0, 0.201, 0.624, 1.047, 2.050 max_d=2.050 avg_d=0.624 std_dev=0.423
OP1	B	0, 0.300, 0.729, 1.158, 1.941 max_d=1.941 avg_d=0.729 std_dev=0.429
O5'	A	0, 0.110, 0.559, 1.008, 2.075 max_d=2.075 avg_d=0.559 std_dev=0.449
P	A	0, 0.241, 0.719, 1.197, 2.258 max_d=2.258 avg_d=0.719 std_dev=0.478
OP1	A	0, 0.677, 1.225, 1.772, 2.106 max_d=2.106 avg_d=1.225 std_dev=0.548
OP2	A	0, 0.057, 0.978, 1.899, 3.486 max_d=3.486 avg_d=0.978 std_dev=0.921

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.00	0.17	0.32	0.17	0.20
C2	0.02	0.00	0.05	0.07	0.03	0.04	0.02	0.11	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.07	0.02	0.02	0.25	0.47	0.44	0.29
C2'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.05	0.02	0.06	0.02	0.06	0.02	0.05	0.07	0.01	0.03	0.06	0.01	0.13	0.21	0.14	0.14
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.09	0.01	0.10	0.02	0.09	0.05	0.09	0.07	0.02	0.01	0.11	0.02	0.16	0.25	0.13	0.15
C4	0.02	0.03	0.05	0.09	0.00	0.08	0.01	0.19	0.01	0.02	0.01	0.03	0.06	0.11	0.01	0.03	0.31	0.63	0.68	0.37
C4'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.08	0.00	0.10	0.01	0.09	0.05	0.06	0.03	0.05	0.02	0.09	0.01	0.02	0.14	0.19	0.05
C5	0.02	0.02	0.06	0.10	0.01	0.10	0.00	0.21	0.01	0.01	0.01	0.03	0.05	0.12	0.02	0.04	0.31	0.66	0.67	0.37
C5'	0.04	0.11	0.02	0.02	0.19	0.01	0.21	0.00	0.18	0.12	0.16	0.07	0.05	0.03	0.21	0.02	0.01	0.22	0.34	0.01
C6	0.01	0.02	0.06	0.09	0.01	0.09	0.01	0.18	0.00	0.01	0.02	0.02	0.05	0.10	0.01	0.03	0.29	0.56	0.50	0.33
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.02	0.05	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.05	0.02	0.02	0.25	0.45	0.38	0.28
N3	0.01	0.01	0.05	0.09	0.01	0.06	0.01	0.16	0.02	0.01	0.00	0.02	0.07	0.09	0.01	0.02	0.28	0.56	0.58	0.34
O2	0.03	0.01	0.07	0.07	0.03	0.03	0.03	0.07	0.02	0.02	0.02	0.00	0.11	0.08	0.03	0.03	0.23	0.41	0.38	0.26
O2'	0.02	0.07	0.01	0.02	0.06	0.05	0.05	0.05	0.05	0.03	0.07	0.11	0.00	0.06	0.07	0.05	0.06	0.14	0.11	0.08
O3'	0.02	0.07	0.03	0.01	0.11	0.02	0.12	0.03	0.10	0.05	0.09	0.08	0.06	0.00	0.13	0.02	0.18	0.40	0.25	0.17
O4	0.02	0.02	0.06	0.11	0.01	0.09	0.02	0.21	0.01	0.02	0.01	0.03	0.07	0.13	0.00	0.03	0.31	0.67	0.75	0.38
O4'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.04	0.02	0.03	0.02	0.02	0.03	0.05	0.02	0.03	0.00	0.16	0.34	0.13	0.20
O5'	0.17	0.25	0.13	0.16	0.31	0.02	0.31	0.01	0.29	0.25	0.28	0.23	0.06	0.18	0.31	0.16	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.32	0.47	0.21	0.25	0.63	0.14	0.66	0.22	0.56	0.45	0.56	0.41	0.14	0.40	0.67	0.34	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.17	0.44	0.14	0.13	0.68	0.19	0.67	0.34	0.50	0.38	0.58	0.38	0.11	0.25	0.75	0.13	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.20	0.29	0.14	0.15	0.37	0.05	0.37	0.01	0.33	0.28	0.34	0.26	0.08	0.17	0.38	0.20	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.22	0.18	0.14	0.26	0.15	0.27	0.18	0.22	0.19	0.23	0.29	0.25	0.25	0.13	0.20	0.15	0.05	0.10	0.05
C2	0.22	0.25	0.20	0.14	0.25	0.14	0.24	0.18	0.22	0.20	0.27	0.28	0.30	0.25	0.14	0.16	0.19	0.12	0.18	0.12
C2'	0.21	0.20	0.18	0.16	0.26	0.16	0.29	0.20	0.24	0.19	0.22	0.28	0.21	0.21	0.14	0.21	0.17	0.09	0.09	0.08
C3'	0.16	0.15	0.12	0.14	0.27	0.13	0.30	0.14	0.22	0.15	0.20	0.30	0.15	0.15	0.14	0.19	0.07	0.02	0.08	0.02
C4	0.22	0.23	0.21	0.18	0.19	0.19	0.17	0.17	0.19	0.19	0.25	0.25	0.28	0.24	0.18	0.20	0.19	0.15	0.27	0.17
C4'	0.17	0.16	0.13	0.14	0.29	0.14	0.32	0.16	0.23	0.16	0.21	0.33	0.17	0.17	0.14	0.19	0.05	0.07	0.12	0.05
C5	0.22	0.22	0.20	0.18	0.22	0.20	0.18	0.17	0.19	0.19	0.24	0.28	0.25	0.23	0.18	0.23	0.18	0.16	0.27	0.17
C5'	0.19	0.21	0.15	0.16	0.35	0.14	0.36	0.14	0.27	0.20	0.27	0.40	0.20	0.17	0.18	0.21	0.07	0.16	0.20	0.12
C6	0.21	0.20	0.18	0.15	0.25	0.18	0.22	0.15	0.17	0.17	0.24	0.31	0.23	0.22	0.15	0.22	0.17	0.13	0.23	0.13
N1	0.20	0.21	0.17	0.12	0.25	0.14	0.25	0.15	0.20	0.17	0.24	0.29	0.25	0.23	0.12	0.18	0.15	0.07	0.17	0.08
N3	0.21	0.25	0.21	0.16	0.23	0.16	0.20	0.18	0.20	0.18	0.27	0.27	0.30	0.26	0.17	0.17	0.20	0.14	0.24	0.15
O2	0.27	0.31	0.26	0.18	0.27	0.17	0.25	0.22	0.25	0.25	0.31	0.29	0.36	0.32	0.19	0.19	0.23	0.16	0.16	0.13
O2'	0.27	0.25	0.25	0.25	0.27	0.25	0.29	0.30	0.27	0.24	0.25	0.28	0.27	0.28	0.24	0.27	0.20	0.14	0.09	0.11
O3'	0.14	0.14	0.12	0.16	0.25	0.14	0.28	0.16	0.20	0.13	0.18	0.29	0.13	0.14	0.18	0.18	0.02	0.02	0.03	0.01
O4	0.24	0.25	0.24	0.22	0.18	0.21	0.20	0.20	0.22	0.21	0.25	0.24	0.30	0.27	0.22	0.22	0.21	0.19	0.31	0.20
O4'	0.19	0.19	0.15	0.12	0.27	0.14	0.29	0.16	0.21	0.16	0.22	0.32	0.21	0.21	0.12	0.19	0.10	0.04	0.13	0.04
O5'	0.25	0.41	0.26	0.26	0.57	0.17	0.54	0.18	0.40	0.35	0.50	0.64	0.37	0.21	0.26	0.21	0.24	0.19	0.20	0.18
OP1	0.39	0.52	0.42	0.46	0.67	0.38	0.61	0.41	0.49	0.45	0.62	0.77	0.49	0.39	0.50	0.36	0.45	0.65	0.65	0.55
OP2	0.50	0.74	0.52	0.45	0.90	0.31	0.77	0.22	0.61	0.62	0.86	1.02	0.73	0.48	0.44	0.39	0.30	0.32	0.28	0.23
P	0.26	0.44	0.30	0.29	0.61	0.19	0.55	0.17	0.40	0.36	0.55	0.71	0.42	0.25	0.30	0.21	0.23	0.23	0.26	0.19

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.09	0.11	0.13	0.07
C2	0.02	0.00	0.08	0.10	0.01	0.05	0.02	0.10	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.07	0.10	0.03	0.18	0.18	0.26	0.18
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.04	0.02	0.05	0.02	0.07	0.02	0.07	0.04	0.14	0.00	0.02	0.01	0.13	0.18	0.15	0.11
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.07	0.00	0.09	0.02	0.10	0.04	0.10	0.08	0.15	0.02	0.01	0.02	0.17	0.23	0.18	0.16
C4	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.06	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.09	0.03	0.25	0.27	0.37	0.28
C4'	0.02	0.05	0.02	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.06	0.03	0.05	0.06	0.07	0.06	0.02	0.01	0.02	0.11	0.11	0.02
C5	0.01	0.02	0.05	0.09	0.01	0.07	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.11	0.03	0.27	0.28	0.36	0.29
C5'	0.03	0.10	0.02	0.02	0.16	0.01	0.17	0.00	0.14	0.09	0.13	0.17	0.09	0.07	0.04	0.02	0.01	0.12	0.15	0.02
C6	0.02	0.02	0.07	0.10	0.01	0.06	0.01	0.14	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.11	0.04	0.24	0.22	0.27	0.22
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.17	0.16	0.22	0.15
N3	0.02	0.00	0.07	0.10	0.01	0.05	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.06	0.11	0.03	0.22	0.23	0.33	0.24
N4	0.02	0.02	0.04	0.08	0.01	0.06	0.01	0.17	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.04	0.10	0.03	0.26	0.31	0.41	0.31
O2	0.03	0.01	0.14	0.15	0.02	0.07	0.02	0.09	0.02	0.02	0.02	0.02	0.00	0.11	0.17	0.04	0.16	0.17	0.25	0.15
O2'	0.02	0.07	0.00	0.02	0.04	0.06	0.04	0.07	0.05	0.02	0.06	0.04	0.11	0.00	0.07	0.04	0.06	0.17	0.11	0.07
O3'	0.02	0.10	0.02	0.01	0.09	0.02	0.11	0.04	0.11	0.04	0.11	0.10	0.17	0.07	0.00	0.02	0.18	0.29	0.25	0.21
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.02	0.04	0.02	0.03	0.03	0.04	0.04	0.02	0.00	0.10	0.10	0.17	0.11
O5'	0.09	0.18	0.13	0.17	0.25	0.02	0.27	0.01	0.24	0.17	0.22	0.26	0.16	0.06	0.18	0.10	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.11	0.18	0.18	0.23	0.27	0.11	0.28	0.12	0.22	0.16	0.23	0.31	0.17	0.17	0.29	0.10	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.13	0.26	0.15	0.18	0.37	0.11	0.36	0.15	0.27	0.22	0.33	0.41	0.25	0.11	0.25	0.17	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.18	0.11	0.16	0.28	0.02	0.29	0.02	0.22	0.15	0.24	0.31	0.15	0.07	0.21	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00