Doublet Group distance statistics: 48966

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 3, 3, 3, 5, 5, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.006, 0.009, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.006 std_dev=0.003
N3	A	0, 0.002, 0.006, 0.011, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.006 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.004, 0.009, 0.014, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.003, 0.011, 0.018, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.004, 0.012, 0.019, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.005, 0.013, 0.020, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.013 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.005, 0.013, 0.020, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.013 std_dev=0.007
O2	A	0, 0.009, 0.025, 0.042, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.025 std_dev=0.017
O4	A	0, 0.006, 0.052, 0.098, 0.213 max_d=0.213 avg_d=0.052 std_dev=0.046
O4'	A	0, 0.019, 0.080, 0.141, 0.322 max_d=0.322 avg_d=0.080 std_dev=0.061
C2'	A	0, 0.014, 0.092, 0.169, 0.364 max_d=0.364 avg_d=0.092 std_dev=0.078
C4'	A	0, 0.072, 0.172, 0.272, 0.491 max_d=0.491 avg_d=0.172 std_dev=0.100
O2'	A	0, 0.068, 0.175, 0.282, 0.430 max_d=0.430 avg_d=0.175 std_dev=0.107
C3'	A	0, 0.061, 0.188, 0.314, 0.556 max_d=0.556 avg_d=0.188 std_dev=0.127
C5'	A	0, 0.123, 0.291, 0.459, 0.850 max_d=0.850 avg_d=0.291 std_dev=0.168
N1	B	0, 0.208, 0.382, 0.556, 0.694 max_d=0.694 avg_d=0.382 std_dev=0.174
O5'	A	0, 0.145, 0.336, 0.526, 0.888 max_d=0.888 avg_d=0.336 std_dev=0.190
O5'	B	0, 0.178, 0.388, 0.597, 0.818 max_d=0.818 avg_d=0.388 std_dev=0.209
O4'	B	0, 0.255, 0.467, 0.679, 0.764 max_d=0.764 avg_d=0.467 std_dev=0.212
C2	B	0, 0.242, 0.456, 0.671, 0.783 max_d=0.783 avg_d=0.456 std_dev=0.214
C6	B	0, 0.200, 0.416, 0.633, 0.888 max_d=0.888 avg_d=0.416 std_dev=0.216
C5'	B	0, 0.202, 0.419, 0.637, 0.870 max_d=0.870 avg_d=0.419 std_dev=0.217
O3'	A	0, 0.090, 0.308, 0.526, 0.818 max_d=0.818 avg_d=0.308 std_dev=0.218
C1'	B	0, 0.259, 0.486, 0.712, 0.827 max_d=0.827 avg_d=0.486 std_dev=0.226
C4'	B	0, 0.252, 0.499, 0.746, 1.026 max_d=1.026 avg_d=0.499 std_dev=0.247
N3	B	0, 0.257, 0.507, 0.757, 1.047 max_d=1.047 avg_d=0.507 std_dev=0.250
C5	B	0, 0.273, 0.544, 0.815, 0.946 max_d=0.946 avg_d=0.544 std_dev=0.271
P	B	0, 0.157, 0.432, 0.706, 1.115 max_d=1.115 avg_d=0.432 std_dev=0.275
O2	B	0, 0.293, 0.594, 0.894, 1.108 max_d=1.108 avg_d=0.594 std_dev=0.300
C4	B	0, 0.243, 0.545, 0.846, 0.983 max_d=0.983 avg_d=0.545 std_dev=0.302
C3'	B	0, 0.307, 0.612, 0.916, 1.373 max_d=1.373 avg_d=0.612 std_dev=0.305
P	A	0, 0.208, 0.526, 0.844, 1.184 max_d=1.184 avg_d=0.526 std_dev=0.318
C2'	B	0, 0.292, 0.630, 0.969, 1.336 max_d=1.336 avg_d=0.630 std_dev=0.338
OP2	B	0, 0.150, 0.507, 0.865, 1.482 max_d=1.482 avg_d=0.507 std_dev=0.358
OP2	A	0, 0.279, 0.637, 0.996, 1.287 max_d=1.287 avg_d=0.637 std_dev=0.358
OP1	B	0, 0.229, 0.604, 0.979, 1.534 max_d=1.534 avg_d=0.604 std_dev=0.375
OP1	A	0, 0.231, 0.619, 1.008, 1.510 max_d=1.510 avg_d=0.619 std_dev=0.388
N4	B	0, 0.259, 0.696, 1.134, 1.410 max_d=1.410 avg_d=0.696 std_dev=0.437
O3'	B	0, 0.431, 0.893, 1.356, 2.023 max_d=2.023 avg_d=0.893 std_dev=0.463
O2'	B	0, 0.353, 0.867, 1.381, 1.890 max_d=1.890 avg_d=0.867 std_dev=0.514

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.06	0.09	0.13	0.10
C2	0.01	0.00	0.04	0.07	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.07	0.01	0.02	0.11	0.12	0.18	0.13
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.05	0.02	0.04	0.07	0.00	0.01	0.05	0.01	0.06	0.18	0.13	0.08
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.10	0.00	0.11	0.02	0.10	0.06	0.08	0.07	0.02	0.01	0.11	0.01	0.06	0.21	0.14	0.11
C4	0.01	0.01	0.04	0.10	0.00	0.07	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.13	0.00	0.03	0.15	0.18	0.23	0.19
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.07	0.04	0.05	0.03	0.05	0.03	0.07	0.00	0.02	0.10	0.04	0.03
C5	0.01	0.01	0.05	0.11	0.00	0.08	0.00	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.14	0.01	0.03	0.16	0.18	0.23	0.19
C5'	0.02	0.07	0.02	0.02	0.12	0.01	0.13	0.00	0.11	0.07	0.09	0.05	0.05	0.03	0.13	0.01	0.01	0.07	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.07	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.12	0.01	0.03	0.13	0.14	0.18	0.15
N1	0.00	0.01	0.02	0.06	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01	0.01	0.10	0.11	0.16	0.12
N3	0.01	0.00	0.04	0.08	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.10	0.01	0.03	0.13	0.15	0.21	0.16
O2	0.02	0.00	0.07	0.07	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.08	0.02	0.03	0.09	0.12	0.17	0.12
O2'	0.01	0.04	0.00	0.02	0.02	0.05	0.03	0.05	0.03	0.01	0.03	0.08	0.00	0.04	0.03	0.04	0.04	0.16	0.10	0.05
O3'	0.02	0.07	0.01	0.01	0.13	0.03	0.14	0.03	0.12	0.06	0.10	0.08	0.04	0.00	0.15	0.02	0.09	0.29	0.21	0.16
O4	0.02	0.01	0.05	0.11	0.00	0.07	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.15	0.00	0.04	0.16	0.20	0.25	0.21
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.03	0.04	0.02	0.04	0.00	0.07	0.08	0.16	0.14
O5'	0.06	0.11	0.06	0.06	0.15	0.02	0.16	0.01	0.13	0.10	0.13	0.09	0.04	0.09	0.16	0.07	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.09	0.12	0.18	0.21	0.18	0.10	0.18	0.07	0.14	0.11	0.15	0.12	0.16	0.29	0.20	0.08	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.13	0.18	0.13	0.14	0.23	0.04	0.23	0.02	0.18	0.16	0.21	0.17	0.10	0.21	0.25	0.16	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.13	0.08	0.11	0.19	0.03	0.19	0.01	0.15	0.12	0.16	0.12	0.05	0.16	0.21	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.32	0.34	0.29	0.21	0.45	0.34	0.37	0.24	0.19	0.20	0.44	0.57	0.40	0.47	0.26	0.35	0.13	0.04	0.09	0.04
C2	0.39	0.34	0.37	0.27	0.40	0.36	0.34	0.25	0.21	0.20	0.41	0.54	0.46	0.55	0.30	0.39	0.15	0.09	0.21	0.12
C2'	0.25	0.33	0.23	0.18	0.43	0.30	0.37	0.24	0.22	0.22	0.41	0.50	0.34	0.36	0.23	0.29	0.15	0.07	0.08	0.07
C3'	0.18	0.30	0.11	0.08	0.43	0.18	0.38	0.14	0.23	0.20	0.40	0.51	0.29	0.22	0.11	0.23	0.05	0.02	0.06	0.01
C4	0.35	0.27	0.27	0.22	0.34	0.31	0.35	0.25	0.28	0.22	0.35	0.57	0.39	0.41	0.22	0.38	0.20	0.20	0.33	0.22
C4'	0.22	0.32	0.15	0.09	0.46	0.22	0.39	0.16	0.22	0.20	0.42	0.58	0.33	0.31	0.14	0.26	0.04	0.07	0.13	0.06
C5	0.30	0.27	0.21	0.18	0.39	0.28	0.31	0.24	0.21	0.17	0.38	0.61	0.35	0.34	0.19	0.37	0.18	0.21	0.32	0.22
C5'	0.18	0.33	0.10	0.11	0.50	0.16	0.42	0.12	0.24	0.21	0.45	0.64	0.33	0.24	0.14	0.23	0.08	0.16	0.23	0.13
C6	0.29	0.30	0.20	0.16	0.44	0.28	0.33	0.22	0.17	0.16	0.42	0.62	0.37	0.35	0.17	0.36	0.15	0.16	0.25	0.16
N1	0.33	0.33	0.28	0.20	0.45	0.32	0.35	0.24	0.18	0.18	0.44	0.59	0.41	0.45	0.22	0.37	0.13	0.08	0.19	0.10
N3	0.39	0.31	0.35	0.26	0.36	0.34	0.36	0.26	0.27	0.23	0.38	0.54	0.45	0.51	0.27	0.39	0.18	0.14	0.28	0.17
O2	0.42	0.34	0.45	0.34	0.37	0.40	0.32	0.27	0.20	0.21	0.39	0.49	0.49	0.66	0.41	0.38	0.15	0.08	0.18	0.09
O2'	0.28	0.35	0.33	0.31	0.42	0.38	0.36	0.31	0.26	0.27	0.41	0.47	0.37	0.45	0.39	0.29	0.22	0.15	0.09	0.12
O3'	0.15	0.27	0.09	0.09	0.39	0.13	0.35	0.11	0.25	0.21	0.35	0.44	0.25	0.16	0.13	0.18	0.01	0.02	0.02	0.01
O4	0.36	0.26	0.29	0.24	0.30	0.32	0.38	0.27	0.32	0.26	0.28	0.52	0.38	0.40	0.24	0.39	0.23	0.24	0.37	0.25
O4'	0.28	0.33	0.23	0.15	0.47	0.29	0.38	0.21	0.19	0.19	0.44	0.61	0.38	0.42	0.19	0.32	0.08	0.05	0.11	0.03
O5'	0.16	0.35	0.12	0.19	0.54	0.12	0.46	0.13	0.27	0.22	0.49	0.69	0.34	0.17	0.24	0.21	0.15	0.21	0.27	0.18
OP1	0.25	0.42	0.32	0.40	0.60	0.28	0.52	0.34	0.37	0.33	0.54	0.73	0.40	0.26	0.47	0.25	0.37	0.48	0.47	0.41
OP2	0.21	0.40	0.28	0.37	0.61	0.21	0.51	0.26	0.34	0.29	0.54	0.78	0.40	0.20	0.45	0.23	0.33	0.40	0.45	0.35
P	0.17	0.38	0.19	0.28	0.58	0.16	0.49	0.20	0.30	0.26	0.52	0.75	0.37	0.16	0.34	0.21	0.25	0.34	0.39	0.29

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.07	0.08	0.15	0.09
C2	0.01	0.00	0.09	0.10	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.11	0.12	0.05	0.17	0.18	0.28	0.22
C2'	0.00	0.09	0.00	0.01	0.06	0.01	0.08	0.02	0.09	0.03	0.08	0.07	0.15	0.00	0.02	0.01	0.07	0.12	0.12	0.08
C3'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.15	0.00	0.18	0.02	0.18	0.09	0.12	0.16	0.13	0.03	0.01	0.02	0.11	0.15	0.17	0.12
C4	0.01	0.00	0.06	0.15	0.00	0.09	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.19	0.03	0.26	0.32	0.41	0.34
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.09	0.00	0.12	0.01	0.11	0.05	0.06	0.10	0.04	0.07	0.02	0.00	0.01	0.09	0.04	0.02
C5	0.01	0.00	0.08	0.18	0.00	0.12	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.23	0.02	0.28	0.34	0.41	0.35
C5'	0.03	0.10	0.02	0.02	0.18	0.01	0.21	0.00	0.18	0.10	0.14	0.20	0.07	0.07	0.05	0.02	0.01	0.09	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.09	0.18	0.00	0.11	0.00	0.18	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.20	0.03	0.24	0.26	0.30	0.26
N1	0.00	0.01	0.03	0.09	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.09	0.01	0.16	0.17	0.24	0.19
N3	0.01	0.00	0.08	0.12	0.00	0.06	0.00	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.15	0.05	0.22	0.26	0.36	0.29
N4	0.01	0.01	0.07	0.16	0.00	0.10	0.00	0.20	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.22	0.03	0.28	0.37	0.47	0.38
O2	0.02	0.00	0.15	0.13	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.18	0.17	0.07	0.13	0.13	0.24	0.18
O2'	0.02	0.11	0.00	0.03	0.05	0.07	0.04	0.07	0.05	0.03	0.09	0.06	0.18	0.00	0.06	0.05	0.07	0.13	0.11	0.07
O3'	0.02	0.12	0.02	0.01	0.19	0.02	0.23	0.05	0.20	0.09	0.15	0.22	0.17	0.06	0.00	0.02	0.16	0.24	0.29	0.20
O4'	0.01	0.05	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.02	0.03	0.01	0.05	0.03	0.07	0.05	0.02	0.00	0.09	0.10	0.18	0.12
O5'	0.07	0.17	0.07	0.11	0.26	0.01	0.28	0.01	0.24	0.16	0.22	0.28	0.13	0.07	0.16	0.09	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.08	0.18	0.12	0.15	0.32	0.09	0.34	0.09	0.26	0.17	0.26	0.37	0.13	0.13	0.24	0.10	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.15	0.28	0.12	0.17	0.41	0.04	0.41	0.02	0.30	0.24	0.36	0.47	0.24	0.11	0.29	0.18	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.22	0.08	0.12	0.34	0.02	0.35	0.01	0.26	0.19	0.29	0.38	0.18	0.07	0.20	0.12	0.00	0.01	0.01	0.00