Doublet Group distance statistics: 48968

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 3, 4, 1, 2, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.004, 0.008, 0.013, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.008 std_dev=0.004
N3	A	0, 0.004, 0.012, 0.020, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.012 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.004, 0.013, 0.022, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.005, 0.014, 0.024, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.004, 0.015, 0.026, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.015 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.005, 0.016, 0.027, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.016 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.003, 0.018, 0.034, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.018 std_dev=0.016
O2	A	0, 0.011, 0.041, 0.071, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.041 std_dev=0.030
O4	A	0, 0.012, 0.071, 0.130, 0.208 max_d=0.208 avg_d=0.071 std_dev=0.059
C2'	A	0, 0.045, 0.128, 0.211, 0.293 max_d=0.293 avg_d=0.128 std_dev=0.083
O4'	A	0, 0.039, 0.130, 0.221, 0.338 max_d=0.338 avg_d=0.130 std_dev=0.091
O2'	A	0, 0.077, 0.185, 0.293, 0.375 max_d=0.375 avg_d=0.185 std_dev=0.108
C3'	A	0, 0.101, 0.245, 0.390, 0.494 max_d=0.494 avg_d=0.245 std_dev=0.144
C4'	A	0, 0.087, 0.237, 0.387, 0.532 max_d=0.532 avg_d=0.237 std_dev=0.150
O4'	B	0, 0.214, 0.369, 0.525, 0.632 max_d=0.632 avg_d=0.369 std_dev=0.156
C6	B	0, 0.211, 0.392, 0.572, 0.639 max_d=0.639 avg_d=0.392 std_dev=0.181
C4'	B	0, 0.254, 0.439, 0.624, 0.660 max_d=0.660 avg_d=0.439 std_dev=0.185
N1	B	0, 0.154, 0.347, 0.541, 0.771 max_d=0.771 avg_d=0.347 std_dev=0.193
C5'	B	0, 0.248, 0.444, 0.641, 0.747 max_d=0.747 avg_d=0.444 std_dev=0.196
C1'	B	0, 0.197, 0.399, 0.601, 0.845 max_d=0.845 avg_d=0.399 std_dev=0.202
C5	B	0, 0.203, 0.410, 0.616, 0.670 max_d=0.670 avg_d=0.410 std_dev=0.206
O3'	A	0, 0.157, 0.370, 0.583, 0.720 max_d=0.720 avg_d=0.370 std_dev=0.213
C4	B	0, 0.218, 0.436, 0.653, 0.886 max_d=0.886 avg_d=0.436 std_dev=0.218
O5'	B	0, 0.228, 0.448, 0.668, 0.783 max_d=0.783 avg_d=0.448 std_dev=0.220
C3'	B	0, 0.278, 0.512, 0.746, 0.853 max_d=0.853 avg_d=0.512 std_dev=0.234
N4	B	0, 0.336, 0.575, 0.815, 1.044 max_d=1.044 avg_d=0.575 std_dev=0.240
C2	B	0, 0.129, 0.373, 0.618, 0.946 max_d=0.946 avg_d=0.373 std_dev=0.245
P	B	0, 0.230, 0.478, 0.725, 0.871 max_d=0.871 avg_d=0.478 std_dev=0.247
O5'	A	0, 0.159, 0.408, 0.657, 0.781 max_d=0.781 avg_d=0.408 std_dev=0.249
C5'	A	0, 0.146, 0.405, 0.664, 0.882 max_d=0.882 avg_d=0.405 std_dev=0.259
C2'	B	0, 0.238, 0.498, 0.758, 1.004 max_d=1.004 avg_d=0.498 std_dev=0.260
N3	B	0, 0.159, 0.421, 0.682, 0.994 max_d=0.994 avg_d=0.421 std_dev=0.262
O2	B	0, 0.162, 0.449, 0.736, 1.116 max_d=1.116 avg_d=0.449 std_dev=0.287
OP2	B	0, 0.272, 0.575, 0.877, 1.105 max_d=1.105 avg_d=0.575 std_dev=0.303
OP1	B	0, 0.292, 0.619, 0.946, 1.261 max_d=1.261 avg_d=0.619 std_dev=0.327
O3'	B	0, 0.304, 0.655, 1.005, 1.353 max_d=1.353 avg_d=0.655 std_dev=0.350
O2'	B	0, 0.265, 0.615, 0.966, 1.301 max_d=1.301 avg_d=0.615 std_dev=0.351
P	A	0, 0.297, 0.696, 1.094, 1.420 max_d=1.420 avg_d=0.696 std_dev=0.399
OP1	A	0, 0.457, 1.004, 1.552, 1.864 max_d=1.864 avg_d=1.004 std_dev=0.548
OP2	A	0, 0.396, 1.141, 1.885, 2.296 max_d=2.296 avg_d=1.141 std_dev=0.744

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.05	0.01	0.01	0.03	0.01	0.09	0.10	0.18	0.11
C2	0.03	0.00	0.05	0.08	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.09	0.02	0.05	0.16	0.18	0.34	0.20
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.06	0.02	0.04	0.08	0.00	0.02	0.05	0.01	0.05	0.07	0.08	0.05
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.07	0.00	0.08	0.02	0.08	0.05	0.08	0.09	0.02	0.01	0.07	0.01	0.07	0.08	0.11	0.07
C4	0.02	0.01	0.04	0.07	0.00	0.06	0.01	0.12	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.09	0.01	0.03	0.21	0.31	0.49	0.29
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.06	0.03	0.04	0.04	0.04	0.01	0.06	0.01	0.02	0.10	0.04	0.02
C5	0.02	0.01	0.05	0.08	0.01	0.07	0.00	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.09	0.01	0.03	0.23	0.32	0.49	0.29
C5'	0.02	0.07	0.02	0.02	0.12	0.01	0.13	0.00	0.11	0.07	0.09	0.06	0.04	0.03	0.13	0.02	0.01	0.12	0.03	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.08	0.01	0.06	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.09	0.01	0.04	0.20	0.24	0.38	0.24
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.02	0.03	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.06	0.02	0.01	0.16	0.16	0.30	0.18
N3	0.02	0.00	0.04	0.08	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.09	0.01	0.04	0.19	0.25	0.42	0.25
O2	0.05	0.00	0.08	0.09	0.01	0.04	0.01	0.06	0.02	0.02	0.01	0.00	0.07	0.11	0.02	0.09	0.13	0.13	0.30	0.17
O2'	0.01	0.05	0.00	0.02	0.05	0.04	0.05	0.04	0.04	0.02	0.05	0.07	0.00	0.03	0.07	0.03	0.05	0.10	0.06	0.05
O3'	0.01	0.09	0.02	0.01	0.09	0.01	0.09	0.03	0.09	0.06	0.09	0.11	0.03	0.00	0.09	0.01	0.12	0.13	0.21	0.12
O4	0.03	0.02	0.05	0.07	0.01	0.06	0.01	0.13	0.01	0.02	0.01	0.02	0.07	0.09	0.00	0.03	0.22	0.35	0.53	0.31
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.04	0.01	0.04	0.09	0.03	0.01	0.03	0.00	0.11	0.12	0.17	0.11
O5'	0.09	0.16	0.05	0.07	0.21	0.02	0.23	0.01	0.20	0.16	0.19	0.13	0.05	0.12	0.22	0.11	0.00	0.03	0.02	0.00
OP1	0.10	0.18	0.07	0.08	0.31	0.10	0.32	0.12	0.24	0.16	0.25	0.13	0.10	0.13	0.35	0.12	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.18	0.34	0.08	0.11	0.49	0.04	0.49	0.03	0.38	0.30	0.42	0.30	0.06	0.21	0.53	0.17	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.20	0.05	0.07	0.29	0.02	0.29	0.02	0.24	0.18	0.25	0.17	0.05	0.12	0.31	0.11	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.14	0.14	0.13	0.13	0.12	0.16	0.12	0.19	0.14	0.15	0.15	0.15	0.19	0.13	0.14	0.14	0.08	0.10	0.03
C2	0.17	0.17	0.18	0.14	0.20	0.15	0.21	0.13	0.22	0.16	0.19	0.21	0.18	0.24	0.16	0.14	0.15	0.13	0.16	0.10
C2'	0.18	0.18	0.17	0.17	0.17	0.14	0.19	0.13	0.22	0.19	0.18	0.17	0.18	0.19	0.16	0.17	0.18	0.12	0.05	0.08
C3'	0.08	0.11	0.05	0.06	0.10	0.05	0.10	0.07	0.10	0.08	0.12	0.11	0.13	0.08	0.09	0.08	0.06	0.03	0.08	0.01
C4	0.18	0.14	0.19	0.16	0.25	0.18	0.27	0.14	0.23	0.14	0.20	0.29	0.19	0.26	0.18	0.18	0.17	0.12	0.22	0.13
C4'	0.07	0.12	0.04	0.06	0.12	0.05	0.09	0.07	0.09	0.07	0.15	0.15	0.14	0.08	0.10	0.07	0.05	0.07	0.18	0.07
C5	0.18	0.14	0.16	0.15	0.19	0.17	0.25	0.14	0.22	0.12	0.16	0.23	0.21	0.21	0.15	0.18	0.18	0.13	0.23	0.14
C5'	0.13	0.20	0.11	0.11	0.21	0.11	0.17	0.12	0.15	0.15	0.23	0.24	0.21	0.10	0.13	0.12	0.10	0.18	0.29	0.16
C6	0.15	0.13	0.14	0.14	0.15	0.16	0.21	0.14	0.21	0.11	0.15	0.17	0.17	0.17	0.15	0.16	0.18	0.12	0.21	0.13
N1	0.14	0.13	0.13	0.11	0.15	0.12	0.19	0.11	0.20	0.12	0.16	0.17	0.15	0.18	0.11	0.13	0.15	0.09	0.15	0.07
N3	0.19	0.18	0.21	0.17	0.24	0.19	0.25	0.15	0.23	0.17	0.22	0.27	0.19	0.28	0.20	0.16	0.17	0.14	0.19	0.12
O2	0.20	0.19	0.21	0.17	0.20	0.17	0.21	0.15	0.22	0.18	0.21	0.21	0.21	0.27	0.20	0.15	0.16	0.16	0.14	0.11
O2'	0.26	0.22	0.26	0.26	0.18	0.25	0.19	0.23	0.23	0.23	0.20	0.16	0.23	0.30	0.25	0.26	0.23	0.19	0.06	0.13
O3'	0.10	0.11	0.08	0.09	0.11	0.09	0.10	0.09	0.10	0.10	0.11	0.11	0.12	0.10	0.12	0.10	0.02	0.02	0.02	0.01
O4	0.19	0.16	0.21	0.17	0.30	0.18	0.29	0.14	0.23	0.15	0.25	0.36	0.20	0.28	0.19	0.17	0.17	0.13	0.23	0.14
O4'	0.09	0.11	0.07	0.08	0.11	0.08	0.09	0.09	0.11	0.06	0.14	0.14	0.14	0.13	0.09	0.09	0.09	0.03	0.17	0.05
O5'	0.16	0.25	0.13	0.13	0.23	0.11	0.17	0.13	0.16	0.19	0.27	0.25	0.28	0.12	0.17	0.15	0.12	0.15	0.23	0.13
OP1	0.31	0.45	0.27	0.20	0.51	0.20	0.43	0.16	0.35	0.37	0.51	0.56	0.46	0.25	0.19	0.25	0.17	0.21	0.24	0.15
OP2	0.27	0.39	0.23	0.26	0.35	0.20	0.25	0.19	0.23	0.29	0.41	0.35	0.43	0.23	0.31	0.23	0.23	0.26	0.31	0.24
P	0.22	0.33	0.17	0.15	0.33	0.13	0.23	0.12	0.20	0.25	0.37	0.36	0.36	0.17	0.19	0.18	0.11	0.16	0.20	0.11

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.02	0.01	0.00	0.06	0.07	0.11	0.07
C2	0.02	0.00	0.09	0.08	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.11	0.02	0.09	0.09	0.16	0.10
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.04	0.01	0.07	0.02	0.08	0.02	0.08	0.05	0.16	0.00	0.01	0.01	0.05	0.08	0.08	0.05
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.06	0.00	0.09	0.02	0.10	0.04	0.07	0.06	0.13	0.02	0.01	0.02	0.07	0.10	0.11	0.08
C4	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.09	0.03	0.10	0.14	0.22	0.14
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.02	0.03	0.06	0.06	0.01	0.00	0.02	0.09	0.03	0.03
C5	0.01	0.01	0.07	0.09	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.12	0.04	0.11	0.16	0.24	0.15
C5'	0.02	0.03	0.02	0.02	0.05	0.01	0.07	0.00	0.06	0.03	0.03	0.06	0.05	0.07	0.04	0.01	0.02	0.09	0.02	0.02
C6	0.01	0.01	0.08	0.10	0.01	0.05	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.06	0.12	0.04	0.10	0.12	0.20	0.13
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.09	0.09	0.16	0.10
N3	0.02	0.00	0.08	0.07	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.11	0.02	0.09	0.10	0.19	0.12
N4	0.01	0.01	0.05	0.06	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.10	0.03	0.10	0.16	0.23	0.15
O2	0.04	0.01	0.16	0.13	0.01	0.06	0.01	0.05	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.16	0.17	0.04	0.10	0.10	0.15	0.10
O2'	0.02	0.09	0.00	0.02	0.05	0.06	0.05	0.07	0.06	0.02	0.08	0.06	0.16	0.00	0.03	0.04	0.06	0.13	0.07	0.07
O3'	0.01	0.11	0.01	0.01	0.09	0.01	0.12	0.04	0.12	0.04	0.11	0.10	0.17	0.03	0.00	0.01	0.14	0.18	0.21	0.16
O4'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.02	0.03	0.04	0.04	0.01	0.00	0.08	0.09	0.09	0.07
O5'	0.06	0.09	0.05	0.07	0.10	0.02	0.11	0.02	0.10	0.09	0.09	0.10	0.10	0.06	0.14	0.08	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.07	0.09	0.08	0.10	0.14	0.09	0.16	0.09	0.12	0.09	0.10	0.16	0.10	0.13	0.18	0.09	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.11	0.16	0.08	0.11	0.22	0.03	0.24	0.02	0.20	0.16	0.19	0.23	0.15	0.07	0.21	0.09	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.10	0.05	0.08	0.14	0.03	0.15	0.02	0.13	0.10	0.12	0.15	0.10	0.07	0.16	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00