Doublet Group distance statistics: 48969

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 3, 0, 4, 2, 2, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.000, 0.010, 0.019, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.010 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.008, 0.020, 0.032, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.020 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.012, 0.026, 0.040, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.026 std_dev=0.014
C6	A	0, 0.011, 0.025, 0.039, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.025 std_dev=0.014
C5	A	0, -0.001, 0.016, 0.034, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.016 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.008, 0.027, 0.046, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.027 std_dev=0.019
C2	A	0, 0.004, 0.030, 0.056, 0.114 max_d=0.114 avg_d=0.030 std_dev=0.026
O2	A	0, 0.023, 0.060, 0.097, 0.163 max_d=0.163 avg_d=0.060 std_dev=0.037
O4	A	0, 0.038, 0.083, 0.128, 0.144 max_d=0.144 avg_d=0.083 std_dev=0.045
O4'	A	0, 0.031, 0.109, 0.187, 0.328 max_d=0.328 avg_d=0.109 std_dev=0.078
C2'	A	0, 0.034, 0.123, 0.212, 0.270 max_d=0.270 avg_d=0.123 std_dev=0.089
C4'	A	0, 0.055, 0.171, 0.287, 0.512 max_d=0.512 avg_d=0.171 std_dev=0.116
C3'	A	0, 0.069, 0.191, 0.312, 0.499 max_d=0.499 avg_d=0.191 std_dev=0.121
O2'	A	0, 0.040, 0.164, 0.288, 0.443 max_d=0.443 avg_d=0.164 std_dev=0.124
O3'	A	0, 0.122, 0.298, 0.473, 0.763 max_d=0.763 avg_d=0.298 std_dev=0.176
C5'	A	0, 0.062, 0.248, 0.434, 0.685 max_d=0.685 avg_d=0.248 std_dev=0.186
C5	B	0, 0.173, 0.371, 0.569, 0.754 max_d=0.754 avg_d=0.371 std_dev=0.198
O5'	A	0, 0.117, 0.316, 0.515, 0.706 max_d=0.706 avg_d=0.316 std_dev=0.199
C6	B	0, 0.159, 0.366, 0.572, 0.781 max_d=0.781 avg_d=0.366 std_dev=0.207
N1	B	0, 0.142, 0.350, 0.557, 0.765 max_d=0.765 avg_d=0.350 std_dev=0.208
C4	B	0, 0.157, 0.366, 0.575, 0.749 max_d=0.749 avg_d=0.366 std_dev=0.209
C2	B	0, 0.147, 0.373, 0.599, 0.727 max_d=0.727 avg_d=0.373 std_dev=0.226
N4	B	0, 0.189, 0.417, 0.646, 0.852 max_d=0.852 avg_d=0.417 std_dev=0.228
O4'	B	0, 0.159, 0.398, 0.637, 0.852 max_d=0.852 avg_d=0.398 std_dev=0.239
C1'	B	0, 0.147, 0.389, 0.631, 0.886 max_d=0.886 avg_d=0.389 std_dev=0.242
N3	B	0, 0.136, 0.380, 0.624, 0.832 max_d=0.832 avg_d=0.380 std_dev=0.244
O2	B	0, 0.181, 0.436, 0.692, 0.894 max_d=0.894 avg_d=0.436 std_dev=0.256
P	B	0, 0.163, 0.433, 0.702, 0.948 max_d=0.948 avg_d=0.433 std_dev=0.269
OP2	B	0, 0.208, 0.494, 0.780, 1.151 max_d=1.151 avg_d=0.494 std_dev=0.286
C2'	B	0, 0.168, 0.481, 0.794, 1.206 max_d=1.206 avg_d=0.481 std_dev=0.313
C4'	B	0, 0.171, 0.497, 0.822, 1.108 max_d=1.108 avg_d=0.497 std_dev=0.325
C3'	B	0, 0.187, 0.536, 0.884, 1.310 max_d=1.310 avg_d=0.536 std_dev=0.349
O5'	B	0, 0.235, 0.589, 0.943, 1.019 max_d=1.019 avg_d=0.589 std_dev=0.354
OP1	B	0, 0.201, 0.579, 0.957, 1.313 max_d=1.313 avg_d=0.579 std_dev=0.378
P	A	0, 0.317, 0.695, 1.074, 1.227 max_d=1.227 avg_d=0.695 std_dev=0.379
O2'	B	0, 0.154, 0.540, 0.926, 1.361 max_d=1.361 avg_d=0.540 std_dev=0.386
C5'	B	0, 0.270, 0.666, 1.063, 1.454 max_d=1.454 avg_d=0.666 std_dev=0.397
OP2	A	0, 0.407, 0.806, 1.205, 1.378 max_d=1.378 avg_d=0.806 std_dev=0.399
O3'	B	0, 0.210, 0.644, 1.077, 1.596 max_d=1.596 avg_d=0.644 std_dev=0.434
OP1	A	0, 0.407, 0.934, 1.461, 1.710 max_d=1.710 avg_d=0.934 std_dev=0.527

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.05	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.10	0.08	0.07
C2	0.02	0.00	0.05	0.06	0.04	0.03	0.04	0.05	0.03	0.01	0.01	0.01	0.05	0.08	0.02	0.03	0.09	0.12	0.16	0.12
C2'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.07	0.01	0.07	0.02	0.07	0.03	0.05	0.09	0.01	0.02	0.07	0.01	0.06	0.18	0.09	0.08
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.08	0.00	0.08	0.03	0.07	0.04	0.07	0.08	0.02	0.01	0.09	0.01	0.08	0.21	0.12	0.12
C4	0.02	0.04	0.07	0.08	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.02	0.02	0.03	0.07	0.10	0.01	0.03	0.12	0.15	0.26	0.18
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.04	0.02	0.03	0.06	0.03	0.02	0.04	0.01	0.02	0.11	0.04	0.03
C5	0.01	0.04	0.07	0.08	0.01	0.05	0.00	0.08	0.02	0.01	0.02	0.04	0.06	0.10	0.02	0.04	0.12	0.16	0.26	0.18
C5'	0.02	0.05	0.02	0.03	0.07	0.00	0.08	0.00	0.06	0.04	0.06	0.07	0.03	0.05	0.07	0.01	0.01	0.12	0.05	0.03
C6	0.02	0.03	0.07	0.07	0.01	0.04	0.02	0.06	0.00	0.02	0.01	0.04	0.05	0.08	0.01	0.03	0.10	0.11	0.18	0.14
N1	0.01	0.01	0.03	0.04	0.02	0.02	0.01	0.04	0.02	0.00	0.01	0.03	0.03	0.04	0.02	0.02	0.08	0.09	0.14	0.11
N3	0.02	0.01	0.05	0.07	0.02	0.03	0.02	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.10	0.01	0.04	0.10	0.12	0.22	0.15
O2	0.05	0.01	0.09	0.08	0.03	0.06	0.04	0.07	0.04	0.03	0.01	0.00	0.10	0.11	0.01	0.06	0.10	0.15	0.15	0.12
O2'	0.01	0.05	0.01	0.02	0.07	0.03	0.06	0.03	0.05	0.03	0.06	0.10	0.00	0.06	0.07	0.02	0.05	0.17	0.08	0.06
O3'	0.01	0.08	0.02	0.01	0.10	0.02	0.10	0.05	0.08	0.04	0.10	0.11	0.06	0.00	0.13	0.01	0.14	0.33	0.19	0.21
O4	0.02	0.02	0.07	0.09	0.01	0.04	0.02	0.07	0.01	0.02	0.01	0.01	0.07	0.13	0.00	0.03	0.12	0.17	0.28	0.19
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.03	0.02	0.04	0.06	0.02	0.01	0.03	0.00	0.06	0.13	0.10	0.11
O5'	0.05	0.09	0.06	0.08	0.12	0.02	0.12	0.01	0.10	0.08	0.10	0.10	0.05	0.14	0.12	0.06	0.00	0.03	0.01	0.01
OP1	0.10	0.12	0.18	0.21	0.15	0.11	0.16	0.12	0.11	0.09	0.12	0.15	0.17	0.33	0.17	0.13	0.03	0.00	0.02	0.01
OP2	0.08	0.16	0.09	0.12	0.26	0.04	0.26	0.05	0.18	0.14	0.22	0.15	0.08	0.19	0.28	0.10	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.07	0.12	0.08	0.12	0.18	0.03	0.18	0.03	0.14	0.11	0.15	0.12	0.06	0.21	0.19	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.08	0.12	0.07	0.09	0.14	0.10	0.17	0.18	0.13	0.08	0.14	0.16	0.17	0.12	0.09	0.08	0.19	0.06	0.12	0.06
C2	0.10	0.14	0.10	0.11	0.15	0.13	0.16	0.19	0.13	0.08	0.16	0.16	0.19	0.12	0.12	0.13	0.20	0.12	0.17	0.10
C2'	0.11	0.14	0.10	0.13	0.13	0.11	0.15	0.20	0.14	0.11	0.13	0.13	0.18	0.13	0.11	0.09	0.22	0.09	0.14	0.10
C3'	0.14	0.15	0.15	0.18	0.16	0.11	0.19	0.18	0.17	0.14	0.14	0.16	0.17	0.15	0.14	0.13	0.08	0.02	0.07	0.02
C4	0.12	0.17	0.12	0.11	0.17	0.09	0.16	0.20	0.12	0.11	0.18	0.20	0.21	0.15	0.10	0.09	0.22	0.15	0.25	0.15
C4'	0.11	0.14	0.12	0.16	0.17	0.10	0.20	0.20	0.16	0.12	0.14	0.18	0.17	0.14	0.13	0.10	0.10	0.03	0.11	0.02
C5	0.13	0.17	0.13	0.13	0.17	0.10	0.18	0.22	0.14	0.13	0.18	0.20	0.21	0.14	0.12	0.10	0.19	0.16	0.27	0.16
C5'	0.12	0.16	0.13	0.17	0.20	0.10	0.22	0.17	0.17	0.13	0.17	0.22	0.18	0.14	0.14	0.11	0.05	0.11	0.19	0.07
C6	0.11	0.15	0.11	0.11	0.17	0.08	0.18	0.18	0.14	0.11	0.16	0.19	0.19	0.12	0.09	0.08	0.13	0.12	0.23	0.12
N1	0.07	0.13	0.07	0.07	0.16	0.07	0.17	0.16	0.13	0.07	0.15	0.17	0.18	0.10	0.06	0.06	0.14	0.06	0.16	0.06
N3	0.11	0.16	0.11	0.11	0.16	0.11	0.16	0.19	0.13	0.09	0.17	0.17	0.21	0.15	0.10	0.12	0.21	0.13	0.21	0.12
O2	0.17	0.16	0.17	0.20	0.17	0.23	0.19	0.25	0.18	0.15	0.17	0.17	0.20	0.19	0.21	0.23	0.28	0.20	0.18	0.15
O2'	0.14	0.16	0.13	0.16	0.12	0.17	0.14	0.32	0.14	0.12	0.14	0.12	0.21	0.18	0.16	0.12	0.34	0.18	0.15	0.17
O3'	0.20	0.18	0.22	0.26	0.18	0.17	0.21	0.26	0.20	0.19	0.17	0.18	0.21	0.20	0.20	0.20	0.03	0.02	0.01	0.01
O4	0.14	0.18	0.14	0.14	0.19	0.11	0.18	0.23	0.15	0.14	0.20	0.22	0.21	0.17	0.14	0.10	0.26	0.19	0.28	0.19
O4'	0.08	0.13	0.07	0.11	0.17	0.09	0.19	0.18	0.15	0.09	0.15	0.19	0.17	0.11	0.10	0.07	0.14	0.03	0.11	0.03
O5'	0.13	0.18	0.14	0.18	0.22	0.16	0.23	0.26	0.17	0.15	0.20	0.24	0.20	0.16	0.19	0.12	0.08	0.21	0.20	0.14
OP1	0.24	0.24	0.28	0.34	0.28	0.36	0.29	0.47	0.25	0.23	0.25	0.31	0.25	0.31	0.41	0.26	0.28	0.42	0.32	0.33
OP2	0.20	0.23	0.23	0.29	0.30	0.29	0.28	0.44	0.22	0.21	0.27	0.34	0.23	0.23	0.33	0.21	0.18	0.31	0.26	0.22
P	0.16	0.20	0.19	0.24	0.25	0.24	0.25	0.36	0.19	0.18	0.23	0.28	0.21	0.20	0.28	0.17	0.15	0.29	0.22	0.20

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.05	0.02	0.01	0.04	0.03	0.06	0.02	0.01	0.01	0.17	0.20	0.14	0.11
C2	0.04	0.00	0.07	0.09	0.01	0.06	0.03	0.18	0.04	0.02	0.01	0.02	0.00	0.14	0.08	0.04	0.25	0.20	0.15	0.14
C2'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.06	0.02	0.05	0.03	0.05	0.03	0.07	0.06	0.10	0.01	0.02	0.02	0.18	0.22	0.11	0.12
C3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.13	0.01	0.15	0.03	0.13	0.09	0.11	0.14	0.09	0.01	0.00	0.03	0.24	0.28	0.12	0.16
C4	0.03	0.01	0.06	0.13	0.00	0.13	0.01	0.32	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.10	0.14	0.04	0.31	0.21	0.25	0.20
C4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.13	0.00	0.16	0.01	0.15	0.08	0.09	0.14	0.06	0.06	0.02	0.01	0.04	0.16	0.27	0.04
C5	0.02	0.03	0.05	0.15	0.01	0.16	0.00	0.37	0.01	0.01	0.03	0.02	0.04	0.05	0.17	0.04	0.32	0.23	0.27	0.22
C5'	0.05	0.18	0.03	0.03	0.32	0.01	0.37	0.00	0.31	0.19	0.25	0.35	0.11	0.06	0.03	0.02	0.01	0.23	0.40	0.02
C6	0.02	0.04	0.05	0.13	0.01	0.15	0.01	0.31	0.00	0.02	0.02	0.01	0.04	0.04	0.15	0.03	0.30	0.20	0.20	0.18
N1	0.01	0.02	0.03	0.09	0.01	0.08	0.01	0.19	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.06	0.07	0.02	0.24	0.19	0.15	0.14
N3	0.04	0.01	0.07	0.11	0.01	0.09	0.03	0.25	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.15	0.11	0.04	0.27	0.19	0.20	0.16
N4	0.03	0.02	0.06	0.14	0.01	0.14	0.02	0.35	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.12	0.16	0.03	0.32	0.24	0.29	0.22
O2	0.06	0.00	0.10	0.09	0.02	0.06	0.04	0.11	0.04	0.03	0.01	0.02	0.00	0.20	0.10	0.06	0.22	0.22	0.14	0.14
O2'	0.02	0.14	0.01	0.01	0.10	0.06	0.05	0.06	0.04	0.06	0.15	0.12	0.20	0.00	0.05	0.08	0.10	0.16	0.21	0.11
O3'	0.01	0.08	0.02	0.00	0.14	0.02	0.17	0.03	0.15	0.07	0.11	0.16	0.10	0.05	0.00	0.01	0.13	0.22	0.20	0.10
O4'	0.01	0.04	0.02	0.03	0.04	0.01	0.04	0.02	0.03	0.02	0.04	0.03	0.06	0.08	0.01	0.00	0.15	0.19	0.17	0.11
O5'	0.17	0.25	0.18	0.24	0.31	0.04	0.32	0.01	0.30	0.24	0.27	0.32	0.22	0.10	0.13	0.15	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.20	0.20	0.22	0.28	0.21	0.16	0.23	0.23	0.20	0.19	0.19	0.24	0.22	0.16	0.22	0.19	0.01	0.00	0.02	0.00
OP2	0.14	0.15	0.11	0.12	0.25	0.27	0.27	0.40	0.20	0.15	0.20	0.29	0.14	0.21	0.20	0.17	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.11	0.14	0.12	0.16	0.20	0.04	0.22	0.02	0.18	0.14	0.16	0.22	0.14	0.11	0.10	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00