Doublet Group distance statistics: 48970

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 1, 0, 1, 2, 4, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.001, 0.006, 0.011, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.006 std_dev=0.005
N3	A	0, 0.003, 0.009, 0.014, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.009 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.003, 0.015, 0.026, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.015 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.004, 0.020, 0.035, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.020 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.007, 0.023, 0.038, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.023 std_dev=0.016
C2	A	0, 0.007, 0.023, 0.039, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.023 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.005, 0.021, 0.038, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.021 std_dev=0.016
O2	A	0, 0.017, 0.052, 0.087, 0.113 max_d=0.113 avg_d=0.052 std_dev=0.035
O4'	A	0, 0.022, 0.095, 0.168, 0.262 max_d=0.262 avg_d=0.095 std_dev=0.073
O4	A	0, -0.003, 0.074, 0.151, 0.252 max_d=0.252 avg_d=0.074 std_dev=0.077
C2'	A	0, 0.059, 0.206, 0.352, 0.473 max_d=0.473 avg_d=0.206 std_dev=0.147
C4'	A	0, 0.087, 0.235, 0.383, 0.505 max_d=0.505 avg_d=0.235 std_dev=0.148
C3'	A	0, 0.116, 0.337, 0.558, 0.697 max_d=0.697 avg_d=0.337 std_dev=0.221
N1	B	0, 0.244, 0.465, 0.687, 0.826 max_d=0.826 avg_d=0.465 std_dev=0.221
O2'	A	0, 0.109, 0.343, 0.578, 0.769 max_d=0.769 avg_d=0.343 std_dev=0.235
C2	B	0, 0.228, 0.474, 0.721, 0.972 max_d=0.972 avg_d=0.474 std_dev=0.247
C5'	A	0, 0.155, 0.409, 0.662, 0.799 max_d=0.799 avg_d=0.409 std_dev=0.254
O2	B	0, 0.253, 0.508, 0.762, 0.948 max_d=0.948 avg_d=0.508 std_dev=0.255
C1'	B	0, 0.266, 0.523, 0.779, 1.002 max_d=1.002 avg_d=0.523 std_dev=0.257
O5'	A	0, 0.234, 0.501, 0.769, 0.885 max_d=0.885 avg_d=0.501 std_dev=0.268
C6	B	0, 0.293, 0.563, 0.833, 0.921 max_d=0.921 avg_d=0.563 std_dev=0.270
N3	B	0, 0.297, 0.611, 0.925, 1.202 max_d=1.202 avg_d=0.611 std_dev=0.314
O4'	B	0, 0.307, 0.625, 0.943, 1.157 max_d=1.157 avg_d=0.625 std_dev=0.318
C2'	B	0, 0.308, 0.636, 0.965, 1.200 max_d=1.200 avg_d=0.636 std_dev=0.328
C5	B	0, 0.312, 0.655, 0.999, 1.128 max_d=1.128 avg_d=0.655 std_dev=0.344
C4	B	0, 0.327, 0.685, 1.044, 1.265 max_d=1.265 avg_d=0.685 std_dev=0.359
O3'	A	0, 0.192, 0.553, 0.914, 1.154 max_d=1.154 avg_d=0.553 std_dev=0.361
C3'	B	0, 0.370, 0.775, 1.180, 1.282 max_d=1.282 avg_d=0.775 std_dev=0.405
O2'	B	0, 0.328, 0.748, 1.168, 1.448 max_d=1.448 avg_d=0.748 std_dev=0.420
C4'	B	0, 0.367, 0.787, 1.207, 1.323 max_d=1.323 avg_d=0.787 std_dev=0.420
P	A	0, 0.327, 0.749, 1.171, 1.631 max_d=1.631 avg_d=0.749 std_dev=0.422
O5'	B	0, 0.258, 0.688, 1.118, 1.417 max_d=1.417 avg_d=0.688 std_dev=0.430
N4	B	0, 0.444, 0.882, 1.319, 1.496 max_d=1.496 avg_d=0.882 std_dev=0.438
C5'	B	0, 0.413, 0.889, 1.366, 1.489 max_d=1.489 avg_d=0.889 std_dev=0.476
P	B	0, 0.268, 0.759, 1.249, 1.623 max_d=1.623 avg_d=0.759 std_dev=0.491
OP2	B	0, 0.395, 0.907, 1.420, 1.756 max_d=1.756 avg_d=0.907 std_dev=0.512
OP1	A	0, 0.308, 0.821, 1.334, 1.984 max_d=1.984 avg_d=0.821 std_dev=0.513
O3'	B	0, 0.425, 0.949, 1.473, 1.681 max_d=1.681 avg_d=0.949 std_dev=0.524
OP2	A	0, 0.441, 1.033, 1.626, 2.318 max_d=2.318 avg_d=1.033 std_dev=0.593
OP1	B	0, 0.362, 1.002, 1.642, 2.150 max_d=2.150 avg_d=1.002 std_dev=0.640

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.00	0.06	0.07	0.08	0.07
C2	0.02	0.00	0.05	0.08	0.01	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.08	0.01	0.02	0.19	0.23	0.19	0.22
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.07	0.01	0.07	0.02	0.06	0.03	0.05	0.09	0.01	0.01	0.08	0.01	0.07	0.12	0.23	0.11
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.15	0.00	0.16	0.02	0.14	0.08	0.12	0.10	0.01	0.01	0.18	0.01	0.10	0.18	0.35	0.16
C4	0.02	0.01	0.07	0.15	0.00	0.11	0.01	0.20	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.18	0.00	0.03	0.27	0.39	0.36	0.30
C4'	0.00	0.06	0.01	0.00	0.11	0.00	0.11	0.01	0.10	0.05	0.08	0.05	0.04	0.02	0.12	0.00	0.02	0.07	0.21	0.03
C5	0.01	0.01	0.07	0.16	0.01	0.11	0.00	0.20	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.19	0.01	0.03	0.26	0.38	0.42	0.26
C5'	0.03	0.12	0.02	0.02	0.20	0.01	0.20	0.00	0.17	0.11	0.16	0.10	0.04	0.03	0.22	0.01	0.01	0.06	0.21	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.14	0.01	0.10	0.01	0.17	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.15	0.02	0.02	0.20	0.28	0.31	0.18
N1	0.01	0.01	0.03	0.08	0.01	0.05	0.01	0.11	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.08	0.02	0.01	0.15	0.19	0.17	0.15
N3	0.02	0.00	0.05	0.12	0.01	0.08	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.13	0.01	0.02	0.23	0.32	0.26	0.28
O2	0.03	0.01	0.09	0.10	0.01	0.05	0.02	0.10	0.02	0.02	0.01	0.00	0.09	0.11	0.02	0.03	0.17	0.20	0.20	0.21
O2'	0.02	0.05	0.01	0.01	0.04	0.04	0.04	0.04	0.03	0.02	0.04	0.09	0.00	0.02	0.05	0.04	0.07	0.13	0.28	0.10
O3'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.18	0.02	0.19	0.03	0.15	0.08	0.13	0.11	0.02	0.00	0.22	0.02	0.14	0.31	0.54	0.23
O4	0.02	0.01	0.08	0.18	0.00	0.12	0.01	0.22	0.02	0.02	0.01	0.02	0.05	0.22	0.00	0.03	0.29	0.45	0.42	0.35
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.04	0.02	0.03	0.00	0.06	0.08	0.13	0.12
O5'	0.06	0.19	0.07	0.10	0.27	0.02	0.26	0.01	0.20	0.15	0.23	0.17	0.07	0.14	0.29	0.06	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.07	0.23	0.12	0.18	0.39	0.07	0.38	0.06	0.28	0.19	0.32	0.20	0.13	0.31	0.45	0.08	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.08	0.19	0.23	0.35	0.36	0.21	0.42	0.21	0.31	0.17	0.26	0.20	0.28	0.54	0.42	0.13	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.07	0.22	0.11	0.16	0.30	0.03	0.26	0.01	0.18	0.15	0.28	0.21	0.10	0.23	0.35	0.12	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.28	0.22	0.29	0.35	0.27	0.38	0.24	0.44	0.24	0.23	0.26	0.33	0.22	0.33	0.37	0.33	0.14	0.05	0.09	0.03
C2	0.27	0.21	0.26	0.29	0.25	0.32	0.18	0.36	0.22	0.22	0.26	0.31	0.21	0.28	0.30	0.31	0.21	0.13	0.17	0.12
C2'	0.23	0.19	0.26	0.34	0.23	0.35	0.21	0.43	0.21	0.20	0.22	0.26	0.18	0.28	0.37	0.28	0.14	0.08	0.10	0.05
C3'	0.15	0.15	0.18	0.26	0.20	0.25	0.18	0.33	0.16	0.14	0.18	0.23	0.14	0.19	0.30	0.18	0.08	0.01	0.05	0.01
C4	0.21	0.16	0.19	0.24	0.18	0.27	0.13	0.33	0.20	0.18	0.21	0.30	0.18	0.20	0.24	0.26	0.30	0.24	0.32	0.25
C4'	0.19	0.17	0.21	0.28	0.23	0.30	0.21	0.37	0.17	0.16	0.21	0.29	0.16	0.25	0.33	0.23	0.07	0.05	0.08	0.04
C5	0.22	0.18	0.20	0.25	0.23	0.29	0.15	0.36	0.19	0.18	0.24	0.35	0.19	0.21	0.26	0.27	0.30	0.26	0.35	0.27
C5'	0.14	0.14	0.16	0.23	0.24	0.24	0.21	0.31	0.15	0.13	0.20	0.31	0.13	0.19	0.28	0.18	0.08	0.13	0.15	0.09
C6	0.24	0.20	0.23	0.28	0.27	0.32	0.19	0.38	0.20	0.20	0.26	0.37	0.21	0.24	0.29	0.29	0.25	0.20	0.28	0.21
N1	0.26	0.21	0.26	0.30	0.28	0.33	0.21	0.39	0.22	0.22	0.27	0.35	0.21	0.28	0.31	0.31	0.19	0.10	0.16	0.11
N3	0.23	0.18	0.22	0.25	0.19	0.28	0.13	0.32	0.20	0.19	0.23	0.28	0.19	0.23	0.25	0.27	0.25	0.17	0.24	0.18
O2	0.32	0.23	0.32	0.35	0.24	0.37	0.22	0.39	0.27	0.26	0.25	0.28	0.22	0.33	0.36	0.36	0.25	0.19	0.20	0.17
O2'	0.28	0.22	0.33	0.40	0.22	0.42	0.20	0.50	0.21	0.22	0.23	0.25	0.22	0.36	0.44	0.32	0.18	0.13	0.11	0.09
O3'	0.14	0.14	0.17	0.25	0.15	0.21	0.13	0.28	0.13	0.13	0.14	0.16	0.14	0.18	0.31	0.15	0.01	0.01	0.02	0.01
O4	0.22	0.16	0.20	0.25	0.16	0.27	0.21	0.33	0.25	0.20	0.18	0.23	0.17	0.20	0.25	0.26	0.36	0.31	0.40	0.32
O4'	0.25	0.21	0.25	0.31	0.29	0.34	0.25	0.41	0.22	0.20	0.26	0.37	0.20	0.29	0.34	0.29	0.11	0.02	0.09	0.02
O5'	0.17	0.16	0.20	0.29	0.25	0.28	0.22	0.36	0.17	0.15	0.21	0.33	0.14	0.21	0.33	0.21	0.26	0.20	0.30	0.22
OP1	0.22	0.20	0.30	0.41	0.28	0.39	0.25	0.47	0.21	0.20	0.25	0.37	0.18	0.31	0.49	0.27	0.44	0.52	0.57	0.47
OP2	0.35	0.26	0.45	0.58	0.31	0.54	0.31	0.64	0.33	0.30	0.28	0.38	0.25	0.44	0.65	0.40	0.66	0.63	0.75	0.66
P	0.26	0.26	0.32	0.40	0.35	0.36	0.33	0.44	0.29	0.26	0.31	0.41	0.24	0.31	0.45	0.28	0.40	0.28	0.48	0.35

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.05	0.07	0.32	0.11
C2	0.02	0.00	0.06	0.08	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.05	0.09	0.03	0.11	0.09	0.28	0.11
C2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.05	0.01	0.04	0.01	0.05	0.02	0.06	0.05	0.09	0.00	0.02	0.01	0.14	0.14	0.27	0.08
C3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.09	0.00	0.09	0.02	0.08	0.05	0.09	0.10	0.09	0.02	0.01	0.01	0.25	0.20	0.23	0.13
C4	0.02	0.01	0.05	0.09	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.11	0.03	0.21	0.11	0.22	0.10
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.06	0.03	0.04	0.06	0.03	0.04	0.02	0.00	0.01	0.07	0.25	0.04
C5	0.02	0.01	0.04	0.09	0.00	0.07	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.10	0.03	0.23	0.11	0.23	0.10
C5'	0.02	0.04	0.01	0.02	0.09	0.00	0.10	0.00	0.09	0.05	0.07	0.11	0.03	0.04	0.02	0.01	0.01	0.05	0.20	0.01
C6	0.02	0.01	0.05	0.08	0.01	0.06	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.08	0.04	0.18	0.09	0.29	0.10
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.11	0.08	0.31	0.11
N3	0.02	0.00	0.06	0.09	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.06	0.11	0.03	0.16	0.10	0.24	0.10
N4	0.02	0.02	0.05	0.10	0.00	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.05	0.13	0.03	0.23	0.13	0.18	0.12
O2	0.02	0.00	0.09	0.09	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.08	0.11	0.04	0.08	0.10	0.30	0.12
O2'	0.01	0.05	0.00	0.02	0.05	0.04	0.04	0.04	0.04	0.02	0.06	0.05	0.08	0.00	0.02	0.03	0.07	0.12	0.26	0.05
O3'	0.02	0.09	0.02	0.01	0.11	0.02	0.10	0.02	0.08	0.05	0.11	0.13	0.11	0.02	0.00	0.02	0.29	0.30	0.20	0.20
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.03	0.03	0.04	0.03	0.02	0.00	0.15	0.11	0.35	0.16
O5'	0.05	0.11	0.14	0.25	0.21	0.01	0.23	0.01	0.18	0.11	0.16	0.23	0.08	0.07	0.29	0.15	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.07	0.09	0.14	0.20	0.11	0.07	0.11	0.05	0.09	0.08	0.10	0.13	0.10	0.12	0.30	0.11	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.32	0.28	0.27	0.23	0.22	0.25	0.23	0.20	0.29	0.31	0.24	0.18	0.30	0.26	0.20	0.35	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.11	0.08	0.13	0.10	0.04	0.10	0.01	0.10	0.11	0.10	0.12	0.12	0.05	0.20	0.16	0.00	0.01	0.00	0.00