Doublet Group distance statistics: 48971

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 2, 3, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.004, 0.007, 0.010, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.007 std_dev=0.003
N3	A	0, 0.005, 0.012, 0.019, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.012 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.005, 0.013, 0.022, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.007, 0.017, 0.028, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.017 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.006, 0.017, 0.028, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.017 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.007, 0.018, 0.029, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.018 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.005, 0.019, 0.034, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.019 std_dev=0.015
O2	A	0, 0.018, 0.050, 0.083, 0.116 max_d=0.116 avg_d=0.050 std_dev=0.033
O4	A	0, 0.001, 0.054, 0.107, 0.170 max_d=0.170 avg_d=0.054 std_dev=0.053
N1	B	0, 0.130, 0.299, 0.467, 0.607 max_d=0.607 avg_d=0.299 std_dev=0.169
C2	B	0, 0.239, 0.443, 0.647, 0.730 max_d=0.730 avg_d=0.443 std_dev=0.204
C1'	B	0, 0.140, 0.362, 0.584, 0.782 max_d=0.782 avg_d=0.362 std_dev=0.222
O4'	A	0, 0.019, 0.243, 0.467, 0.692 max_d=0.692 avg_d=0.243 std_dev=0.224
C2'	A	0, 0.048, 0.292, 0.537, 0.761 max_d=0.761 avg_d=0.292 std_dev=0.244
C2'	B	0, 0.180, 0.433, 0.686, 0.801 max_d=0.801 avg_d=0.433 std_dev=0.253
O2'	A	0, 0.121, 0.400, 0.678, 0.892 max_d=0.892 avg_d=0.400 std_dev=0.278
O2	B	0, 0.316, 0.602, 0.888, 1.076 max_d=1.076 avg_d=0.602 std_dev=0.286
C3'	B	0, 0.173, 0.486, 0.798, 1.022 max_d=1.022 avg_d=0.486 std_dev=0.313
C4'	A	0, 0.071, 0.387, 0.703, 1.028 max_d=1.028 avg_d=0.387 std_dev=0.316
C3'	A	0, 0.067, 0.437, 0.807, 1.172 max_d=1.172 avg_d=0.437 std_dev=0.370
O3'	B	0, 0.327, 0.698, 1.070, 1.122 max_d=1.122 avg_d=0.698 std_dev=0.372
N3	B	0, 0.255, 0.636, 1.017, 1.365 max_d=1.365 avg_d=0.636 std_dev=0.381
O5'	B	0, 0.179, 0.595, 1.012, 1.366 max_d=1.366 avg_d=0.595 std_dev=0.416
O2'	B	0, 0.347, 0.768, 1.188, 1.376 max_d=1.376 avg_d=0.768 std_dev=0.421
C6	B	0, -0.017, 0.425, 0.867, 1.326 max_d=1.326 avg_d=0.425 std_dev=0.442
O4'	B	0, 0.011, 0.471, 0.931, 1.491 max_d=1.491 avg_d=0.471 std_dev=0.460
OP2	B	0, 0.248, 0.734, 1.219, 1.441 max_d=1.441 avg_d=0.734 std_dev=0.486
O5'	A	0, 0.196, 0.705, 1.214, 1.763 max_d=1.763 avg_d=0.705 std_dev=0.509
P	B	0, 0.204, 0.731, 1.258, 1.654 max_d=1.654 avg_d=0.731 std_dev=0.527
C4'	B	0, 0.103, 0.632, 1.161, 1.724 max_d=1.724 avg_d=0.632 std_dev=0.529
C5'	A	0, 0.143, 0.676, 1.208, 1.746 max_d=1.746 avg_d=0.676 std_dev=0.532
O3'	A	0, 0.144, 0.683, 1.222, 1.751 max_d=1.751 avg_d=0.683 std_dev=0.539
C4	B	0, 0.151, 0.719, 1.286, 1.844 max_d=1.844 avg_d=0.719 std_dev=0.568
C5	B	0, 0.018, 0.637, 1.255, 1.858 max_d=1.858 avg_d=0.637 std_dev=0.618
P	A	0, 0.499, 1.142, 1.785, 2.366 max_d=2.366 avg_d=1.142 std_dev=0.643
OP1	A	0, 0.531, 1.193, 1.854, 2.449 max_d=2.449 avg_d=1.193 std_dev=0.662
OP2	A	0, 0.862, 1.573, 2.284, 2.728 max_d=2.728 avg_d=1.573 std_dev=0.711
C5'	B	0, 0.041, 0.815, 1.588, 2.359 max_d=2.359 avg_d=0.815 std_dev=0.774
OP1	B	0, 0.211, 0.985, 1.759, 2.305 max_d=2.305 avg_d=0.985 std_dev=0.774
N4	B	0, 0.180, 0.989, 1.799, 2.581 max_d=2.581 avg_d=0.989 std_dev=0.810

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.07	0.08	0.12	0.10
C2	0.02	0.00	0.10	0.10	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.11	0.01	0.04	0.14	0.16	0.22	0.18
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.09	0.03	0.08	0.18	0.00	0.01	0.06	0.01	0.03	0.05	0.09	0.04
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.09	0.04	0.08	0.15	0.01	0.01	0.06	0.01	0.06	0.08	0.11	0.06
C4	0.02	0.01	0.05	0.05	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.06	0.00	0.03	0.16	0.22	0.28	0.23
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.04	0.03	0.04	0.06	0.02	0.02	0.05	0.00	0.01	0.04	0.03	0.02
C5	0.01	0.01	0.07	0.07	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.10	0.00	0.04	0.16	0.21	0.27	0.23
C5'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.08	0.00	0.08	0.00	0.08	0.05	0.07	0.06	0.02	0.02	0.09	0.01	0.01	0.06	0.01	0.02
C6	0.01	0.01	0.09	0.09	0.01	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.02	0.01	0.06	0.11	0.01	0.05	0.14	0.17	0.21	0.19
N1	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.02	0.12	0.14	0.18	0.16
N3	0.02	0.00	0.08	0.08	0.00	0.04	0.01	0.07	0.02	0.01	0.00	0.01	0.07	0.10	0.01	0.03	0.15	0.19	0.26	0.21
O2	0.05	0.00	0.18	0.15	0.01	0.06	0.01	0.06	0.01	0.02	0.01	0.00	0.15	0.19	0.01	0.06	0.14	0.14	0.20	0.16
O2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.05	0.02	0.06	0.02	0.06	0.02	0.07	0.15	0.00	0.03	0.06	0.03	0.03	0.05	0.08	0.03
O3'	0.01	0.11	0.01	0.01	0.06	0.02	0.10	0.02	0.11	0.04	0.10	0.19	0.03	0.00	0.07	0.01	0.10	0.17	0.18	0.13
O4	0.02	0.01	0.06	0.06	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.07	0.00	0.03	0.16	0.24	0.30	0.24
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.03	0.06	0.03	0.01	0.03	0.00	0.08	0.10	0.09	0.10
O5'	0.07	0.14	0.03	0.06	0.16	0.01	0.16	0.01	0.14	0.12	0.15	0.14	0.03	0.10	0.16	0.08	0.00	0.03	0.02	0.00
OP1	0.08	0.16	0.05	0.08	0.22	0.04	0.21	0.06	0.17	0.14	0.19	0.14	0.05	0.17	0.24	0.10	0.03	0.00	0.00	0.00
OP2	0.12	0.22	0.09	0.11	0.28	0.03	0.27	0.01	0.21	0.18	0.26	0.20	0.08	0.18	0.30	0.09	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.10	0.18	0.04	0.06	0.23	0.02	0.23	0.02	0.19	0.16	0.21	0.16	0.03	0.13	0.24	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.10	0.21	0.09	0.46	0.16	0.59	0.16	0.44	0.14	0.23	0.57	0.25	0.46	0.17	0.14	0.14	0.04	0.11	0.07
C2	0.13	0.12	0.20	0.07	0.33	0.08	0.43	0.16	0.34	0.10	0.17	0.40	0.33	0.41	0.15	0.07	0.09	0.11	0.15	0.07
C2'	0.14	0.16	0.16	0.13	0.45	0.16	0.57	0.21	0.46	0.21	0.27	0.52	0.16	0.35	0.15	0.15	0.21	0.06	0.17	0.12
C3'	0.07	0.23	0.10	0.22	0.59	0.08	0.72	0.21	0.58	0.29	0.39	0.68	0.07	0.14	0.14	0.06	0.03	0.03	0.06	0.02
C4	0.19	0.13	0.19	0.13	0.26	0.17	0.27	0.12	0.16	0.08	0.14	0.34	0.30	0.29	0.15	0.17	0.13	0.09	0.25	0.11
C4'	0.04	0.21	0.06	0.19	0.67	0.08	0.81	0.23	0.61	0.27	0.41	0.80	0.08	0.22	0.12	0.07	0.05	0.05	0.20	0.08
C5	0.25	0.09	0.20	0.15	0.37	0.25	0.37	0.21	0.18	0.09	0.18	0.50	0.24	0.32	0.17	0.29	0.11	0.15	0.30	0.17
C5'	0.11	0.31	0.18	0.30	0.80	0.09	0.92	0.20	0.67	0.35	0.52	0.96	0.14	0.15	0.26	0.08	0.17	0.09	0.36	0.16
C6	0.24	0.08	0.21	0.13	0.45	0.25	0.50	0.18	0.29	0.06	0.22	0.57	0.24	0.38	0.17	0.29	0.11	0.15	0.27	0.17
N1	0.19	0.09	0.20	0.08	0.42	0.15	0.52	0.09	0.37	0.09	0.21	0.52	0.28	0.42	0.16	0.15	0.08	0.05	0.18	0.08
N3	0.14	0.14	0.19	0.10	0.26	0.10	0.32	0.11	0.24	0.07	0.16	0.32	0.35	0.34	0.14	0.09	0.12	0.10	0.19	0.08
O2	0.09	0.14	0.20	0.08	0.31	0.12	0.43	0.30	0.36	0.14	0.17	0.36	0.35	0.44	0.15	0.17	0.11	0.20	0.12	0.12
O2'	0.25	0.20	0.31	0.26	0.42	0.29	0.53	0.35	0.44	0.24	0.26	0.49	0.25	0.50	0.33	0.26	0.36	0.10	0.14	0.15
O3'	0.13	0.27	0.18	0.30	0.57	0.14	0.68	0.29	0.55	0.32	0.40	0.65	0.12	0.08	0.24	0.09	0.02	0.02	0.02	0.00
O4	0.17	0.16	0.17	0.14	0.20	0.15	0.18	0.14	0.12	0.12	0.17	0.27	0.27	0.23	0.14	0.16	0.18	0.11	0.26	0.12
O4'	0.11	0.11	0.10	0.08	0.60	0.11	0.73	0.19	0.53	0.19	0.32	0.73	0.19	0.37	0.06	0.11	0.06	0.04	0.13	0.04
O5'	0.16	0.36	0.23	0.30	0.83	0.08	0.92	0.07	0.64	0.36	0.57	1.00	0.23	0.16	0.27	0.13	0.18	0.11	0.21	0.09
OP1	0.20	0.44	0.30	0.32	0.88	0.10	0.88	0.08	0.58	0.39	0.66	1.12	0.34	0.20	0.33	0.18	0.18	0.22	0.27	0.11
OP2	0.26	0.47	0.33	0.31	0.87	0.17	0.81	0.14	0.51	0.38	0.67	1.12	0.40	0.28	0.32	0.25	0.20	0.23	0.22	0.15
P	0.21	0.43	0.28	0.31	0.88	0.10	0.89	0.05	0.59	0.38	0.64	1.10	0.32	0.20	0.30	0.17	0.19	0.19	0.23	0.12

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.18	0.16	0.21	0.06
C2	0.02	0.00	0.06	0.08	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.09	0.03	0.42	0.33	0.13	0.27
C2'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.03	0.02	0.05	0.05	0.10	0.00	0.02	0.00	0.24	0.28	0.11	0.15
C3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.08	0.00	0.08	0.01	0.07	0.05	0.08	0.09	0.10	0.02	0.01	0.01	0.33	0.37	0.11	0.24
C4	0.01	0.00	0.04	0.08	0.00	0.08	0.00	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.10	0.04	0.67	0.54	0.39	0.54
C4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.08	0.00	0.09	0.00	0.08	0.05	0.06	0.09	0.05	0.04	0.02	0.00	0.02	0.13	0.33	0.04
C5	0.01	0.00	0.04	0.08	0.00	0.09	0.00	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.09	0.04	0.73	0.57	0.42	0.60
C5'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.14	0.00	0.15	0.00	0.13	0.08	0.11	0.16	0.07	0.04	0.02	0.01	0.01	0.18	0.38	0.02
C6	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.08	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.07	0.04	0.63	0.46	0.21	0.46
N1	0.00	0.01	0.02	0.05	0.01	0.05	0.01	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.02	0.43	0.32	0.10	0.27
N3	0.01	0.00	0.05	0.08	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.10	0.03	0.54	0.43	0.26	0.40
N4	0.01	0.00	0.05	0.09	0.00	0.09	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.11	0.04	0.72	0.61	0.51	0.62
O2	0.03	0.00	0.10	0.10	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.07	0.11	0.04	0.29	0.23	0.14	0.16
O2'	0.02	0.04	0.00	0.02	0.03	0.04	0.03	0.04	0.03	0.01	0.04	0.04	0.07	0.00	0.03	0.03	0.03	0.14	0.22	0.04
O3'	0.01	0.09	0.02	0.01	0.10	0.02	0.09	0.02	0.07	0.05	0.10	0.11	0.11	0.03	0.00	0.01	0.21	0.36	0.15	0.21
O4'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.03	0.04	0.04	0.03	0.01	0.00	0.02	0.06	0.39	0.08
O5'	0.18	0.42	0.24	0.33	0.67	0.02	0.73	0.01	0.63	0.43	0.54	0.72	0.29	0.03	0.21	0.02	0.00	0.01	0.03	0.00
OP1	0.16	0.33	0.28	0.37	0.54	0.13	0.57	0.18	0.46	0.32	0.43	0.61	0.23	0.14	0.36	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.21	0.13	0.11	0.11	0.39	0.33	0.42	0.38	0.21	0.10	0.26	0.51	0.14	0.22	0.15	0.39	0.03	0.00	0.00	0.00
P	0.06	0.27	0.15	0.24	0.54	0.04	0.60	0.02	0.46	0.27	0.40	0.62	0.16	0.04	0.21	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00