Doublet Group distance statistics: 48972

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 3, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.002, 0.005, 0.007, 0.007 max_d=0.007 avg_d=0.005 std_dev=0.002
C5	A	0, 0.002, 0.005, 0.008, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.005 std_dev=0.003
C6	A	0, 0.005, 0.008, 0.011, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.008 std_dev=0.003
C2	A	0, 0.003, 0.008, 0.012, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.008 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.001, 0.007, 0.012, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.007 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.002, 0.008, 0.015, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.008 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.004, 0.010, 0.017, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.010 std_dev=0.006
O2	A	0, 0.008, 0.020, 0.031, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.020 std_dev=0.012
O4	A	0, 0.006, 0.026, 0.046, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.026 std_dev=0.020
O4'	A	0, 0.018, 0.066, 0.114, 0.175 max_d=0.175 avg_d=0.066 std_dev=0.048
C2'	A	0, 0.036, 0.090, 0.144, 0.207 max_d=0.207 avg_d=0.090 std_dev=0.054
O2'	A	0, 0.040, 0.109, 0.177, 0.253 max_d=0.253 avg_d=0.109 std_dev=0.068
C3'	A	0, 0.051, 0.149, 0.248, 0.383 max_d=0.383 avg_d=0.149 std_dev=0.098
C4'	A	0, 0.023, 0.128, 0.233, 0.396 max_d=0.396 avg_d=0.128 std_dev=0.105
O3'	A	0, 0.080, 0.211, 0.341, 0.506 max_d=0.506 avg_d=0.211 std_dev=0.131
O5'	A	0, 0.016, 0.167, 0.318, 0.561 max_d=0.561 avg_d=0.167 std_dev=0.151
C6	B	0, 0.178, 0.338, 0.497, 0.657 max_d=0.657 avg_d=0.338 std_dev=0.159
C5	B	0, 0.170, 0.340, 0.511, 0.583 max_d=0.583 avg_d=0.340 std_dev=0.171
C5'	A	0, 0.014, 0.194, 0.374, 0.644 max_d=0.644 avg_d=0.194 std_dev=0.180
O3'	B	0, 0.189, 0.401, 0.612, 0.775 max_d=0.775 avg_d=0.401 std_dev=0.211
P	A	0, 0.013, 0.257, 0.501, 0.892 max_d=0.892 avg_d=0.257 std_dev=0.244
C4	B	0, 0.152, 0.403, 0.654, 0.744 max_d=0.744 avg_d=0.403 std_dev=0.251
N1	B	0, 0.117, 0.372, 0.627, 1.029 max_d=1.029 avg_d=0.372 std_dev=0.255
C3'	B	0, 0.133, 0.390, 0.646, 0.948 max_d=0.948 avg_d=0.390 std_dev=0.257
C2	B	0, 0.110, 0.426, 0.743, 1.200 max_d=1.200 avg_d=0.426 std_dev=0.317
N3	B	0, 0.126, 0.445, 0.764, 1.087 max_d=1.087 avg_d=0.445 std_dev=0.319
OP1	A	0, 0.015, 0.350, 0.684, 1.190 max_d=1.190 avg_d=0.350 std_dev=0.334
N4	B	0, 0.169, 0.510, 0.851, 1.036 max_d=1.036 avg_d=0.510 std_dev=0.341
OP2	A	0, -0.053, 0.331, 0.715, 1.374 max_d=1.374 avg_d=0.331 std_dev=0.384
O2	B	0, 0.054, 0.501, 0.949, 1.659 max_d=1.659 avg_d=0.501 std_dev=0.448
C1'	B	0, -0.021, 0.446, 0.913, 1.724 max_d=1.724 avg_d=0.446 std_dev=0.467
O5'	B	0, -0.095, 0.378, 0.852, 1.645 max_d=1.645 avg_d=0.378 std_dev=0.474
OP2	B	0, 0.049, 0.558, 1.067, 1.762 max_d=1.762 avg_d=0.558 std_dev=0.509
P	B	0, -0.016, 0.508, 1.032, 1.775 max_d=1.775 avg_d=0.508 std_dev=0.524
C4'	B	0, -0.095, 0.475, 1.045, 2.026 max_d=2.026 avg_d=0.475 std_dev=0.570
C5'	B	0, -0.090, 0.487, 1.063, 2.054 max_d=2.054 avg_d=0.487 std_dev=0.577
C2'	B	0, -0.073, 0.509, 1.090, 2.112 max_d=2.112 avg_d=0.509 std_dev=0.581
O4'	B	0, -0.259, 0.520, 1.299, 2.692 max_d=2.692 avg_d=0.520 std_dev=0.779
OP1	B	0, -0.112, 0.695, 1.502, 2.796 max_d=2.796 avg_d=0.695 std_dev=0.807
O2'	B	0, -0.489, 0.870, 2.228, 4.684 max_d=4.684 avg_d=0.870 std_dev=1.358

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.03	0.10	0.07
C2	0.01	0.00	0.01	0.05	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.04	0.01	0.02	0.10	0.11	0.23	0.16
C2'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.01	0.04	0.00	0.01	0.04	0.00	0.03	0.11	0.07	0.04
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.06	0.01	0.07	0.02	0.06	0.04	0.05	0.05	0.01	0.01	0.06	0.01	0.05	0.15	0.12	0.09
C4	0.02	0.00	0.04	0.06	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.07	0.01	0.02	0.13	0.22	0.32	0.23
C4'	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.02	0.08	0.03	0.02
C5	0.01	0.00	0.05	0.07	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.08	0.01	0.02	0.14	0.23	0.31	0.23
C5'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.08	0.01	0.09	0.00	0.08	0.05	0.06	0.02	0.01	0.04	0.08	0.01	0.01	0.06	0.02	0.02
C6	0.01	0.00	0.04	0.06	0.01	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.07	0.01	0.01	0.12	0.16	0.23	0.18
N1	0.00	0.00	0.02	0.04	0.01	0.02	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01	0.09	0.10	0.19	0.14
N3	0.01	0.00	0.01	0.05	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.05	0.01	0.02	0.12	0.17	0.28	0.20
O2	0.01	0.00	0.04	0.05	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.02	0.08	0.08	0.20	0.14
O2'	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.03	0.02	0.03	0.03	0.00	0.02	0.05	0.03	0.02	0.12	0.06	0.03
O3'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.07	0.01	0.08	0.04	0.07	0.03	0.05	0.05	0.02	0.00	0.07	0.01	0.08	0.24	0.20	0.16
O4	0.02	0.01	0.04	0.06	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.03	0.14	0.25	0.35	0.25
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.03	0.00	0.03	0.03	0.08	0.07
O5'	0.04	0.10	0.03	0.05	0.13	0.02	0.14	0.01	0.12	0.09	0.12	0.08	0.02	0.08	0.14	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.03	0.11	0.11	0.15	0.22	0.08	0.23	0.06	0.16	0.10	0.17	0.08	0.12	0.24	0.25	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.10	0.23	0.07	0.12	0.32	0.03	0.31	0.02	0.23	0.19	0.28	0.20	0.06	0.20	0.35	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.16	0.04	0.09	0.23	0.02	0.23	0.02	0.18	0.14	0.20	0.14	0.03	0.16	0.25	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.06	0.10	0.23	0.08	0.14	0.44	0.08	0.56	0.07	0.05	0.15	0.19	0.11	0.64	0.10	0.53	0.34	0.08	0.11	0.09
C2	0.23	0.07	0.20	0.10	0.08	0.49	0.11	0.56	0.18	0.17	0.09	0.17	0.08	0.49	0.12	0.64	0.35	0.21	0.15	0.14
C2'	0.08	0.14	0.17	0.10	0.20	0.41	0.13	0.55	0.06	0.07	0.20	0.26	0.14	0.59	0.10	0.44	0.37	0.09	0.12	0.11
C3'	0.06	0.17	0.06	0.17	0.24	0.40	0.14	0.55	0.08	0.10	0.23	0.33	0.17	0.38	0.15	0.40	0.45	0.13	0.18	0.17
C4	0.36	0.24	0.06	0.13	0.08	0.39	0.13	0.46	0.21	0.27	0.11	0.20	0.30	0.08	0.13	0.51	0.39	0.34	0.27	0.23
C4'	0.06	0.15	0.12	0.11	0.21	0.40	0.12	0.55	0.08	0.08	0.22	0.30	0.16	0.52	0.11	0.43	0.38	0.06	0.15	0.11
C5	0.29	0.26	0.07	0.14	0.08	0.37	0.12	0.46	0.17	0.24	0.19	0.11	0.31	0.10	0.13	0.46	0.42	0.31	0.28	0.24
C5'	0.09	0.22	0.08	0.16	0.25	0.40	0.14	0.53	0.11	0.14	0.28	0.34	0.23	0.37	0.14	0.42	0.42	0.09	0.19	0.15
C6	0.21	0.20	0.06	0.12	0.10	0.39	0.10	0.50	0.14	0.18	0.18	0.12	0.23	0.23	0.11	0.48	0.41	0.24	0.24	0.20
N1	0.16	0.11	0.16	0.09	0.10	0.44	0.09	0.54	0.13	0.13	0.12	0.16	0.13	0.45	0.10	0.55	0.37	0.18	0.17	0.14
N3	0.34	0.14	0.12	0.10	0.09	0.45	0.13	0.51	0.21	0.24	0.05	0.20	0.17	0.25	0.12	0.61	0.36	0.29	0.21	0.19
O2	0.20	0.05	0.33	0.13	0.10	0.55	0.11	0.61	0.17	0.12	0.14	0.16	0.09	0.73	0.15	0.73	0.31	0.16	0.09	0.10
O2'	0.25	0.23	0.35	0.12	0.24	0.35	0.18	0.49	0.15	0.19	0.25	0.27	0.25	0.90	0.11	0.37	0.22	0.14	0.17	0.12
O3'	0.10	0.17	0.06	0.18	0.27	0.36	0.17	0.52	0.08	0.09	0.25	0.38	0.16	0.37	0.16	0.31	0.44	0.10	0.18	0.18
O4	0.42	0.28	0.08	0.14	0.12	0.36	0.14	0.41	0.21	0.30	0.12	0.23	0.36	0.16	0.14	0.48	0.38	0.38	0.29	0.25
O4'	0.06	0.12	0.19	0.09	0.15	0.43	0.09	0.56	0.08	0.07	0.16	0.21	0.13	0.59	0.10	0.50	0.35	0.06	0.12	0.09
O5'	0.17	0.29	0.12	0.21	0.27	0.41	0.16	0.53	0.15	0.21	0.33	0.32	0.32	0.20	0.19	0.44	0.47	0.18	0.24	0.20
OP1	0.12	0.30	0.14	0.17	0.25	0.29	0.12	0.38	0.12	0.17	0.36	0.33	0.36	0.17	0.17	0.29	0.35	0.06	0.12	0.08
OP2	0.26	0.38	0.23	0.25	0.23	0.35	0.14	0.44	0.16	0.26	0.39	0.21	0.47	0.20	0.25	0.37	0.43	0.18	0.18	0.17
P	0.19	0.33	0.16	0.22	0.25	0.37	0.13	0.47	0.14	0.22	0.36	0.27	0.39	0.15	0.21	0.39	0.43	0.14	0.18	0.16

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.04	0.01	0.15	0.02	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.14	0.01	0.22	0.11	0.38	0.30
C2	0.04	0.00	0.10	0.15	0.01	0.13	0.01	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.13	0.19	0.09	0.11	0.20	0.24	0.16
C2'	0.00	0.10	0.00	0.01	0.06	0.01	0.15	0.03	0.15	0.02	0.05	0.06	0.21	0.00	0.01	0.01	0.05	0.40	0.28	0.18
C3'	0.00	0.15	0.01	0.00	0.03	0.03	0.14	0.04	0.16	0.01	0.10	0.03	0.29	0.01	0.01	0.04	0.03	0.45	0.16	0.17
C4	0.01	0.01	0.06	0.03	0.00	0.04	0.00	0.19	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.11	0.07	0.02	0.33	0.32	0.32	0.27
C4'	0.04	0.13	0.01	0.03	0.04	0.00	0.16	0.01	0.18	0.01	0.08	0.05	0.25	0.09	0.03	0.02	0.01	0.22	0.20	0.03
C5	0.01	0.01	0.15	0.14	0.00	0.16	0.00	0.30	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.08	0.11	0.42	0.32	0.29	0.28
C5'	0.15	0.07	0.03	0.04	0.19	0.01	0.30	0.00	0.27	0.06	0.07	0.22	0.19	0.27	0.06	0.02	0.00	0.09	0.21	0.00
C6	0.02	0.00	0.15	0.16	0.01	0.18	0.00	0.27	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.12	0.13	0.35	0.26	0.21	0.20
N1	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.13	0.18	0.23	0.15
N3	0.03	0.00	0.05	0.10	0.00	0.08	0.01	0.07	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.14	0.18	0.06	0.20	0.26	0.28	0.20
N4	0.01	0.01	0.06	0.03	0.00	0.05	0.01	0.22	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.12	0.09	0.02	0.38	0.36	0.38	0.32
O2	0.07	0.00	0.21	0.29	0.00	0.25	0.01	0.19	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.18	0.32	0.16	0.12	0.15	0.25	0.18
O2'	0.01	0.13	0.00	0.01	0.11	0.09	0.06	0.27	0.03	0.05	0.14	0.12	0.18	0.00	0.22	0.04	0.37	0.12	0.21	0.27
O3'	0.14	0.19	0.01	0.01	0.07	0.03	0.08	0.06	0.12	0.02	0.18	0.09	0.32	0.22	0.00	0.02	0.03	0.45	0.14	0.15
O4'	0.01	0.09	0.01	0.04	0.02	0.02	0.11	0.02	0.13	0.01	0.06	0.02	0.16	0.04	0.02	0.00	0.04	0.07	0.37	0.14
O5'	0.22	0.11	0.05	0.03	0.33	0.01	0.42	0.00	0.35	0.13	0.20	0.38	0.12	0.37	0.03	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.11	0.20	0.40	0.45	0.32	0.22	0.32	0.09	0.26	0.18	0.26	0.36	0.15	0.12	0.45	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.38	0.24	0.28	0.16	0.32	0.20	0.29	0.21	0.21	0.23	0.28	0.38	0.25	0.21	0.14	0.37	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.30	0.16	0.18	0.17	0.27	0.03	0.28	0.00	0.20	0.15	0.20	0.32	0.18	0.27	0.15	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00