Doublet Group distance statistics: 48973

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 2, 0, 2, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.004, 0.009, 0.014, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.009 std_dev=0.005
N3	A	0, 0.002, 0.012, 0.021, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.012 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.003, 0.015, 0.028, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.015 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.005, 0.020, 0.035, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.020 std_dev=0.015
C6	A	0, 0.004, 0.019, 0.035, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.019 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.007, 0.023, 0.038, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.023 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.005, 0.023, 0.041, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.023 std_dev=0.018
O2	A	0, 0.019, 0.062, 0.105, 0.120 max_d=0.120 avg_d=0.062 std_dev=0.043
O4	A	0, 0.010, 0.069, 0.127, 0.202 max_d=0.202 avg_d=0.069 std_dev=0.059
C2'	A	0, 0.064, 0.225, 0.387, 0.511 max_d=0.511 avg_d=0.225 std_dev=0.162
O4'	A	0, 0.027, 0.189, 0.352, 0.458 max_d=0.458 avg_d=0.189 std_dev=0.162
O2'	A	0, 0.124, 0.319, 0.514, 0.583 max_d=0.583 avg_d=0.319 std_dev=0.195
N1	B	0, 0.141, 0.336, 0.532, 0.645 max_d=0.645 avg_d=0.336 std_dev=0.196
C6	B	0, 0.197, 0.415, 0.633, 0.711 max_d=0.711 avg_d=0.415 std_dev=0.218
C5	B	0, 0.192, 0.461, 0.730, 0.933 max_d=0.933 avg_d=0.461 std_dev=0.269
C4'	A	0, 0.057, 0.330, 0.603, 0.753 max_d=0.753 avg_d=0.330 std_dev=0.273
C2	B	0, 0.131, 0.425, 0.719, 0.957 max_d=0.957 avg_d=0.425 std_dev=0.294
C4	B	0, 0.183, 0.513, 0.842, 1.198 max_d=1.198 avg_d=0.513 std_dev=0.330
C3'	A	0, 0.058, 0.395, 0.732, 0.996 max_d=0.996 avg_d=0.395 std_dev=0.337
O5'	A	0, 0.173, 0.525, 0.877, 1.268 max_d=1.268 avg_d=0.525 std_dev=0.352
N3	B	0, 0.177, 0.539, 0.902, 1.228 max_d=1.228 avg_d=0.539 std_dev=0.363
C5'	A	0, 0.123, 0.519, 0.914, 1.150 max_d=1.150 avg_d=0.519 std_dev=0.395
OP2	A	0, 0.101, 0.525, 0.950, 1.418 max_d=1.418 avg_d=0.525 std_dev=0.424
C1'	B	0, 0.083, 0.514, 0.945, 1.431 max_d=1.431 avg_d=0.514 std_dev=0.431
P	A	0, 0.158, 0.590, 1.022, 1.451 max_d=1.451 avg_d=0.590 std_dev=0.432
O4'	B	0, 0.072, 0.594, 1.116, 1.716 max_d=1.716 avg_d=0.594 std_dev=0.522
O2	B	0, 0.055, 0.583, 1.111, 1.674 max_d=1.674 avg_d=0.583 std_dev=0.528
O3'	A	0, 0.075, 0.611, 1.146, 1.643 max_d=1.643 avg_d=0.611 std_dev=0.536
N4	B	0, 0.172, 0.735, 1.297, 2.022 max_d=2.022 avg_d=0.735 std_dev=0.563
OP1	A	0, 0.142, 0.728, 1.315, 1.655 max_d=1.655 avg_d=0.728 std_dev=0.586
C2'	B	0, 0.025, 0.709, 1.392, 2.316 max_d=2.316 avg_d=0.709 std_dev=0.684
C4'	B	0, -0.036, 0.780, 1.597, 2.683 max_d=2.683 avg_d=0.780 std_dev=0.816
C3'	B	0, -0.038, 0.792, 1.622, 2.742 max_d=2.742 avg_d=0.792 std_dev=0.830
O2'	B	0, -0.032, 0.905, 1.841, 3.178 max_d=3.178 avg_d=0.905 std_dev=0.936
C5'	B	0, -0.118, 0.865, 1.848, 3.227 max_d=3.227 avg_d=0.865 std_dev=0.983
O5'	B	0, -0.163, 0.848, 1.859, 3.329 max_d=3.329 avg_d=0.848 std_dev=1.011
O3'	B	0, -0.141, 0.984, 2.110, 3.692 max_d=3.692 avg_d=0.984 std_dev=1.125
P	B	0, -0.241, 0.959, 2.159, 3.890 max_d=3.890 avg_d=0.959 std_dev=1.200
OP2	B	0, -0.235, 1.025, 2.285, 4.091 max_d=4.091 avg_d=1.025 std_dev=1.260
OP1	B	0, -0.285, 1.130, 2.544, 4.528 max_d=4.528 avg_d=1.130 std_dev=1.415

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.05	0.02	0.03	0.02	0.00	0.06	0.06	0.07	0.04
C2	0.03	0.00	0.09	0.17	0.01	0.05	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.12	0.21	0.01	0.03	0.09	0.09	0.11	0.10
C2'	0.00	0.09	0.00	0.01	0.06	0.03	0.05	0.01	0.05	0.03	0.09	0.13	0.00	0.07	0.08	0.02	0.09	0.12	0.16	0.11
C3'	0.02	0.17	0.01	0.00	0.20	0.00	0.18	0.01	0.14	0.12	0.20	0.17	0.04	0.02	0.22	0.02	0.09	0.11	0.13	0.09
C4	0.02	0.01	0.06	0.20	0.00	0.07	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.11	0.26	0.00	0.02	0.17	0.18	0.23	0.19
C4'	0.01	0.05	0.03	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.07	0.04	0.06	0.06	0.17	0.02	0.08	0.00	0.02	0.05	0.04	0.02
C5	0.01	0.01	0.05	0.18	0.00	0.08	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.22	0.00	0.02	0.19	0.20	0.23	0.20
C5'	0.03	0.04	0.01	0.01	0.09	0.01	0.11	0.00	0.10	0.05	0.06	0.04	0.15	0.01	0.10	0.02	0.01	0.04	0.03	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.14	0.00	0.07	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.17	0.00	0.02	0.16	0.15	0.16	0.15
N1	0.01	0.01	0.03	0.12	0.01	0.04	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.15	0.01	0.02	0.10	0.09	0.10	0.09
N3	0.03	0.00	0.09	0.20	0.00	0.06	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.13	0.26	0.01	0.03	0.13	0.13	0.17	0.14
O2	0.05	0.00	0.13	0.17	0.01	0.06	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.16	0.22	0.01	0.06	0.07	0.06	0.09	0.08
O2'	0.02	0.12	0.00	0.04	0.11	0.17	0.07	0.15	0.05	0.06	0.13	0.16	0.00	0.09	0.11	0.12	0.06	0.06	0.11	0.06
O3'	0.03	0.21	0.07	0.02	0.26	0.02	0.22	0.01	0.17	0.15	0.26	0.22	0.09	0.00	0.30	0.02	0.12	0.14	0.17	0.10
O4	0.02	0.01	0.08	0.22	0.00	0.08	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.30	0.00	0.03	0.18	0.21	0.27	0.21
O4'	0.00	0.03	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.06	0.12	0.02	0.03	0.00	0.05	0.05	0.04	0.04
O5'	0.06	0.09	0.09	0.09	0.17	0.02	0.19	0.01	0.16	0.10	0.13	0.07	0.06	0.12	0.18	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.06	0.09	0.12	0.11	0.18	0.05	0.20	0.04	0.15	0.09	0.13	0.06	0.06	0.14	0.21	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.07	0.11	0.16	0.13	0.23	0.04	0.23	0.03	0.16	0.10	0.17	0.09	0.11	0.17	0.27	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.04	0.10	0.11	0.09	0.19	0.02	0.20	0.01	0.15	0.09	0.14	0.08	0.06	0.10	0.21	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.32	0.22	0.35	0.46	0.18	0.52	0.15	0.63	0.14	0.20	0.20	0.29	0.31	0.38	0.50	0.44	0.71	0.60	0.66	0.65
C2	0.21	0.24	0.22	0.26	0.11	0.30	0.14	0.34	0.17	0.13	0.21	0.16	0.36	0.24	0.28	0.26	0.39	0.25	0.33	0.27
C2'	0.46	0.26	0.54	0.66	0.21	0.73	0.17	0.82	0.17	0.29	0.19	0.32	0.34	0.60	0.72	0.60	0.83	0.65	0.59	0.67
C3'	0.63	0.34	0.75	0.93	0.12	0.96	0.20	1.11	0.43	0.47	0.18	0.18	0.39	0.77	1.01	0.78	1.23	1.09	1.09	1.17
C4	0.28	0.24	0.29	0.26	0.12	0.28	0.15	0.24	0.23	0.17	0.24	0.19	0.36	0.36	0.28	0.28	0.25	0.16	0.31	0.19
C4'	0.46	0.18	0.56	0.78	0.12	0.82	0.20	1.02	0.34	0.32	0.10	0.26	0.22	0.56	0.86	0.63	1.17	1.21	1.26	1.24
C5	0.24	0.27	0.24	0.21	0.11	0.22	0.15	0.25	0.22	0.19	0.27	0.17	0.36	0.30	0.21	0.23	0.37	0.30	0.50	0.36
C5'	0.41	0.14	0.52	0.77	0.15	0.79	0.25	1.02	0.37	0.30	0.12	0.30	0.14	0.49	0.85	0.60	1.21	1.33	1.46	1.34
C6	0.20	0.24	0.20	0.25	0.16	0.28	0.12	0.38	0.18	0.16	0.26	0.23	0.32	0.21	0.26	0.27	0.52	0.44	0.61	0.50
N1	0.23	0.22	0.24	0.31	0.15	0.35	0.14	0.43	0.16	0.16	0.21	0.22	0.32	0.25	0.33	0.32	0.54	0.40	0.53	0.46
N3	0.21	0.24	0.22	0.24	0.10	0.29	0.14	0.29	0.21	0.12	0.23	0.16	0.38	0.26	0.26	0.27	0.27	0.20	0.25	0.18
O2	0.23	0.25	0.26	0.30	0.11	0.33	0.16	0.38	0.15	0.14	0.20	0.16	0.39	0.32	0.33	0.26	0.38	0.28	0.27	0.26
O2'	0.36	0.26	0.44	0.53	0.26	0.58	0.24	0.66	0.16	0.24	0.24	0.35	0.34	0.52	0.61	0.44	0.63	0.52	0.43	0.51
O3'	0.82	0.49	1.01	1.23	0.20	1.23	0.30	1.42	0.56	0.63	0.30	0.12	0.55	1.04	1.36	0.95	1.52	1.51	1.34	1.56
O4	0.36	0.21	0.40	0.34	0.19	0.35	0.19	0.28	0.24	0.20	0.26	0.29	0.36	0.52	0.38	0.33	0.19	0.15	0.25	0.13
O4'	0.29	0.13	0.34	0.53	0.16	0.58	0.18	0.76	0.23	0.17	0.15	0.30	0.21	0.34	0.58	0.46	0.91	0.89	0.99	0.94
O5'	0.35	0.10	0.43	0.65	0.13	0.66	0.22	0.84	0.34	0.25	0.11	0.30	0.11	0.39	0.71	0.51	1.04	1.08	1.27	1.12
OP1	0.34	0.16	0.43	0.66	0.20	0.66	0.25	0.86	0.34	0.26	0.19	0.33	0.14	0.40	0.75	0.48	1.03	1.21	1.37	1.16
OP2	0.27	0.14	0.31	0.48	0.15	0.47	0.23	0.60	0.30	0.22	0.17	0.29	0.15	0.28	0.52	0.38	0.76	0.81	0.99	0.80
P	0.30	0.10	0.35	0.57	0.13	0.58	0.23	0.76	0.32	0.23	0.15	0.30	0.11	0.32	0.62	0.45	0.94	1.04	1.23	1.04

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.01	0.00	0.07	0.05	0.09	0.04
C2	0.02	0.00	0.08	0.08	0.01	0.04	0.01	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.07	0.10	0.03	0.08	0.09	0.12	0.06
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.06	0.01	0.08	0.02	0.08	0.03	0.07	0.07	0.15	0.00	0.01	0.01	0.05	0.10	0.12	0.06
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.08	0.00	0.12	0.02	0.13	0.04	0.08	0.10	0.15	0.01	0.00	0.01	0.07	0.13	0.14	0.09
C4	0.02	0.01	0.06	0.08	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.11	0.02	0.13	0.12	0.20	0.11
C4'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.06	0.02	0.03	0.03	0.07	0.05	0.02	0.00	0.02	0.05	0.06	0.02
C5	0.01	0.01	0.08	0.12	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.15	0.02	0.18	0.16	0.27	0.16
C5'	0.01	0.03	0.02	0.02	0.05	0.01	0.08	0.00	0.08	0.03	0.04	0.06	0.06	0.05	0.04	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01
C6	0.01	0.00	0.08	0.13	0.00	0.06	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.14	0.02	0.18	0.13	0.22	0.14
N1	0.01	0.00	0.03	0.04	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.05	0.02	0.10	0.06	0.13	0.07
N3	0.02	0.00	0.07	0.08	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.10	0.03	0.10	0.10	0.15	0.08
N4	0.02	0.01	0.07	0.10	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.13	0.03	0.14	0.14	0.22	0.12
O2	0.04	0.00	0.15	0.15	0.01	0.07	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.13	0.18	0.04	0.08	0.12	0.13	0.07
O2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.05	0.05	0.06	0.05	0.05	0.03	0.07	0.06	0.13	0.00	0.02	0.03	0.06	0.12	0.11	0.07
O3'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.11	0.02	0.15	0.04	0.14	0.05	0.10	0.13	0.18	0.02	0.00	0.01	0.11	0.20	0.19	0.14
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.04	0.03	0.01	0.00	0.08	0.04	0.09	0.05
O5'	0.07	0.08	0.05	0.07	0.13	0.02	0.18	0.01	0.18	0.10	0.10	0.14	0.08	0.06	0.11	0.08	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.05	0.09	0.10	0.13	0.12	0.05	0.16	0.03	0.13	0.06	0.10	0.14	0.12	0.12	0.20	0.04	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.09	0.12	0.12	0.14	0.20	0.06	0.27	0.03	0.22	0.13	0.15	0.22	0.13	0.11	0.19	0.09	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.06	0.06	0.09	0.11	0.02	0.16	0.01	0.14	0.07	0.08	0.12	0.07	0.07	0.14	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00