Doublet Group distance statistics: 48974

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.002, 0.006, 0.010, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.006 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.002, 0.008, 0.014, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.008 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.003, 0.014, 0.025, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.004, 0.014, 0.025, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.014 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.004, 0.015, 0.027, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.015 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.004, 0.015, 0.027, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.015 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.004, 0.017, 0.029, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.017 std_dev=0.012
O2	A	0, 0.004, 0.031, 0.058, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.031 std_dev=0.027
O4	A	0, 0.003, 0.054, 0.104, 0.134 max_d=0.134 avg_d=0.054 std_dev=0.051
OP1	A	0, 0.117, 0.307, 0.497, 0.507 max_d=0.507 avg_d=0.307 std_dev=0.190
O4'	A	0, -0.039, 0.159, 0.357, 0.493 max_d=0.493 avg_d=0.159 std_dev=0.198
C2'	A	0, -0.031, 0.178, 0.387, 0.531 max_d=0.531 avg_d=0.178 std_dev=0.209
OP2	A	0, 0.162, 0.393, 0.624, 0.563 max_d=0.563 avg_d=0.393 std_dev=0.231
O2'	A	0, -0.014, 0.230, 0.475, 0.640 max_d=0.640 avg_d=0.230 std_dev=0.244
P	A	0, 0.089, 0.362, 0.635, 0.760 max_d=0.760 avg_d=0.362 std_dev=0.273
C4'	A	0, -0.051, 0.254, 0.558, 0.767 max_d=0.767 avg_d=0.254 std_dev=0.304
C3'	A	0, -0.072, 0.260, 0.593, 0.821 max_d=0.821 avg_d=0.260 std_dev=0.333
N4	B	0, 0.191, 0.573, 0.956, 1.040 max_d=1.040 avg_d=0.573 std_dev=0.383
C4	B	0, 0.165, 0.566, 0.967, 1.133 max_d=1.133 avg_d=0.566 std_dev=0.401
N3	B	0, 0.159, 0.572, 0.984, 1.165 max_d=1.165 avg_d=0.572 std_dev=0.412
O4'	B	0, 0.138, 0.570, 1.002, 1.186 max_d=1.186 avg_d=0.570 std_dev=0.432
C2	B	0, 0.127, 0.561, 0.995, 1.211 max_d=1.211 avg_d=0.561 std_dev=0.434
O2	B	0, 0.141, 0.598, 1.055, 1.281 max_d=1.281 avg_d=0.598 std_dev=0.457
O5'	A	0, -0.117, 0.351, 0.819, 1.153 max_d=1.153 avg_d=0.351 std_dev=0.468
C5	B	0, 0.123, 0.615, 1.107, 1.376 max_d=1.376 avg_d=0.615 std_dev=0.492
O3'	A	0, -0.068, 0.434, 0.935, 1.268 max_d=1.268 avg_d=0.434 std_dev=0.501
C5'	A	0, -0.109, 0.398, 0.904, 1.267 max_d=1.267 avg_d=0.398 std_dev=0.506
N1	B	0, 0.060, 0.568, 1.076, 1.357 max_d=1.357 avg_d=0.568 std_dev=0.508
C4'	B	0, 0.175, 0.706, 1.236, 1.477 max_d=1.477 avg_d=0.706 std_dev=0.530
C6	B	0, 0.061, 0.622, 1.184, 1.517 max_d=1.517 avg_d=0.622 std_dev=0.562
C5'	B	0, 0.245, 0.815, 1.385, 1.611 max_d=1.611 avg_d=0.815 std_dev=0.570
C1'	B	0, 0.002, 0.586, 1.171, 1.488 max_d=1.488 avg_d=0.586 std_dev=0.584
C3'	B	0, 0.105, 0.780, 1.455, 1.824 max_d=1.824 avg_d=0.780 std_dev=0.675
O3'	B	0, 0.044, 0.747, 1.451, 1.855 max_d=1.855 avg_d=0.747 std_dev=0.704
C2'	B	0, 0.086, 0.806, 1.526, 1.945 max_d=1.945 avg_d=0.806 std_dev=0.720
O2'	B	0, 0.135, 0.965, 1.796, 2.288 max_d=2.288 avg_d=0.965 std_dev=0.831
OP1	B	0, 0.394, 1.320, 2.245, 2.603 max_d=2.603 avg_d=1.320 std_dev=0.926
P	B	0, 0.166, 1.100, 2.034, 2.580 max_d=2.580 avg_d=1.100 std_dev=0.934
O5'	B	0, 0.152, 1.133, 2.114, 2.704 max_d=2.704 avg_d=1.133 std_dev=0.981
OP2	B	0, 0.252, 1.334, 2.416, 3.007 max_d=3.007 avg_d=1.334 std_dev=1.082

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.04	0.13	0.11
C2	0.00	0.00	0.08	0.06	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.09	0.01	0.03	0.09	0.06	0.07	0.05
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.02	0.01	0.06	0.01	0.08	0.01	0.06	0.15	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.16	0.04	0.02
C3'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.05	0.00	0.11	0.02	0.12	0.02	0.03	0.13	0.01	0.01	0.06	0.01	0.05	0.21	0.09	0.07
C4	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.07	0.01	0.15	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.04	0.00	0.03	0.20	0.14	0.05	0.10
C4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.07	0.00	0.11	0.00	0.10	0.03	0.03	0.04	0.03	0.02	0.08	0.00	0.01	0.08	0.06	0.05
C5	0.02	0.01	0.06	0.11	0.01	0.11	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.11	0.01	0.02	0.24	0.14	0.04	0.11
C5'	0.01	0.05	0.01	0.02	0.15	0.00	0.18	0.00	0.16	0.07	0.09	0.01	0.04	0.06	0.16	0.01	0.01	0.07	0.01	0.01
C6	0.02	0.00	0.08	0.12	0.01	0.10	0.00	0.16	0.00	0.00	0.01	0.00	0.06	0.12	0.01	0.01	0.20	0.10	0.05	0.04
N1	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.06	0.09	0.06
N3	0.01	0.00	0.06	0.03	0.00	0.03	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.07	0.01	0.04	0.14	0.10	0.03	0.05
O2	0.00	0.01	0.15	0.13	0.02	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.13	0.17	0.03	0.04	0.04	0.05	0.09	0.08
O2'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.03	0.05	0.04	0.06	0.01	0.05	0.13	0.00	0.04	0.02	0.00	0.02	0.13	0.05	0.04
O3'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.04	0.02	0.11	0.06	0.12	0.01	0.07	0.17	0.04	0.00	0.05	0.01	0.09	0.31	0.17	0.14
O4	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.08	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.05	0.00	0.03	0.23	0.17	0.11	0.14
O4'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.04	0.00	0.01	0.03	0.00	0.04	0.08	0.22	0.19
O5'	0.03	0.09	0.04	0.05	0.20	0.01	0.24	0.01	0.20	0.10	0.14	0.04	0.02	0.09	0.23	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.04	0.06	0.16	0.21	0.14	0.08	0.14	0.07	0.10	0.06	0.10	0.05	0.13	0.31	0.17	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.13	0.07	0.04	0.09	0.05	0.06	0.04	0.01	0.05	0.09	0.03	0.09	0.05	0.17	0.11	0.22	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.11	0.05	0.02	0.07	0.10	0.05	0.11	0.01	0.04	0.06	0.05	0.08	0.04	0.14	0.14	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.30	0.16	0.17	0.12	0.18	0.17	0.24	0.11	0.14	0.29	0.13	0.41	0.14	0.19	0.16	0.64	0.47	0.44	0.45
C2	0.06	0.18	0.04	0.10	0.18	0.16	0.36	0.21	0.28	0.04	0.16	0.24	0.36	0.04	0.14	0.15	0.45	0.20	0.39	0.18
C2'	0.11	0.25	0.13	0.11	0.15	0.10	0.14	0.16	0.11	0.13	0.28	0.15	0.33	0.14	0.13	0.08	0.60	0.45	0.49	0.44
C3'	0.07	0.21	0.09	0.06	0.12	0.05	0.12	0.09	0.10	0.09	0.24	0.14	0.27	0.10	0.09	0.04	0.53	0.42	0.52	0.41
C4	0.13	0.14	0.10	0.14	0.17	0.19	0.27	0.22	0.22	0.10	0.10	0.27	0.32	0.09	0.17	0.20	0.41	0.11	0.43	0.14
C4'	0.10	0.24	0.11	0.10	0.11	0.10	0.13	0.15	0.10	0.10	0.26	0.11	0.33	0.11	0.13	0.08	0.57	0.47	0.53	0.45
C5	0.13	0.23	0.09	0.14	0.07	0.18	0.16	0.22	0.11	0.10	0.22	0.18	0.37	0.06	0.19	0.18	0.53	0.22	0.37	0.24
C5'	0.10	0.24	0.10	0.08	0.11	0.09	0.11	0.13	0.09	0.10	0.26	0.11	0.34	0.11	0.13	0.08	0.54	0.42	0.51	0.40
C6	0.14	0.28	0.12	0.15	0.09	0.19	0.13	0.24	0.07	0.12	0.28	0.14	0.40	0.10	0.20	0.18	0.60	0.33	0.38	0.33
N1	0.11	0.26	0.10	0.14	0.09	0.17	0.21	0.23	0.13	0.08	0.26	0.15	0.40	0.08	0.18	0.16	0.57	0.33	0.38	0.32
N3	0.12	0.10	0.10	0.13	0.23	0.19	0.37	0.22	0.31	0.12	0.09	0.30	0.32	0.11	0.15	0.19	0.38	0.09	0.45	0.12
O2	0.06	0.14	0.07	0.09	0.22	0.15	0.44	0.21	0.39	0.11	0.13	0.25	0.33	0.09	0.11	0.13	0.39	0.18	0.41	0.14
O2'	0.17	0.29	0.21	0.18	0.19	0.16	0.13	0.22	0.13	0.19	0.30	0.18	0.36	0.21	0.18	0.15	0.67	0.62	0.58	0.59
O3'	0.08	0.15	0.08	0.08	0.11	0.07	0.09	0.02	0.11	0.07	0.19	0.15	0.19	0.09	0.07	0.09	0.48	0.49	0.59	0.45
O4	0.17	0.10	0.15	0.16	0.22	0.20	0.29	0.22	0.25	0.15	0.08	0.31	0.25	0.16	0.19	0.21	0.34	0.07	0.49	0.14
O4'	0.13	0.26	0.13	0.15	0.08	0.17	0.17	0.22	0.11	0.11	0.26	0.09	0.38	0.12	0.18	0.15	0.62	0.48	0.48	0.46
O5'	0.14	0.27	0.13	0.12	0.13	0.13	0.06	0.17	0.03	0.14	0.29	0.13	0.37	0.14	0.18	0.12	0.57	0.34	0.44	0.35
OP1	0.27	0.36	0.30	0.28	0.30	0.26	0.20	0.30	0.20	0.28	0.38	0.31	0.42	0.31	0.30	0.24	0.77	0.55	0.60	0.57
OP2	0.17	0.28	0.17	0.17	0.18	0.16	0.05	0.21	0.06	0.17	0.30	0.19	0.36	0.19	0.21	0.16	0.63	0.33	0.41	0.36
P	0.13	0.26	0.14	0.13	0.16	0.13	0.05	0.17	0.03	0.14	0.29	0.17	0.35	0.16	0.17	0.11	0.60	0.38	0.46	0.39

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.22	0.12	0.40	0.08
C2	0.01	0.00	0.11	0.05	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.18	0.04	0.08	0.30	0.05	0.49	0.11
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.10	0.06	0.13	0.01	0.08	0.01	0.21	0.00	0.02	0.00	0.13	0.24	0.43	0.17
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.12	0.27	0.41	0.21
C4	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.05	0.01	0.46	0.07	0.31	0.11
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.04	0.01	0.00	0.00	0.01	0.24	0.32	0.09
C5	0.01	0.00	0.10	0.05	0.00	0.02	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.06	0.06	0.55	0.19	0.24	0.22
C5'	0.04	0.08	0.06	0.01	0.11	0.00	0.11	0.00	0.10	0.08	0.10	0.11	0.07	0.06	0.02	0.01	0.01	0.30	0.18	0.02
C6	0.00	0.01	0.13	0.07	0.00	0.01	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.07	0.09	0.54	0.21	0.22	0.20
N1	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.37	0.08	0.37	0.08
N3	0.01	0.00	0.08	0.04	0.00	0.03	0.01	0.10	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.13	0.04	0.06	0.36	0.06	0.44	0.09
N4	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.05	0.01	0.47	0.09	0.29	0.13
O2	0.01	0.00	0.21	0.10	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.36	0.05	0.13	0.19	0.13	0.59	0.19
O2'	0.01	0.18	0.00	0.01	0.02	0.01	0.13	0.06	0.15	0.02	0.13	0.02	0.36	0.00	0.05	0.01	0.12	0.32	0.46	0.23
O3'	0.04	0.04	0.02	0.00	0.05	0.00	0.06	0.02	0.07	0.04	0.04	0.05	0.05	0.05	0.00	0.05	0.16	0.27	0.41	0.21
O4'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.00	0.06	0.01	0.09	0.01	0.06	0.01	0.13	0.01	0.05	0.00	0.19	0.18	0.40	0.16
O5'	0.22	0.30	0.13	0.12	0.46	0.01	0.55	0.01	0.54	0.37	0.36	0.47	0.19	0.12	0.16	0.19	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.12	0.05	0.24	0.27	0.07	0.24	0.19	0.30	0.21	0.08	0.06	0.09	0.13	0.32	0.27	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.40	0.49	0.43	0.41	0.31	0.32	0.24	0.18	0.22	0.37	0.44	0.29	0.59	0.46	0.41	0.40	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.11	0.17	0.21	0.11	0.09	0.22	0.02	0.20	0.08	0.09	0.13	0.19	0.23	0.21	0.16	0.01	0.01	0.00	0.00