Doublet Group distance statistics: 48975

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.003, 0.008, 0.012, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.004, 0.009, 0.015, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.007, 0.017, 0.027, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.017 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.007, 0.018, 0.029, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.018 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.008, 0.020, 0.032, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.020 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.006, 0.019, 0.031, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.019 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.007, 0.020, 0.032, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.020 std_dev=0.012
O2	A	0, 0.017, 0.043, 0.069, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.043 std_dev=0.026
O4	A	0, 0.026, 0.062, 0.097, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.062 std_dev=0.036
O4'	A	0, 0.053, 0.137, 0.222, 0.223 max_d=0.223 avg_d=0.137 std_dev=0.085
C2'	A	0, 0.059, 0.211, 0.364, 0.413 max_d=0.413 avg_d=0.211 std_dev=0.152
C4'	A	0, 0.072, 0.253, 0.434, 0.434 max_d=0.434 avg_d=0.253 std_dev=0.181
C3'	B	0, 0.172, 0.416, 0.661, 0.628 max_d=0.628 avg_d=0.416 std_dev=0.244
N1	B	0, 0.151, 0.402, 0.653, 0.692 max_d=0.692 avg_d=0.402 std_dev=0.251
C3'	A	0, 0.143, 0.395, 0.646, 0.697 max_d=0.697 avg_d=0.395 std_dev=0.252
O2'	A	0, 0.086, 0.350, 0.614, 0.720 max_d=0.720 avg_d=0.350 std_dev=0.264
C5'	A	0, 0.171, 0.438, 0.704, 0.721 max_d=0.721 avg_d=0.438 std_dev=0.267
C6	B	0, 0.146, 0.440, 0.734, 0.827 max_d=0.827 avg_d=0.440 std_dev=0.294
O3'	B	0, 0.224, 0.545, 0.867, 0.820 max_d=0.820 avg_d=0.545 std_dev=0.321
C1'	B	0, 0.174, 0.534, 0.893, 0.977 max_d=0.977 avg_d=0.534 std_dev=0.359
C2'	B	0, 0.242, 0.607, 0.973, 0.955 max_d=0.955 avg_d=0.607 std_dev=0.366
C5	B	0, 0.233, 0.608, 0.982, 1.015 max_d=1.015 avg_d=0.608 std_dev=0.375
C2	B	0, 0.125, 0.500, 0.875, 1.020 max_d=1.020 avg_d=0.500 std_dev=0.375
C4'	B	0, 0.236, 0.661, 1.087, 1.091 max_d=1.091 avg_d=0.661 std_dev=0.425
O4'	B	0, 0.182, 0.628, 1.075, 1.057 max_d=1.057 avg_d=0.628 std_dev=0.447
O3'	A	0, 0.275, 0.734, 1.193, 1.266 max_d=1.266 avg_d=0.734 std_dev=0.459
C4	B	0, 0.197, 0.680, 1.164, 1.345 max_d=1.345 avg_d=0.680 std_dev=0.483
N3	B	0, 0.108, 0.617, 1.125, 1.351 max_d=1.351 avg_d=0.617 std_dev=0.509
O5'	B	0, 0.253, 0.764, 1.275, 1.302 max_d=1.302 avg_d=0.764 std_dev=0.511
O2	B	0, 0.106, 0.620, 1.134, 1.402 max_d=1.402 avg_d=0.620 std_dev=0.514
OP2	A	0, 0.231, 0.754, 1.277, 1.355 max_d=1.355 avg_d=0.754 std_dev=0.523
P	A	0, 0.186, 0.750, 1.314, 1.559 max_d=1.559 avg_d=0.750 std_dev=0.564
O2'	B	0, 0.359, 0.926, 1.493, 1.395 max_d=1.395 avg_d=0.926 std_dev=0.567
O5'	A	0, 0.146, 0.782, 1.418, 1.772 max_d=1.772 avg_d=0.782 std_dev=0.636
P	B	0, 0.385, 1.023, 1.662, 1.754 max_d=1.754 avg_d=1.023 std_dev=0.638
N4	B	0, 0.260, 0.936, 1.611, 1.898 max_d=1.898 avg_d=0.936 std_dev=0.675
OP1	A	0, 0.289, 1.012, 1.735, 2.045 max_d=2.045 avg_d=1.012 std_dev=0.723
OP2	B	0, 0.540, 1.338, 2.137, 1.990 max_d=1.990 avg_d=1.338 std_dev=0.798
C5'	B	0, 0.260, 1.069, 1.879, 2.222 max_d=2.222 avg_d=1.069 std_dev=0.810
OP1	B	0, 0.653, 1.681, 2.708, 2.552 max_d=2.552 avg_d=1.681 std_dev=1.028

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.10	0.13	0.31	0.13
C2	0.02	0.00	0.05	0.05	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.05	0.00	0.02	0.27	0.16	0.19	0.09
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.07	0.02	0.03	0.10	0.00	0.01	0.03	0.00	0.24	0.43	0.15	0.12
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.10	0.00	0.12	0.00	0.11	0.05	0.07	0.07	0.01	0.00	0.11	0.01	0.36	0.61	0.12	0.28
C4	0.01	0.01	0.03	0.10	0.00	0.09	0.00	0.18	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.00	0.03	0.48	0.28	0.18	0.19
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.09	0.00	0.11	0.00	0.10	0.03	0.05	0.05	0.04	0.01	0.10	0.00	0.01	0.22	0.35	0.04
C5	0.01	0.01	0.06	0.12	0.00	0.11	0.00	0.20	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.15	0.01	0.05	0.52	0.32	0.18	0.23
C5'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.18	0.00	0.20	0.00	0.16	0.07	0.12	0.01	0.04	0.01	0.20	0.01	0.01	0.21	0.43	0.01
C6	0.02	0.01	0.07	0.11	0.01	0.10	0.00	0.16	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.13	0.02	0.06	0.44	0.27	0.17	0.14
N1	0.00	0.00	0.02	0.05	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.27	0.18	0.22	0.08
N3	0.01	0.00	0.03	0.07	0.00	0.05	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.07	0.00	0.01	0.38	0.22	0.15	0.11
O2	0.05	0.00	0.10	0.07	0.01	0.05	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.13	0.10	0.01	0.06	0.17	0.10	0.23	0.12
O2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01	0.04	0.04	0.04	0.05	0.01	0.05	0.13	0.00	0.03	0.01	0.03	0.07	0.37	0.21	0.04
O3'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.11	0.01	0.15	0.01	0.13	0.04	0.07	0.10	0.03	0.00	0.13	0.01	0.35	0.84	0.19	0.42
O4	0.01	0.00	0.03	0.11	0.00	0.10	0.01	0.20	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.00	0.04	0.51	0.32	0.23	0.24
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.06	0.03	0.01	0.04	0.00	0.12	0.09	0.47	0.28
O5'	0.10	0.27	0.24	0.36	0.48	0.01	0.52	0.01	0.44	0.27	0.38	0.17	0.07	0.35	0.51	0.12	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.13	0.16	0.43	0.61	0.28	0.22	0.32	0.21	0.27	0.18	0.22	0.10	0.37	0.84	0.32	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.31	0.19	0.15	0.12	0.18	0.35	0.18	0.43	0.17	0.22	0.15	0.23	0.21	0.19	0.23	0.47	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.13	0.09	0.12	0.28	0.19	0.04	0.23	0.01	0.14	0.08	0.11	0.12	0.04	0.42	0.24	0.28	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.33	0.19	0.29	0.34	0.10	0.38	0.13	0.57	0.23	0.26	0.12	0.12	0.21	0.35	0.35	0.33	0.44	0.07	0.08	0.07
C2	0.34	0.22	0.32	0.29	0.11	0.34	0.13	0.43	0.22	0.28	0.14	0.13	0.25	0.37	0.29	0.33	0.52	0.08	0.21	0.09
C2'	0.30	0.18	0.22	0.31	0.06	0.35	0.08	0.61	0.17	0.22	0.11	0.09	0.24	0.30	0.33	0.28	0.46	0.08	0.09	0.13
C3'	0.37	0.26	0.21	0.14	0.13	0.14	0.15	0.32	0.25	0.30	0.18	0.11	0.31	0.31	0.17	0.33	0.23	0.12	0.05	0.00
C4	0.33	0.32	0.33	0.28	0.23	0.25	0.26	0.24	0.30	0.33	0.28	0.14	0.34	0.35	0.29	0.26	0.55	0.22	0.29	0.19
C4'	0.33	0.23	0.19	0.16	0.17	0.16	0.19	0.37	0.26	0.28	0.18	0.17	0.26	0.29	0.21	0.26	0.12	0.30	0.08	0.09
C5	0.34	0.33	0.33	0.30	0.29	0.26	0.31	0.26	0.35	0.35	0.32	0.26	0.33	0.34	0.31	0.28	0.54	0.27	0.29	0.22
C5'	0.38	0.31	0.22	0.09	0.28	0.12	0.30	0.16	0.35	0.35	0.28	0.27	0.32	0.31	0.11	0.33	0.05	0.52	0.16	0.19
C6	0.36	0.30	0.32	0.32	0.25	0.30	0.28	0.34	0.36	0.35	0.26	0.22	0.30	0.35	0.33	0.31	0.52	0.23	0.23	0.19
N1	0.36	0.25	0.32	0.32	0.14	0.34	0.17	0.44	0.29	0.32	0.18	0.12	0.26	0.36	0.32	0.32	0.51	0.12	0.16	0.11
N3	0.33	0.26	0.33	0.28	0.14	0.29	0.19	0.33	0.25	0.29	0.18	0.14	0.29	0.36	0.28	0.29	0.55	0.13	0.25	0.13
O2	0.30	0.17	0.30	0.28	0.14	0.38	0.08	0.52	0.14	0.21	0.14	0.20	0.20	0.37	0.27	0.36	0.50	0.09	0.21	0.09
O2'	0.23	0.15	0.20	0.38	0.06	0.48	0.08	0.82	0.10	0.13	0.11	0.11	0.23	0.29	0.41	0.28	0.40	0.19	0.07	0.14
O3'	0.42	0.27	0.22	0.06	0.08	0.15	0.10	0.24	0.19	0.30	0.16	0.07	0.35	0.35	0.14	0.44	0.01	0.01	0.01	0.00
O4	0.31	0.33	0.33	0.27	0.24	0.23	0.27	0.19	0.28	0.31	0.31	0.17	0.37	0.34	0.28	0.24	0.56	0.25	0.32	0.21
O4'	0.32	0.21	0.24	0.26	0.16	0.28	0.18	0.47	0.25	0.27	0.16	0.17	0.23	0.32	0.28	0.27	0.28	0.24	0.04	0.03
O5'	0.44	0.60	0.48	0.61	0.79	0.44	0.80	0.59	0.67	0.58	0.70	0.87	0.53	0.37	0.64	0.38	0.53	0.13	0.74	0.38
OP1	0.78	0.83	0.87	1.02	0.93	0.87	0.98	1.00	0.94	0.86	0.86	0.95	0.77	0.78	1.09	0.76	1.01	0.81	1.33	1.00
OP2	0.48	0.53	0.44	0.43	0.66	0.34	0.64	0.28	0.57	0.53	0.60	0.75	0.50	0.43	0.44	0.44	0.42	0.56	0.58	0.36
P	0.48	0.56	0.51	0.61	0.70	0.47	0.72	0.58	0.64	0.56	0.62	0.77	0.50	0.44	0.66	0.43	0.63	0.42	0.87	0.54

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.17	0.03	0.54	0.22
C2	0.02	0.00	0.14	0.15	0.00	0.06	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.18	0.02	0.41	0.09	0.36	0.10
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.02	0.01	0.08	0.00	0.11	0.01	0.11	0.03	0.25	0.00	0.01	0.00	0.26	0.26	0.36	0.03
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.12	0.03	0.13	0.04	0.25	0.01	0.00	0.01	0.35	0.45	0.27	0.16
C4	0.01	0.00	0.02	0.04	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.07	0.03	0.59	0.16	0.18	0.17
C4'	0.00	0.06	0.01	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.11	0.03	0.01	0.00	0.01	0.14	0.50	0.14
C5	0.01	0.00	0.08	0.09	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.06	0.11	0.03	0.62	0.16	0.18	0.19
C5'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.05	0.00	0.07	0.00	0.06	0.03	0.05	0.06	0.08	0.03	0.01	0.00	0.00	0.25	0.44	0.00
C6	0.02	0.00	0.11	0.12	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.14	0.04	0.54	0.10	0.34	0.10
N1	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.39	0.07	0.42	0.12
N3	0.02	0.00	0.11	0.13	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.16	0.03	0.51	0.13	0.25	0.11
N4	0.01	0.00	0.03	0.04	0.00	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.07	0.03	0.64	0.19	0.15	0.23
O2	0.05	0.00	0.25	0.25	0.00	0.11	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.20	0.30	0.02	0.31	0.08	0.41	0.15
O2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.02	0.03	0.06	0.03	0.08	0.01	0.08	0.03	0.20	0.00	0.03	0.02	0.07	0.18	0.44	0.13
O3'	0.01	0.18	0.01	0.00	0.07	0.01	0.11	0.01	0.14	0.03	0.16	0.07	0.30	0.03	0.00	0.01	0.29	0.63	0.20	0.26
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.03	0.03	0.02	0.02	0.01	0.00	0.06	0.17	0.68	0.36
O5'	0.17	0.41	0.26	0.35	0.59	0.01	0.62	0.00	0.54	0.39	0.51	0.64	0.31	0.07	0.29	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.03	0.09	0.26	0.45	0.16	0.14	0.16	0.25	0.10	0.07	0.13	0.19	0.08	0.18	0.63	0.17	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.54	0.36	0.36	0.27	0.18	0.50	0.18	0.44	0.34	0.42	0.25	0.15	0.41	0.44	0.20	0.68	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.22	0.10	0.03	0.16	0.17	0.14	0.19	0.00	0.10	0.12	0.11	0.23	0.15	0.13	0.26	0.36	0.00	0.00	0.00	0.00