Doublet Group distance statistics: 48976

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.000, 0.006, 0.012, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.006 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.000, 0.009, 0.018, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.000, 0.015, 0.029, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.015 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.000, 0.015, 0.030, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.015 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.000, 0.019, 0.038, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.019 std_dev=0.019
C1'	A	0, 0.000, 0.021, 0.041, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.021 std_dev=0.021
C2	A	0, 0.000, 0.023, 0.045, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.023 std_dev=0.023
O2	A	0, 0.000, 0.029, 0.057, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.029 std_dev=0.029
O4	A	0, 0.000, 0.046, 0.092, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.046 std_dev=0.046
O4'	A	0, 0.000, 0.301, 0.603, 0.603 max_d=0.603 avg_d=0.301 std_dev=0.301
N3	B	0, 0.000, 0.340, 0.680, 0.680 max_d=0.680 avg_d=0.340 std_dev=0.340
C2	B	0, 0.000, 0.371, 0.741, 0.741 max_d=0.741 avg_d=0.371 std_dev=0.371
O2	B	0, 0.000, 0.389, 0.779, 0.779 max_d=0.779 avg_d=0.389 std_dev=0.389
C2'	A	0, 0.000, 0.391, 0.781, 0.781 max_d=0.781 avg_d=0.391 std_dev=0.391
C4'	A	0, 0.000, 0.468, 0.936, 0.936 max_d=0.936 avg_d=0.468 std_dev=0.468
C4	B	0, 0.000, 0.514, 1.028, 1.028 max_d=1.028 avg_d=0.514 std_dev=0.514
O2'	A	0, 0.000, 0.539, 1.078, 1.078 max_d=1.078 avg_d=0.539 std_dev=0.539
N1	B	0, 0.000, 0.551, 1.102, 1.102 max_d=1.102 avg_d=0.551 std_dev=0.551
C3'	A	0, 0.000, 0.591, 1.182, 1.182 max_d=1.182 avg_d=0.591 std_dev=0.591
N4	B	0, 0.000, 0.639, 1.278, 1.278 max_d=1.278 avg_d=0.639 std_dev=0.639
C5	B	0, 0.000, 0.646, 1.292, 1.292 max_d=1.292 avg_d=0.646 std_dev=0.646
C6	B	0, 0.000, 0.660, 1.320, 1.320 max_d=1.320 avg_d=0.660 std_dev=0.660
O4'	B	0, 0.000, 0.686, 1.372, 1.372 max_d=1.372 avg_d=0.686 std_dev=0.686
C1'	B	0, 0.000, 0.784, 1.567, 1.567 max_d=1.567 avg_d=0.784 std_dev=0.784
O5'	A	0, 0.000, 0.830, 1.659, 1.659 max_d=1.659 avg_d=0.830 std_dev=0.830
C5'	A	0, 0.000, 0.831, 1.662, 1.662 max_d=1.662 avg_d=0.831 std_dev=0.831
O3'	A	0, 0.000, 0.893, 1.786, 1.786 max_d=1.786 avg_d=0.893 std_dev=0.893
C5'	B	0, 0.000, 0.983, 1.967, 1.967 max_d=1.967 avg_d=0.983 std_dev=0.983
O5'	B	0, 0.000, 1.019, 2.037, 2.037 max_d=2.037 avg_d=1.019 std_dev=1.019
C4'	B	0, 0.000, 1.025, 2.049, 2.049 max_d=2.049 avg_d=1.025 std_dev=1.025
P	B	0, 0.000, 1.029, 2.058, 2.058 max_d=2.058 avg_d=1.029 std_dev=1.029
OP2	B	0, 0.000, 1.064, 2.128, 2.128 max_d=2.128 avg_d=1.064 std_dev=1.064
OP1	B	0, 0.000, 1.125, 2.250, 2.250 max_d=2.250 avg_d=1.125 std_dev=1.125
C2'	B	0, 0.000, 1.154, 2.308, 2.308 max_d=2.308 avg_d=1.154 std_dev=1.154
C3'	B	0, 0.000, 1.286, 2.572, 2.572 max_d=2.572 avg_d=1.286 std_dev=1.286
P	A	0, 0.000, 1.417, 2.834, 2.834 max_d=2.834 avg_d=1.417 std_dev=1.417
O2'	B	0, 0.000, 1.477, 2.953, 2.953 max_d=2.953 avg_d=1.477 std_dev=1.477
OP2	A	0, 0.000, 1.477, 2.954, 2.954 max_d=2.954 avg_d=1.477 std_dev=1.477
O3'	B	0, 0.000, 1.802, 3.605, 3.605 max_d=3.605 avg_d=1.802 std_dev=1.802
OP1	A	0, 0.000, 2.074, 4.148, 4.148 max_d=4.148 avg_d=2.074 std_dev=2.074

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.10	0.48	0.25
C2	0.00	0.00	0.08	0.01	0.01	0.04	0.02	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.03	0.02	0.06	0.02	0.40	0.72	0.47
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.04	0.00	0.11	0.00	0.13	0.01	0.04	0.16	0.00	0.01	0.04	0.00	0.01	0.01	0.46	0.22
C3'	0.01	0.01	0.00	0.00	0.11	0.00	0.17	0.00	0.17	0.05	0.04	0.07	0.00	0.00	0.12	0.00	0.05	0.05	0.36	0.17
C4	0.01	0.01	0.04	0.11	0.00	0.08	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.13	0.00	0.03	0.08	0.61	0.82	0.56
C4'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.08	0.00	0.09	0.00	0.07	0.04	0.06	0.02	0.01	0.00	0.09	0.00	0.00	0.10	0.25	0.10
C5	0.02	0.02	0.11	0.17	0.00	0.09	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.02	0.08	0.22	0.01	0.02	0.06	0.52	0.76	0.48
C5'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.13	0.00	0.10	0.00	0.06	0.06	0.12	0.09	0.01	0.00	0.15	0.00	0.00	0.16	0.07	0.00
C6	0.02	0.01	0.13	0.17	0.01	0.07	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.10	0.21	0.01	0.04	0.01	0.34	0.64	0.38
N1	0.01	0.00	0.01	0.05	0.01	0.04	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.29	0.63	0.38
N3	0.00	0.01	0.04	0.04	0.01	0.06	0.01	0.12	0.00	0.00	0.00	0.02	0.08	0.03	0.01	0.05	0.06	0.54	0.80	0.55
O2	0.01	0.01	0.16	0.07	0.02	0.02	0.02	0.09	0.01	0.01	0.02	0.00	0.21	0.12	0.03	0.09	0.02	0.36	0.70	0.46
O2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.01	0.10	0.01	0.08	0.21	0.00	0.01	0.00	0.02	0.03	0.06	0.42	0.18
O3'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.13	0.00	0.22	0.00	0.21	0.05	0.03	0.12	0.01	0.00	0.15	0.00	0.11	0.16	0.29	0.11
O4	0.01	0.02	0.04	0.12	0.00	0.09	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.15	0.00	0.03	0.11	0.71	0.84	0.60
O4'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.05	0.09	0.02	0.00	0.03	0.00	0.08	0.02	0.33	0.17
O5'	0.04	0.02	0.01	0.05	0.08	0.00	0.06	0.00	0.01	0.01	0.06	0.02	0.03	0.11	0.11	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00
OP1	0.10	0.40	0.01	0.05	0.61	0.10	0.52	0.16	0.34	0.29	0.54	0.36	0.06	0.16	0.71	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.48	0.72	0.46	0.36	0.82	0.25	0.76	0.07	0.64	0.63	0.80	0.70	0.42	0.29	0.84	0.33	0.00	0.01	0.00	0.00
P	0.25	0.47	0.22	0.17	0.56	0.10	0.48	0.00	0.38	0.38	0.55	0.46	0.18	0.11	0.60	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.23	0.20	0.17	0.03	0.23	0.03	0.27	0.13	0.28	0.23	0.20	0.20	0.16	0.19	0.00	0.15	0.21	0.06	0.02	0.06
C2	0.33	0.24	0.33	0.17	0.16	0.14	0.19	0.04	0.25	0.27	0.17	0.10	0.24	0.41	0.18	0.21	0.15	0.04	0.01	0.04
C2'	0.25	0.21	0.18	0.05	0.20	0.06	0.24	0.11	0.27	0.24	0.19	0.17	0.18	0.18	0.01	0.21	0.20	0.10	0.01	0.09
C3'	0.29	0.26	0.21	0.09	0.28	0.13	0.34	0.01	0.36	0.30	0.25	0.23	0.23	0.19	0.01	0.27	0.09	0.01	0.04	0.01
C4	0.16	0.13	0.15	0.04	0.01	0.05	0.03	0.21	0.02	0.09	0.07	0.06	0.19	0.26	0.04	0.02	0.33	0.22	0.19	0.22
C4'	0.29	0.28	0.20	0.08	0.33	0.11	0.39	0.02	0.39	0.31	0.29	0.31	0.23	0.19	0.01	0.24	0.08	0.05	0.10	0.03
C5	0.06	0.11	0.02	0.18	0.04	0.17	0.03	0.32	0.02	0.04	0.11	0.03	0.15	0.10	0.21	0.06	0.43	0.31	0.27	0.31
C5'	0.31	0.32	0.23	0.11	0.40	0.14	0.46	0.04	0.43	0.35	0.34	0.39	0.26	0.21	0.02	0.27	0.01	0.14	0.16	0.09
C6	0.10	0.15	0.03	0.16	0.15	0.15	0.11	0.31	0.09	0.11	0.17	0.14	0.15	0.08	0.20	0.02	0.42	0.27	0.21	0.28
N1	0.23	0.21	0.18	0.02	0.19	0.01	0.21	0.15	0.23	0.22	0.19	0.16	0.19	0.23	0.00	0.12	0.25	0.12	0.05	0.12
N3	0.28	0.20	0.30	0.12	0.06	0.09	0.08	0.08	0.15	0.20	0.11	0.00	0.24	0.41	0.14	0.14	0.20	0.11	0.07	0.10
O2	0.43	0.26	0.44	0.31	0.18	0.28	0.24	0.09	0.32	0.33	0.19	0.12	0.26	0.54	0.34	0.31	0.03	0.06	0.09	0.06
O2'	0.21	0.16	0.14	0.04	0.16	0.05	0.20	0.12	0.22	0.19	0.15	0.14	0.14	0.14	0.01	0.17	0.18	0.12	0.02	0.08
O3'	0.27	0.23	0.19	0.09	0.22	0.16	0.27	0.07	0.31	0.27	0.21	0.18	0.21	0.16	0.00	0.28	0.01	0.01	0.01	0.01
O4	0.13	0.08	0.15	0.05	0.13	0.05	0.14	0.21	0.06	0.04	0.01	0.20	0.18	0.28	0.04	0.00	0.34	0.25	0.22	0.24
O4'	0.27	0.27	0.20	0.06	0.33	0.07	0.38	0.07	0.37	0.29	0.28	0.32	0.21	0.20	0.01	0.20	0.14	0.01	0.09	0.00
O5'	0.31	0.36	0.21	0.06	0.44	0.09	0.47	0.03	0.42	0.36	0.39	0.44	0.32	0.20	0.05	0.25	0.08	0.00	0.05	0.03
OP1	0.18	0.07	0.16	0.10	0.13	0.16	0.26	0.16	0.26	0.17	0.05	0.09	0.02	0.15	0.04	0.20	0.11	0.45	0.28	0.27
OP2	0.24	0.22	0.25	0.35	0.03	0.34	0.01	0.37	0.09	0.20	0.15	0.07	0.28	0.27	0.39	0.29	0.39	0.07	0.07	0.19
P	0.04	0.03	0.00	0.10	0.16	0.07	0.23	0.13	0.17	0.07	0.07	0.19	0.03	0.02	0.17	0.00	0.16	0.12	0.08	0.00

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.17	0.12
C2	0.02	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.04	0.19	0.12
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.02	0.01	0.08	0.01	0.09	0.00	0.04	0.02	0.14	0.00	0.00	0.00	0.03	0.10	0.07	0.04
C3'	0.01	0.01	0.00	0.00	0.09	0.00	0.15	0.01	0.15	0.05	0.03	0.10	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.16	0.04	0.04
C4	0.01	0.01	0.02	0.09	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.14	0.02	0.01	0.07	0.21	0.13
C4'	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.04	0.01	0.00	0.01	0.09	0.04	0.02
C5	0.01	0.00	0.08	0.15	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.21	0.05	0.02	0.09	0.24	0.16
C5'	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.06	0.00	0.00
C6	0.00	0.00	0.09	0.15	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.07	0.19	0.06	0.04	0.07	0.24	0.17
N1	0.01	0.00	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01	0.02	0.04	0.20	0.13
N3	0.02	0.00	0.04	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.04	0.00	0.01	0.05	0.19	0.12
N4	0.01	0.01	0.02	0.10	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.16	0.02	0.03	0.07	0.17	0.10
O2	0.03	0.00	0.14	0.07	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.18	0.10	0.03	0.00	0.02	0.18	0.10
O2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.04	0.06	0.04	0.07	0.01	0.07	0.01	0.18	0.00	0.02	0.03	0.01	0.17	0.04	0.00
O3'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.14	0.01	0.21	0.00	0.19	0.06	0.04	0.16	0.10	0.02	0.00	0.01	0.02	0.30	0.16	0.14
O4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.00	0.02	0.03	0.03	0.01	0.00	0.02	0.02	0.17	0.13
O5'	0.03	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.00	0.04	0.10	0.16	0.07	0.09	0.09	0.06	0.07	0.04	0.05	0.07	0.02	0.17	0.30	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.17	0.19	0.07	0.04	0.21	0.04	0.24	0.00	0.24	0.20	0.19	0.17	0.18	0.04	0.16	0.17	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.12	0.04	0.04	0.13	0.02	0.16	0.00	0.17	0.13	0.12	0.10	0.10	0.00	0.14	0.13	0.00	0.00	0.01	0.00