Doublet Group distance statistics: 48977

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.000, 0.004, 0.008, 0.008 max_d=0.008 avg_d=0.004 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.000, 0.005, 0.009, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.005 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.000, 0.009, 0.018, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.000, 0.013, 0.027, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.000, 0.013, 0.027, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.000, 0.014, 0.027, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.014 std_dev=0.014
C6	A	0, 0.000, 0.014, 0.027, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.014 std_dev=0.014
O2	A	0, 0.000, 0.039, 0.077, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.039 std_dev=0.039
O4	A	0, 0.000, 0.056, 0.112, 0.112 max_d=0.112 avg_d=0.056 std_dev=0.056
O4'	B	0, 0.000, 0.277, 0.554, 0.554 max_d=0.554 avg_d=0.277 std_dev=0.277
C6	B	0, 0.000, 0.302, 0.605, 0.605 max_d=0.605 avg_d=0.302 std_dev=0.302
C5	B	0, 0.000, 0.317, 0.633, 0.633 max_d=0.633 avg_d=0.317 std_dev=0.317
N3	B	0, 0.000, 0.328, 0.656, 0.656 max_d=0.656 avg_d=0.328 std_dev=0.328
C4	B	0, 0.000, 0.329, 0.658, 0.658 max_d=0.658 avg_d=0.329 std_dev=0.329
N1	B	0, 0.000, 0.330, 0.660, 0.660 max_d=0.660 avg_d=0.330 std_dev=0.330
C2	B	0, 0.000, 0.342, 0.683, 0.683 max_d=0.683 avg_d=0.342 std_dev=0.342
N4	B	0, 0.000, 0.366, 0.732, 0.732 max_d=0.732 avg_d=0.366 std_dev=0.366
C1'	B	0, 0.000, 0.376, 0.753, 0.753 max_d=0.753 avg_d=0.376 std_dev=0.376
O2	B	0, 0.000, 0.385, 0.770, 0.770 max_d=0.770 avg_d=0.385 std_dev=0.385
C4'	B	0, 0.000, 0.390, 0.779, 0.779 max_d=0.779 avg_d=0.390 std_dev=0.390
C5'	B	0, 0.000, 0.576, 1.151, 1.151 max_d=1.151 avg_d=0.576 std_dev=0.576
C2'	B	0, 0.000, 0.665, 1.330, 1.330 max_d=1.330 avg_d=0.665 std_dev=0.665
C3'	B	0, 0.000, 0.680, 1.360, 1.360 max_d=1.360 avg_d=0.680 std_dev=0.680
O4'	A	0, 0.000, 0.728, 1.456, 1.456 max_d=1.456 avg_d=0.728 std_dev=0.728
C2'	A	0, 0.000, 0.781, 1.562, 1.562 max_d=1.562 avg_d=0.781 std_dev=0.781
O2'	B	0, 0.000, 0.825, 1.650, 1.650 max_d=1.650 avg_d=0.825 std_dev=0.825
O5'	B	0, 0.000, 0.896, 1.791, 1.791 max_d=1.791 avg_d=0.896 std_dev=0.896
O3'	B	0, 0.000, 0.911, 1.822, 1.822 max_d=1.822 avg_d=0.911 std_dev=0.911
C3'	A	0, 0.000, 1.000, 2.001, 2.001 max_d=2.001 avg_d=1.000 std_dev=1.000
C4'	A	0, 0.000, 1.075, 2.151, 2.151 max_d=2.151 avg_d=1.075 std_dev=1.075
O3'	A	0, 0.000, 1.160, 2.320, 2.320 max_d=2.320 avg_d=1.160 std_dev=1.160
P	B	0, 0.000, 1.209, 2.417, 2.417 max_d=2.417 avg_d=1.209 std_dev=1.209
O2'	A	0, 0.000, 1.242, 2.483, 2.483 max_d=2.483 avg_d=1.242 std_dev=1.242
OP2	B	0, 0.000, 1.261, 2.521, 2.521 max_d=2.521 avg_d=1.261 std_dev=1.261
OP1	B	0, 0.000, 1.516, 3.032, 3.032 max_d=3.032 avg_d=1.516 std_dev=1.516
C5'	A	0, 0.000, 1.616, 3.232, 3.232 max_d=3.232 avg_d=1.616 std_dev=1.616
O5'	A	0, 0.000, 2.656, 5.313, 5.313 max_d=5.313 avg_d=2.656 std_dev=2.656
P	A	0, 0.000, 3.492, 6.984, 6.984 max_d=6.984 avg_d=3.492 std_dev=3.492
OP2	A	0, 0.000, 4.391, 8.783, 8.783 max_d=8.783 avg_d=4.391 std_dev=4.391
OP1	A	0, 0.000, 4.447, 8.893, 8.893 max_d=8.893 avg_d=4.447 std_dev=4.447

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.21	0.00	0.00	0.06	0.06	0.18	0.05
C2	0.00	0.00	0.19	0.22	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.04	0.00	0.12	0.12	0.22	0.54	0.13
C2'	0.00	0.19	0.00	0.00	0.02	0.00	0.16	0.14	0.20	0.01	0.12	0.35	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.15	0.12	0.06
C3'	0.00	0.22	0.00	0.00	0.24	0.00	0.19	0.00	0.13	0.15	0.26	0.22	0.02	0.00	0.26	0.01	0.31	0.51	0.17	0.27
C4	0.00	0.00	0.02	0.24	0.00	0.09	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.30	0.07	0.00	0.01	0.33	0.14	1.03	0.38
C4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.09	0.00	0.13	0.00	0.13	0.05	0.04	0.04	0.22	0.01	0.10	0.00	0.01	0.17	0.18	0.01
C5	0.00	0.00	0.16	0.19	0.00	0.13	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.39	0.06	0.00	0.10	0.43	0.01	1.08	0.47
C5'	0.05	0.03	0.14	0.00	0.07	0.00	0.11	0.00	0.09	0.00	0.01	0.08	0.07	0.15	0.08	0.00	0.00	0.29	0.24	0.00
C6	0.00	0.00	0.20	0.13	0.00	0.13	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.36	0.01	0.00	0.14	0.38	0.03	0.82	0.38
N1	0.00	0.00	0.01	0.15	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.17	0.06	0.00	0.00	0.19	0.10	0.53	0.19
N3	0.00	0.00	0.12	0.26	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.15	0.03	0.00	0.08	0.21	0.23	0.79	0.23
O2	0.01	0.00	0.35	0.22	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.18	0.08	0.00	0.20	0.01	0.29	0.35	0.01
O2'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.30	0.22	0.39	0.07	0.36	0.17	0.15	0.18	0.00	0.01	0.32	0.16	0.22	0.32	0.16	0.17
O3'	0.21	0.04	0.00	0.00	0.07	0.01	0.06	0.15	0.01	0.06	0.03	0.08	0.01	0.00	0.09	0.15	0.34	0.75	0.18	0.38
O4	0.00	0.00	0.01	0.26	0.00	0.10	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.32	0.09	0.00	0.00	0.35	0.16	1.15	0.41
O4'	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.10	0.00	0.14	0.00	0.08	0.20	0.16	0.15	0.00	0.00	0.08	0.15	0.03	0.06
O5'	0.06	0.12	0.11	0.31	0.33	0.01	0.43	0.00	0.38	0.19	0.21	0.01	0.22	0.34	0.35	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00
OP1	0.06	0.22	0.15	0.51	0.14	0.17	0.01	0.29	0.03	0.10	0.23	0.29	0.32	0.75	0.16	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.18	0.54	0.12	0.17	1.03	0.18	1.08	0.24	0.82	0.53	0.79	0.35	0.16	0.18	1.15	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.05	0.13	0.06	0.27	0.38	0.01	0.47	0.00	0.38	0.19	0.23	0.01	0.17	0.38	0.41	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.01	0.02	0.05	0.20	0.02	0.21	0.01	0.36	0.00	0.01	0.03	0.02	0.03	0.05	0.20	0.10	0.51	0.64	0.47	0.59
C2	0.06	0.03	0.07	0.19	0.02	0.21	0.05	0.29	0.07	0.06	0.02	0.01	0.02	0.00	0.17	0.17	0.36	0.39	0.22	0.36
C2'	0.54	0.43	0.63	0.76	0.25	0.73	0.26	0.80	0.40	0.47	0.33	0.16	0.46	0.56	0.76	0.63	0.91	0.85	0.62	0.81
C3'	0.40	0.45	0.55	0.75	0.51	0.62	0.57	0.83	0.55	0.47	0.47	0.50	0.40	0.37	0.75	0.44	1.18	1.31	1.33	1.34
C4	0.11	0.11	0.13	0.23	0.14	0.22	0.15	0.27	0.14	0.12	0.12	0.13	0.09	0.07	0.23	0.18	0.35	0.33	0.22	0.33
C4'	0.11	0.14	0.24	0.50	0.29	0.43	0.37	0.74	0.32	0.19	0.19	0.31	0.06	0.03	0.51	0.22	1.07	1.45	1.36	1.37
C5	0.10	0.11	0.15	0.27	0.14	0.24	0.16	0.32	0.14	0.12	0.11	0.14	0.08	0.07	0.28	0.17	0.44	0.47	0.39	0.46
C5'	0.17	0.21	0.34	0.63	0.40	0.52	0.50	0.85	0.42	0.26	0.27	0.44	0.11	0.10	0.66	0.28	1.22	1.69	1.68	1.58
C6	0.07	0.07	0.14	0.27	0.10	0.25	0.12	0.35	0.12	0.09	0.08	0.10	0.05	0.04	0.28	0.16	0.50	0.57	0.48	0.55
N1	0.05	0.03	0.10	0.23	0.04	0.23	0.06	0.34	0.07	0.05	0.03	0.03	0.02	0.00	0.23	0.15	0.47	0.54	0.40	0.51
N3	0.09	0.08	0.10	0.19	0.08	0.20	0.10	0.25	0.11	0.10	0.07	0.06	0.07	0.04	0.18	0.18	0.31	0.30	0.15	0.29
O2	0.03	0.02	0.02	0.14	0.04	0.19	0.01	0.27	0.01	0.01	0.04	0.05	0.02	0.04	0.11	0.17	0.30	0.34	0.15	0.30
O2'	0.26	0.00	0.33	0.40	0.34	0.50	0.41	0.51	0.21	0.02	0.16	0.45	0.13	0.40	0.46	0.39	0.36	0.36	0.14	0.19
O3'	0.10	0.15	0.30	0.56	0.27	0.41	0.33	0.74	0.29	0.18	0.20	0.29	0.09	0.10	0.60	0.13	1.15	1.55	1.40	1.51
O4	0.12	0.12	0.13	0.21	0.15	0.20	0.15	0.23	0.13	0.13	0.13	0.16	0.11	0.08	0.21	0.18	0.29	0.24	0.14	0.25
O4'	0.12	0.10	0.04	0.21	0.05	0.19	0.12	0.48	0.06	0.06	0.05	0.09	0.18	0.22	0.21	0.03	0.73	1.04	0.93	0.97
O5'	0.35	0.46	0.53	0.87	0.81	0.70	0.94	1.05	0.78	0.53	0.59	0.90	0.29	0.22	0.88	0.45	1.53	1.97	2.15	1.91
OP1	0.33	0.30	0.60	1.08	0.67	0.90	0.90	1.38	0.78	0.47	0.40	0.75	0.09	0.24	1.17	0.52	1.88	2.65	2.69	2.42
OP2	0.64	1.00	0.85	1.13	1.54	0.82	1.58	1.10	1.25	0.97	1.26	1.79	0.79	0.46	1.11	0.61	1.70	2.05	2.49	2.03
P	0.41	0.55	0.62	0.98	0.95	0.77	1.07	1.12	0.88	0.61	0.71	1.08	0.36	0.28	1.01	0.49	1.63	2.14	2.36	2.04

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.05	0.03	0.16	0.07
C2	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.02	0.12	0.17	0.30	0.18
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.04	0.00	0.08	0.02	0.08	0.02	0.01	0.04	0.09	0.00	0.00	0.00	0.06	0.04	0.12	0.07
C3'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.04	0.00	0.10	0.02	0.11	0.02	0.02	0.04	0.10	0.01	0.00	0.00	0.05	0.02	0.05	0.04
C4	0.01	0.01	0.04	0.04	0.00	0.00	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.05	0.00	0.08	0.20	0.31	0.18
C4'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.04	0.01
C5	0.01	0.00	0.08	0.10	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.12	0.02	0.02	0.12	0.23	0.12
C5'	0.02	0.06	0.02	0.02	0.06	0.00	0.03	0.00	0.02	0.04	0.07	0.06	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.02	0.00
C6	0.00	0.00	0.08	0.11	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.12	0.02	0.00	0.06	0.18	0.09
N1	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.07	0.10	0.22	0.12
N3	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.13	0.22	0.34	0.20
N4	0.01	0.01	0.04	0.04	0.00	0.00	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.06	0.00	0.09	0.23	0.33	0.20
O2	0.02	0.00	0.09	0.10	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.12	0.03	0.14	0.18	0.30	0.18
O2'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.05	0.02	0.02	0.05	0.03	0.00	0.02	0.01	0.05	0.00	0.10	0.05
O3'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.05	0.01	0.12	0.01	0.12	0.02	0.02	0.06	0.12	0.02	0.00	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01
O4'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.11	0.03
O5'	0.05	0.12	0.06	0.05	0.08	0.01	0.02	0.00	0.00	0.07	0.13	0.09	0.14	0.05	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.03	0.17	0.04	0.02	0.20	0.05	0.12	0.07	0.06	0.10	0.22	0.23	0.18	0.00	0.01	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.16	0.30	0.12	0.05	0.31	0.04	0.23	0.02	0.18	0.22	0.34	0.33	0.30	0.10	0.01	0.11	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.07	0.18	0.07	0.04	0.18	0.01	0.12	0.00	0.09	0.12	0.20	0.20	0.18	0.05	0.01	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00