Doublet Group distance statistics: 48981

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 6, 10, 7, 8, 10, 5, 8, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.001, 0.011, 0.020, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.011 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.005, 0.016, 0.027, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.016 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.003, 0.016, 0.028, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.016 std_dev=0.012
N3	A	0, -0.001, 0.013, 0.027, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.013 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.000, 0.015, 0.029, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.015 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.003, 0.018, 0.033, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.018 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.001, 0.022, 0.044, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.022 std_dev=0.021
O4	A	0, 0.017, 0.053, 0.089, 0.231 max_d=0.231 avg_d=0.053 std_dev=0.036
O2	A	0, -0.001, 0.044, 0.088, 0.206 max_d=0.206 avg_d=0.044 std_dev=0.045
C2'	A	0, 0.025, 0.151, 0.277, 0.492 max_d=0.492 avg_d=0.151 std_dev=0.126
O4'	A	0, 0.035, 0.175, 0.315, 0.527 max_d=0.527 avg_d=0.175 std_dev=0.140
O2'	A	0, 0.039, 0.180, 0.322, 0.705 max_d=0.705 avg_d=0.180 std_dev=0.141
C5	B	0, 0.169, 0.334, 0.498, 0.908 max_d=0.908 avg_d=0.334 std_dev=0.165
N7	B	0, 0.192, 0.375, 0.559, 0.987 max_d=0.987 avg_d=0.375 std_dev=0.183
C6	B	0, 0.227, 0.414, 0.601, 0.903 max_d=0.903 avg_d=0.414 std_dev=0.187
C8	B	0, 0.181, 0.370, 0.559, 0.965 max_d=0.965 avg_d=0.370 std_dev=0.189
C4	B	0, 0.168, 0.370, 0.572, 0.863 max_d=0.863 avg_d=0.370 std_dev=0.202
N9	B	0, 0.151, 0.353, 0.555, 0.880 max_d=0.880 avg_d=0.353 std_dev=0.202
N6	B	0, 0.285, 0.492, 0.698, 1.108 max_d=1.108 avg_d=0.492 std_dev=0.207
C4'	A	0, 0.078, 0.290, 0.503, 0.832 max_d=0.832 avg_d=0.290 std_dev=0.213
C3'	A	0, 0.089, 0.301, 0.514, 0.855 max_d=0.855 avg_d=0.301 std_dev=0.213
O4'	B	0, 0.140, 0.384, 0.627, 0.934 max_d=0.934 avg_d=0.384 std_dev=0.243
N1	B	0, 0.254, 0.518, 0.781, 1.115 max_d=1.115 avg_d=0.518 std_dev=0.264
C1'	B	0, 0.163, 0.453, 0.743, 1.174 max_d=1.174 avg_d=0.453 std_dev=0.290
O3'	A	0, 0.176, 0.467, 0.758, 1.164 max_d=1.164 avg_d=0.467 std_dev=0.291
N3	B	0, 0.222, 0.520, 0.818, 1.082 max_d=1.082 avg_d=0.520 std_dev=0.298
O5'	B	0, 0.252, 0.569, 0.886, 1.262 max_d=1.262 avg_d=0.569 std_dev=0.317
C2	B	0, 0.251, 0.570, 0.889, 1.281 max_d=1.281 avg_d=0.570 std_dev=0.319
C5'	B	0, 0.214, 0.541, 0.868, 1.260 max_d=1.260 avg_d=0.541 std_dev=0.327
P	B	0, 0.254, 0.592, 0.930, 1.576 max_d=1.576 avg_d=0.592 std_dev=0.338
C4'	B	0, 0.142, 0.499, 0.855, 1.259 max_d=1.259 avg_d=0.499 std_dev=0.357
OP2	B	0, 0.351, 0.713, 1.076, 1.798 max_d=1.798 avg_d=0.713 std_dev=0.362
C5'	A	0, 0.090, 0.465, 0.839, 1.464 max_d=1.464 avg_d=0.465 std_dev=0.374
OP1	B	0, 0.341, 0.729, 1.117, 2.161 max_d=2.161 avg_d=0.729 std_dev=0.388
O5'	A	0, 0.066, 0.521, 0.976, 1.651 max_d=1.651 avg_d=0.521 std_dev=0.455
C2'	B	0, 0.196, 0.684, 1.172, 2.152 max_d=2.152 avg_d=0.684 std_dev=0.488
C3'	B	0, 0.190, 0.686, 1.183, 1.695 max_d=1.695 avg_d=0.686 std_dev=0.497
P	A	0, 0.145, 0.771, 1.398, 2.221 max_d=2.221 avg_d=0.771 std_dev=0.626
O2'	B	0, 0.204, 0.894, 1.584, 3.687 max_d=3.687 avg_d=0.894 std_dev=0.690
O3'	B	0, 0.223, 0.955, 1.687, 2.739 max_d=2.739 avg_d=0.955 std_dev=0.732
OP1	A	0, 0.255, 1.297, 2.338, 3.328 max_d=3.328 avg_d=1.297 std_dev=1.041
OP2	A	0, 0.343, 1.434, 2.524, 3.530 max_d=3.530 avg_d=1.434 std_dev=1.091

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.04	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.04	0.07	0.02	0.02	0.04	0.01	0.07	0.56	0.27	0.19
C2	0.04	0.00	0.07	0.09	0.01	0.05	0.02	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.10	0.02	0.04	0.13	0.81	0.50	0.27
C2'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.05	0.01	0.06	0.02	0.06	0.02	0.06	0.12	0.00	0.02	0.06	0.01	0.06	0.32	0.13	0.12
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.08	0.01	0.09	0.02	0.09	0.05	0.09	0.13	0.02	0.01	0.08	0.01	0.10	0.24	0.19	0.10
C4	0.04	0.01	0.05	0.08	0.00	0.06	0.01	0.13	0.01	0.02	0.01	0.02	0.07	0.09	0.01	0.04	0.18	1.03	0.77	0.34
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.06	0.00	0.07	0.01	0.06	0.04	0.05	0.08	0.06	0.02	0.06	0.01	0.02	0.18	0.25	0.07
C5	0.03	0.02	0.06	0.09	0.01	0.07	0.00	0.14	0.01	0.02	0.01	0.02	0.06	0.11	0.01	0.05	0.19	1.05	0.78	0.35
C5'	0.02	0.08	0.02	0.02	0.13	0.01	0.14	0.00	0.12	0.07	0.10	0.08	0.06	0.03	0.14	0.02	0.01	0.16	0.41	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.09	0.01	0.06	0.01	0.12	0.00	0.01	0.02	0.02	0.04	0.10	0.01	0.05	0.16	0.92	0.61	0.30
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.02	0.04	0.02	0.07	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.05	0.03	0.02	0.12	0.77	0.46	0.25
N3	0.04	0.01	0.06	0.09	0.01	0.05	0.01	0.10	0.02	0.02	0.00	0.01	0.08	0.10	0.01	0.04	0.16	0.93	0.64	0.31
O2	0.07	0.01	0.12	0.13	0.02	0.08	0.02	0.08	0.02	0.02	0.01	0.00	0.14	0.15	0.02	0.08	0.12	0.72	0.42	0.24
O2'	0.02	0.08	0.00	0.02	0.07	0.06	0.06	0.06	0.04	0.03	0.08	0.14	0.00	0.04	0.08	0.06	0.05	0.26	0.18	0.08
O3'	0.02	0.10	0.02	0.01	0.09	0.02	0.11	0.03	0.10	0.05	0.10	0.15	0.04	0.00	0.10	0.02	0.13	0.47	0.42	0.17
O4	0.04	0.02	0.06	0.08	0.01	0.06	0.01	0.14	0.01	0.03	0.01	0.02	0.08	0.10	0.00	0.04	0.19	1.08	0.85	0.36
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.01	0.05	0.02	0.05	0.02	0.04	0.08	0.06	0.02	0.04	0.00	0.10	0.52	0.27	0.20
O5'	0.07	0.13	0.06	0.10	0.18	0.02	0.19	0.01	0.16	0.12	0.16	0.12	0.05	0.13	0.19	0.10	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.56	0.81	0.32	0.24	1.03	0.18	1.05	0.16	0.92	0.77	0.93	0.72	0.26	0.47	1.08	0.52	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.27	0.50	0.13	0.19	0.77	0.25	0.78	0.41	0.61	0.46	0.64	0.42	0.18	0.42	0.85	0.27	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.19	0.27	0.12	0.10	0.34	0.07	0.35	0.02	0.30	0.25	0.31	0.24	0.08	0.17	0.36	0.20	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.20	0.17	0.14	0.12	0.16	0.12	0.16	0.17	0.17	0.19	0.18	0.20	0.17	0.13	0.25	0.14	0.18	0.11	0.03	0.06	0.03
C2	0.23	0.24	0.22	0.17	0.14	0.19	0.11	0.17	0.15	0.18	0.20	0.23	0.17	0.17	0.15	0.33	0.20	0.20	0.13	0.11	0.13	0.11
C2'	0.16	0.16	0.14	0.14	0.12	0.15	0.13	0.16	0.15	0.17	0.16	0.15	0.18	0.16	0.12	0.20	0.13	0.16	0.13	0.05	0.07	0.06
C3'	0.14	0.22	0.11	0.08	0.18	0.08	0.21	0.08	0.24	0.17	0.24	0.19	0.27	0.21	0.14	0.13	0.09	0.14	0.05	0.02	0.05	0.02
C4	0.22	0.33	0.20	0.18	0.19	0.18	0.14	0.16	0.17	0.21	0.28	0.30	0.19	0.22	0.18	0.27	0.18	0.19	0.15	0.13	0.20	0.14
C4'	0.14	0.24	0.10	0.08	0.18	0.09	0.23	0.08	0.28	0.17	0.27	0.19	0.33	0.24	0.13	0.15	0.08	0.14	0.05	0.07	0.12	0.06
C5	0.19	0.31	0.17	0.18	0.18	0.16	0.14	0.17	0.21	0.22	0.29	0.27	0.22	0.21	0.16	0.22	0.17	0.18	0.17	0.16	0.21	0.16
C5'	0.16	0.33	0.14	0.12	0.27	0.08	0.34	0.07	0.41	0.25	0.39	0.27	0.47	0.34	0.20	0.14	0.14	0.15	0.10	0.12	0.21	0.11
C6	0.19	0.27	0.16	0.16	0.15	0.16	0.13	0.16	0.20	0.19	0.26	0.23	0.23	0.18	0.14	0.21	0.16	0.18	0.15	0.13	0.18	0.14
N1	0.19	0.23	0.17	0.14	0.13	0.16	0.11	0.15	0.17	0.18	0.21	0.21	0.20	0.17	0.13	0.25	0.14	0.18	0.11	0.07	0.11	0.07
N3	0.24	0.28	0.24	0.19	0.17	0.20	0.11	0.18	0.14	0.19	0.22	0.28	0.17	0.19	0.17	0.32	0.21	0.21	0.15	0.12	0.17	0.13
O2	0.26	0.23	0.28	0.23	0.16	0.24	0.13	0.21	0.15	0.18	0.19	0.23	0.17	0.17	0.17	0.41	0.29	0.23	0.17	0.16	0.14	0.15
O2'	0.24	0.21	0.23	0.23	0.19	0.24	0.17	0.24	0.17	0.20	0.19	0.22	0.18	0.18	0.20	0.28	0.22	0.24	0.19	0.09	0.07	0.09
O3'	0.13	0.18	0.11	0.07	0.17	0.08	0.20	0.06	0.22	0.17	0.21	0.16	0.25	0.22	0.15	0.12	0.10	0.14	0.03	0.02	0.02	0.01
O4	0.22	0.38	0.22	0.20	0.21	0.19	0.18	0.17	0.19	0.23	0.31	0.33	0.22	0.26	0.19	0.28	0.21	0.20	0.17	0.15	0.21	0.15
O4'	0.16	0.23	0.12	0.10	0.14	0.12	0.18	0.12	0.24	0.16	0.25	0.19	0.30	0.21	0.11	0.20	0.10	0.16	0.07	0.05	0.10	0.03
O5'	0.26	0.44	0.25	0.20	0.37	0.17	0.44	0.15	0.50	0.33	0.49	0.38	0.55	0.42	0.31	0.25	0.20	0.23	0.19	0.21	0.27	0.20
OP1	0.43	0.96	0.38	0.41	0.70	0.33	0.77	0.45	0.97	0.45	1.04	0.80	1.05	0.60	0.51	0.39	0.51	0.34	0.48	0.81	0.69	0.63
OP2	0.29	0.51	0.34	0.35	0.43	0.26	0.50	0.31	0.58	0.38	0.58	0.44	0.67	0.47	0.36	0.30	0.38	0.24	0.34	0.63	0.47	0.47
P	0.32	0.57	0.29	0.24	0.47	0.20	0.55	0.18	0.64	0.39	0.63	0.49	0.71	0.50	0.38	0.30	0.25	0.26	0.22	0.27	0.29	0.23

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03	0.02	0.01	0.02	0.08	0.01	0.08	0.08	0.16	0.11
C2	0.03	0.00	0.14	0.15	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.14	0.20	0.05	0.12	0.16	0.28	0.18
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.09	0.01	0.09	0.06	0.11	0.07	0.13	0.13	0.11	0.08	0.04	0.00	0.02	0.01	0.12	0.13	0.16	0.13
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.12	0.00	0.15	0.02	0.17	0.14	0.16	0.13	0.18	0.16	0.09	0.02	0.01	0.02	0.06	0.09	0.09	0.07
C4	0.02	0.01	0.09	0.12	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.10	0.13	0.03	0.13	0.16	0.26	0.18
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.08	0.05	0.05	0.07	0.09	0.04	0.10	0.03	0.01	0.01	0.06	0.04	0.02
C5	0.02	0.01	0.09	0.15	0.01	0.06	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.12	0.17	0.03	0.16	0.22	0.32	0.23
C5'	0.03	0.06	0.06	0.02	0.07	0.01	0.10	0.00	0.10	0.12	0.08	0.05	0.12	0.13	0.07	0.06	0.07	0.01	0.01	0.06	0.02	0.02
C6	0.02	0.01	0.11	0.17	0.01	0.06	0.01	0.10	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.14	0.20	0.04	0.16	0.23	0.33	0.24
C8	0.02	0.02	0.07	0.14	0.01	0.08	0.01	0.12	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.00	0.01	0.10	0.14	0.04	0.16	0.21	0.27	0.21
N1	0.03	0.00	0.13	0.16	0.01	0.05	0.01	0.08	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.14	0.20	0.05	0.14	0.20	0.32	0.22
N3	0.03	0.00	0.13	0.13	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.12	0.17	0.05	0.11	0.13	0.25	0.16
N6	0.03	0.01	0.11	0.18	0.02	0.07	0.02	0.12	0.01	0.04	0.01	0.02	0.00	0.04	0.03	0.15	0.23	0.05	0.17	0.27	0.36	0.26
N7	0.02	0.01	0.08	0.16	0.01	0.09	0.01	0.13	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.00	0.01	0.12	0.18	0.04	0.18	0.25	0.33	0.25
N9	0.01	0.02	0.04	0.09	0.01	0.04	0.01	0.07	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.06	0.08	0.02	0.12	0.14	0.23	0.16
O2'	0.02	0.14	0.00	0.02	0.10	0.10	0.12	0.06	0.14	0.10	0.14	0.12	0.15	0.12	0.06	0.00	0.05	0.08	0.09	0.12	0.16	0.10
O3'	0.08	0.20	0.02	0.01	0.13	0.03	0.17	0.07	0.20	0.14	0.20	0.17	0.23	0.18	0.08	0.05	0.00	0.06	0.13	0.20	0.19	0.16
O4'	0.01	0.05	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.04	0.05	0.05	0.05	0.04	0.02	0.08	0.06	0.00	0.07	0.09	0.14	0.10
O5'	0.08	0.12	0.12	0.06	0.13	0.01	0.16	0.01	0.16	0.16	0.14	0.11	0.17	0.18	0.12	0.09	0.13	0.07	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.08	0.16	0.13	0.09	0.16	0.06	0.22	0.06	0.23	0.21	0.20	0.13	0.27	0.25	0.14	0.12	0.20	0.09	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.16	0.28	0.16	0.09	0.26	0.04	0.32	0.02	0.33	0.27	0.32	0.25	0.36	0.33	0.23	0.16	0.19	0.14	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.18	0.13	0.07	0.18	0.02	0.23	0.02	0.24	0.21	0.22	0.16	0.26	0.25	0.16	0.10	0.16	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00