Doublet Group distance statistics: 48984

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 4, 1, 6, 6, 5, 9, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.008, 0.012, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.008 std_dev=0.005
N3	A	0, 0.002, 0.009, 0.016, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.009 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.004, 0.012, 0.021, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.007, 0.016, 0.026, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.016 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.008, 0.018, 0.027, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.018 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.007, 0.017, 0.027, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.017 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.007, 0.021, 0.034, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.021 std_dev=0.013
O2	A	0, 0.016, 0.038, 0.061, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.038 std_dev=0.023
O4	A	0, 0.032, 0.089, 0.146, 0.237 max_d=0.237 avg_d=0.089 std_dev=0.057
O4'	A	0, 0.286, 0.400, 0.515, 0.647 max_d=0.647 avg_d=0.400 std_dev=0.114
C2'	A	0, 0.325, 0.451, 0.578, 0.733 max_d=0.733 avg_d=0.451 std_dev=0.126
C5	B	0, 0.255, 0.404, 0.553, 0.704 max_d=0.704 avg_d=0.404 std_dev=0.149
C6	B	0, 0.334, 0.483, 0.632, 0.795 max_d=0.795 avg_d=0.483 std_dev=0.149
N6	B	0, 0.356, 0.517, 0.679, 0.907 max_d=0.907 avg_d=0.517 std_dev=0.162
N7	B	0, 0.205, 0.368, 0.531, 0.640 max_d=0.640 avg_d=0.368 std_dev=0.163
C4'	A	0, 0.429, 0.602, 0.775, 0.990 max_d=0.990 avg_d=0.602 std_dev=0.173
O2'	A	0, 0.446, 0.620, 0.795, 0.996 max_d=0.996 avg_d=0.620 std_dev=0.174
C3'	A	0, 0.505, 0.699, 0.893, 1.137 max_d=1.137 avg_d=0.699 std_dev=0.194
C4	B	0, 0.356, 0.556, 0.755, 0.906 max_d=0.906 avg_d=0.556 std_dev=0.200
N1	B	0, 0.458, 0.665, 0.872, 0.946 max_d=0.946 avg_d=0.665 std_dev=0.207
C8	B	0, 0.296, 0.524, 0.753, 0.964 max_d=0.964 avg_d=0.524 std_dev=0.228
N9	B	0, 0.381, 0.624, 0.866, 1.083 max_d=1.083 avg_d=0.624 std_dev=0.243
C2	B	0, 0.496, 0.741, 0.986, 1.082 max_d=1.082 avg_d=0.741 std_dev=0.245
N3	B	0, 0.468, 0.715, 0.962, 1.121 max_d=1.121 avg_d=0.715 std_dev=0.247
O3'	A	0, 0.762, 1.047, 1.332, 1.748 max_d=1.748 avg_d=1.047 std_dev=0.285
O4'	B	0, 0.315, 0.602, 0.889, 1.193 max_d=1.193 avg_d=0.602 std_dev=0.287
P	A	0, 0.442, 0.731, 1.021, 1.432 max_d=1.432 avg_d=0.731 std_dev=0.290
C5'	B	0, 1.056, 1.349, 1.641, 1.837 max_d=1.837 avg_d=1.349 std_dev=0.292
C5'	A	0, 0.700, 0.993, 1.286, 1.684 max_d=1.684 avg_d=0.993 std_dev=0.293
O5'	A	0, 0.615, 0.908, 1.202, 1.290 max_d=1.290 avg_d=0.908 std_dev=0.294
OP2	A	0, 0.386, 0.685, 0.983, 1.459 max_d=1.459 avg_d=0.685 std_dev=0.298
C1'	B	0, 0.521, 0.826, 1.131, 1.339 max_d=1.339 avg_d=0.826 std_dev=0.305
OP1	A	0, 0.461, 0.777, 1.093, 1.651 max_d=1.651 avg_d=0.777 std_dev=0.316
C4'	B	0, 0.521, 0.845, 1.169, 1.655 max_d=1.655 avg_d=0.845 std_dev=0.324
P	B	0, 0.796, 1.135, 1.474, 1.626 max_d=1.626 avg_d=1.135 std_dev=0.339
O5'	B	0, 1.156, 1.511, 1.865, 1.930 max_d=1.930 avg_d=1.511 std_dev=0.354
C3'	B	0, 0.957, 1.344, 1.730, 2.004 max_d=2.004 avg_d=1.344 std_dev=0.386
OP1	B	0, 0.550, 0.945, 1.341, 1.922 max_d=1.922 avg_d=0.945 std_dev=0.396
OP2	B	0, 0.861, 1.260, 1.659, 1.828 max_d=1.828 avg_d=1.260 std_dev=0.399
C2'	B	0, 0.938, 1.369, 1.800, 2.043 max_d=2.043 avg_d=1.369 std_dev=0.431
O3'	B	0, 1.166, 1.601, 2.036, 2.346 max_d=2.346 avg_d=1.601 std_dev=0.435
O2'	B	0, 1.031, 1.534, 2.037, 2.384 max_d=2.384 avg_d=1.534 std_dev=0.503

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.02	0.02	0.00	0.07	0.20	0.15	0.11
C2	0.02	0.00	0.03	0.05	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.05	0.01	0.04	0.12	0.19	0.19	0.14
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.04	0.03	0.04	0.05	0.01	0.02	0.04	0.01	0.04	0.22	0.14	0.10
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.06	0.01	0.06	0.02	0.06	0.04	0.06	0.05	0.01	0.01	0.06	0.01	0.07	0.22	0.14	0.11
C4	0.02	0.01	0.04	0.06	0.00	0.04	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.08	0.00	0.04	0.10	0.22	0.21	0.15
C4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.03	0.05	0.06	0.05	0.02	0.04	0.00	0.02	0.15	0.06	0.04
C5	0.01	0.01	0.04	0.06	0.01	0.05	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.09	0.01	0.04	0.07	0.22	0.20	0.14
C5'	0.02	0.11	0.01	0.02	0.11	0.01	0.10	0.00	0.09	0.07	0.12	0.12	0.05	0.05	0.11	0.01	0.01	0.12	0.03	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.06	0.01	0.05	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.08	0.01	0.04	0.06	0.22	0.18	0.12
N1	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.01	0.07	0.20	0.16	0.11
N3	0.02	0.00	0.04	0.06	0.00	0.05	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.06	0.01	0.04	0.13	0.21	0.22	0.16
O2	0.04	0.00	0.05	0.05	0.01	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.04	0.02	0.07	0.15	0.19	0.20	0.16
O2'	0.02	0.05	0.01	0.01	0.04	0.05	0.04	0.05	0.04	0.03	0.05	0.09	0.00	0.05	0.04	0.03	0.03	0.21	0.13	0.09
O3'	0.02	0.05	0.02	0.01	0.08	0.02	0.09	0.05	0.08	0.05	0.06	0.04	0.05	0.00	0.08	0.02	0.10	0.26	0.17	0.15
O4	0.02	0.01	0.04	0.06	0.00	0.04	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.08	0.00	0.05	0.11	0.24	0.25	0.18
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.04	0.07	0.03	0.02	0.05	0.00	0.14	0.19	0.17	0.13
O5'	0.07	0.12	0.04	0.07	0.10	0.02	0.07	0.01	0.06	0.07	0.13	0.15	0.03	0.10	0.11	0.14	0.00	0.03	0.03	0.01
OP1	0.20	0.19	0.22	0.22	0.22	0.15	0.22	0.12	0.22	0.20	0.21	0.19	0.21	0.26	0.24	0.19	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.15	0.19	0.14	0.14	0.21	0.06	0.20	0.03	0.18	0.16	0.22	0.20	0.13	0.17	0.25	0.17	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.14	0.10	0.11	0.15	0.04	0.14	0.01	0.12	0.11	0.16	0.16	0.09	0.15	0.18	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.05	0.17	0.04	0.13	0.10	0.12	0.12	0.24	0.15	0.10	0.17	0.14	0.16	0.11	0.08	0.07	0.11	0.07	0.21	0.06	0.11	0.05
C2	0.08	0.11	0.08	0.14	0.07	0.14	0.09	0.19	0.13	0.08	0.14	0.09	0.16	0.09	0.07	0.08	0.13	0.13	0.23	0.08	0.15	0.07
C2'	0.08	0.19	0.06	0.14	0.13	0.12	0.14	0.29	0.16	0.11	0.18	0.17	0.16	0.13	0.10	0.08	0.12	0.07	0.22	0.11	0.11	0.09
C3'	0.12	0.18	0.12	0.18	0.13	0.13	0.13	0.18	0.14	0.12	0.17	0.17	0.15	0.12	0.11	0.12	0.16	0.11	0.11	0.03	0.09	0.02
C4	0.15	0.10	0.16	0.18	0.13	0.17	0.10	0.22	0.08	0.14	0.08	0.13	0.12	0.12	0.15	0.14	0.17	0.16	0.29	0.13	0.17	0.13
C4'	0.09	0.18	0.10	0.17	0.12	0.12	0.12	0.21	0.15	0.11	0.17	0.15	0.17	0.12	0.09	0.10	0.16	0.10	0.08	0.09	0.15	0.05
C5	0.18	0.12	0.19	0.21	0.14	0.20	0.11	0.26	0.10	0.16	0.10	0.15	0.13	0.13	0.17	0.18	0.20	0.18	0.31	0.14	0.17	0.14
C5'	0.10	0.18	0.12	0.18	0.13	0.14	0.15	0.19	0.18	0.13	0.19	0.15	0.20	0.15	0.10	0.11	0.18	0.11	0.11	0.19	0.24	0.14
C6	0.14	0.13	0.15	0.19	0.11	0.17	0.10	0.20	0.12	0.11	0.12	0.14	0.14	0.11	0.12	0.14	0.18	0.16	0.28	0.12	0.16	0.12
N1	0.07	0.13	0.07	0.14	0.07	0.13	0.10	0.18	0.13	0.07	0.14	0.10	0.16	0.10	0.05	0.07	0.13	0.11	0.23	0.09	0.14	0.08
N3	0.11	0.10	0.11	0.14	0.09	0.14	0.08	0.17	0.10	0.10	0.10	0.10	0.14	0.09	0.10	0.10	0.14	0.14	0.25	0.10	0.16	0.10
O2	0.11	0.16	0.11	0.16	0.12	0.18	0.12	0.25	0.16	0.10	0.18	0.14	0.18	0.11	0.10	0.13	0.16	0.15	0.22	0.08	0.14	0.06
O2'	0.12	0.21	0.10	0.16	0.15	0.18	0.15	0.46	0.17	0.14	0.20	0.18	0.17	0.14	0.13	0.12	0.13	0.11	0.29	0.16	0.12	0.13
O3'	0.15	0.20	0.16	0.22	0.15	0.17	0.13	0.24	0.15	0.12	0.18	0.19	0.15	0.12	0.13	0.17	0.21	0.15	0.02	0.02	0.02	0.01
O4	0.18	0.13	0.19	0.19	0.17	0.19	0.16	0.25	0.12	0.19	0.11	0.15	0.13	0.18	0.18	0.18	0.19	0.17	0.30	0.14	0.18	0.14
O4'	0.06	0.17	0.06	0.14	0.09	0.11	0.10	0.22	0.14	0.09	0.17	0.13	0.15	0.10	0.07	0.07	0.12	0.07	0.14	0.05	0.14	0.02
O5'	0.10	0.15	0.11	0.13	0.10	0.14	0.11	0.19	0.13	0.13	0.15	0.13	0.15	0.13	0.10	0.09	0.13	0.11	0.12	0.17	0.18	0.09
OP1	0.22	0.22	0.29	0.32	0.21	0.19	0.21	0.20	0.20	0.24	0.21	0.22	0.21	0.23	0.23	0.28	0.31	0.20	0.35	0.12	0.28	0.22
OP2	0.17	0.18	0.21	0.23	0.17	0.14	0.17	0.23	0.18	0.20	0.18	0.17	0.19	0.20	0.18	0.20	0.22	0.15	0.33	0.09	0.11	0.14
P	0.12	0.16	0.17	0.20	0.12	0.12	0.13	0.19	0.14	0.15	0.15	0.14	0.16	0.15	0.12	0.15	0.19	0.11	0.25	0.10	0.12	0.09

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.05	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.13	0.15	0.20	0.05
C2	0.05	0.00	0.07	0.05	0.01	0.11	0.01	0.16	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.09	0.07	0.09	0.16	0.12	0.25	0.13
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.05	0.02	0.05	0.03	0.05	0.05	0.06	0.07	0.05	0.05	0.04	0.00	0.02	0.01	0.19	0.26	0.12	0.11
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.03	0.02	0.06	0.03	0.05	0.03	0.06	0.02	0.02	0.01	0.03	0.24	0.34	0.09	0.18
C4	0.02	0.01	0.05	0.02	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.04	0.04	0.17	0.12	0.22	0.08
C4'	0.02	0.11	0.02	0.00	0.05	0.00	0.02	0.01	0.04	0.08	0.08	0.11	0.03	0.06	0.01	0.11	0.03	0.00	0.02	0.16	0.28	0.05
C5	0.01	0.01	0.05	0.03	0.00	0.02	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.03	0.03	0.21	0.12	0.22	0.10
C5'	0.02	0.16	0.03	0.03	0.06	0.01	0.09	0.00	0.08	0.21	0.11	0.14	0.10	0.19	0.08	0.11	0.07	0.02	0.01	0.28	0.38	0.01
C6	0.02	0.01	0.05	0.02	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.04	0.04	0.20	0.12	0.23	0.11
C8	0.02	0.02	0.05	0.06	0.01	0.08	0.01	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.09	0.05	0.06	0.24	0.17	0.21	0.11
N1	0.03	0.00	0.06	0.03	0.01	0.08	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.05	0.07	0.18	0.11	0.24	0.12
N3	0.05	0.00	0.07	0.05	0.00	0.11	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.09	0.07	0.09	0.15	0.11	0.24	0.11
N6	0.01	0.01	0.05	0.03	0.01	0.03	0.01	0.10	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.08	0.03	0.04	0.23	0.13	0.23	0.12
N7	0.01	0.01	0.05	0.06	0.01	0.06	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.09	0.05	0.05	0.25	0.15	0.21	0.11
N9	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.05	0.03	0.01	0.19	0.15	0.20	0.08
O2'	0.03	0.09	0.00	0.02	0.06	0.11	0.07	0.11	0.07	0.09	0.08	0.09	0.08	0.09	0.05	0.00	0.04	0.05	0.12	0.26	0.13	0.09
O3'	0.03	0.07	0.02	0.01	0.04	0.03	0.03	0.07	0.04	0.05	0.05	0.07	0.03	0.05	0.03	0.04	0.00	0.02	0.15	0.34	0.13	0.15
O4'	0.00	0.09	0.01	0.03	0.04	0.00	0.03	0.02	0.04	0.06	0.07	0.09	0.04	0.05	0.01	0.05	0.02	0.00	0.14	0.15	0.24	0.06
O5'	0.13	0.16	0.19	0.24	0.17	0.02	0.21	0.01	0.20	0.24	0.18	0.15	0.23	0.25	0.19	0.12	0.15	0.14	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.15	0.12	0.26	0.34	0.12	0.16	0.12	0.28	0.12	0.17	0.11	0.11	0.13	0.15	0.15	0.26	0.34	0.15	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.20	0.25	0.12	0.09	0.22	0.28	0.22	0.38	0.23	0.21	0.24	0.24	0.23	0.21	0.20	0.13	0.13	0.24	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.13	0.11	0.18	0.08	0.05	0.10	0.01	0.11	0.11	0.12	0.11	0.12	0.11	0.08	0.09	0.15	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00