Doublet Group distance statistics: 48985

back

Distances from reference structure (by RMSD)

3, 8, 9, 10, 0, 2, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.004, 0.007, 0.011, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.007 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.004, 0.009, 0.015, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.005, 0.010, 0.016, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.010 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.009 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.002, 0.008, 0.014, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.008 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.004, 0.010, 0.016, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.010 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.004, 0.011, 0.018, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.011 std_dev=0.007
O2	A	0, 0.009, 0.024, 0.040, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.024 std_dev=0.015
O4	A	0, -0.001, 0.042, 0.085, 0.203 max_d=0.203 avg_d=0.042 std_dev=0.043
O4'	A	0, 0.016, 0.065, 0.114, 0.174 max_d=0.174 avg_d=0.065 std_dev=0.049
C2'	A	0, 0.017, 0.075, 0.132, 0.231 max_d=0.231 avg_d=0.075 std_dev=0.057
C4'	A	0, 0.037, 0.114, 0.190, 0.287 max_d=0.287 avg_d=0.114 std_dev=0.076
C3'	A	0, 0.035, 0.124, 0.214, 0.326 max_d=0.326 avg_d=0.124 std_dev=0.090
O2'	A	0, 0.025, 0.116, 0.207, 0.406 max_d=0.406 avg_d=0.116 std_dev=0.091
C5'	A	0, 0.052, 0.192, 0.332, 0.560 max_d=0.560 avg_d=0.192 std_dev=0.140
O3'	A	0, 0.051, 0.200, 0.349, 0.588 max_d=0.588 avg_d=0.200 std_dev=0.149
O5'	A	0, 0.067, 0.218, 0.368, 0.597 max_d=0.597 avg_d=0.218 std_dev=0.151
C1'	B	0, 0.096, 0.251, 0.407, 0.642 max_d=0.642 avg_d=0.251 std_dev=0.156
C4	B	0, 0.089, 0.246, 0.403, 0.730 max_d=0.730 avg_d=0.246 std_dev=0.157
N9	B	0, 0.084, 0.244, 0.405, 0.713 max_d=0.713 avg_d=0.244 std_dev=0.160
C5	B	0, 0.093, 0.263, 0.433, 0.853 max_d=0.853 avg_d=0.263 std_dev=0.170
C6	B	0, 0.100, 0.286, 0.472, 0.914 max_d=0.914 avg_d=0.286 std_dev=0.186
N3	B	0, 0.092, 0.278, 0.464, 0.748 max_d=0.748 avg_d=0.278 std_dev=0.186
O4'	B	0, 0.079, 0.273, 0.468, 0.822 max_d=0.822 avg_d=0.273 std_dev=0.195
C8	B	0, 0.088, 0.286, 0.484, 0.897 max_d=0.897 avg_d=0.286 std_dev=0.198
N7	B	0, 0.096, 0.296, 0.496, 0.946 max_d=0.946 avg_d=0.296 std_dev=0.200
P	A	0, 0.109, 0.310, 0.512, 0.816 max_d=0.816 avg_d=0.310 std_dev=0.202
N6	B	0, 0.120, 0.322, 0.524, 0.955 max_d=0.955 avg_d=0.322 std_dev=0.202
OP2	A	0, 0.111, 0.317, 0.522, 0.882 max_d=0.882 avg_d=0.317 std_dev=0.205
N1	B	0, 0.081, 0.304, 0.527, 0.980 max_d=0.980 avg_d=0.304 std_dev=0.223
C2	B	0, 0.080, 0.307, 0.533, 0.901 max_d=0.901 avg_d=0.307 std_dev=0.227
C2'	B	0, 0.079, 0.350, 0.622, 1.245 max_d=1.245 avg_d=0.350 std_dev=0.272
OP1	A	0, 0.122, 0.401, 0.679, 1.108 max_d=1.108 avg_d=0.401 std_dev=0.279
P	B	0, 0.053, 0.333, 0.614, 1.075 max_d=1.075 avg_d=0.333 std_dev=0.281
O5'	B	0, 0.059, 0.391, 0.722, 1.226 max_d=1.226 avg_d=0.391 std_dev=0.331
OP1	B	0, 0.082, 0.416, 0.750, 1.373 max_d=1.373 avg_d=0.416 std_dev=0.334
OP2	B	0, 0.052, 0.388, 0.724, 1.230 max_d=1.230 avg_d=0.388 std_dev=0.336
C5'	B	0, 0.020, 0.383, 0.746, 1.302 max_d=1.302 avg_d=0.383 std_dev=0.363
C4'	B	0, 0.006, 0.405, 0.804, 1.457 max_d=1.457 avg_d=0.405 std_dev=0.399
O2'	B	0, 0.037, 0.466, 0.894, 2.020 max_d=2.020 avg_d=0.466 std_dev=0.429
C3'	B	0, -0.062, 0.529, 1.121, 2.072 max_d=2.072 avg_d=0.529 std_dev=0.592
O3'	B	0, -0.250, 0.789, 1.827, 3.467 max_d=3.467 avg_d=0.789 std_dev=1.038

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.05	0.06	0.06	0.05
C2	0.01	0.00	0.03	0.04	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.05	0.01	0.02	0.10	0.12	0.13	0.11
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.03	0.06	0.00	0.02	0.03	0.00	0.03	0.07	0.04	0.03
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.07	0.04	0.05	0.06	0.01	0.01	0.06	0.01	0.05	0.08	0.07	0.05
C4	0.01	0.00	0.03	0.06	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.07	0.00	0.02	0.15	0.17	0.18	0.16
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.05	0.03	0.03	0.03	0.05	0.02	0.05	0.00	0.01	0.05	0.02	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.06	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.08	0.00	0.02	0.15	0.17	0.17	0.17
C5'	0.02	0.05	0.01	0.01	0.09	0.01	0.10	0.00	0.09	0.06	0.07	0.04	0.05	0.04	0.10	0.02	0.01	0.04	0.02	0.02
C6	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.05	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.02	0.13	0.14	0.12	0.13
N1	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.10	0.11	0.10	0.09
N3	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.05	0.01	0.02	0.13	0.15	0.16	0.14
O2	0.02	0.00	0.06	0.06	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.08	0.01	0.03	0.09	0.10	0.11	0.09
O2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.04	0.05	0.03	0.05	0.03	0.02	0.05	0.08	0.00	0.03	0.05	0.03	0.03	0.08	0.04	0.04
O3'	0.02	0.05	0.02	0.01	0.07	0.02	0.08	0.04	0.07	0.03	0.05	0.08	0.03	0.00	0.07	0.02	0.10	0.13	0.13	0.11
O4	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.02	0.15	0.19	0.20	0.18
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.02	0.02	0.00	0.05	0.05	0.07	0.05
O5'	0.05	0.10	0.03	0.05	0.15	0.01	0.15	0.01	0.13	0.10	0.13	0.09	0.03	0.10	0.15	0.05	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.06	0.12	0.07	0.08	0.17	0.05	0.17	0.04	0.14	0.11	0.15	0.10	0.08	0.13	0.19	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.06	0.13	0.04	0.07	0.18	0.02	0.17	0.02	0.12	0.10	0.16	0.11	0.04	0.13	0.20	0.07	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.05	0.11	0.03	0.05	0.16	0.02	0.17	0.02	0.13	0.09	0.14	0.09	0.04	0.11	0.18	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.06	0.24	0.09	0.06	0.12	0.10	0.12	0.11	0.18	0.15	0.23	0.19	0.17	0.13	0.07	0.09	0.19	0.07	0.09	0.04	0.04	0.03
C2	0.10	0.25	0.10	0.09	0.10	0.14	0.10	0.13	0.14	0.20	0.23	0.19	0.13	0.18	0.11	0.14	0.36	0.11	0.12	0.09	0.11	0.08
C2'	0.07	0.23	0.14	0.06	0.15	0.10	0.14	0.11	0.18	0.14	0.22	0.20	0.16	0.13	0.09	0.08	0.14	0.07	0.10	0.06	0.06	0.05
C3'	0.09	0.23	0.20	0.09	0.17	0.05	0.17	0.05	0.20	0.12	0.23	0.21	0.19	0.14	0.12	0.10	0.10	0.06	0.05	0.02	0.04	0.01
C4	0.13	0.24	0.14	0.21	0.08	0.10	0.11	0.11	0.11	0.23	0.23	0.15	0.12	0.23	0.14	0.11	0.22	0.10	0.13	0.11	0.14	0.11
C4'	0.07	0.25	0.19	0.09	0.17	0.05	0.18	0.06	0.23	0.12	0.26	0.21	0.23	0.15	0.11	0.08	0.09	0.06	0.05	0.03	0.07	0.03
C5	0.11	0.24	0.11	0.26	0.09	0.11	0.10	0.12	0.16	0.21	0.25	0.17	0.15	0.20	0.11	0.11	0.13	0.09	0.15	0.12	0.15	0.12
C5'	0.10	0.29	0.22	0.14	0.21	0.05	0.23	0.05	0.28	0.13	0.31	0.25	0.29	0.19	0.15	0.18	0.18	0.06	0.08	0.09	0.12	0.08
C6	0.09	0.25	0.08	0.22	0.11	0.09	0.11	0.11	0.19	0.19	0.26	0.19	0.18	0.16	0.09	0.09	0.12	0.08	0.14	0.10	0.12	0.10
N1	0.07	0.25	0.07	0.11	0.11	0.08	0.11	0.09	0.17	0.18	0.24	0.19	0.16	0.16	0.08	0.08	0.20	0.07	0.09	0.06	0.08	0.06
N3	0.13	0.25	0.14	0.13	0.09	0.12	0.11	0.11	0.12	0.23	0.22	0.17	0.12	0.21	0.14	0.14	0.35	0.11	0.12	0.10	0.13	0.09
O2	0.12	0.25	0.12	0.16	0.12	0.22	0.12	0.19	0.14	0.19	0.22	0.20	0.13	0.17	0.12	0.21	0.51	0.16	0.16	0.12	0.13	0.12
O2'	0.10	0.23	0.17	0.15	0.15	0.18	0.14	0.19	0.17	0.14	0.22	0.21	0.16	0.13	0.12	0.17	0.23	0.11	0.15	0.09	0.07	0.08
O3'	0.12	0.21	0.26	0.07	0.17	0.05	0.17	0.05	0.19	0.13	0.21	0.20	0.18	0.15	0.14	0.12	0.19	0.07	0.02	0.02	0.02	0.01
O4	0.16	0.19	0.19	0.24	0.12	0.12	0.17	0.12	0.11	0.25	0.18	0.12	0.15	0.26	0.18	0.14	0.23	0.11	0.15	0.12	0.16	0.13
O4'	0.05	0.25	0.12	0.08	0.14	0.07	0.15	0.08	0.20	0.12	0.26	0.20	0.20	0.13	0.08	0.05	0.10	0.06	0.06	0.02	0.06	0.02
O5'	0.10	0.31	0.19	0.22	0.22	0.09	0.24	0.11	0.31	0.12	0.33	0.26	0.32	0.18	0.14	0.23	0.23	0.07	0.16	0.16	0.19	0.16
OP1	0.19	0.37	0.30	0.25	0.30	0.12	0.33	0.14	0.39	0.22	0.40	0.33	0.42	0.29	0.24	0.39	0.36	0.12	0.17	0.19	0.20	0.17
OP2	0.14	0.35	0.21	0.30	0.25	0.13	0.28	0.16	0.36	0.14	0.39	0.29	0.39	0.20	0.17	0.38	0.30	0.08	0.21	0.20	0.23	0.20
P	0.13	0.34	0.22	0.25	0.25	0.10	0.28	0.12	0.35	0.15	0.37	0.29	0.37	0.21	0.17	0.32	0.29	0.08	0.17	0.17	0.20	0.17

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.26	0.01	0.19	0.18	0.27	0.20
C2	0.01	0.00	0.18	0.16	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.14	0.26	0.12	0.15	0.19	0.28	0.21
C2'	0.00	0.18	0.00	0.00	0.10	0.01	0.06	0.17	0.09	0.09	0.15	0.18	0.08	0.05	0.02	0.00	0.03	0.01	0.34	0.37	0.45	0.37
C3'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.20	0.01	0.28	0.02	0.28	0.30	0.22	0.12	0.32	0.33	0.19	0.02	0.01	0.02	0.07	0.07	0.10	0.07
C4	0.01	0.01	0.10	0.20	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.16	0.14	0.06	0.14	0.18	0.27	0.20
C4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.04	0.00	0.08	0.01	0.07	0.15	0.04	0.05	0.10	0.14	0.07	0.23	0.02	0.00	0.02	0.07	0.03	0.02
C5	0.01	0.01	0.06	0.28	0.00	0.08	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.24	0.11	0.03	0.12	0.18	0.26	0.18
C5'	0.07	0.09	0.17	0.02	0.06	0.01	0.07	0.00	0.07	0.11	0.07	0.09	0.09	0.11	0.05	0.08	0.20	0.02	0.01	0.08	0.02	0.02
C6	0.01	0.00	0.09	0.28	0.01	0.07	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.23	0.11	0.05	0.12	0.18	0.25	0.19
C8	0.01	0.01	0.09	0.30	0.00	0.15	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.26	0.18	0.09	0.11	0.16	0.25	0.17
N1	0.02	0.00	0.15	0.22	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.19	0.16	0.10	0.14	0.19	0.27	0.20
N3	0.01	0.00	0.18	0.12	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.12	0.29	0.12	0.17	0.19	0.28	0.21
N6	0.01	0.00	0.08	0.32	0.01	0.10	0.01	0.09	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.27	0.16	0.04	0.13	0.18	0.24	0.18
N7	0.01	0.01	0.05	0.33	0.00	0.14	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.29	0.21	0.06	0.13	0.17	0.24	0.17
N9	0.00	0.01	0.02	0.19	0.00	0.07	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.16	0.08	0.02	0.14	0.17	0.27	0.19
O2'	0.01	0.14	0.00	0.02	0.16	0.23	0.24	0.08	0.23	0.26	0.19	0.12	0.27	0.29	0.16	0.00	0.08	0.15	0.24	0.27	0.48	0.30
O3'	0.26	0.26	0.03	0.01	0.14	0.02	0.11	0.20	0.11	0.18	0.16	0.29	0.16	0.21	0.08	0.08	0.00	0.19	0.25	0.39	0.30	0.30
O4'	0.01	0.12	0.01	0.02	0.06	0.00	0.03	0.02	0.05	0.09	0.10	0.12	0.04	0.06	0.02	0.15	0.19	0.00	0.08	0.08	0.12	0.08
O5'	0.19	0.15	0.34	0.07	0.14	0.02	0.12	0.01	0.12	0.11	0.14	0.17	0.13	0.13	0.14	0.24	0.25	0.08	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.18	0.19	0.37	0.07	0.18	0.07	0.18	0.08	0.18	0.16	0.19	0.19	0.18	0.17	0.17	0.27	0.39	0.08	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.27	0.28	0.45	0.10	0.27	0.03	0.26	0.02	0.25	0.25	0.27	0.28	0.24	0.24	0.27	0.48	0.30	0.12	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.20	0.21	0.37	0.07	0.20	0.02	0.18	0.02	0.19	0.17	0.20	0.21	0.18	0.17	0.19	0.30	0.30	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00