Doublet Group distance statistics: 48990

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 1, 2, 1, 2, 1, 1, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.009 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.006, 0.016, 0.025, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.016 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.004, 0.015, 0.026, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.015 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.007, 0.019, 0.032, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.019 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.007, 0.024, 0.042, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.024 std_dev=0.018
C1'	A	0, 0.013, 0.032, 0.051, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.032 std_dev=0.019
C4	A	0, 0.005, 0.024, 0.043, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.024 std_dev=0.019
O2	A	0, 0.010, 0.037, 0.065, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.037 std_dev=0.028
O4	A	0, 0.017, 0.057, 0.097, 0.134 max_d=0.134 avg_d=0.057 std_dev=0.040
O4'	A	0, 0.015, 0.072, 0.129, 0.220 max_d=0.220 avg_d=0.072 std_dev=0.057
C2'	A	0, 0.036, 0.100, 0.164, 0.203 max_d=0.203 avg_d=0.100 std_dev=0.064
C4'	A	0, 0.155, 0.309, 0.464, 0.534 max_d=0.534 avg_d=0.309 std_dev=0.155
O2'	A	0, 0.100, 0.286, 0.471, 0.602 max_d=0.602 avg_d=0.286 std_dev=0.185
C3'	A	0, 0.148, 0.349, 0.550, 0.649 max_d=0.649 avg_d=0.349 std_dev=0.201
C4	B	0, 0.166, 0.370, 0.575, 0.682 max_d=0.682 avg_d=0.370 std_dev=0.205
N3	B	0, 0.168, 0.390, 0.612, 0.802 max_d=0.802 avg_d=0.390 std_dev=0.222
O5'	A	0, 0.225, 0.451, 0.677, 0.734 max_d=0.734 avg_d=0.451 std_dev=0.226
C5'	A	0, 0.192, 0.427, 0.662, 0.742 max_d=0.742 avg_d=0.427 std_dev=0.235
C2	B	0, 0.210, 0.492, 0.775, 0.963 max_d=0.963 avg_d=0.492 std_dev=0.283
C5	B	0, 0.192, 0.476, 0.760, 1.052 max_d=1.052 avg_d=0.476 std_dev=0.284
N9	B	0, 0.094, 0.391, 0.689, 0.906 max_d=0.906 avg_d=0.391 std_dev=0.298
N1	B	0, 0.256, 0.591, 0.926, 1.067 max_d=1.067 avg_d=0.591 std_dev=0.335
P	A	0, 0.327, 0.670, 1.013, 1.212 max_d=1.212 avg_d=0.670 std_dev=0.343
C6	B	0, 0.248, 0.592, 0.935, 1.226 max_d=1.226 avg_d=0.592 std_dev=0.343
O3'	A	0, 0.280, 0.649, 1.018, 1.224 max_d=1.224 avg_d=0.649 std_dev=0.369
N7	B	0, 0.169, 0.553, 0.937, 1.448 max_d=1.448 avg_d=0.553 std_dev=0.384
C8	B	0, 0.110, 0.496, 0.881, 1.365 max_d=1.365 avg_d=0.496 std_dev=0.385
C1'	B	0, 0.060, 0.446, 0.831, 1.215 max_d=1.215 avg_d=0.446 std_dev=0.385
C2'	B	0, 0.100, 0.516, 0.933, 1.435 max_d=1.435 avg_d=0.516 std_dev=0.417
OP2	A	0, 0.324, 0.770, 1.215, 1.674 max_d=1.674 avg_d=0.770 std_dev=0.445
O2'	B	0, 0.096, 0.560, 1.024, 1.592 max_d=1.592 avg_d=0.560 std_dev=0.464
OP1	A	0, 0.445, 0.912, 1.379, 1.681 max_d=1.681 avg_d=0.912 std_dev=0.467
N6	B	0, 0.297, 0.773, 1.249, 1.729 max_d=1.729 avg_d=0.773 std_dev=0.476
O5'	B	0, 0.286, 0.773, 1.260, 1.769 max_d=1.769 avg_d=0.773 std_dev=0.487
O4'	B	0, 0.012, 0.539, 1.065, 1.679 max_d=1.679 avg_d=0.539 std_dev=0.527
P	B	0, 0.345, 0.905, 1.464, 1.921 max_d=1.921 avg_d=0.905 std_dev=0.560
C3'	B	0, 0.143, 0.714, 1.286, 1.805 max_d=1.805 avg_d=0.714 std_dev=0.572
OP2	B	0, 0.427, 1.040, 1.652, 2.083 max_d=2.083 avg_d=1.040 std_dev=0.613
C4'	B	0, 0.081, 0.716, 1.350, 1.980 max_d=1.980 avg_d=0.716 std_dev=0.635
O3'	B	0, 0.209, 0.961, 1.713, 2.477 max_d=2.477 avg_d=0.961 std_dev=0.752
C5'	B	0, 0.074, 0.886, 1.698, 2.952 max_d=2.952 avg_d=0.886 std_dev=0.812
OP1	B	0, 0.420, 1.249, 2.079, 2.845 max_d=2.845 avg_d=1.249 std_dev=0.830

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.04	0.04	0.01	0.03	0.01	0.06	0.09	0.14	0.11
C2	0.02	0.00	0.04	0.09	0.02	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.09	0.03	0.03	0.11	0.14	0.23	0.17
C2'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.07	0.02	0.06	0.02	0.05	0.03	0.05	0.06	0.00	0.03	0.07	0.01	0.06	0.14	0.12	0.08
C3'	0.02	0.09	0.00	0.00	0.15	0.00	0.16	0.03	0.14	0.09	0.12	0.07	0.03	0.01	0.16	0.02	0.09	0.17	0.13	0.08
C4	0.03	0.02	0.07	0.15	0.00	0.09	0.01	0.14	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.19	0.01	0.03	0.18	0.22	0.31	0.22
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.09	0.00	0.10	0.01	0.10	0.05	0.06	0.04	0.12	0.03	0.10	0.01	0.01	0.10	0.07	0.04
C5	0.01	0.01	0.06	0.16	0.01	0.10	0.00	0.16	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.20	0.01	0.03	0.19	0.22	0.30	0.22
C5'	0.03	0.08	0.02	0.03	0.14	0.01	0.16	0.00	0.14	0.09	0.11	0.06	0.12	0.07	0.16	0.02	0.01	0.10	0.02	0.02
C6	0.01	0.01	0.05	0.14	0.01	0.10	0.00	0.14	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.17	0.01	0.02	0.16	0.17	0.23	0.18
N1	0.01	0.01	0.03	0.09	0.02	0.05	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.09	0.02	0.02	0.11	0.12	0.20	0.15
N3	0.02	0.01	0.05	0.12	0.01	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.14	0.02	0.03	0.15	0.19	0.28	0.20
O2	0.04	0.01	0.06	0.07	0.02	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.00	0.08	0.09	0.03	0.04	0.09	0.11	0.22	0.16
O2'	0.04	0.04	0.00	0.03	0.03	0.12	0.03	0.12	0.03	0.02	0.04	0.08	0.00	0.06	0.04	0.11	0.07	0.12	0.12	0.09
O3'	0.01	0.09	0.03	0.01	0.19	0.03	0.20	0.07	0.17	0.09	0.14	0.09	0.06	0.00	0.21	0.01	0.17	0.25	0.21	0.14
O4	0.03	0.03	0.07	0.16	0.01	0.10	0.01	0.16	0.01	0.02	0.02	0.03	0.04	0.21	0.00	0.04	0.19	0.25	0.34	0.24
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.03	0.04	0.11	0.01	0.04	0.00	0.10	0.09	0.17	0.13
O5'	0.06	0.11	0.06	0.09	0.18	0.01	0.19	0.01	0.16	0.11	0.15	0.09	0.07	0.17	0.19	0.10	0.00	0.02	0.03	0.02
OP1	0.09	0.14	0.14	0.17	0.22	0.10	0.22	0.10	0.17	0.12	0.19	0.11	0.12	0.25	0.25	0.09	0.02	0.00	0.03	0.01
OP2	0.14	0.23	0.12	0.13	0.31	0.07	0.30	0.02	0.23	0.20	0.28	0.22	0.12	0.21	0.34	0.17	0.03	0.03	0.00	0.02
P	0.11	0.17	0.08	0.08	0.22	0.04	0.22	0.02	0.18	0.15	0.20	0.16	0.09	0.14	0.24	0.13	0.02	0.01	0.02	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.16	0.18	0.13	0.13	0.12	0.20	0.22	0.24	0.16	0.21	0.13	0.29	0.23	0.13	0.28	0.14	0.14	0.25	0.05	0.17	0.06
C2	0.21	0.19	0.20	0.13	0.13	0.12	0.14	0.15	0.21	0.10	0.22	0.16	0.24	0.10	0.13	0.26	0.14	0.14	0.31	0.14	0.32	0.16
C2'	0.20	0.15	0.18	0.15	0.15	0.13	0.22	0.24	0.24	0.21	0.20	0.13	0.29	0.28	0.14	0.27	0.15	0.17	0.27	0.11	0.13	0.09
C3'	0.22	0.16	0.17	0.16	0.14	0.17	0.21	0.18	0.24	0.17	0.20	0.14	0.31	0.25	0.14	0.26	0.16	0.24	0.15	0.04	0.09	0.01
C4	0.25	0.25	0.22	0.21	0.16	0.20	0.14	0.20	0.23	0.25	0.28	0.19	0.27	0.18	0.21	0.24	0.21	0.22	0.28	0.30	0.47	0.28
C4'	0.21	0.16	0.17	0.15	0.14	0.14	0.21	0.21	0.26	0.16	0.22	0.13	0.33	0.25	0.13	0.27	0.15	0.20	0.12	0.10	0.10	0.05
C5	0.26	0.23	0.21	0.21	0.14	0.24	0.15	0.23	0.26	0.23	0.28	0.17	0.33	0.14	0.20	0.25	0.22	0.27	0.25	0.35	0.48	0.30
C5'	0.22	0.20	0.19	0.19	0.16	0.19	0.24	0.19	0.30	0.17	0.27	0.15	0.39	0.27	0.15	0.27	0.19	0.24	0.12	0.26	0.17	0.15
C6	0.25	0.20	0.20	0.17	0.13	0.20	0.18	0.16	0.27	0.15	0.26	0.15	0.34	0.14	0.16	0.26	0.17	0.25	0.23	0.28	0.40	0.24
N1	0.21	0.19	0.18	0.10	0.13	0.11	0.18	0.12	0.24	0.10	0.23	0.14	0.30	0.16	0.13	0.26	0.11	0.16	0.25	0.14	0.30	0.14
N3	0.22	0.23	0.21	0.16	0.15	0.14	0.12	0.13	0.20	0.17	0.24	0.19	0.23	0.10	0.17	0.25	0.17	0.16	0.29	0.20	0.40	0.21
O2	0.22	0.17	0.23	0.19	0.14	0.21	0.14	0.27	0.18	0.12	0.18	0.16	0.21	0.13	0.15	0.30	0.20	0.20	0.37	0.18	0.27	0.18
O2'	0.29	0.23	0.31	0.31	0.25	0.30	0.28	0.45	0.28	0.31	0.24	0.23	0.30	0.33	0.26	0.36	0.31	0.27	0.33	0.23	0.12	0.17
O3'	0.21	0.15	0.16	0.16	0.15	0.17	0.21	0.19	0.23	0.19	0.19	0.15	0.29	0.26	0.15	0.25	0.15	0.25	0.01	0.03	0.04	0.01
O4	0.27	0.27	0.25	0.26	0.20	0.25	0.19	0.26	0.22	0.31	0.29	0.22	0.25	0.28	0.25	0.25	0.27	0.25	0.29	0.34	0.51	0.32
O4'	0.20	0.18	0.17	0.13	0.14	0.12	0.21	0.21	0.26	0.15	0.23	0.14	0.33	0.23	0.13	0.27	0.13	0.16	0.19	0.07	0.15	0.02
O5'	0.27	0.25	0.26	0.28	0.21	0.29	0.27	0.27	0.34	0.21	0.32	0.20	0.43	0.28	0.20	0.30	0.29	0.31	0.25	0.41	0.34	0.29
OP1	0.25	0.29	0.26	0.32	0.25	0.26	0.31	0.28	0.36	0.24	0.34	0.25	0.43	0.30	0.23	0.26	0.36	0.27	0.31	0.31	0.34	0.28
OP2	0.35	0.24	0.34	0.37	0.22	0.38	0.23	0.37	0.28	0.27	0.27	0.22	0.35	0.23	0.27	0.37	0.40	0.40	0.36	0.41	0.42	0.35
P	0.30	0.22	0.26	0.27	0.19	0.28	0.23	0.25	0.29	0.21	0.27	0.19	0.37	0.23	0.22	0.31	0.29	0.33	0.26	0.33	0.31	0.25

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.05	0.05	0.04	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.16	0.10	0.32	0.12
C2	0.05	0.00	0.14	0.21	0.02	0.10	0.02	0.15	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.03	0.13	0.24	0.04	0.28	0.20	0.28	0.18
C2'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.07	0.01	0.04	0.02	0.06	0.08	0.11	0.15	0.05	0.06	0.02	0.01	0.03	0.01	0.18	0.22	0.18	0.08
C3'	0.02	0.21	0.00	0.00	0.12	0.01	0.11	0.02	0.14	0.12	0.18	0.20	0.13	0.11	0.06	0.02	0.01	0.02	0.23	0.31	0.11	0.15
C4	0.02	0.02	0.07	0.12	0.00	0.06	0.01	0.11	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.12	0.03	0.31	0.20	0.28	0.18
C4'	0.01	0.10	0.01	0.01	0.06	0.00	0.07	0.01	0.08	0.10	0.09	0.09	0.09	0.09	0.04	0.05	0.03	0.01	0.02	0.14	0.29	0.08
C5	0.02	0.02	0.04	0.11	0.01	0.07	0.00	0.14	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.06	0.11	0.04	0.40	0.26	0.30	0.25
C5'	0.02	0.15	0.02	0.02	0.11	0.01	0.14	0.00	0.16	0.14	0.16	0.12	0.18	0.16	0.08	0.05	0.03	0.01	0.01	0.20	0.28	0.03
C6	0.04	0.02	0.06	0.14	0.02	0.08	0.01	0.16	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.03	0.08	0.15	0.04	0.40	0.28	0.31	0.27
C8	0.02	0.02	0.08	0.12	0.01	0.10	0.01	0.14	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.00	0.01	0.05	0.13	0.04	0.44	0.25	0.29	0.24
N1	0.05	0.01	0.11	0.18	0.03	0.09	0.02	0.16	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.04	0.11	0.21	0.05	0.34	0.25	0.29	0.23
N3	0.05	0.01	0.15	0.20	0.01	0.09	0.01	0.12	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.13	0.22	0.04	0.24	0.17	0.29	0.16
N6	0.04	0.03	0.05	0.13	0.02	0.09	0.02	0.18	0.00	0.03	0.02	0.02	0.00	0.03	0.03	0.07	0.15	0.05	0.45	0.33	0.35	0.33
N7	0.02	0.02	0.06	0.11	0.01	0.09	0.01	0.16	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.05	0.13	0.04	0.47	0.30	0.31	0.30
N9	0.01	0.03	0.02	0.06	0.01	0.04	0.02	0.08	0.03	0.01	0.04	0.02	0.03	0.01	0.00	0.03	0.06	0.02	0.30	0.18	0.29	0.16
O2'	0.02	0.13	0.01	0.02	0.06	0.05	0.06	0.05	0.08	0.05	0.11	0.13	0.07	0.05	0.03	0.00	0.06	0.05	0.06	0.16	0.23	0.08
O3'	0.03	0.24	0.03	0.01	0.12	0.03	0.11	0.03	0.15	0.13	0.21	0.22	0.15	0.13	0.06	0.06	0.00	0.02	0.17	0.37	0.11	0.16
O4'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.03	0.01	0.04	0.01	0.04	0.04	0.05	0.04	0.05	0.04	0.02	0.05	0.02	0.00	0.11	0.09	0.41	0.19
O5'	0.16	0.28	0.18	0.23	0.31	0.02	0.40	0.01	0.40	0.44	0.34	0.24	0.45	0.47	0.30	0.06	0.17	0.11	0.00	0.02	0.02	0.02
OP1	0.10	0.20	0.22	0.31	0.20	0.14	0.26	0.20	0.28	0.25	0.25	0.17	0.33	0.30	0.18	0.16	0.37	0.09	0.02	0.00	0.03	0.01
OP2	0.32	0.28	0.18	0.11	0.28	0.29	0.30	0.28	0.31	0.29	0.29	0.29	0.35	0.31	0.29	0.23	0.11	0.41	0.02	0.03	0.00	0.01
P	0.12	0.18	0.08	0.15	0.18	0.08	0.25	0.03	0.27	0.24	0.23	0.16	0.33	0.30	0.16	0.08	0.16	0.19	0.02	0.01	0.01	0.00