Doublet Group distance statistics: 48991

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 5, 4, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.002, 0.009, 0.015, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.009 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.003, 0.011, 0.020, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.011 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.012, 0.024, 0.036, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.024 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.015, 0.027, 0.038, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.027 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.014, 0.026, 0.038, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.026 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.008, 0.020, 0.032, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.020 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.010, 0.023, 0.035, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.023 std_dev=0.012
O2	A	0, 0.031, 0.056, 0.081, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.056 std_dev=0.025
O4	A	0, 0.071, 0.147, 0.222, 0.309 max_d=0.309 avg_d=0.147 std_dev=0.076
O4'	A	0, 0.103, 0.201, 0.300, 0.306 max_d=0.306 avg_d=0.201 std_dev=0.098
C2'	A	0, 0.090, 0.207, 0.324, 0.356 max_d=0.356 avg_d=0.207 std_dev=0.117
C4	B	0, 0.270, 0.406, 0.541, 0.511 max_d=0.511 avg_d=0.406 std_dev=0.135
C4'	A	0, 0.161, 0.316, 0.471, 0.500 max_d=0.500 avg_d=0.316 std_dev=0.155
N9	B	0, 0.275, 0.438, 0.601, 0.640 max_d=0.640 avg_d=0.438 std_dev=0.163
O2'	A	0, 0.084, 0.256, 0.429, 0.468 max_d=0.468 avg_d=0.256 std_dev=0.172
C3'	A	0, 0.160, 0.334, 0.507, 0.520 max_d=0.520 avg_d=0.334 std_dev=0.173
C5	B	0, 0.197, 0.377, 0.557, 0.688 max_d=0.688 avg_d=0.377 std_dev=0.180
N7	B	0, 0.253, 0.433, 0.612, 0.713 max_d=0.713 avg_d=0.433 std_dev=0.180
C8	B	0, 0.286, 0.466, 0.646, 0.620 max_d=0.620 avg_d=0.466 std_dev=0.180
N3	B	0, 0.334, 0.527, 0.720, 0.799 max_d=0.799 avg_d=0.527 std_dev=0.193
O3'	A	0, 0.229, 0.471, 0.714, 0.777 max_d=0.777 avg_d=0.471 std_dev=0.243
O5'	A	0, 0.168, 0.426, 0.684, 0.867 max_d=0.867 avg_d=0.426 std_dev=0.258
C1'	B	0, 0.288, 0.565, 0.843, 1.044 max_d=1.044 avg_d=0.565 std_dev=0.277
O5'	B	0, 0.307, 0.594, 0.880, 0.999 max_d=0.999 avg_d=0.594 std_dev=0.286
C5'	A	0, 0.236, 0.523, 0.809, 0.916 max_d=0.916 avg_d=0.523 std_dev=0.287
C2	B	0, 0.290, 0.583, 0.877, 1.373 max_d=1.373 avg_d=0.583 std_dev=0.293
C5'	B	0, 0.357, 0.652, 0.948, 1.141 max_d=1.141 avg_d=0.652 std_dev=0.296
O4'	B	0, 0.248, 0.546, 0.844, 0.978 max_d=0.978 avg_d=0.546 std_dev=0.298
P	B	0, 0.216, 0.528, 0.840, 0.919 max_d=0.919 avg_d=0.528 std_dev=0.312
C6	B	0, 0.118, 0.437, 0.756, 1.335 max_d=1.335 avg_d=0.437 std_dev=0.319
OP1	B	0, 0.262, 0.626, 0.991, 1.087 max_d=1.087 avg_d=0.626 std_dev=0.365
N6	B	0, 0.169, 0.550, 0.930, 1.667 max_d=1.667 avg_d=0.550 std_dev=0.381
OP2	B	0, 0.228, 0.609, 0.990, 0.985 max_d=0.985 avg_d=0.609 std_dev=0.381
N1	B	0, 0.154, 0.537, 0.920, 1.679 max_d=1.679 avg_d=0.537 std_dev=0.383
C4'	B	0, 0.288, 0.676, 1.064, 1.430 max_d=1.430 avg_d=0.676 std_dev=0.388
C2'	B	0, 0.262, 0.706, 1.150, 1.706 max_d=1.706 avg_d=0.706 std_dev=0.444
P	A	0, 0.266, 0.779, 1.291, 1.655 max_d=1.655 avg_d=0.779 std_dev=0.513
C3'	B	0, 0.227, 0.758, 1.288, 1.974 max_d=1.974 avg_d=0.758 std_dev=0.530
O2'	B	0, 0.255, 0.861, 1.468, 2.274 max_d=2.274 avg_d=0.861 std_dev=0.606
O3'	B	0, 0.262, 1.081, 1.901, 3.038 max_d=3.038 avg_d=1.081 std_dev=0.820
OP2	A	0, 0.343, 1.397, 2.451, 3.078 max_d=3.078 avg_d=1.397 std_dev=1.054
OP1	A	0, 0.173, 1.748, 3.324, 4.411 max_d=4.411 avg_d=1.748 std_dev=1.575

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.57	0.21	0.18
C2	0.03	0.00	0.07	0.10	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.12	0.02	0.03	0.15	0.80	0.56	0.22
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.02	0.06	0.02	0.06	0.01	0.06	0.14	0.01	0.02	0.05	0.01	0.15	0.37	0.26	0.15
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.09	0.00	0.10	0.02	0.10	0.05	0.10	0.15	0.02	0.01	0.11	0.02	0.22	0.42	0.28	0.22
C4	0.02	0.01	0.04	0.09	0.00	0.08	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.10	0.01	0.02	0.23	1.00	0.84	0.33
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.08	0.00	0.10	0.01	0.09	0.04	0.05	0.07	0.06	0.02	0.09	0.00	0.01	0.21	0.17	0.08
C5	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.10	0.00	0.19	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.11	0.01	0.04	0.23	1.02	0.80	0.34
C5'	0.01	0.07	0.02	0.02	0.16	0.01	0.19	0.00	0.15	0.08	0.11	0.06	0.06	0.04	0.18	0.01	0.01	0.27	0.37	0.02
C6	0.01	0.01	0.06	0.10	0.01	0.09	0.00	0.15	0.00	0.00	0.01	0.02	0.04	0.11	0.01	0.04	0.19	0.91	0.59	0.28
N1	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.05	0.02	0.01	0.13	0.78	0.46	0.22
N3	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.12	0.02	0.02	0.20	0.92	0.73	0.28
O2	0.05	0.01	0.14	0.15	0.02	0.07	0.02	0.06	0.02	0.02	0.01	0.00	0.13	0.19	0.03	0.05	0.14	0.72	0.48	0.19
O2'	0.01	0.08	0.01	0.02	0.06	0.06	0.04	0.06	0.04	0.03	0.08	0.13	0.00	0.04	0.07	0.05	0.06	0.27	0.15	0.10
O3'	0.01	0.12	0.02	0.01	0.10	0.02	0.11	0.04	0.11	0.05	0.12	0.19	0.04	0.00	0.12	0.02	0.21	0.65	0.36	0.28
O4	0.02	0.02	0.05	0.11	0.01	0.09	0.01	0.18	0.01	0.02	0.02	0.03	0.07	0.12	0.00	0.03	0.25	1.04	0.94	0.36
O4'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.02	0.05	0.05	0.02	0.03	0.00	0.11	0.56	0.17	0.24
O5'	0.05	0.15	0.15	0.22	0.23	0.01	0.23	0.01	0.19	0.13	0.20	0.14	0.06	0.21	0.25	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.57	0.80	0.37	0.42	1.00	0.21	1.02	0.27	0.91	0.78	0.92	0.72	0.27	0.65	1.04	0.56	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.21	0.56	0.26	0.28	0.84	0.17	0.80	0.37	0.59	0.46	0.73	0.48	0.15	0.36	0.94	0.17	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.18	0.22	0.15	0.22	0.33	0.08	0.34	0.02	0.28	0.22	0.28	0.19	0.10	0.28	0.36	0.24	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.34	0.30	0.30	0.23	0.17	0.31	0.19	0.27	0.28	0.24	0.31	0.27	0.37	0.25	0.20	0.39	0.26	0.35	0.23	0.04	0.13	0.04
C2	0.38	0.34	0.39	0.29	0.15	0.33	0.17	0.25	0.28	0.29	0.33	0.30	0.37	0.27	0.22	0.51	0.35	0.33	0.22	0.09	0.24	0.11
C2'	0.27	0.23	0.24	0.22	0.16	0.29	0.21	0.27	0.27	0.19	0.27	0.21	0.34	0.25	0.15	0.30	0.25	0.31	0.27	0.09	0.07	0.09
C3'	0.26	0.10	0.19	0.11	0.06	0.20	0.12	0.13	0.18	0.18	0.15	0.09	0.27	0.18	0.15	0.20	0.10	0.31	0.10	0.04	0.09	0.01
C4	0.32	0.42	0.32	0.19	0.18	0.23	0.15	0.19	0.33	0.28	0.43	0.34	0.42	0.24	0.22	0.44	0.23	0.25	0.23	0.14	0.30	0.16
C4'	0.29	0.13	0.21	0.12	0.10	0.20	0.11	0.13	0.17	0.25	0.16	0.13	0.27	0.21	0.19	0.23	0.11	0.32	0.06	0.17	0.21	0.11
C5	0.33	0.39	0.29	0.17	0.23	0.23	0.18	0.21	0.34	0.29	0.41	0.33	0.45	0.23	0.25	0.39	0.18	0.30	0.25	0.17	0.28	0.17
C5'	0.33	0.14	0.27	0.20	0.17	0.22	0.15	0.15	0.16	0.31	0.15	0.17	0.24	0.24	0.26	0.25	0.19	0.35	0.11	0.31	0.33	0.21
C6	0.37	0.35	0.31	0.20	0.23	0.28	0.20	0.24	0.32	0.29	0.37	0.32	0.42	0.24	0.27	0.39	0.20	0.35	0.26	0.15	0.24	0.15
N1	0.37	0.33	0.33	0.23	0.19	0.31	0.18	0.25	0.30	0.28	0.34	0.30	0.39	0.26	0.24	0.43	0.26	0.36	0.22	0.07	0.20	0.08
N3	0.36	0.39	0.38	0.26	0.15	0.28	0.16	0.22	0.30	0.29	0.37	0.33	0.37	0.26	0.22	0.52	0.33	0.28	0.22	0.12	0.28	0.14
O2	0.38	0.30	0.43	0.36	0.12	0.38	0.17	0.29	0.26	0.30	0.29	0.27	0.34	0.28	0.20	0.57	0.46	0.33	0.23	0.15	0.24	0.15
O2'	0.27	0.29	0.29	0.30	0.22	0.34	0.24	0.35	0.30	0.21	0.30	0.27	0.35	0.26	0.20	0.37	0.36	0.29	0.29	0.15	0.04	0.12
O3'	0.22	0.09	0.16	0.12	0.08	0.18	0.12	0.13	0.17	0.11	0.13	0.09	0.24	0.15	0.12	0.15	0.13	0.28	0.02	0.02	0.01	0.01
O4	0.26	0.45	0.29	0.16	0.14	0.19	0.15	0.18	0.34	0.26	0.47	0.32	0.43	0.24	0.18	0.42	0.21	0.20	0.24	0.17	0.33	0.18
O4'	0.32	0.25	0.25	0.15	0.15	0.24	0.19	0.18	0.27	0.29	0.28	0.22	0.38	0.29	0.22	0.31	0.15	0.33	0.13	0.12	0.21	0.07
O5'	0.37	0.31	0.31	0.29	0.31	0.27	0.32	0.24	0.34	0.38	0.34	0.31	0.39	0.36	0.35	0.33	0.31	0.36	0.34	0.15	0.24	0.20
OP1	0.53	0.66	0.51	0.65	0.57	0.49	0.52	0.61	0.54	0.49	0.61	0.64	0.47	0.49	0.53	0.52	0.80	0.47	0.77	0.89	0.98	0.83
OP2	0.67	1.07	0.76	0.76	0.95	0.53	1.08	0.49	1.21	0.84	1.18	0.96	1.33	1.04	0.80	0.72	0.81	0.49	0.56	0.61	0.54	0.48
P	0.33	0.33	0.30	0.38	0.33	0.26	0.35	0.30	0.35	0.37	0.34	0.33	0.39	0.39	0.34	0.30	0.46	0.31	0.39	0.36	0.41	0.34

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.07	0.28	0.11
C2	0.02	0.00	0.22	0.19	0.01	0.04	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.28	0.27	0.09	0.22	0.19	0.33	0.18
C2'	0.01	0.22	0.00	0.00	0.12	0.02	0.08	0.02	0.12	0.10	0.18	0.22	0.10	0.07	0.03	0.01	0.01	0.01	0.06	0.16	0.24	0.11
C3'	0.02	0.19	0.00	0.00	0.09	0.01	0.12	0.02	0.12	0.24	0.15	0.18	0.13	0.20	0.09	0.02	0.01	0.01	0.09	0.23	0.21	0.14
C4	0.02	0.01	0.12	0.09	0.00	0.04	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.15	0.11	0.06	0.21	0.16	0.30	0.14
C4'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.04	0.00	0.09	0.01	0.08	0.14	0.06	0.04	0.11	0.14	0.06	0.06	0.04	0.01	0.02	0.14	0.15	0.04
C5	0.02	0.01	0.08	0.12	0.00	0.09	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.11	0.12	0.05	0.27	0.20	0.30	0.18
C5'	0.03	0.11	0.02	0.02	0.11	0.01	0.17	0.00	0.18	0.20	0.15	0.09	0.21	0.22	0.11	0.06	0.05	0.02	0.01	0.15	0.06	0.01
C6	0.03	0.01	0.12	0.12	0.01	0.08	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.16	0.14	0.07	0.28	0.22	0.32	0.21
C8	0.02	0.01	0.10	0.24	0.01	0.14	0.01	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.06	0.25	0.04	0.30	0.19	0.28	0.15
N1	0.03	0.00	0.18	0.15	0.01	0.06	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.24	0.21	0.09	0.25	0.22	0.33	0.20
N3	0.02	0.00	0.22	0.18	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.26	0.24	0.08	0.19	0.16	0.31	0.15
N6	0.03	0.01	0.10	0.13	0.01	0.11	0.01	0.21	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.14	0.15	0.07	0.31	0.26	0.33	0.25
N7	0.02	0.02	0.07	0.20	0.01	0.14	0.00	0.22	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.23	0.03	0.32	0.22	0.29	0.20
N9	0.01	0.01	0.03	0.09	0.00	0.06	0.01	0.11	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.08	0.02	0.19	0.12	0.28	0.11
O2'	0.01	0.28	0.01	0.02	0.15	0.06	0.11	0.06	0.16	0.06	0.24	0.26	0.14	0.03	0.04	0.00	0.05	0.07	0.08	0.22	0.22	0.09
O3'	0.01	0.27	0.01	0.01	0.11	0.04	0.12	0.05	0.14	0.25	0.21	0.24	0.15	0.23	0.08	0.05	0.00	0.02	0.15	0.38	0.29	0.23
O4'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.06	0.01	0.05	0.02	0.07	0.04	0.09	0.08	0.07	0.03	0.02	0.07	0.02	0.00	0.08	0.07	0.29	0.15
O5'	0.09	0.22	0.06	0.09	0.21	0.02	0.27	0.01	0.28	0.30	0.25	0.19	0.31	0.32	0.19	0.08	0.15	0.08	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.07	0.19	0.16	0.23	0.16	0.14	0.20	0.15	0.22	0.19	0.22	0.16	0.26	0.22	0.12	0.22	0.38	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.28	0.33	0.24	0.21	0.30	0.15	0.30	0.06	0.32	0.28	0.33	0.31	0.33	0.29	0.28	0.22	0.29	0.29	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.18	0.11	0.14	0.14	0.04	0.18	0.01	0.21	0.15	0.20	0.15	0.25	0.20	0.11	0.09	0.23	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00