Doublet Group distance statistics: 48995

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 2, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.001, 0.010, 0.020, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.010 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.007, 0.017, 0.026, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.017 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.006, 0.017, 0.028, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.017 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.006, 0.019, 0.032, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.019 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.004, 0.017, 0.031, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.017 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.009, 0.024, 0.040, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.024 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.013, 0.031, 0.049, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.031 std_dev=0.018
O2	A	0, 0.024, 0.065, 0.105, 0.132 max_d=0.132 avg_d=0.065 std_dev=0.041
O4	A	0, -0.004, 0.067, 0.137, 0.234 max_d=0.234 avg_d=0.067 std_dev=0.070
C4	B	0, 0.153, 0.342, 0.531, 0.624 max_d=0.624 avg_d=0.342 std_dev=0.189
N3	B	0, 0.112, 0.368, 0.624, 0.861 max_d=0.861 avg_d=0.368 std_dev=0.256
O4'	A	0, 0.144, 0.411, 0.678, 0.827 max_d=0.827 avg_d=0.411 std_dev=0.267
C2'	A	0, 0.209, 0.494, 0.780, 0.904 max_d=0.904 avg_d=0.494 std_dev=0.286
O2'	A	0, 0.277, 0.630, 0.983, 1.028 max_d=1.028 avg_d=0.630 std_dev=0.353
C2	B	0, 0.252, 0.607, 0.963, 1.230 max_d=1.230 avg_d=0.607 std_dev=0.356
C5	B	0, 0.176, 0.538, 0.899, 1.124 max_d=1.124 avg_d=0.538 std_dev=0.361
C4'	A	0, 0.248, 0.641, 1.035, 1.241 max_d=1.241 avg_d=0.641 std_dev=0.394
C6	B	0, 0.261, 0.677, 1.093, 1.247 max_d=1.247 avg_d=0.677 std_dev=0.416
N1	B	0, 0.306, 0.732, 1.158, 1.346 max_d=1.346 avg_d=0.732 std_dev=0.426
C3'	A	0, 0.306, 0.750, 1.195, 1.390 max_d=1.390 avg_d=0.750 std_dev=0.444
N9	B	0, 0.255, 0.715, 1.176, 1.238 max_d=1.238 avg_d=0.715 std_dev=0.460
N7	B	0, 0.315, 0.931, 1.547, 1.708 max_d=1.708 avg_d=0.931 std_dev=0.616
C1'	B	0, 0.358, 0.981, 1.605, 1.847 max_d=1.847 avg_d=0.981 std_dev=0.623
O3'	A	0, 0.452, 1.100, 1.749, 1.996 max_d=1.996 avg_d=1.100 std_dev=0.649
C2'	B	0, 0.374, 1.027, 1.680, 1.983 max_d=1.983 avg_d=1.027 std_dev=0.653
C8	B	0, 0.333, 0.992, 1.651, 1.673 max_d=1.673 avg_d=0.992 std_dev=0.659
N6	B	0, 0.371, 1.036, 1.701, 1.885 max_d=1.885 avg_d=1.036 std_dev=0.665
O5'	A	0, 0.309, 0.986, 1.663, 2.107 max_d=2.107 avg_d=0.986 std_dev=0.677
OP2	B	0, 0.427, 1.113, 1.799, 2.133 max_d=2.133 avg_d=1.113 std_dev=0.686
C5'	A	0, 0.435, 1.127, 1.820, 2.166 max_d=2.166 avg_d=1.127 std_dev=0.692
O5'	B	0, 0.509, 1.273, 2.037, 2.332 max_d=2.332 avg_d=1.273 std_dev=0.764
P	B	0, 0.500, 1.279, 2.059, 2.349 max_d=2.349 avg_d=1.279 std_dev=0.780
C3'	B	0, 0.504, 1.338, 2.173, 2.553 max_d=2.553 avg_d=1.338 std_dev=0.834
O2'	B	0, 0.498, 1.354, 2.209, 2.569 max_d=2.569 avg_d=1.354 std_dev=0.856
O4'	B	0, 0.455, 1.320, 2.185, 2.478 max_d=2.478 avg_d=1.320 std_dev=0.865
C4'	B	0, 0.593, 1.616, 2.639, 2.999 max_d=2.999 avg_d=1.616 std_dev=1.023
O3'	B	0, 0.528, 1.563, 2.599, 3.052 max_d=3.052 avg_d=1.563 std_dev=1.035
P	A	0, 0.362, 1.399, 2.437, 2.925 max_d=2.925 avg_d=1.399 std_dev=1.038
OP2	A	0, 0.446, 1.542, 2.639, 3.086 max_d=3.086 avg_d=1.542 std_dev=1.096
OP1	B	0, 0.615, 1.818, 3.021, 3.498 max_d=3.498 avg_d=1.818 std_dev=1.203
C5'	B	0, 0.744, 1.966, 3.188, 3.462 max_d=3.462 avg_d=1.966 std_dev=1.222
OP1	A	0, 0.446, 1.702, 2.958, 3.572 max_d=3.572 avg_d=1.702 std_dev=1.256

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.08	0.09	0.18	0.07
C2	0.03	0.00	0.08	0.06	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.09	0.08	0.02	0.06	0.11	0.10	0.22	0.11
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.04	0.01	0.08	0.02	0.09	0.03	0.06	0.13	0.01	0.01	0.04	0.01	0.15	0.13	0.08	0.10
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.07	0.00	0.10	0.03	0.11	0.04	0.07	0.09	0.02	0.01	0.07	0.01	0.23	0.17	0.05	0.15
C4	0.03	0.01	0.04	0.07	0.00	0.07	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.07	0.00	0.04	0.18	0.20	0.29	0.20
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.07	0.00	0.09	0.00	0.08	0.03	0.05	0.05	0.05	0.03	0.08	0.00	0.02	0.07	0.16	0.02
C5	0.02	0.01	0.08	0.10	0.01	0.09	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.12	0.01	0.06	0.21	0.21	0.27	0.22
C5'	0.01	0.05	0.02	0.03	0.12	0.00	0.15	0.00	0.12	0.05	0.08	0.05	0.05	0.07	0.14	0.01	0.01	0.07	0.21	0.02
C6	0.02	0.01	0.09	0.11	0.01	0.08	0.01	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.13	0.02	0.07	0.19	0.16	0.21	0.17
N1	0.02	0.01	0.03	0.04	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.02	0.03	0.12	0.11	0.19	0.11
N3	0.03	0.00	0.06	0.07	0.00	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.07	0.01	0.05	0.14	0.15	0.26	0.16
O2	0.05	0.00	0.13	0.09	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.16	0.14	0.02	0.10	0.08	0.07	0.20	0.08
O2'	0.01	0.09	0.01	0.02	0.06	0.05	0.07	0.05	0.07	0.03	0.09	0.16	0.00	0.03	0.07	0.04	0.09	0.09	0.09	0.07
O3'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.07	0.03	0.12	0.07	0.13	0.03	0.07	0.14	0.03	0.00	0.07	0.02	0.25	0.19	0.06	0.17
O4	0.03	0.02	0.04	0.07	0.00	0.08	0.01	0.14	0.02	0.02	0.01	0.02	0.07	0.07	0.00	0.06	0.18	0.23	0.33	0.23
O4'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.07	0.03	0.05	0.10	0.04	0.02	0.06	0.00	0.14	0.11	0.23	0.11
O5'	0.08	0.11	0.15	0.23	0.18	0.02	0.21	0.01	0.19	0.12	0.14	0.08	0.09	0.25	0.18	0.14	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.09	0.10	0.13	0.17	0.20	0.07	0.21	0.07	0.16	0.11	0.15	0.07	0.09	0.19	0.23	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.18	0.22	0.08	0.05	0.29	0.16	0.27	0.21	0.21	0.19	0.26	0.20	0.09	0.06	0.33	0.23	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.07	0.11	0.10	0.15	0.20	0.02	0.22	0.02	0.17	0.11	0.16	0.08	0.07	0.17	0.23	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.16	0.09	0.14	0.18	0.12	0.40	0.30	0.39	0.54	0.24	0.14	0.54	0.63	0.22	0.28	0.11	0.10	0.26	0.03	0.16	0.05
C2	0.18	0.17	0.17	0.19	0.14	0.23	0.35	0.31	0.34	0.49	0.23	0.13	0.47	0.55	0.23	0.26	0.18	0.22	0.34	0.10	0.18	0.07
C2'	0.15	0.17	0.10	0.18	0.25	0.11	0.43	0.33	0.42	0.57	0.28	0.14	0.54	0.63	0.28	0.23	0.13	0.13	0.31	0.12	0.18	0.13
C3'	0.28	0.25	0.26	0.30	0.34	0.19	0.51	0.24	0.50	0.61	0.36	0.24	0.62	0.69	0.38	0.25	0.26	0.27	0.13	0.03	0.09	0.03
C4	0.25	0.18	0.20	0.18	0.11	0.25	0.24	0.27	0.32	0.26	0.25	0.15	0.49	0.35	0.17	0.27	0.18	0.28	0.27	0.12	0.29	0.09
C4'	0.23	0.18	0.21	0.29	0.30	0.17	0.51	0.30	0.50	0.62	0.33	0.16	0.66	0.72	0.34	0.24	0.25	0.22	0.09	0.18	0.21	0.13
C5	0.27	0.15	0.21	0.21	0.08	0.31	0.27	0.33	0.37	0.25	0.27	0.11	0.58	0.39	0.15	0.29	0.22	0.35	0.20	0.23	0.36	0.18
C5'	0.30	0.26	0.32	0.40	0.38	0.26	0.58	0.31	0.58	0.66	0.41	0.24	0.75	0.78	0.41	0.28	0.38	0.30	0.20	0.37	0.43	0.29
C6	0.24	0.13	0.19	0.18	0.09	0.27	0.33	0.26	0.39	0.34	0.26	0.10	0.59	0.51	0.13	0.31	0.20	0.31	0.20	0.21	0.34	0.17
N1	0.16	0.15	0.14	0.14	0.14	0.17	0.38	0.23	0.38	0.48	0.24	0.12	0.54	0.59	0.18	0.27	0.13	0.18	0.26	0.05	0.23	0.06
N3	0.23	0.17	0.21	0.19	0.12	0.23	0.29	0.26	0.31	0.38	0.22	0.14	0.44	0.44	0.21	0.28	0.19	0.25	0.33	0.08	0.23	0.07
O2	0.22	0.21	0.21	0.27	0.17	0.34	0.36	0.45	0.32	0.55	0.22	0.14	0.42	0.56	0.30	0.26	0.26	0.32	0.40	0.21	0.12	0.15
O2'	0.14	0.21	0.10	0.25	0.27	0.24	0.44	0.54	0.41	0.57	0.29	0.18	0.52	0.61	0.32	0.24	0.20	0.20	0.40	0.21	0.17	0.19
O3'	0.32	0.32	0.32	0.37	0.38	0.27	0.50	0.33	0.50	0.56	0.40	0.30	0.60	0.63	0.40	0.27	0.33	0.34	0.03	0.01	0.02	0.01
O4	0.28	0.27	0.23	0.19	0.19	0.28	0.19	0.31	0.29	0.21	0.30	0.25	0.42	0.22	0.21	0.30	0.18	0.31	0.27	0.13	0.30	0.10
O4'	0.15	0.13	0.12	0.19	0.21	0.10	0.45	0.27	0.44	0.59	0.26	0.11	0.62	0.70	0.27	0.26	0.15	0.13	0.16	0.12	0.19	0.07
O5'	0.38	0.51	0.37	0.34	0.52	0.31	0.71	0.24	0.77	0.66	0.65	0.44	0.94	0.85	0.48	0.36	0.29	0.37	0.30	0.43	0.40	0.33
OP1	0.41	0.61	0.46	0.47	0.60	0.33	0.78	0.29	0.86	0.70	0.75	0.54	1.02	0.87	0.54	0.35	0.44	0.37	0.37	0.43	0.51	0.34
OP2	0.43	0.64	0.45	0.42	0.61	0.32	0.78	0.23	0.87	0.64	0.78	0.56	1.05	0.84	0.53	0.39	0.39	0.39	0.32	0.34	0.35	0.23
P	0.39	0.56	0.39	0.38	0.55	0.30	0.74	0.23	0.81	0.65	0.70	0.48	1.00	0.84	0.49	0.34	0.34	0.36	0.30	0.41	0.41	0.29

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.05	0.06	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.24	0.20	0.27	0.11
C2	0.06	0.00	0.18	0.16	0.01	0.08	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.22	0.22	0.04	0.51	0.37	0.17	0.31
C2'	0.00	0.18	0.00	0.00	0.11	0.02	0.09	0.01	0.12	0.06	0.16	0.17	0.11	0.06	0.04	0.01	0.01	0.01	0.30	0.35	0.09	0.18
C3'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.09	0.01	0.08	0.02	0.10	0.11	0.14	0.15	0.09	0.09	0.05	0.01	0.01	0.02	0.36	0.45	0.04	0.27
C4	0.03	0.01	0.11	0.09	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.11	0.12	0.01	0.52	0.35	0.15	0.31
C4'	0.01	0.08	0.02	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.08	0.05	0.08	0.03	0.07	0.02	0.05	0.02	0.00	0.02	0.18	0.36	0.06
C5	0.02	0.01	0.09	0.08	0.00	0.02	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.10	0.12	0.02	0.63	0.42	0.24	0.43
C5'	0.03	0.04	0.01	0.02	0.06	0.01	0.11	0.00	0.10	0.16	0.06	0.04	0.13	0.16	0.08	0.06	0.05	0.02	0.01	0.21	0.40	0.02
C6	0.03	0.00	0.12	0.10	0.01	0.03	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.14	0.16	0.02	0.65	0.45	0.30	0.46
C8	0.01	0.01	0.06	0.11	0.00	0.08	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.13	0.04	0.61	0.37	0.15	0.39
N1	0.05	0.00	0.16	0.14	0.01	0.05	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.19	0.20	0.02	0.60	0.42	0.25	0.40
N3	0.06	0.00	0.17	0.15	0.00	0.08	0.01	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.20	0.19	0.04	0.44	0.33	0.14	0.25
N6	0.02	0.01	0.11	0.09	0.01	0.03	0.00	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.13	0.16	0.03	0.71	0.49	0.40	0.54
N7	0.01	0.01	0.06	0.09	0.01	0.07	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.05	0.13	0.04	0.68	0.43	0.28	0.49
N9	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.02	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.06	0.01	0.47	0.31	0.14	0.26
O2'	0.01	0.22	0.01	0.01	0.11	0.05	0.10	0.06	0.14	0.04	0.19	0.20	0.13	0.05	0.03	0.00	0.03	0.04	0.07	0.21	0.23	0.05
O3'	0.01	0.22	0.01	0.01	0.12	0.02	0.12	0.05	0.16	0.13	0.20	0.19	0.16	0.13	0.06	0.03	0.00	0.02	0.27	0.50	0.11	0.27
O4'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.04	0.02	0.04	0.03	0.04	0.01	0.04	0.02	0.00	0.07	0.10	0.46	0.15
O5'	0.24	0.51	0.30	0.36	0.52	0.02	0.63	0.01	0.65	0.61	0.60	0.44	0.71	0.68	0.47	0.07	0.27	0.07	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.20	0.37	0.35	0.45	0.35	0.18	0.42	0.21	0.45	0.37	0.42	0.33	0.49	0.43	0.31	0.21	0.50	0.10	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.27	0.17	0.09	0.04	0.15	0.36	0.24	0.40	0.30	0.15	0.25	0.14	0.40	0.28	0.14	0.23	0.11	0.46	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.31	0.18	0.27	0.31	0.06	0.43	0.02	0.46	0.39	0.40	0.25	0.54	0.49	0.26	0.05	0.27	0.15	0.00	0.01	0.00	0.00