Doublet Group distance statistics: 48996

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.005, 0.012, 0.020, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.007, 0.018, 0.028, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.018 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.003, 0.023, 0.044, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.023 std_dev=0.020
C2	A	0, 0.004, 0.025, 0.047, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.025 std_dev=0.021
C6	A	0, -0.001, 0.021, 0.044, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.021 std_dev=0.022
C1'	A	0, 0.003, 0.029, 0.055, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.029 std_dev=0.026
N1	A	0, 0.011, 0.040, 0.070, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.040 std_dev=0.030
O2	A	0, 0.017, 0.066, 0.116, 0.161 max_d=0.161 avg_d=0.066 std_dev=0.050
O4'	A	0, 0.030, 0.119, 0.209, 0.246 max_d=0.246 avg_d=0.119 std_dev=0.090
O4	A	0, -0.033, 0.091, 0.216, 0.362 max_d=0.362 avg_d=0.091 std_dev=0.124
C3'	A	0, 0.065, 0.227, 0.388, 0.411 max_d=0.411 avg_d=0.227 std_dev=0.161
C4'	A	0, 0.061, 0.237, 0.414, 0.463 max_d=0.463 avg_d=0.237 std_dev=0.177
C2'	A	0, 0.024, 0.204, 0.383, 0.489 max_d=0.489 avg_d=0.204 std_dev=0.180
O3'	A	0, 0.046, 0.271, 0.496, 0.666 max_d=0.666 avg_d=0.271 std_dev=0.225
C2	B	0, 0.103, 0.350, 0.598, 0.665 max_d=0.665 avg_d=0.350 std_dev=0.247
N1	B	0, 0.100, 0.360, 0.620, 0.692 max_d=0.692 avg_d=0.360 std_dev=0.260
O5'	A	0, 0.105, 0.366, 0.628, 0.681 max_d=0.681 avg_d=0.366 std_dev=0.261
N3	B	0, 0.133, 0.404, 0.674, 0.654 max_d=0.654 avg_d=0.404 std_dev=0.270
C6	B	0, 0.113, 0.388, 0.663, 0.691 max_d=0.691 avg_d=0.388 std_dev=0.275
N6	B	0, 0.130, 0.417, 0.705, 0.682 max_d=0.682 avg_d=0.417 std_dev=0.287
C5	B	0, 0.135, 0.444, 0.753, 0.813 max_d=0.813 avg_d=0.444 std_dev=0.309
C4	B	0, 0.152, 0.465, 0.777, 0.758 max_d=0.758 avg_d=0.465 std_dev=0.313
C5'	A	0, 0.069, 0.386, 0.703, 0.919 max_d=0.919 avg_d=0.386 std_dev=0.317
O2'	A	0, 0.007, 0.363, 0.719, 0.943 max_d=0.943 avg_d=0.363 std_dev=0.356
P	A	0, 0.108, 0.489, 0.870, 0.949 max_d=0.949 avg_d=0.489 std_dev=0.381
N7	B	0, 0.156, 0.556, 0.956, 1.091 max_d=1.091 avg_d=0.556 std_dev=0.400
N9	B	0, 0.190, 0.598, 1.006, 0.983 max_d=0.983 avg_d=0.598 std_dev=0.408
P	B	0, 0.116, 0.539, 0.962, 1.245 max_d=1.245 avg_d=0.539 std_dev=0.423
O4'	B	0, 0.184, 0.638, 1.093, 1.234 max_d=1.234 avg_d=0.638 std_dev=0.455
C8	B	0, 0.195, 0.652, 1.109, 1.203 max_d=1.203 avg_d=0.652 std_dev=0.457
C1'	B	0, 0.213, 0.683, 1.154, 1.225 max_d=1.225 avg_d=0.683 std_dev=0.471
OP2	B	0, 0.078, 0.555, 1.032, 1.434 max_d=1.434 avg_d=0.555 std_dev=0.477
C3'	B	0, 0.196, 0.716, 1.236, 1.369 max_d=1.369 avg_d=0.716 std_dev=0.520
OP1	A	0, 0.103, 0.639, 1.176, 1.567 max_d=1.567 avg_d=0.639 std_dev=0.536
C4'	B	0, 0.176, 0.732, 1.288, 1.436 max_d=1.436 avg_d=0.732 std_dev=0.556
C2'	B	0, 0.250, 0.808, 1.366, 1.445 max_d=1.445 avg_d=0.808 std_dev=0.558
OP2	A	0, 0.110, 0.684, 1.259, 1.698 max_d=1.698 avg_d=0.684 std_dev=0.574
C5'	B	0, 0.113, 0.706, 1.299, 1.498 max_d=1.498 avg_d=0.706 std_dev=0.593
O3'	B	0, 0.209, 0.863, 1.516, 1.744 max_d=1.744 avg_d=0.863 std_dev=0.654
O2'	B	0, 0.328, 1.091, 1.855, 1.839 max_d=1.839 avg_d=1.091 std_dev=0.764
O5'	B	0, 0.088, 0.867, 1.646, 2.180 max_d=2.180 avg_d=0.867 std_dev=0.779
OP1	B	0, 0.020, 0.802, 1.585, 2.239 max_d=2.239 avg_d=0.802 std_dev=0.783

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.02	0.03	0.03	0.03	0.01	0.02	0.06	0.01	0.09	0.03	0.01	0.14	0.29	0.28	0.05
C2	0.03	0.00	0.07	0.06	0.01	0.03	0.02	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.08	0.02	0.06	0.14	0.39	0.22	0.10
C2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.11	0.01	0.13	0.07	0.12	0.04	0.08	0.10	0.01	0.01	0.12	0.01	0.09	0.36	0.23	0.04
C3'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.10	0.01	0.09	0.02	0.08	0.05	0.08	0.05	0.02	0.00	0.11	0.02	0.07	0.26	0.26	0.03
C4	0.03	0.01	0.11	0.10	0.00	0.07	0.01	0.18	0.01	0.02	0.01	0.03	0.17	0.10	0.01	0.06	0.17	0.45	0.23	0.17
C4'	0.02	0.03	0.01	0.01	0.07	0.00	0.08	0.01	0.08	0.03	0.04	0.06	0.10	0.02	0.06	0.01	0.02	0.25	0.26	0.03
C5	0.03	0.02	0.13	0.09	0.01	0.08	0.00	0.21	0.01	0.02	0.01	0.02	0.19	0.10	0.02	0.04	0.19	0.48	0.28	0.21
C5'	0.03	0.10	0.07	0.02	0.18	0.01	0.21	0.00	0.19	0.11	0.13	0.10	0.04	0.09	0.18	0.01	0.01	0.25	0.25	0.04
C6	0.03	0.01	0.12	0.08	0.01	0.08	0.01	0.19	0.00	0.01	0.01	0.02	0.17	0.09	0.02	0.03	0.18	0.46	0.27	0.19
N1	0.01	0.01	0.04	0.05	0.02	0.03	0.02	0.11	0.01	0.00	0.02	0.03	0.08	0.07	0.02	0.03	0.16	0.39	0.24	0.11
N3	0.02	0.01	0.08	0.08	0.01	0.04	0.01	0.13	0.01	0.02	0.00	0.03	0.12	0.08	0.02	0.06	0.16	0.41	0.21	0.12
O2	0.06	0.01	0.10	0.05	0.03	0.06	0.02	0.10	0.02	0.03	0.03	0.00	0.07	0.09	0.04	0.11	0.11	0.38	0.21	0.10
O2'	0.01	0.07	0.01	0.02	0.17	0.10	0.19	0.04	0.17	0.08	0.12	0.07	0.00	0.05	0.19	0.05	0.13	0.28	0.39	0.06
O3'	0.09	0.08	0.01	0.00	0.10	0.02	0.10	0.09	0.09	0.07	0.08	0.09	0.05	0.00	0.11	0.05	0.04	0.19	0.35	0.08
O4	0.03	0.02	0.12	0.11	0.01	0.06	0.02	0.18	0.02	0.02	0.02	0.04	0.19	0.11	0.00	0.06	0.20	0.41	0.22	0.14
O4'	0.01	0.06	0.01	0.02	0.06	0.01	0.04	0.01	0.03	0.03	0.06	0.11	0.05	0.05	0.06	0.00	0.15	0.24	0.26	0.05
O5'	0.14	0.14	0.09	0.07	0.17	0.02	0.19	0.01	0.18	0.16	0.16	0.11	0.13	0.04	0.20	0.15	0.00	0.04	0.04	0.01
OP1	0.29	0.39	0.36	0.26	0.45	0.25	0.48	0.25	0.46	0.39	0.41	0.38	0.28	0.19	0.41	0.24	0.04	0.00	0.02	0.02
OP2	0.28	0.22	0.23	0.26	0.23	0.26	0.28	0.25	0.27	0.24	0.21	0.21	0.39	0.35	0.22	0.26	0.04	0.02	0.00	0.01
P	0.05	0.10	0.04	0.03	0.17	0.03	0.21	0.04	0.19	0.11	0.12	0.10	0.06	0.08	0.14	0.05	0.01	0.02	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.21	0.19	0.15	0.17	0.15	0.14	0.12	0.13	0.15	0.17	0.20	0.10	0.13	0.17	0.23	0.17	0.18	0.37	0.24	0.38	0.14
C2	0.14	0.15	0.13	0.12	0.13	0.14	0.13	0.21	0.13	0.14	0.15	0.14	0.11	0.13	0.14	0.15	0.13	0.17	0.55	0.21	0.25	0.11
C2'	0.28	0.22	0.28	0.24	0.22	0.25	0.15	0.15	0.10	0.19	0.13	0.25	0.05	0.15	0.23	0.35	0.23	0.27	0.30	0.11	0.43	0.11
C3'	0.11	0.04	0.12	0.09	0.05	0.10	0.04	0.06	0.05	0.07	0.05	0.05	0.09	0.05	0.07	0.17	0.08	0.09	0.30	0.24	0.35	0.06
C4	0.12	0.08	0.12	0.15	0.09	0.17	0.11	0.26	0.09	0.13	0.08	0.08	0.11	0.13	0.11	0.11	0.16	0.16	0.63	0.34	0.17	0.06
C4'	0.10	0.07	0.10	0.07	0.06	0.07	0.05	0.03	0.05	0.08	0.06	0.06	0.07	0.07	0.08	0.14	0.08	0.07	0.27	0.32	0.43	0.08
C5	0.19	0.07	0.18	0.18	0.15	0.19	0.16	0.23	0.11	0.20	0.06	0.11	0.11	0.19	0.19	0.19	0.20	0.20	0.57	0.26	0.20	0.07
C5'	0.14	0.05	0.13	0.12	0.11	0.12	0.11	0.16	0.08	0.16	0.06	0.07	0.08	0.15	0.14	0.14	0.06	0.13	0.32	0.40	0.44	0.10
C6	0.22	0.14	0.20	0.18	0.18	0.18	0.16	0.19	0.12	0.19	0.10	0.18	0.10	0.18	0.20	0.22	0.20	0.21	0.47	0.21	0.27	0.11
N1	0.18	0.17	0.17	0.15	0.16	0.15	0.14	0.17	0.12	0.15	0.14	0.17	0.10	0.14	0.17	0.20	0.16	0.18	0.48	0.20	0.30	0.12
N3	0.13	0.11	0.11	0.13	0.10	0.15	0.10	0.24	0.09	0.12	0.11	0.11	0.08	0.12	0.12	0.12	0.14	0.16	0.61	0.28	0.20	0.08
O2	0.14	0.17	0.13	0.11	0.15	0.13	0.16	0.20	0.17	0.15	0.19	0.15	0.18	0.16	0.15	0.17	0.12	0.16	0.55	0.20	0.27	0.11
O2'	0.48	0.49	0.49	0.42	0.45	0.39	0.39	0.26	0.35	0.41	0.41	0.49	0.24	0.37	0.45	0.57	0.41	0.42	0.32	0.13	0.45	0.15
O3'	0.11	0.05	0.12	0.09	0.07	0.09	0.04	0.06	0.02	0.07	0.04	0.06	0.03	0.05	0.08	0.16	0.06	0.09	0.30	0.25	0.34	0.07
O4	0.07	0.15	0.09	0.14	0.12	0.16	0.16	0.27	0.20	0.10	0.18	0.12	0.23	0.15	0.08	0.08	0.14	0.11	0.65	0.47	0.14	0.04
O4'	0.22	0.18	0.22	0.20	0.18	0.21	0.15	0.18	0.12	0.17	0.14	0.19	0.10	0.15	0.19	0.25	0.24	0.22	0.33	0.36	0.45	0.21
O5'	0.39	0.29	0.40	0.39	0.33	0.38	0.32	0.34	0.29	0.36	0.27	0.32	0.27	0.34	0.37	0.42	0.45	0.39	0.33	0.70	0.53	0.40
OP1	0.40	0.38	0.40	0.36	0.43	0.35	0.45	0.33	0.43	0.47	0.40	0.39	0.44	0.47	0.44	0.42	0.36	0.40	0.44	0.79	0.32	0.29
OP2	0.29	0.25	0.29	0.29	0.28	0.29	0.30	0.32	0.29	0.35	0.26	0.24	0.30	0.35	0.31	0.31	0.31	0.29	0.47	0.86	0.39	0.35
P	0.23	0.13	0.24	0.21	0.19	0.21	0.21	0.20	0.17	0.27	0.13	0.15	0.17	0.25	0.24	0.28	0.25	0.23	0.33	0.75	0.37	0.24

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.04	0.02	0.02	0.01	0.01	0.04	0.01	0.17	0.29	0.44	0.12
C2	0.04	0.00	0.06	0.06	0.03	0.03	0.02	0.09	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.03	0.04	0.10	0.05	0.06	0.42	0.21	0.06	0.06
C2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.04	0.03	0.05	0.05	0.05	0.03	0.02	0.01	0.04	0.02	0.06	0.30	0.57	0.11
C3'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.08	0.01	0.13	0.02	0.12	0.17	0.08	0.05	0.13	0.17	0.09	0.02	0.01	0.01	0.03	0.36	0.57	0.06
C4	0.02	0.03	0.03	0.08	0.00	0.06	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.08	0.02	0.45	0.29	0.22	0.11
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.06	0.00	0.11	0.01	0.09	0.19	0.04	0.04	0.12	0.18	0.09	0.05	0.03	0.00	0.04	0.28	0.57	0.12
C5	0.01	0.02	0.04	0.13	0.01	0.11	0.00	0.24	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.13	0.01	0.58	0.33	0.22	0.14
C5'	0.03	0.09	0.01	0.02	0.15	0.01	0.24	0.00	0.23	0.30	0.15	0.06	0.26	0.33	0.17	0.04	0.05	0.02	0.01	0.36	0.38	0.02
C6	0.02	0.01	0.04	0.12	0.01	0.09	0.01	0.23	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.07	0.12	0.02	0.59	0.29	0.12	0.12
C8	0.02	0.04	0.03	0.17	0.01	0.19	0.02	0.30	0.03	0.00	0.03	0.02	0.05	0.00	0.00	0.03	0.17	0.06	0.54	0.40	0.42	0.19
N1	0.03	0.01	0.05	0.08	0.01	0.04	0.02	0.15	0.00	0.03	0.00	0.03	0.02	0.03	0.02	0.08	0.08	0.04	0.52	0.24	0.05	0.08
N3	0.04	0.01	0.05	0.05	0.01	0.04	0.01	0.06	0.03	0.02	0.03	0.00	0.04	0.00	0.02	0.09	0.03	0.06	0.36	0.22	0.13	0.06
N6	0.02	0.02	0.05	0.13	0.02	0.12	0.02	0.26	0.01	0.05	0.02	0.04	0.00	0.05	0.03	0.07	0.14	0.02	0.65	0.32	0.12	0.13
N7	0.02	0.03	0.03	0.17	0.01	0.18	0.01	0.33	0.03	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.01	0.03	0.18	0.05	0.63	0.39	0.34	0.18
N9	0.01	0.04	0.02	0.09	0.01	0.09	0.01	0.17	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.01	0.00	0.03	0.09	0.02	0.41	0.33	0.37	0.14
O2'	0.01	0.10	0.01	0.02	0.06	0.05	0.05	0.04	0.07	0.03	0.08	0.09	0.07	0.03	0.03	0.00	0.08	0.08	0.07	0.19	0.70	0.20
O3'	0.04	0.05	0.04	0.01	0.08	0.03	0.13	0.05	0.12	0.17	0.08	0.03	0.14	0.18	0.09	0.08	0.00	0.04	0.18	0.29	0.69	0.12
O4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.06	0.04	0.06	0.02	0.05	0.02	0.08	0.04	0.00	0.13	0.28	0.44	0.12
O5'	0.17	0.42	0.06	0.03	0.45	0.04	0.58	0.01	0.59	0.54	0.52	0.36	0.65	0.63	0.41	0.07	0.18	0.13	0.00	0.03	0.03	0.01
OP1	0.29	0.21	0.30	0.36	0.29	0.28	0.33	0.36	0.29	0.40	0.24	0.22	0.32	0.39	0.33	0.19	0.29	0.28	0.03	0.00	0.02	0.01
OP2	0.44	0.06	0.57	0.57	0.22	0.57	0.22	0.38	0.12	0.42	0.05	0.13	0.12	0.34	0.37	0.70	0.69	0.44	0.03	0.02	0.00	0.01
P	0.12	0.06	0.11	0.06	0.11	0.12	0.14	0.02	0.12	0.19	0.08	0.06	0.13	0.18	0.14	0.20	0.12	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00