Doublet Group distance statistics: 48997

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.004, 0.012, 0.019, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.002, 0.010, 0.018, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.006, 0.015, 0.023, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.015 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.006, 0.014, 0.023, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.014 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.008, 0.017, 0.026, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.017 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.003, 0.012, 0.021, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.012 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.008, 0.019, 0.029, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.019 std_dev=0.010
O4	A	0, 0.017, 0.046, 0.075, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.046 std_dev=0.029
O2	A	0, 0.000, 0.029, 0.057, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.029 std_dev=0.029
O4'	A	0, 0.030, 0.165, 0.301, 0.344 max_d=0.344 avg_d=0.165 std_dev=0.136
C2'	A	0, 0.039, 0.208, 0.377, 0.457 max_d=0.457 avg_d=0.208 std_dev=0.169
C4'	A	0, 0.043, 0.226, 0.408, 0.459 max_d=0.459 avg_d=0.226 std_dev=0.183
O2'	A	0, 0.106, 0.342, 0.577, 0.659 max_d=0.659 avg_d=0.342 std_dev=0.235
C3'	A	0, 0.055, 0.309, 0.563, 0.633 max_d=0.633 avg_d=0.309 std_dev=0.254
C1'	B	0, 0.287, 0.586, 0.885, 0.907 max_d=0.907 avg_d=0.586 std_dev=0.299
O4'	B	0, 0.308, 0.614, 0.920, 0.954 max_d=0.954 avg_d=0.614 std_dev=0.306
N9	B	0, 0.241, 0.597, 0.953, 1.032 max_d=1.032 avg_d=0.597 std_dev=0.356
C2'	B	0, 0.279, 0.638, 0.996, 1.048 max_d=1.048 avg_d=0.638 std_dev=0.359
C4'	B	0, 0.318, 0.677, 1.036, 1.066 max_d=1.066 avg_d=0.677 std_dev=0.359
O3'	A	0, 0.099, 0.461, 0.823, 0.890 max_d=0.890 avg_d=0.461 std_dev=0.362
O2'	B	0, 0.381, 0.751, 1.122, 1.166 max_d=1.166 avg_d=0.751 std_dev=0.370
N3	B	0, 0.308, 0.685, 1.063, 1.131 max_d=1.131 avg_d=0.685 std_dev=0.378
C4	B	0, 0.260, 0.641, 1.022, 1.121 max_d=1.121 avg_d=0.641 std_dev=0.381
C5'	A	0, 0.040, 0.422, 0.804, 1.022 max_d=1.022 avg_d=0.422 std_dev=0.382
C5'	B	0, 0.332, 0.726, 1.120, 1.128 max_d=1.128 avg_d=0.726 std_dev=0.394
P	B	0, 0.171, 0.571, 0.971, 0.985 max_d=0.985 avg_d=0.571 std_dev=0.400
OP2	B	0, 0.236, 0.662, 1.087, 1.121 max_d=1.121 avg_d=0.662 std_dev=0.426
O5'	B	0, 0.270, 0.698, 1.127, 1.162 max_d=1.162 avg_d=0.698 std_dev=0.428
C2	B	0, 0.350, 0.787, 1.224, 1.258 max_d=1.258 avg_d=0.787 std_dev=0.437
C8	B	0, 0.263, 0.702, 1.140, 1.256 max_d=1.256 avg_d=0.702 std_dev=0.439
C3'	B	0, 0.224, 0.663, 1.102, 1.162 max_d=1.162 avg_d=0.663 std_dev=0.439
C5	B	0, 0.265, 0.730, 1.195, 1.373 max_d=1.373 avg_d=0.730 std_dev=0.465
O3'	B	0, 0.328, 0.813, 1.298, 1.417 max_d=1.417 avg_d=0.813 std_dev=0.485
O5'	A	0, -0.030, 0.455, 0.940, 1.338 max_d=1.338 avg_d=0.455 std_dev=0.485
N1	B	0, 0.351, 0.844, 1.338, 1.425 max_d=1.425 avg_d=0.844 std_dev=0.494
N7	B	0, 0.267, 0.780, 1.293, 1.507 max_d=1.507 avg_d=0.780 std_dev=0.513
OP1	B	0, 0.229, 0.743, 1.257, 1.340 max_d=1.340 avg_d=0.743 std_dev=0.514
C6	B	0, 0.306, 0.828, 1.351, 1.541 max_d=1.541 avg_d=0.828 std_dev=0.522
N6	B	0, 0.335, 0.970, 1.605, 1.901 max_d=1.901 avg_d=0.970 std_dev=0.635
OP2	A	0, 0.049, 0.808, 1.567, 2.178 max_d=2.178 avg_d=0.808 std_dev=0.759
P	A	0, -0.045, 0.738, 1.520, 2.029 max_d=2.029 avg_d=0.738 std_dev=0.783
OP1	A	0, -0.049, 0.942, 1.933, 2.427 max_d=2.427 avg_d=0.942 std_dev=0.991

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.04	0.01	0.03	0.03	0.01	0.07	0.06	0.13	0.09
C2	0.03	0.00	0.04	0.06	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.06	0.01	0.05	0.13	0.15	0.25	0.20
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.07	0.02	0.11	0.01	0.11	0.04	0.03	0.11	0.00	0.02	0.07	0.01	0.09	0.08	0.17	0.10
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.11	0.00	0.16	0.01	0.16	0.07	0.08	0.09	0.01	0.01	0.12	0.01	0.08	0.10	0.14	0.10
C4	0.03	0.01	0.07	0.11	0.00	0.07	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.14	0.00	0.03	0.19	0.25	0.33	0.29
C4'	0.01	0.03	0.02	0.00	0.07	0.00	0.08	0.00	0.08	0.04	0.05	0.03	0.06	0.04	0.07	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01
C5	0.02	0.01	0.11	0.16	0.01	0.08	0.00	0.15	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.19	0.01	0.03	0.20	0.26	0.32	0.30
C5'	0.02	0.07	0.01	0.01	0.13	0.00	0.15	0.00	0.13	0.08	0.09	0.05	0.06	0.03	0.14	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01
C6	0.02	0.01	0.11	0.16	0.01	0.08	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.18	0.01	0.04	0.18	0.20	0.25	0.24
N1	0.02	0.00	0.04	0.07	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.02	0.13	0.14	0.21	0.18
N3	0.03	0.00	0.03	0.08	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.09	0.01	0.05	0.16	0.20	0.29	0.25
O2	0.04	0.00	0.11	0.09	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.10	0.12	0.01	0.08	0.12	0.12	0.23	0.17
O2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.04	0.06	0.08	0.06	0.08	0.02	0.02	0.10	0.00	0.04	0.04	0.04	0.04	0.04	0.10	0.03
O3'	0.03	0.06	0.02	0.01	0.14	0.04	0.19	0.03	0.18	0.06	0.09	0.12	0.04	0.00	0.15	0.05	0.07	0.12	0.14	0.09
O4	0.03	0.01	0.07	0.12	0.00	0.07	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.15	0.00	0.04	0.20	0.28	0.36	0.32
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.05	0.08	0.04	0.05	0.04	0.00	0.05	0.07	0.08	0.07
O5'	0.07	0.13	0.09	0.08	0.19	0.01	0.20	0.01	0.18	0.13	0.16	0.12	0.04	0.07	0.20	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.06	0.15	0.08	0.10	0.25	0.02	0.26	0.05	0.20	0.14	0.20	0.12	0.04	0.12	0.28	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.13	0.25	0.17	0.14	0.33	0.03	0.32	0.01	0.25	0.21	0.29	0.23	0.10	0.14	0.36	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.20	0.10	0.10	0.29	0.01	0.30	0.01	0.24	0.18	0.25	0.17	0.03	0.09	0.32	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.30	0.18	0.22	0.14	0.28	0.18	0.33	0.27	0.19	0.30	0.24	0.31	0.22	0.09	0.21	0.24	0.25	0.28	0.05	0.08	0.09
C2	0.22	0.31	0.22	0.24	0.12	0.28	0.11	0.31	0.17	0.27	0.27	0.26	0.23	0.25	0.18	0.22	0.24	0.27	0.30	0.14	0.24	0.18
C2'	0.09	0.26	0.10	0.17	0.16	0.21	0.19	0.32	0.25	0.17	0.28	0.21	0.25	0.18	0.09	0.11	0.19	0.14	0.31	0.12	0.13	0.16
C3'	0.18	0.31	0.15	0.09	0.27	0.07	0.32	0.12	0.34	0.31	0.34	0.27	0.35	0.33	0.24	0.13	0.08	0.13	0.09	0.03	0.04	0.01
C4	0.18	0.36	0.18	0.23	0.11	0.25	0.10	0.30	0.18	0.29	0.35	0.25	0.26	0.30	0.16	0.17	0.22	0.24	0.36	0.26	0.36	0.28
C4'	0.11	0.32	0.08	0.08	0.24	0.11	0.33	0.17	0.38	0.29	0.37	0.25	0.44	0.36	0.18	0.09	0.10	0.12	0.08	0.16	0.18	0.10
C5	0.17	0.39	0.17	0.23	0.16	0.26	0.19	0.32	0.33	0.27	0.42	0.28	0.40	0.29	0.15	0.17	0.23	0.25	0.38	0.26	0.36	0.30
C5'	0.15	0.41	0.16	0.15	0.33	0.10	0.44	0.10	0.51	0.39	0.49	0.33	0.59	0.48	0.27	0.10	0.14	0.13	0.11	0.29	0.35	0.22
C6	0.17	0.37	0.17	0.22	0.18	0.26	0.23	0.32	0.35	0.27	0.41	0.28	0.42	0.29	0.14	0.17	0.22	0.25	0.36	0.21	0.29	0.26
N1	0.17	0.33	0.17	0.21	0.12	0.26	0.16	0.31	0.27	0.24	0.33	0.25	0.32	0.24	0.11	0.18	0.21	0.25	0.31	0.13	0.20	0.18
N3	0.21	0.33	0.21	0.24	0.13	0.26	0.13	0.29	0.13	0.30	0.27	0.26	0.22	0.30	0.20	0.21	0.23	0.26	0.32	0.20	0.32	0.23
O2	0.29	0.28	0.28	0.29	0.19	0.32	0.17	0.33	0.17	0.27	0.22	0.28	0.21	0.25	0.24	0.29	0.29	0.32	0.28	0.13	0.22	0.16
O2'	0.15	0.21	0.21	0.31	0.12	0.35	0.14	0.46	0.19	0.13	0.22	0.16	0.20	0.12	0.09	0.21	0.34	0.22	0.39	0.18	0.14	0.19
O3'	0.25	0.27	0.21	0.15	0.26	0.15	0.26	0.08	0.27	0.27	0.28	0.26	0.26	0.26	0.26	0.20	0.12	0.25	0.03	0.02	0.01	0.01
O4	0.18	0.34	0.18	0.23	0.12	0.24	0.12	0.29	0.09	0.29	0.31	0.24	0.20	0.31	0.18	0.17	0.23	0.24	0.36	0.29	0.40	0.31
O4'	0.11	0.32	0.11	0.13	0.18	0.21	0.27	0.26	0.34	0.25	0.35	0.25	0.42	0.32	0.10	0.17	0.17	0.18	0.16	0.11	0.12	0.04
O5'	0.21	0.54	0.24	0.22	0.44	0.11	0.55	0.12	0.63	0.43	0.62	0.46	0.70	0.56	0.34	0.19	0.20	0.09	0.17	0.20	0.30	0.17
OP1	0.37	0.65	0.45	0.45	0.59	0.28	0.74	0.26	0.81	0.65	0.76	0.56	0.92	0.79	0.52	0.37	0.45	0.23	0.39	0.48	0.64	0.42
OP2	0.41	0.80	0.48	0.45	0.67	0.29	0.79	0.25	0.91	0.60	0.89	0.69	1.01	0.76	0.54	0.43	0.45	0.24	0.32	0.21	0.35	0.23
P	0.29	0.66	0.36	0.34	0.55	0.19	0.67	0.17	0.77	0.53	0.75	0.56	0.88	0.69	0.44	0.29	0.34	0.15	0.27	0.31	0.44	0.27

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.04	0.14	0.10
C2	0.01	0.00	0.18	0.17	0.01	0.02	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.18	0.22	0.09	0.09	0.10	0.19	0.13
C2'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.10	0.01	0.07	0.02	0.11	0.08	0.15	0.18	0.10	0.06	0.03	0.00	0.03	0.02	0.06	0.05	0.14	0.09
C3'	0.01	0.17	0.00	0.00	0.10	0.00	0.10	0.02	0.13	0.11	0.15	0.15	0.13	0.10	0.05	0.01	0.00	0.02	0.07	0.08	0.10	0.07
C4	0.01	0.01	0.10	0.10	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.12	0.04	0.08	0.09	0.18	0.12
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.05	0.07	0.03	0.02	0.06	0.07	0.03	0.05	0.02	0.01	0.01	0.05	0.05	0.05
C5	0.01	0.01	0.07	0.10	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.12	0.04	0.10	0.12	0.19	0.13
C5'	0.03	0.07	0.02	0.02	0.07	0.00	0.08	0.00	0.08	0.08	0.08	0.07	0.09	0.09	0.06	0.04	0.05	0.01	0.01	0.05	0.01	0.02
C6	0.01	0.00	0.11	0.13	0.00	0.05	0.01	0.08	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.10	0.16	0.04	0.11	0.13	0.20	0.14
C8	0.01	0.01	0.08	0.11	0.00	0.07	0.01	0.08	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.06	0.13	0.10	0.11	0.10	0.18	0.12
N1	0.01	0.00	0.15	0.15	0.00	0.03	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.20	0.07	0.10	0.12	0.20	0.14
N3	0.02	0.00	0.18	0.15	0.00	0.02	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.17	0.19	0.09	0.08	0.08	0.18	0.12
N6	0.01	0.01	0.10	0.13	0.00	0.06	0.01	0.09	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.09	0.18	0.05	0.12	0.14	0.19	0.14
N7	0.01	0.01	0.06	0.10	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.04	0.13	0.08	0.12	0.13	0.19	0.13
N9	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.05	0.03	0.07	0.07	0.17	0.11
O2'	0.02	0.18	0.00	0.01	0.09	0.05	0.06	0.04	0.10	0.06	0.14	0.17	0.09	0.04	0.02	0.00	0.05	0.08	0.06	0.03	0.12	0.07
O3'	0.02	0.22	0.03	0.00	0.12	0.02	0.12	0.05	0.16	0.13	0.20	0.19	0.18	0.13	0.05	0.05	0.00	0.02	0.07	0.14	0.07	0.07
O4'	0.00	0.09	0.02	0.02	0.04	0.01	0.04	0.01	0.04	0.10	0.07	0.09	0.05	0.08	0.03	0.08	0.02	0.00	0.07	0.12	0.13	0.13
O5'	0.03	0.09	0.06	0.07	0.08	0.01	0.10	0.01	0.11	0.11	0.10	0.08	0.12	0.12	0.07	0.06	0.07	0.07	0.00	0.02	0.00	0.00
OP1	0.04	0.10	0.05	0.08	0.09	0.05	0.12	0.05	0.13	0.10	0.12	0.08	0.14	0.13	0.07	0.03	0.14	0.12	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.14	0.19	0.14	0.10	0.18	0.05	0.19	0.01	0.20	0.18	0.20	0.18	0.19	0.19	0.17	0.12	0.07	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.10	0.13	0.09	0.07	0.12	0.05	0.13	0.02	0.14	0.12	0.14	0.12	0.14	0.13	0.11	0.07	0.07	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00