Doublet Group distance statistics: 48998

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.007, 0.011, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.007 std_dev=0.004
C6	A	0, 0.002, 0.016, 0.030, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.016 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.002, 0.018, 0.033, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.018 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.000, 0.018, 0.035, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.018 std_dev=0.018
N1	A	0, 0.002, 0.021, 0.040, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.021 std_dev=0.019
N3	A	0, 0.000, 0.019, 0.039, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.019 std_dev=0.019
C1'	A	0, 0.002, 0.023, 0.044, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.023 std_dev=0.021
O2	A	0, 0.013, 0.054, 0.096, 0.113 max_d=0.113 avg_d=0.054 std_dev=0.042
O4	A	0, 0.043, 0.094, 0.145, 0.141 max_d=0.141 avg_d=0.094 std_dev=0.051
O4'	A	0, 0.035, 0.111, 0.187, 0.238 max_d=0.238 avg_d=0.111 std_dev=0.076
C2'	A	0, 0.068, 0.153, 0.239, 0.233 max_d=0.233 avg_d=0.153 std_dev=0.086
C4'	A	0, 0.080, 0.215, 0.350, 0.353 max_d=0.353 avg_d=0.215 std_dev=0.135
O2'	A	0, 0.114, 0.289, 0.465, 0.473 max_d=0.473 avg_d=0.289 std_dev=0.176
C3'	A	0, 0.093, 0.283, 0.473, 0.545 max_d=0.545 avg_d=0.283 std_dev=0.190
C5'	A	0, 0.129, 0.348, 0.567, 0.660 max_d=0.660 avg_d=0.348 std_dev=0.219
C4	B	0, 0.108, 0.402, 0.697, 0.813 max_d=0.813 avg_d=0.402 std_dev=0.294
N3	B	0, 0.120, 0.444, 0.769, 0.942 max_d=0.942 avg_d=0.444 std_dev=0.324
N9	B	0, 0.120, 0.503, 0.887, 1.077 max_d=1.077 avg_d=0.503 std_dev=0.383
O3'	A	0, 0.107, 0.498, 0.889, 1.159 max_d=1.159 avg_d=0.498 std_dev=0.391
P	A	0, 0.189, 0.581, 0.972, 1.064 max_d=1.064 avg_d=0.581 std_dev=0.391
C5	B	0, 0.012, 0.413, 0.813, 1.129 max_d=1.129 avg_d=0.413 std_dev=0.400
C2	B	0, 0.035, 0.463, 0.891, 1.247 max_d=1.247 avg_d=0.463 std_dev=0.428
O5'	A	0, 0.118, 0.563, 1.009, 1.234 max_d=1.234 avg_d=0.563 std_dev=0.446
C2'	B	0, 0.186, 0.654, 1.123, 1.243 max_d=1.243 avg_d=0.654 std_dev=0.468
C8	B	0, 0.059, 0.562, 1.065, 1.440 max_d=1.440 avg_d=0.562 std_dev=0.503
C1'	B	0, 0.133, 0.643, 1.152, 1.460 max_d=1.460 avg_d=0.643 std_dev=0.510
C6	B	0, -0.091, 0.421, 0.932, 1.401 max_d=1.401 avg_d=0.421 std_dev=0.511
N1	B	0, -0.065, 0.452, 0.969, 1.442 max_d=1.442 avg_d=0.452 std_dev=0.517
N7	B	0, -0.012, 0.521, 1.054, 1.511 max_d=1.511 avg_d=0.521 std_dev=0.533
OP2	B	0, 0.068, 0.603, 1.137, 1.569 max_d=1.569 avg_d=0.603 std_dev=0.535
P	B	0, 0.108, 0.692, 1.276, 1.708 max_d=1.708 avg_d=0.692 std_dev=0.584
C3'	B	0, 0.183, 0.767, 1.352, 1.614 max_d=1.614 avg_d=0.767 std_dev=0.585
O4'	B	0, 0.084, 0.728, 1.373, 1.867 max_d=1.867 avg_d=0.728 std_dev=0.644
O2'	B	0, 0.162, 0.819, 1.476, 1.839 max_d=1.839 avg_d=0.819 std_dev=0.657
N6	B	0, -0.193, 0.515, 1.223, 1.908 max_d=1.908 avg_d=0.515 std_dev=0.708
O5'	B	0, 0.074, 0.831, 1.588, 2.190 max_d=2.190 avg_d=0.831 std_dev=0.757
C4'	B	0, 0.095, 0.853, 1.611, 2.198 max_d=2.198 avg_d=0.853 std_dev=0.758
O3'	B	0, 0.187, 0.963, 1.739, 2.184 max_d=2.184 avg_d=0.963 std_dev=0.776
OP1	B	0, 0.153, 0.987, 1.821, 2.452 max_d=2.452 avg_d=0.987 std_dev=0.834
OP2	A	0, 0.021, 0.901, 1.782, 2.515 max_d=2.515 avg_d=0.901 std_dev=0.880
C5'	B	0, 0.008, 0.957, 1.907, 2.732 max_d=2.732 avg_d=0.957 std_dev=0.949
OP1	A	0, -0.183, 1.058, 2.299, 3.485 max_d=3.485 avg_d=1.058 std_dev=1.241

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.04	0.03	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.07	0.02	0.03	0.04	0.01	0.08	0.13	0.47	0.15
C2	0.03	0.00	0.05	0.07	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.07	0.02	0.02	0.22	0.42	0.62	0.05
C2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.06	0.02	0.08	0.04	0.08	0.03	0.03	0.12	0.00	0.02	0.08	0.01	0.10	0.12	0.43	0.20
C3'	0.04	0.07	0.01	0.00	0.20	0.01	0.25	0.01	0.24	0.12	0.13	0.06	0.03	0.02	0.22	0.04	0.12	0.24	0.26	0.15
C4	0.03	0.01	0.06	0.20	0.00	0.10	0.00	0.18	0.01	0.03	0.01	0.02	0.08	0.28	0.01	0.03	0.38	0.58	0.73	0.15
C4'	0.02	0.02	0.02	0.01	0.10	0.00	0.14	0.01	0.13	0.05	0.06	0.09	0.04	0.03	0.11	0.01	0.05	0.12	0.23	0.10
C5	0.02	0.01	0.08	0.25	0.00	0.14	0.00	0.21	0.00	0.02	0.02	0.02	0.05	0.35	0.02	0.04	0.40	0.50	0.73	0.13
C5'	0.02	0.06	0.04	0.01	0.18	0.01	0.21	0.00	0.17	0.08	0.13	0.04	0.04	0.05	0.19	0.03	0.02	0.18	0.32	0.03
C6	0.01	0.01	0.08	0.24	0.01	0.13	0.00	0.17	0.00	0.00	0.02	0.02	0.05	0.31	0.02	0.05	0.31	0.34	0.67	0.05
N1	0.01	0.01	0.03	0.12	0.03	0.05	0.02	0.08	0.00	0.00	0.01	0.03	0.05	0.14	0.03	0.02	0.21	0.31	0.60	0.07
N3	0.03	0.01	0.03	0.13	0.01	0.06	0.02	0.13	0.02	0.01	0.00	0.02	0.12	0.16	0.01	0.02	0.32	0.54	0.67	0.10
O2	0.07	0.01	0.12	0.06	0.02	0.09	0.02	0.04	0.02	0.03	0.02	0.00	0.25	0.11	0.03	0.04	0.12	0.37	0.60	0.10
O2'	0.02	0.14	0.00	0.03	0.08	0.04	0.05	0.04	0.05	0.05	0.12	0.25	0.00	0.10	0.08	0.04	0.10	0.15	0.31	0.16
O3'	0.03	0.07	0.02	0.02	0.28	0.03	0.35	0.05	0.31	0.14	0.16	0.11	0.10	0.00	0.32	0.04	0.14	0.34	0.28	0.09
O4	0.04	0.02	0.08	0.22	0.01	0.11	0.02	0.19	0.02	0.03	0.01	0.03	0.08	0.32	0.00	0.03	0.40	0.66	0.75	0.19
O4'	0.01	0.02	0.01	0.04	0.03	0.01	0.04	0.03	0.05	0.02	0.02	0.04	0.04	0.04	0.03	0.00	0.06	0.17	0.37	0.15
O5'	0.08	0.22	0.10	0.12	0.38	0.05	0.40	0.02	0.31	0.21	0.32	0.12	0.10	0.14	0.40	0.06	0.00	0.03	0.03	0.02
OP1	0.13	0.42	0.12	0.24	0.58	0.12	0.50	0.18	0.34	0.31	0.54	0.37	0.15	0.34	0.66	0.17	0.03	0.00	0.06	0.01
OP2	0.47	0.62	0.43	0.26	0.73	0.23	0.73	0.32	0.67	0.60	0.67	0.60	0.31	0.28	0.75	0.37	0.03	0.06	0.00	0.02
P	0.15	0.05	0.20	0.15	0.15	0.10	0.13	0.03	0.05	0.07	0.10	0.10	0.16	0.09	0.19	0.15	0.02	0.01	0.02	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.38	0.08	0.38	0.29	0.30	0.14	0.33	0.05	0.20	0.50	0.09	0.16	0.21	0.46	0.41	0.42	0.27	0.21	0.06	0.31	0.18	0.06
C2	0.13	0.17	0.22	0.22	0.14	0.04	0.32	0.06	0.24	0.42	0.09	0.10	0.39	0.51	0.23	0.17	0.27	0.03	0.16	0.35	0.11	0.07
C2'	0.40	0.10	0.39	0.28	0.30	0.13	0.29	0.08	0.17	0.48	0.10	0.18	0.15	0.38	0.43	0.42	0.26	0.21	0.15	0.11	0.25	0.07
C3'	0.41	0.05	0.35	0.28	0.22	0.23	0.20	0.04	0.08	0.45	0.03	0.13	0.07	0.31	0.38	0.41	0.24	0.35	0.03	0.18	0.19	0.02
C4	0.20	0.33	0.29	0.41	0.07	0.28	0.21	0.31	0.05	0.48	0.32	0.17	0.13	0.51	0.25	0.21	0.50	0.21	0.09	0.61	0.16	0.32
C4'	0.48	0.06	0.42	0.31	0.25	0.28	0.22	0.08	0.09	0.46	0.04	0.16	0.07	0.33	0.41	0.51	0.25	0.41	0.24	0.46	0.08	0.20
C5	0.33	0.25	0.38	0.49	0.13	0.41	0.19	0.42	0.07	0.54	0.29	0.08	0.07	0.51	0.34	0.34	0.57	0.36	0.21	0.71	0.24	0.42
C5'	0.44	0.02	0.37	0.29	0.20	0.33	0.16	0.18	0.04	0.41	0.05	0.11	0.05	0.28	0.35	0.47	0.24	0.44	0.36	0.66	0.04	0.31
C6	0.38	0.15	0.41	0.46	0.19	0.38	0.23	0.34	0.01	0.57	0.18	0.04	0.03	0.51	0.39	0.40	0.50	0.37	0.18	0.64	0.13	0.36
N1	0.29	0.10	0.33	0.32	0.20	0.18	0.30	0.10	0.14	0.51	0.09	0.04	0.19	0.51	0.34	0.32	0.35	0.20	0.05	0.43	0.07	0.15
N3	0.12	0.30	0.22	0.29	0.09	0.12	0.27	0.11	0.15	0.43	0.23	0.18	0.37	0.52	0.21	0.14	0.37	0.06	0.09	0.46	0.03	0.17
O2	0.07	0.12	0.13	0.10	0.13	0.18	0.33	0.26	0.35	0.32	0.12	0.12	0.50	0.43	0.15	0.10	0.14	0.19	0.33	0.20	0.25	0.11
O2'	0.48	0.23	0.46	0.26	0.36	0.06	0.31	0.22	0.24	0.41	0.21	0.29	0.21	0.34	0.46	0.53	0.22	0.16	0.16	0.07	0.24	0.12
O3'	0.40	0.07	0.34	0.27	0.20	0.25	0.18	0.04	0.09	0.39	0.06	0.12	0.09	0.26	0.34	0.40	0.21	0.39	0.07	0.03	0.03	0.01
O4	0.19	0.37	0.29	0.45	0.07	0.32	0.19	0.38	0.08	0.47	0.36	0.20	0.15	0.50	0.24	0.20	0.57	0.22	0.14	0.66	0.24	0.37
O4'	0.45	0.08	0.42	0.31	0.29	0.23	0.28	0.05	0.15	0.50	0.08	0.17	0.15	0.41	0.43	0.49	0.27	0.34	0.15	0.46	0.13	0.16
O5'	0.24	0.14	0.16	0.14	0.07	0.20	0.08	0.18	0.14	0.24	0.18	0.07	0.17	0.15	0.18	0.25	0.13	0.27	0.19	0.50	0.24	0.20
OP1	0.11	0.11	0.20	0.32	0.09	0.21	0.09	0.35	0.12	0.10	0.13	0.09	0.12	0.09	0.10	0.13	0.40	0.13	0.31	0.20	0.57	0.33
OP2	0.24	0.77	0.19	0.25	0.47	0.48	0.64	0.57	0.91	0.20	0.95	0.54	1.08	0.48	0.22	0.29	0.27	0.43	0.60	1.16	0.21	0.56
P	0.21	0.27	0.14	0.14	0.08	0.24	0.13	0.21	0.27	0.15	0.33	0.15	0.31	0.04	0.11	0.23	0.13	0.29	0.23	0.61	0.13	0.23

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.05	0.03	0.00	0.04	0.04	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.23	0.07	0.08	0.06
C2	0.05	0.00	0.18	0.17	0.03	0.07	0.03	0.14	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.03	0.03	0.14	0.31	0.16	0.44	0.05	0.36	0.19
C2'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.11	0.02	0.05	0.05	0.09	0.08	0.14	0.19	0.06	0.04	0.02	0.00	0.03	0.01	0.36	0.14	0.10	0.07
C3'	0.02	0.17	0.00	0.00	0.13	0.01	0.11	0.03	0.14	0.03	0.16	0.16	0.13	0.04	0.06	0.02	0.01	0.02	0.40	0.29	0.10	0.11
C4	0.02	0.03	0.11	0.13	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.21	0.08	0.42	0.02	0.28	0.12
C4'	0.02	0.07	0.02	0.01	0.04	0.00	0.02	0.02	0.03	0.02	0.06	0.07	0.01	0.02	0.02	0.04	0.07	0.01	0.07	0.13	0.20	0.06
C5	0.02	0.03	0.05	0.11	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.20	0.04	0.46	0.04	0.34	0.15
C5'	0.05	0.14	0.05	0.03	0.09	0.02	0.05	0.00	0.07	0.03	0.12	0.13	0.04	0.03	0.06	0.03	0.07	0.04	0.02	0.31	0.30	0.02
C6	0.03	0.01	0.09	0.14	0.00	0.03	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.26	0.07	0.48	0.03	0.40	0.19
C8	0.00	0.02	0.08	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.06	0.04	0.08	0.44	0.06	0.21	0.06
N1	0.04	0.00	0.14	0.16	0.02	0.06	0.02	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.02	0.10	0.31	0.13	0.47	0.05	0.40	0.21
N3	0.04	0.01	0.19	0.16	0.01	0.07	0.01	0.13	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.14	0.27	0.15	0.40	0.03	0.29	0.14
N6	0.02	0.03	0.06	0.13	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.03	0.03	0.01	0.00	0.03	0.01	0.04	0.26	0.04	0.47	0.05	0.42	0.19
N7	0.01	0.03	0.04	0.04	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.04	0.11	0.04	0.47	0.05	0.32	0.12
N9	0.02	0.03	0.02	0.06	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.10	0.01	0.38	0.04	0.18	0.06
O2'	0.02	0.14	0.00	0.02	0.07	0.04	0.03	0.03	0.05	0.06	0.10	0.14	0.04	0.04	0.01	0.00	0.06	0.03	0.18	0.04	0.09	0.06
O3'	0.02	0.31	0.03	0.01	0.21	0.07	0.20	0.07	0.26	0.04	0.31	0.27	0.26	0.11	0.10	0.06	0.00	0.03	0.41	0.44	0.12	0.16
O4'	0.01	0.16	0.01	0.02	0.08	0.01	0.04	0.04	0.07	0.08	0.13	0.15	0.04	0.04	0.01	0.03	0.03	0.00	0.04	0.12	0.16	0.16
O5'	0.23	0.44	0.36	0.40	0.42	0.07	0.46	0.02	0.48	0.44	0.47	0.40	0.47	0.47	0.38	0.18	0.41	0.04	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.07	0.05	0.14	0.29	0.02	0.13	0.04	0.31	0.03	0.06	0.05	0.03	0.05	0.05	0.04	0.04	0.44	0.12	0.02	0.00	0.04	0.00
OP2	0.08	0.36	0.10	0.10	0.28	0.20	0.34	0.30	0.40	0.21	0.40	0.29	0.42	0.32	0.18	0.09	0.12	0.16	0.02	0.04	0.00	0.01
P	0.06	0.19	0.07	0.11	0.12	0.06	0.15	0.02	0.19	0.06	0.21	0.14	0.19	0.12	0.06	0.06	0.16	0.16	0.01	0.00	0.01	0.00