Doublet Group distance statistics: 49001

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.012, 0.021, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.012 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.006, 0.016, 0.027, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.016 std_dev=0.011
N3	A	0, -0.002, 0.009, 0.021, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.009 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.002, 0.016, 0.030, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.016 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.009, 0.025, 0.042, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.025 std_dev=0.016
C2	A	0, 0.005, 0.023, 0.041, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.023 std_dev=0.018
C1'	A	0, 0.001, 0.020, 0.038, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.020 std_dev=0.019
O4	A	0, 0.009, 0.030, 0.051, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.030 std_dev=0.021
O2	A	0, 0.008, 0.059, 0.111, 0.134 max_d=0.134 avg_d=0.059 std_dev=0.051
C2'	A	0, 0.075, 0.260, 0.444, 0.504 max_d=0.504 avg_d=0.260 std_dev=0.184
O4'	A	0, 0.010, 0.237, 0.465, 0.598 max_d=0.598 avg_d=0.237 std_dev=0.228
O2'	A	0, 0.194, 0.463, 0.732, 0.661 max_d=0.661 avg_d=0.463 std_dev=0.269
C8	B	0, 0.179, 0.507, 0.835, 0.819 max_d=0.819 avg_d=0.507 std_dev=0.328
C3'	A	0, 0.217, 0.546, 0.874, 0.865 max_d=0.865 avg_d=0.546 std_dev=0.329
N7	B	0, 0.157, 0.494, 0.832, 0.916 max_d=0.916 avg_d=0.494 std_dev=0.337
N9	B	0, 0.176, 0.537, 0.898, 0.876 max_d=0.876 avg_d=0.537 std_dev=0.361
C4'	A	0, 0.195, 0.586, 0.977, 1.069 max_d=1.069 avg_d=0.586 std_dev=0.391
C1'	B	0, 0.216, 0.609, 1.001, 1.030 max_d=1.030 avg_d=0.609 std_dev=0.392
C5	B	0, 0.108, 0.512, 0.917, 1.104 max_d=1.104 avg_d=0.512 std_dev=0.404
O4'	B	0, 0.172, 0.579, 0.986, 1.121 max_d=1.121 avg_d=0.579 std_dev=0.407
C4	B	0, 0.149, 0.557, 0.965, 1.082 max_d=1.082 avg_d=0.557 std_dev=0.408
C2'	B	0, 0.291, 0.726, 1.161, 1.153 max_d=1.153 avg_d=0.726 std_dev=0.435
C3'	B	0, 0.286, 0.746, 1.207, 1.248 max_d=1.248 avg_d=0.746 std_dev=0.460
N3	B	0, 0.173, 0.650, 1.128, 1.272 max_d=1.272 avg_d=0.650 std_dev=0.478
C4'	B	0, 0.206, 0.691, 1.177, 1.336 max_d=1.336 avg_d=0.691 std_dev=0.485
C6	B	0, 0.054, 0.543, 1.032, 1.317 max_d=1.317 avg_d=0.543 std_dev=0.489
O5'	B	0, 0.315, 0.811, 1.307, 1.284 max_d=1.284 avg_d=0.811 std_dev=0.496
O3'	A	0, 0.324, 0.835, 1.346, 1.357 max_d=1.357 avg_d=0.835 std_dev=0.511
N6	B	0, 0.008, 0.524, 1.039, 1.377 max_d=1.377 avg_d=0.524 std_dev=0.516
C2	B	0, 0.143, 0.683, 1.222, 1.443 max_d=1.443 avg_d=0.683 std_dev=0.540
C5'	B	0, 0.259, 0.805, 1.352, 1.427 max_d=1.427 avg_d=0.805 std_dev=0.547
N1	B	0, 0.083, 0.634, 1.184, 1.471 max_d=1.471 avg_d=0.634 std_dev=0.551
P	B	0, 0.280, 0.891, 1.503, 1.499 max_d=1.499 avg_d=0.891 std_dev=0.611
O2'	B	0, 0.384, 0.996, 1.608, 1.605 max_d=1.605 avg_d=0.996 std_dev=0.612
OP2	B	0, 0.228, 0.851, 1.473, 1.527 max_d=1.527 avg_d=0.851 std_dev=0.623
O3'	B	0, 0.464, 1.107, 1.750, 1.587 max_d=1.587 avg_d=1.107 std_dev=0.643
OP2	A	0, 0.486, 1.204, 1.923, 1.881 max_d=1.881 avg_d=1.204 std_dev=0.718
O5'	A	0, 0.336, 1.068, 1.800, 2.057 max_d=2.057 avg_d=1.068 std_dev=0.732
C5'	A	0, 0.300, 1.051, 1.802, 2.070 max_d=2.070 avg_d=1.051 std_dev=0.751
OP1	B	0, 0.297, 1.063, 1.829, 1.808 max_d=1.808 avg_d=1.063 std_dev=0.766
P	A	0, 0.454, 1.475, 2.495, 2.820 max_d=2.820 avg_d=1.475 std_dev=1.021
OP1	A	0, 0.445, 2.096, 3.747, 4.470 max_d=4.470 avg_d=2.096 std_dev=1.651

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.03	0.03	0.00	0.02	0.09	0.01	0.03	0.01	0.00	0.19	0.52	0.01	0.20
C2	0.04	0.00	0.07	0.13	0.01	0.07	0.01	0.18	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.13	0.01	0.02	0.32	0.87	0.25	0.37
C2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.04	0.02	0.09	0.02	0.09	0.02	0.04	0.13	0.00	0.03	0.04	0.01	0.04	0.10	0.15	0.06
C3'	0.02	0.13	0.01	0.00	0.14	0.01	0.21	0.02	0.22	0.09	0.13	0.19	0.01	0.01	0.14	0.02	0.18	0.25	0.20	0.18
C4	0.00	0.01	0.04	0.14	0.00	0.10	0.00	0.24	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.18	0.00	0.04	0.36	1.22	0.46	0.47
C4'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.10	0.00	0.12	0.00	0.12	0.07	0.09	0.06	0.06	0.01	0.11	0.00	0.01	0.10	0.22	0.02
C5	0.02	0.01	0.09	0.21	0.00	0.12	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.26	0.00	0.06	0.29	1.21	0.47	0.39
C5'	0.03	0.18	0.02	0.02	0.24	0.00	0.23	0.00	0.20	0.14	0.23	0.16	0.06	0.04	0.27	0.01	0.01	0.25	0.39	0.00
C6	0.03	0.01	0.09	0.22	0.01	0.12	0.00	0.20	0.00	0.00	0.01	0.02	0.04	0.24	0.01	0.05	0.23	0.97	0.34	0.28
N1	0.00	0.01	0.02	0.09	0.01	0.07	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.02	0.02	0.09	0.01	0.01	0.26	0.79	0.20	0.28
N3	0.02	0.00	0.04	0.13	0.00	0.09	0.00	0.23	0.01	0.00	0.00	0.02	0.05	0.13	0.01	0.02	0.38	1.07	0.36	0.45
O2	0.09	0.00	0.13	0.19	0.01	0.06	0.01	0.16	0.02	0.02	0.02	0.00	0.08	0.22	0.03	0.07	0.30	0.74	0.21	0.34
O2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.04	0.06	0.05	0.06	0.04	0.02	0.05	0.08	0.00	0.06	0.05	0.06	0.10	0.06	0.12	0.10
O3'	0.03	0.13	0.03	0.01	0.18	0.01	0.26	0.04	0.24	0.09	0.13	0.22	0.06	0.00	0.19	0.02	0.41	0.70	0.33	0.42
O4	0.01	0.01	0.04	0.14	0.00	0.11	0.00	0.27	0.01	0.01	0.01	0.03	0.05	0.19	0.00	0.04	0.38	1.31	0.52	0.51
O4'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.00	0.06	0.01	0.05	0.01	0.02	0.07	0.06	0.02	0.04	0.00	0.26	0.53	0.22	0.26
O5'	0.19	0.32	0.04	0.18	0.36	0.01	0.29	0.01	0.23	0.26	0.38	0.30	0.10	0.41	0.38	0.26	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.52	0.87	0.10	0.25	1.22	0.10	1.21	0.25	0.97	0.79	1.07	0.74	0.06	0.70	1.31	0.53	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.01	0.25	0.15	0.20	0.46	0.22	0.47	0.39	0.34	0.20	0.36	0.21	0.12	0.33	0.52	0.22	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.20	0.37	0.06	0.18	0.47	0.02	0.39	0.00	0.28	0.28	0.45	0.34	0.10	0.42	0.51	0.26	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.14	0.16	0.21	0.16	0.19	0.13	0.40	0.11	0.16	0.12	0.16	0.11	0.13	0.18	0.21	0.19	0.16	0.31	0.11	0.09	0.13
C2	0.24	0.12	0.22	0.07	0.11	0.14	0.09	0.28	0.13	0.03	0.10	0.16	0.19	0.11	0.13	0.37	0.14	0.14	0.28	0.18	0.18	0.17
C2'	0.20	0.14	0.14	0.22	0.16	0.16	0.18	0.40	0.17	0.21	0.15	0.16	0.21	0.22	0.19	0.18	0.20	0.18	0.36	0.16	0.19	0.19
C3'	0.33	0.19	0.22	0.11	0.22	0.18	0.14	0.18	0.10	0.20	0.13	0.23	0.09	0.12	0.26	0.25	0.14	0.35	0.10	0.02	0.07	0.02
C4	0.28	0.29	0.27	0.08	0.25	0.14	0.10	0.30	0.07	0.08	0.18	0.33	0.11	0.05	0.21	0.45	0.12	0.17	0.34	0.30	0.37	0.30
C4'	0.30	0.24	0.18	0.10	0.27	0.11	0.26	0.23	0.23	0.30	0.22	0.25	0.21	0.28	0.29	0.20	0.16	0.26	0.08	0.07	0.29	0.10
C5	0.25	0.28	0.18	0.11	0.24	0.11	0.14	0.35	0.13	0.10	0.21	0.30	0.03	0.06	0.20	0.34	0.11	0.14	0.38	0.35	0.40	0.36
C5'	0.47	0.49	0.38	0.21	0.53	0.22	0.57	0.15	0.55	0.59	0.51	0.49	0.56	0.61	0.52	0.35	0.17	0.41	0.20	0.15	0.50	0.22
C6	0.23	0.21	0.15	0.15	0.20	0.13	0.12	0.38	0.10	0.13	0.15	0.24	0.01	0.09	0.19	0.28	0.15	0.13	0.38	0.30	0.33	0.32
N1	0.23	0.15	0.16	0.10	0.15	0.10	0.10	0.33	0.08	0.11	0.10	0.18	0.10	0.09	0.17	0.28	0.08	0.12	0.31	0.18	0.18	0.19
N3	0.29	0.17	0.29	0.12	0.17	0.18	0.03	0.27	0.09	0.05	0.05	0.24	0.21	0.10	0.18	0.47	0.19	0.19	0.30	0.23	0.27	0.23
O2	0.23	0.16	0.25	0.14	0.12	0.19	0.15	0.27	0.20	0.06	0.19	0.16	0.24	0.15	0.09	0.40	0.25	0.14	0.26	0.20	0.16	0.18
O2'	0.37	0.31	0.38	0.44	0.34	0.41	0.33	0.58	0.31	0.36	0.30	0.33	0.31	0.34	0.37	0.38	0.39	0.40	0.47	0.18	0.19	0.22
O3'	0.28	0.12	0.15	0.10	0.14	0.17	0.09	0.09	0.10	0.12	0.08	0.17	0.17	0.11	0.18	0.16	0.17	0.35	0.03	0.01	0.02	0.01
O4	0.31	0.40	0.32	0.12	0.30	0.17	0.16	0.28	0.14	0.11	0.28	0.41	0.14	0.08	0.24	0.53	0.17	0.20	0.33	0.32	0.40	0.32
O4'	0.24	0.19	0.15	0.13	0.21	0.13	0.20	0.32	0.17	0.23	0.17	0.21	0.14	0.21	0.23	0.21	0.16	0.18	0.17	0.03	0.16	0.03
O5'	0.57	0.72	0.48	0.33	0.70	0.30	0.74	0.35	0.74	0.68	0.73	0.69	0.72	0.74	0.65	0.47	0.38	0.47	0.32	0.39	0.34	0.35
OP1	0.76	1.39	0.60	0.40	1.17	0.29	1.28	0.47	1.46	0.90	1.49	1.23	1.53	1.13	0.94	0.62	0.52	0.53	0.43	0.94	0.60	0.68
OP2	0.30	0.34	0.37	0.44	0.34	0.33	0.38	0.41	0.40	0.37	0.37	0.32	0.44	0.41	0.33	0.34	0.53	0.27	0.40	0.35	0.43	0.38
P	0.65	0.91	0.57	0.41	0.85	0.35	0.93	0.36	0.98	0.79	0.96	0.85	1.01	0.92	0.76	0.56	0.45	0.51	0.36	0.44	0.41	0.38

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.02	0.02	0.00	0.02	0.03	0.03	0.01	0.04	0.04	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.08	0.05	0.08
C2	0.05	0.00	0.16	0.11	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.28	0.17	0.03	0.12	0.17	0.16	0.11
C2'	0.00	0.16	0.00	0.01	0.08	0.02	0.04	0.02	0.06	0.10	0.12	0.17	0.05	0.07	0.02	0.00	0.02	0.01	0.09	0.24	0.13	0.12
C3'	0.02	0.11	0.01	0.00	0.09	0.00	0.16	0.02	0.15	0.24	0.11	0.11	0.19	0.24	0.12	0.02	0.01	0.01	0.15	0.33	0.24	0.21
C4	0.02	0.01	0.08	0.09	0.00	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.15	0.09	0.02	0.13	0.17	0.12	0.10
C4'	0.00	0.04	0.02	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.08	0.12	0.05	0.05	0.12	0.13	0.06	0.08	0.01	0.00	0.02	0.09	0.01	0.04
C5	0.02	0.01	0.04	0.16	0.01	0.09	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.09	0.16	0.02	0.20	0.24	0.20	0.18
C5'	0.03	0.07	0.02	0.02	0.10	0.01	0.16	0.00	0.17	0.18	0.12	0.05	0.22	0.21	0.10	0.07	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02
C6	0.03	0.01	0.06	0.15	0.01	0.08	0.01	0.17	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.14	0.15	0.03	0.22	0.27	0.25	0.21
C8	0.01	0.01	0.10	0.24	0.01	0.12	0.01	0.18	0.02	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.00	0.05	0.26	0.03	0.19	0.21	0.12	0.14
N1	0.04	0.01	0.12	0.11	0.01	0.05	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.23	0.12	0.03	0.17	0.23	0.22	0.17
N3	0.04	0.00	0.17	0.11	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.27	0.17	0.02	0.09	0.13	0.10	0.07
N6	0.03	0.01	0.05	0.19	0.02	0.12	0.02	0.22	0.00	0.04	0.00	0.02	0.00	0.04	0.03	0.10	0.21	0.04	0.27	0.34	0.34	0.29
N7	0.01	0.01	0.07	0.24	0.01	0.13	0.01	0.21	0.02	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.02	0.27	0.02	0.24	0.27	0.22	0.21
N9	0.01	0.01	0.02	0.12	0.00	0.06	0.01	0.10	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.04	0.10	0.01	0.11	0.13	0.06	0.07
O2'	0.01	0.28	0.00	0.02	0.15	0.08	0.09	0.07	0.14	0.05	0.23	0.27	0.10	0.02	0.04	0.00	0.07	0.07	0.10	0.26	0.13	0.11
O3'	0.02	0.17	0.02	0.01	0.09	0.01	0.16	0.03	0.15	0.26	0.12	0.17	0.21	0.27	0.10	0.07	0.00	0.02	0.20	0.49	0.37	0.32
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.02	0.04	0.02	0.01	0.07	0.02	0.00	0.08	0.10	0.18	0.18
O5'	0.04	0.12	0.09	0.15	0.13	0.02	0.20	0.01	0.22	0.19	0.17	0.09	0.27	0.24	0.11	0.10	0.20	0.08	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.08	0.17	0.24	0.33	0.17	0.09	0.24	0.01	0.27	0.21	0.23	0.13	0.34	0.27	0.13	0.26	0.49	0.10	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.05	0.16	0.13	0.24	0.12	0.01	0.20	0.02	0.25	0.12	0.22	0.10	0.34	0.22	0.06	0.13	0.37	0.18	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.11	0.12	0.21	0.10	0.04	0.18	0.02	0.21	0.14	0.17	0.07	0.29	0.21	0.07	0.11	0.32	0.18	0.01	0.01	0.00	0.00