Doublet Group distance statistics: 49003

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.009, 0.016, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.009 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.003, 0.011, 0.018, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.004, 0.015, 0.025, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.015 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.005, 0.020, 0.034, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.020 std_dev=0.014
O4	A	0, 0.004, 0.021, 0.038, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.021 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.008, 0.029, 0.049, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.029 std_dev=0.020
O2	A	0, 0.010, 0.034, 0.057, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.034 std_dev=0.024
N3	A	0, 0.010, 0.034, 0.059, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.034 std_dev=0.024
O2'	A	0, 0.032, 0.114, 0.196, 0.190 max_d=0.190 avg_d=0.114 std_dev=0.082
C2'	A	0, 0.029, 0.135, 0.240, 0.258 max_d=0.258 avg_d=0.135 std_dev=0.106
O4'	A	0, 0.029, 0.139, 0.249, 0.269 max_d=0.269 avg_d=0.139 std_dev=0.110
C8	B	0, 0.063, 0.226, 0.389, 0.377 max_d=0.377 avg_d=0.226 std_dev=0.163
N7	B	0, 0.048, 0.241, 0.434, 0.473 max_d=0.473 avg_d=0.241 std_dev=0.193
C3'	A	0, 0.012, 0.208, 0.404, 0.470 max_d=0.470 avg_d=0.208 std_dev=0.196
C4'	A	0, 0.026, 0.231, 0.435, 0.497 max_d=0.497 avg_d=0.231 std_dev=0.205
N9	B	0, 0.084, 0.298, 0.513, 0.496 max_d=0.496 avg_d=0.298 std_dev=0.214
C1'	B	0, 0.076, 0.333, 0.590, 0.626 max_d=0.626 avg_d=0.333 std_dev=0.257
C5	B	0, 0.107, 0.375, 0.643, 0.613 max_d=0.613 avg_d=0.375 std_dev=0.268
C2'	B	0, 0.098, 0.367, 0.635, 0.635 max_d=0.635 avg_d=0.367 std_dev=0.268
C4	B	0, 0.111, 0.386, 0.661, 0.620 max_d=0.620 avg_d=0.386 std_dev=0.275
O3'	A	0, 0.089, 0.380, 0.671, 0.706 max_d=0.706 avg_d=0.380 std_dev=0.291
C6	B	0, 0.145, 0.510, 0.874, 0.834 max_d=0.834 avg_d=0.510 std_dev=0.365
N3	B	0, 0.136, 0.512, 0.887, 0.892 max_d=0.892 avg_d=0.512 std_dev=0.376
N6	B	0, 0.146, 0.543, 0.939, 0.937 max_d=0.937 avg_d=0.543 std_dev=0.397
C2	B	0, 0.176, 0.626, 1.076, 1.041 max_d=1.041 avg_d=0.626 std_dev=0.450
N1	B	0, 0.191, 0.654, 1.116, 1.002 max_d=1.002 avg_d=0.654 std_dev=0.463
C5'	A	0, -0.002, 0.475, 0.952, 1.128 max_d=1.128 avg_d=0.475 std_dev=0.477
O5'	A	0, 0.215, 0.811, 1.406, 1.413 max_d=1.413 avg_d=0.811 std_dev=0.595
O4'	B	0, 0.260, 0.905, 1.549, 1.449 max_d=1.449 avg_d=0.905 std_dev=0.644
C3'	B	0, 0.320, 1.095, 1.869, 1.662 max_d=1.662 avg_d=1.095 std_dev=0.774
P	A	0, 0.347, 1.198, 2.049, 1.896 max_d=1.896 avg_d=1.198 std_dev=0.851
C4'	B	0, 0.379, 1.311, 2.242, 2.078 max_d=2.078 avg_d=1.311 std_dev=0.931
O2'	B	0, 0.350, 1.293, 2.236, 2.223 max_d=2.223 avg_d=1.293 std_dev=0.943
C5'	B	0, 0.466, 1.592, 2.719, 2.431 max_d=2.431 avg_d=1.592 std_dev=1.126
O5'	B	0, 0.490, 1.675, 2.859, 2.528 max_d=2.528 avg_d=1.675 std_dev=1.184
O3'	B	0, 0.472, 1.714, 2.955, 2.902 max_d=2.902 avg_d=1.714 std_dev=1.242
P	B	0, 0.525, 1.799, 3.072, 2.783 max_d=2.783 avg_d=1.799 std_dev=1.274
OP2	A	0, 0.744, 2.556, 4.367, 3.986 max_d=3.986 avg_d=2.556 std_dev=1.811
OP1	A	0, 0.778, 2.662, 4.545, 4.072 max_d=4.072 avg_d=2.662 std_dev=1.883
OP1	B	0, 0.795, 2.733, 4.670, 4.279 max_d=4.279 avg_d=2.733 std_dev=1.938
OP2	B	0, 0.940, 3.212, 5.484, 4.881 max_d=4.881 avg_d=3.212 std_dev=2.272

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.11	0.51	0.44	0.21
C2	0.00	0.00	0.04	0.08	0.02	0.05	0.01	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.06	0.01	0.02	0.21	0.75	0.50	0.31
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.01	0.02	0.04	0.02	0.02	0.03	0.07	0.00	0.03	0.03	0.00	0.16	0.47	0.28	0.15
C3'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.07	0.01	0.04	0.06	0.02	0.04	0.08	0.09	0.01	0.00	0.07	0.02	0.26	0.44	0.22	0.14
C4	0.01	0.02	0.03	0.07	0.00	0.10	0.00	0.28	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.08	0.01	0.01	0.31	0.96	0.49	0.39
C4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.10	0.00	0.11	0.01	0.09	0.06	0.07	0.04	0.04	0.02	0.10	0.01	0.01	0.36	0.21	0.06
C5	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.11	0.00	0.29	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.33	0.99	0.47	0.41
C5'	0.05	0.17	0.04	0.06	0.28	0.01	0.29	0.00	0.25	0.17	0.22	0.12	0.04	0.05	0.30	0.01	0.01	0.41	0.27	0.02
C6	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.09	0.00	0.25	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.03	0.30	0.87	0.47	0.36
N1	0.00	0.00	0.02	0.04	0.01	0.06	0.00	0.17	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.02	0.22	0.72	0.48	0.30
N3	0.01	0.00	0.03	0.08	0.00	0.07	0.01	0.22	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.07	0.01	0.03	0.28	0.88	0.53	0.38
O2	0.01	0.00	0.07	0.09	0.02	0.04	0.01	0.12	0.00	0.00	0.01	0.00	0.05	0.07	0.02	0.00	0.15	0.65	0.49	0.27
O2'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.04	0.04	0.02	0.04	0.02	0.02	0.03	0.05	0.00	0.05	0.04	0.01	0.02	0.33	0.27	0.08
O3'	0.02	0.06	0.03	0.00	0.08	0.02	0.04	0.05	0.02	0.03	0.07	0.07	0.05	0.00	0.08	0.01	0.19	0.34	0.21	0.07
O4	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.10	0.00	0.30	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.08	0.00	0.02	0.33	1.01	0.50	0.42
O4'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.07	0.41	0.42	0.17
O5'	0.11	0.21	0.16	0.26	0.31	0.01	0.33	0.01	0.30	0.22	0.28	0.15	0.02	0.19	0.33	0.07	0.00	0.05	0.06	0.01
OP1	0.51	0.75	0.47	0.44	0.96	0.36	0.99	0.41	0.87	0.72	0.88	0.65	0.33	0.34	1.01	0.41	0.05	0.00	0.03	0.00
OP2	0.44	0.50	0.28	0.22	0.49	0.21	0.47	0.27	0.47	0.48	0.53	0.49	0.27	0.21	0.50	0.42	0.06	0.03	0.00	0.00
P	0.21	0.31	0.15	0.14	0.39	0.06	0.41	0.02	0.36	0.30	0.38	0.27	0.08	0.07	0.42	0.17	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.13	0.11	0.09	0.11	0.07	0.08	0.17	0.10	0.07	0.11	0.13	0.13	0.04	0.10	0.16	0.09	0.11	0.38	0.98	0.13	0.32
C2	0.10	0.08	0.09	0.02	0.06	0.06	0.08	0.14	0.13	0.01	0.09	0.08	0.19	0.09	0.06	0.11	0.10	0.11	0.54	1.08	0.38	0.50
C2'	0.12	0.12	0.08	0.19	0.12	0.22	0.10	0.32	0.10	0.10	0.11	0.12	0.12	0.08	0.12	0.15	0.21	0.17	0.27	0.83	0.07	0.19
C3'	0.11	0.06	0.06	0.31	0.07	0.31	0.06	0.44	0.05	0.11	0.07	0.06	0.08	0.08	0.09	0.14	0.32	0.17	0.24	0.65	0.37	0.11
C4	0.14	0.16	0.11	0.12	0.12	0.20	0.15	0.18	0.22	0.05	0.19	0.15	0.29	0.13	0.10	0.16	0.34	0.24	0.56	1.00	0.31	0.48
C4'	0.08	0.03	0.06	0.27	0.04	0.24	0.04	0.36	0.05	0.09	0.04	0.01	0.09	0.08	0.07	0.13	0.26	0.11	0.25	0.71	0.28	0.08
C5	0.16	0.19	0.13	0.10	0.15	0.14	0.13	0.09	0.19	0.07	0.18	0.19	0.27	0.08	0.13	0.21	0.31	0.22	0.50	0.98	0.17	0.40
C5'	0.23	0.24	0.25	0.42	0.24	0.36	0.26	0.48	0.28	0.24	0.26	0.23	0.30	0.26	0.24	0.20	0.37	0.21	0.34	0.64	0.44	0.16
C6	0.15	0.18	0.12	0.07	0.14	0.06	0.11	0.08	0.14	0.07	0.15	0.18	0.21	0.06	0.13	0.21	0.21	0.17	0.45	0.98	0.12	0.36
N1	0.12	0.13	0.10	0.04	0.10	0.01	0.08	0.12	0.12	0.05	0.11	0.13	0.17	0.05	0.10	0.15	0.12	0.12	0.46	1.02	0.20	0.40
N3	0.10	0.11	0.08	0.08	0.08	0.16	0.14	0.20	0.19	0.04	0.15	0.09	0.25	0.14	0.06	0.12	0.23	0.17	0.58	1.05	0.42	0.53
O2	0.08	0.06	0.09	0.06	0.03	0.05	0.07	0.17	0.10	0.02	0.07	0.05	0.15	0.08	0.04	0.08	0.03	0.08	0.53	1.10	0.50	0.54
O2'	0.14	0.12	0.10	0.19	0.12	0.25	0.10	0.33	0.10	0.12	0.11	0.13	0.11	0.10	0.13	0.14	0.25	0.21	0.20	0.78	0.05	0.15
O3'	0.18	0.14	0.06	0.42	0.17	0.43	0.17	0.56	0.15	0.19	0.15	0.16	0.14	0.18	0.18	0.12	0.47	0.27	0.21	0.44	0.61	0.21
O4	0.14	0.18	0.12	0.18	0.13	0.29	0.18	0.25	0.26	0.07	0.24	0.16	0.31	0.15	0.10	0.16	0.45	0.30	0.59	0.98	0.36	0.51
O4'	0.10	0.13	0.08	0.14	0.09	0.10	0.06	0.22	0.09	0.06	0.11	0.12	0.12	0.02	0.09	0.16	0.14	0.10	0.33	0.88	0.06	0.22
O5'	0.44	0.61	0.42	0.27	0.51	0.25	0.50	0.15	0.56	0.38	0.61	0.57	0.55	0.40	0.45	0.62	0.41	0.40	0.31	0.78	0.34	0.21
OP1	0.88	1.15	0.89	0.67	0.98	0.73	0.94	0.63	1.03	0.78	1.14	1.08	1.01	0.80	0.88	1.06	0.70	0.88	0.97	1.25	0.33	0.70
OP2	0.23	0.23	0.18	0.07	0.20	0.13	0.15	0.11	0.13	0.16	0.17	0.24	0.07	0.12	0.21	0.37	0.20	0.31	0.39	0.88	0.26	0.22
P	0.29	0.46	0.30	0.06	0.35	0.15	0.31	0.14	0.36	0.22	0.44	0.42	0.34	0.22	0.29	0.49	0.21	0.32	0.43	0.87	0.19	0.23

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.19	0.01	0.30	0.44	0.10	0.24
C2	0.02	0.00	0.20	0.22	0.00	0.04	0.01	0.11	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.14	0.35	0.12	0.21	0.52	0.30	0.10
C2'	0.01	0.20	0.00	0.00	0.09	0.02	0.03	0.10	0.07	0.11	0.17	0.20	0.04	0.07	0.00	0.01	0.08	0.02	0.32	0.40	0.20	0.33
C3'	0.01	0.22	0.00	0.00	0.19	0.00	0.22	0.02	0.24	0.17	0.26	0.20	0.25	0.20	0.14	0.02	0.01	0.01	0.02	0.04	0.22	0.13
C4	0.01	0.00	0.09	0.19	0.00	0.07	0.00	0.14	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.16	0.24	0.08	0.25	0.54	0.20	0.14
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.07	0.00	0.12	0.01	0.11	0.18	0.09	0.04	0.13	0.17	0.10	0.18	0.02	0.01	0.01	0.04	0.17	0.05
C5	0.01	0.01	0.03	0.22	0.00	0.12	0.00	0.22	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.22	0.23	0.05	0.25	0.60	0.30	0.11
C5'	0.00	0.11	0.10	0.02	0.14	0.01	0.22	0.00	0.22	0.25	0.19	0.08	0.26	0.28	0.14	0.07	0.08	0.01	0.01	0.04	0.20	0.02
C6	0.01	0.02	0.07	0.24	0.00	0.11	0.00	0.22	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.24	0.27	0.07	0.23	0.59	0.39	0.07
C8	0.00	0.00	0.11	0.17	0.00	0.18	0.00	0.25	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.19	0.13	0.06	0.31	0.63	0.10	0.20
N1	0.03	0.00	0.17	0.26	0.02	0.09	0.02	0.19	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.18	0.33	0.08	0.19	0.53	0.40	0.05
N3	0.02	0.00	0.20	0.20	0.00	0.04	0.01	0.08	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.11	0.33	0.12	0.22	0.49	0.21	0.13
N6	0.01	0.02	0.04	0.25	0.00	0.13	0.00	0.26	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.26	0.27	0.06	0.23	0.62	0.44	0.05
N7	0.00	0.01	0.07	0.20	0.00	0.17	0.00	0.28	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.24	0.18	0.03	0.28	0.65	0.25	0.14
N9	0.00	0.00	0.00	0.14	0.00	0.10	0.00	0.14	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.13	0.15	0.02	0.28	0.54	0.07	0.20
O2'	0.01	0.14	0.01	0.02	0.16	0.18	0.22	0.07	0.24	0.19	0.18	0.11	0.26	0.24	0.13	0.00	0.11	0.19	0.16	0.25	0.18	0.23
O3'	0.19	0.35	0.08	0.01	0.24	0.02	0.23	0.08	0.27	0.13	0.33	0.33	0.27	0.18	0.15	0.11	0.00	0.12	0.29	0.39	0.51	0.36
O4'	0.01	0.12	0.02	0.01	0.08	0.01	0.05	0.01	0.07	0.06	0.08	0.12	0.06	0.03	0.02	0.19	0.12	0.00	0.21	0.34	0.16	0.16
O5'	0.30	0.21	0.32	0.02	0.25	0.01	0.25	0.01	0.23	0.31	0.19	0.22	0.23	0.28	0.28	0.16	0.29	0.21	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.44	0.52	0.40	0.04	0.54	0.04	0.60	0.04	0.59	0.63	0.53	0.49	0.62	0.65	0.54	0.25	0.39	0.34	0.01	0.00	0.03	0.01
OP2	0.10	0.30	0.20	0.22	0.20	0.17	0.30	0.20	0.39	0.10	0.40	0.21	0.44	0.25	0.07	0.18	0.51	0.16	0.01	0.03	0.00	0.00
P	0.24	0.10	0.33	0.13	0.14	0.05	0.11	0.02	0.07	0.20	0.05	0.13	0.05	0.14	0.20	0.23	0.36	0.16	0.01	0.01	0.00	0.00