Doublet Group distance statistics: 49005

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.005, 0.017, 0.029, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.017 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.003, 0.018, 0.032, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.018 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.009, 0.030, 0.051, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.030 std_dev=0.021
C1'	A	0, 0.011, 0.036, 0.062, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.036 std_dev=0.026
C6	A	0, 0.011, 0.040, 0.068, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.040 std_dev=0.028
C4	A	0, 0.013, 0.045, 0.077, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.045 std_dev=0.032
C2	A	0, 0.013, 0.045, 0.078, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.045 std_dev=0.032
O2	A	0, 0.027, 0.091, 0.156, 0.143 max_d=0.143 avg_d=0.091 std_dev=0.065
O4	A	0, 0.066, 0.225, 0.384, 0.338 max_d=0.338 avg_d=0.225 std_dev=0.159
O4'	B	0, 0.094, 0.320, 0.546, 0.489 max_d=0.489 avg_d=0.320 std_dev=0.226
C1'	B	0, 0.110, 0.393, 0.675, 0.655 max_d=0.655 avg_d=0.393 std_dev=0.283
N3	B	0, 0.117, 0.411, 0.705, 0.669 max_d=0.669 avg_d=0.411 std_dev=0.294
C4	B	0, 0.138, 0.475, 0.811, 0.746 max_d=0.746 avg_d=0.475 std_dev=0.337
C2	B	0, 0.148, 0.506, 0.863, 0.775 max_d=0.775 avg_d=0.506 std_dev=0.358
C4'	B	0, 0.145, 0.506, 0.868, 0.823 max_d=0.823 avg_d=0.506 std_dev=0.362
C2'	B	0, 0.130, 0.493, 0.856, 0.865 max_d=0.865 avg_d=0.493 std_dev=0.363
O2'	B	0, 0.099, 0.471, 0.843, 0.910 max_d=0.910 avg_d=0.471 std_dev=0.372
N9	B	0, 0.154, 0.528, 0.901, 0.801 max_d=0.801 avg_d=0.528 std_dev=0.373
C3'	B	0, 0.147, 0.528, 0.910, 0.886 max_d=0.886 avg_d=0.528 std_dev=0.381
N1	B	0, 0.167, 0.570, 0.973, 0.860 max_d=0.860 avg_d=0.570 std_dev=0.403
O5'	B	0, 0.178, 0.609, 1.041, 0.943 max_d=0.943 avg_d=0.609 std_dev=0.432
O3'	B	0, 0.135, 0.572, 1.010, 1.062 max_d=1.062 avg_d=0.572 std_dev=0.438
C5	B	0, 0.186, 0.636, 1.086, 0.979 max_d=0.979 avg_d=0.636 std_dev=0.450
C6	B	0, 0.187, 0.639, 1.091, 0.970 max_d=0.970 avg_d=0.639 std_dev=0.452
N6	B	0, 0.215, 0.738, 1.261, 1.149 max_d=1.149 avg_d=0.738 std_dev=0.523
C8	B	0, 0.217, 0.756, 1.296, 1.217 max_d=1.217 avg_d=0.756 std_dev=0.539
O4'	A	0, 0.231, 0.789, 1.347, 1.203 max_d=1.203 avg_d=0.789 std_dev=0.558
N7	B	0, 0.236, 0.823, 1.410, 1.327 max_d=1.327 avg_d=0.823 std_dev=0.587
O5'	A	0, 0.249, 0.849, 1.449, 1.274 max_d=1.274 avg_d=0.849 std_dev=0.600
P	A	0, 0.250, 0.871, 1.493, 1.407 max_d=1.407 avg_d=0.871 std_dev=0.621
OP2	A	0, 0.246, 0.885, 1.523, 1.482 max_d=1.482 avg_d=0.885 std_dev=0.638
C5'	B	0, 0.093, 0.753, 1.414, 1.608 max_d=1.608 avg_d=0.753 std_dev=0.660
C2'	A	0, 0.299, 1.021, 1.743, 1.555 max_d=1.555 avg_d=1.021 std_dev=0.722
P	B	0, 0.299, 1.066, 1.833, 1.772 max_d=1.772 avg_d=1.066 std_dev=0.767
C3'	A	0, 0.325, 1.117, 1.908, 1.737 max_d=1.737 avg_d=1.117 std_dev=0.791
C4'	A	0, 0.329, 1.124, 1.920, 1.731 max_d=1.731 avg_d=1.124 std_dev=0.796
O3'	A	0, 0.382, 1.309, 2.237, 2.035 max_d=2.035 avg_d=1.309 std_dev=0.928
OP1	A	0, 0.389, 1.339, 2.289, 2.100 max_d=2.100 avg_d=1.339 std_dev=0.950
C5'	A	0, 0.479, 1.639, 2.799, 2.513 max_d=2.513 avg_d=1.639 std_dev=1.160
O2'	A	0, 0.496, 1.695, 2.893, 2.566 max_d=2.566 avg_d=1.695 std_dev=1.199
OP2	B	0, 0.504, 1.739, 2.974, 2.749 max_d=2.749 avg_d=1.739 std_dev=1.235
OP1	B	0, 0.732, 2.500, 4.268, 3.789 max_d=3.789 avg_d=2.500 std_dev=1.768

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.01	0.00	0.09	0.08	0.11	0.06
C2	0.01	0.00	0.13	0.03	0.02	0.08	0.02	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.16	0.12	0.03	0.03	0.17	0.16	0.29	0.21
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.03	0.01	0.07	0.14	0.11	0.01	0.10	0.21	0.00	0.02	0.04	0.01	0.20	0.46	0.34	0.34
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.11	0.00	0.19	0.01	0.20	0.08	0.04	0.12	0.01	0.00	0.09	0.00	0.23	0.37	0.26	0.31
C4	0.00	0.02	0.03	0.11	0.00	0.04	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.03	0.20	0.03	0.00	0.04	0.17	0.20	0.29	0.22
C4'	0.00	0.08	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.07	0.02	0.07	0.15	0.16	0.02	0.06	0.00	0.02	0.04	0.03	0.03
C5	0.01	0.02	0.07	0.19	0.00	0.05	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.03	0.17	0.05	0.01	0.02	0.17	0.17	0.26	0.19
C5'	0.06	0.18	0.14	0.01	0.13	0.01	0.05	0.00	0.04	0.06	0.19	0.29	0.02	0.09	0.17	0.01	0.01	0.18	0.14	0.01
C6	0.01	0.01	0.11	0.20	0.01	0.07	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.02	0.14	0.05	0.01	0.01	0.17	0.13	0.23	0.17
N1	0.00	0.00	0.01	0.08	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.08	0.01	0.01	0.16	0.10	0.22	0.16
N3	0.01	0.01	0.10	0.04	0.01	0.07	0.01	0.19	0.02	0.01	0.00	0.02	0.19	0.09	0.02	0.04	0.17	0.21	0.31	0.24
O2	0.01	0.01	0.21	0.12	0.03	0.15	0.03	0.29	0.02	0.01	0.02	0.00	0.13	0.19	0.05	0.02	0.16	0.18	0.30	0.23
O2'	0.01	0.16	0.00	0.01	0.20	0.16	0.17	0.02	0.14	0.12	0.19	0.13	0.00	0.06	0.21	0.10	0.04	0.48	0.29	0.27
O3'	0.17	0.12	0.02	0.00	0.03	0.02	0.05	0.09	0.05	0.08	0.09	0.19	0.06	0.00	0.03	0.14	0.18	0.31	0.21	0.24
O4	0.01	0.03	0.04	0.09	0.00	0.06	0.01	0.17	0.01	0.01	0.02	0.05	0.21	0.03	0.00	0.05	0.16	0.20	0.28	0.22
O4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.04	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.10	0.14	0.05	0.00	0.24	0.20	0.28	0.24
O5'	0.09	0.17	0.20	0.23	0.17	0.02	0.17	0.01	0.17	0.16	0.17	0.16	0.04	0.18	0.16	0.24	0.00	0.00	0.01	0.01
OP1	0.08	0.16	0.46	0.37	0.20	0.04	0.17	0.18	0.13	0.10	0.21	0.18	0.48	0.31	0.20	0.20	0.00	0.00	0.02	0.01
OP2	0.11	0.29	0.34	0.26	0.29	0.03	0.26	0.14	0.23	0.22	0.31	0.30	0.29	0.21	0.28	0.28	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.06	0.21	0.34	0.31	0.22	0.03	0.19	0.01	0.17	0.16	0.24	0.23	0.27	0.24	0.22	0.24	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.15	0.13	0.15	0.07	0.15	0.17	0.32	0.07	0.31	0.10	0.08	0.13	0.34	0.17	0.11	0.14	0.11	0.17	0.75	0.33	0.29
C2	0.15	0.08	0.17	0.17	0.14	0.13	0.23	0.18	0.16	0.30	0.01	0.03	0.19	0.32	0.21	0.17	0.17	0.13	0.16	0.86	0.33	0.37
C2'	0.03	0.13	0.03	0.05	0.04	0.08	0.22	0.24	0.19	0.29	0.01	0.13	0.35	0.40	0.10	0.06	0.05	0.05	0.11	0.60	0.37	0.19
C3'	0.28	0.28	0.27	0.30	0.23	0.36	0.11	0.44	0.09	0.11	0.18	0.31	0.07	0.08	0.21	0.28	0.31	0.33	0.32	0.31	0.60	0.15
C4	0.15	0.06	0.19	0.19	0.18	0.13	0.26	0.20	0.26	0.28	0.14	0.07	0.30	0.32	0.20	0.21	0.20	0.13	0.17	0.82	0.33	0.34
C4'	0.35	0.45	0.35	0.37	0.39	0.37	0.27	0.43	0.26	0.19	0.36	0.47	0.15	0.15	0.32	0.34	0.37	0.36	0.27	0.48	0.46	0.08
C5	0.13	0.05	0.16	0.17	0.14	0.13	0.24	0.29	0.22	0.28	0.07	0.03	0.29	0.32	0.18	0.17	0.17	0.11	0.16	0.77	0.33	0.30
C5'	0.55	0.58	0.56	0.57	0.52	0.56	0.35	0.56	0.33	0.29	0.45	0.63	0.20	0.22	0.47	0.57	0.57	0.56	0.41	0.49	0.38	0.07
C6	0.13	0.09	0.15	0.16	0.12	0.14	0.22	0.33	0.17	0.29	0.01	0.03	0.25	0.33	0.18	0.15	0.16	0.11	0.17	0.75	0.33	0.28
N1	0.13	0.11	0.15	0.16	0.12	0.13	0.22	0.28	0.15	0.31	0.04	0.04	0.20	0.34	0.19	0.14	0.16	0.11	0.16	0.80	0.32	0.32
N3	0.16	0.04	0.19	0.18	0.18	0.14	0.26	0.15	0.23	0.28	0.11	0.06	0.25	0.31	0.21	0.21	0.19	0.13	0.16	0.86	0.33	0.37
O2	0.15	0.11	0.16	0.15	0.11	0.13	0.18	0.11	0.10	0.28	0.03	0.06	0.13	0.28	0.20	0.16	0.15	0.13	0.15	0.90	0.34	0.40
O2'	0.32	0.03	0.36	0.44	0.29	0.41	0.47	0.54	0.36	0.65	0.12	0.09	0.49	0.73	0.42	0.27	0.44	0.34	0.54	0.92	0.33	0.57
O3'	0.39	0.47	0.40	0.44	0.42	0.46	0.35	0.57	0.35	0.29	0.41	0.48	0.25	0.27	0.37	0.38	0.44	0.41	0.41	0.14	0.76	0.27
O4	0.18	0.14	0.22	0.22	0.21	0.16	0.29	0.18	0.31	0.28	0.24	0.13	0.34	0.33	0.22	0.25	0.24	0.15	0.19	0.83	0.33	0.36
O4'	0.10	0.42	0.12	0.12	0.27	0.12	0.20	0.29	0.27	0.08	0.37	0.37	0.18	0.07	0.12	0.09	0.12	0.07	0.02	0.72	0.35	0.24
O5'	0.13	0.16	0.14	0.22	0.11	0.27	0.03	0.36	0.04	0.04	0.11	0.18	0.02	0.05	0.08	0.13	0.22	0.23	0.30	0.63	0.28	0.09
OP1	0.01	0.06	0.02	0.15	0.03	0.23	0.05	0.41	0.05	0.06	0.04	0.06	0.08	0.08	0.01	0.06	0.12	0.16	0.37	0.55	0.29	0.04
OP2	0.20	0.19	0.23	0.15	0.23	0.15	0.26	0.21	0.25	0.28	0.21	0.20	0.26	0.28	0.25	0.24	0.14	0.09	0.09	0.85	0.28	0.27
P	0.06	0.08	0.07	0.11	0.06	0.19	0.08	0.33	0.07	0.11	0.06	0.08	0.10	0.12	0.08	0.09	0.07	0.11	0.24	0.71	0.25	0.14

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.09	0.03	0.02	0.04	0.06	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.59	0.17	0.24
C2	0.05	0.00	0.10	0.11	0.01	0.03	0.02	0.25	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.13	0.13	0.06	0.12	0.51	0.40	0.19
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.02	0.02	0.04	0.04	0.06	0.07	0.10	0.03	0.04	0.01	0.00	0.00	0.01	0.17	0.41	0.11	0.18
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.05	0.00	0.05	0.02	0.07	0.10	0.09	0.10	0.07	0.08	0.03	0.01	0.00	0.02	0.21	0.19	0.03	0.13
C4	0.03	0.01	0.05	0.05	0.00	0.07	0.00	0.28	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.05	0.02	0.12	0.49	0.38	0.19
C4'	0.01	0.03	0.02	0.00	0.07	0.00	0.13	0.01	0.13	0.18	0.08	0.03	0.17	0.19	0.09	0.09	0.01	0.00	0.02	0.33	0.25	0.16
C5	0.02	0.02	0.02	0.05	0.00	0.13	0.00	0.40	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.09	0.42	0.50	0.17
C5'	0.09	0.25	0.04	0.02	0.28	0.01	0.40	0.00	0.41	0.42	0.34	0.20	0.47	0.47	0.26	0.08	0.06	0.02	0.01	0.12	0.32	0.03
C6	0.03	0.01	0.04	0.07	0.00	0.13	0.01	0.41	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.08	0.05	0.00	0.07	0.41	0.53	0.15
C8	0.02	0.02	0.06	0.10	0.01	0.18	0.01	0.42	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.03	0.10	0.06	0.10	0.40	0.44	0.18
N1	0.04	0.00	0.07	0.09	0.00	0.08	0.01	0.34	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.11	0.09	0.03	0.09	0.46	0.48	0.16
N3	0.06	0.00	0.10	0.10	0.00	0.03	0.01	0.20	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.13	0.12	0.06	0.14	0.54	0.34	0.21
N6	0.02	0.02	0.03	0.07	0.00	0.17	0.01	0.47	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.03	0.01	0.07	0.04	0.03	0.05	0.36	0.59	0.13
N7	0.01	0.02	0.04	0.08	0.01	0.19	0.01	0.47	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.00	0.00	0.03	0.08	0.05	0.06	0.35	0.56	0.16
N9	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.09	0.01	0.26	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.13	0.50	0.31	0.21
O2'	0.01	0.13	0.00	0.01	0.07	0.09	0.05	0.08	0.08	0.03	0.11	0.13	0.07	0.03	0.02	0.00	0.02	0.03	0.12	0.49	0.19	0.19
O3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.05	0.01	0.02	0.06	0.05	0.10	0.09	0.12	0.04	0.08	0.02	0.02	0.00	0.02	0.16	0.04	0.13	0.05
O4'	0.01	0.06	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.06	0.03	0.06	0.03	0.05	0.01	0.03	0.02	0.00	0.08	0.63	0.19	0.27
O5'	0.12	0.12	0.17	0.21	0.12	0.02	0.09	0.01	0.07	0.10	0.09	0.14	0.05	0.06	0.13	0.12	0.16	0.08	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.59	0.51	0.41	0.19	0.49	0.33	0.42	0.12	0.41	0.40	0.46	0.54	0.36	0.35	0.50	0.49	0.04	0.63	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.17	0.40	0.11	0.03	0.38	0.25	0.50	0.32	0.53	0.44	0.48	0.34	0.59	0.56	0.31	0.19	0.13	0.19	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.24	0.19	0.18	0.13	0.19	0.16	0.17	0.03	0.15	0.18	0.16	0.21	0.13	0.16	0.21	0.19	0.05	0.27	0.01	0.00	0.00	0.00