Doublet Group distance statistics: 49006

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.001, 0.003, 0.003 max_d=0.003 avg_d=0.001 std_dev=0.001
N1	A	0, 0.000, 0.008, 0.016, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.008 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.000, 0.009, 0.019, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.000, 0.012, 0.025, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.012 std_dev=0.012
O4	A	0, 0.000, 0.014, 0.028, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.014
O2	A	0, 0.000, 0.016, 0.031, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.016 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.000, 0.019, 0.037, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.019 std_dev=0.019
N9	B	0, 0.000, 0.168, 0.335, 0.335 max_d=0.335 avg_d=0.168 std_dev=0.168
C4	B	0, 0.000, 0.226, 0.452, 0.452 max_d=0.452 avg_d=0.226 std_dev=0.226
O4'	A	0, 0.000, 0.255, 0.510, 0.510 max_d=0.510 avg_d=0.255 std_dev=0.255
C2'	A	0, 0.000, 0.284, 0.568, 0.568 max_d=0.568 avg_d=0.284 std_dev=0.284
O2'	A	0, 0.000, 0.305, 0.609, 0.609 max_d=0.609 avg_d=0.305 std_dev=0.305
C3'	B	0, 0.000, 0.315, 0.631, 0.631 max_d=0.631 avg_d=0.315 std_dev=0.315
C1'	B	0, 0.000, 0.319, 0.639, 0.639 max_d=0.639 avg_d=0.319 std_dev=0.319
C6	B	0, 0.000, 0.425, 0.849, 0.849 max_d=0.849 avg_d=0.425 std_dev=0.425
C4'	A	0, 0.000, 0.444, 0.889, 0.889 max_d=0.889 avg_d=0.444 std_dev=0.444
C3'	A	0, 0.000, 0.452, 0.904, 0.904 max_d=0.904 avg_d=0.452 std_dev=0.452
C5	B	0, 0.000, 0.456, 0.911, 0.911 max_d=0.911 avg_d=0.456 std_dev=0.456
N1	B	0, 0.000, 0.505, 1.009, 1.009 max_d=1.009 avg_d=0.505 std_dev=0.505
O3'	A	0, 0.000, 0.552, 1.104, 1.104 max_d=1.104 avg_d=0.552 std_dev=0.552
N3	B	0, 0.000, 0.745, 1.489, 1.489 max_d=1.489 avg_d=0.745 std_dev=0.745
C8	B	0, 0.000, 0.762, 1.524, 1.524 max_d=1.524 avg_d=0.762 std_dev=0.762
N6	B	0, 0.000, 0.785, 1.569, 1.569 max_d=1.569 avg_d=0.785 std_dev=0.785
C5'	A	0, 0.000, 0.795, 1.589, 1.589 max_d=1.589 avg_d=0.795 std_dev=0.795
C2	B	0, 0.000, 0.832, 1.665, 1.665 max_d=1.665 avg_d=0.832 std_dev=0.832
C2'	B	0, 0.000, 0.915, 1.829, 1.829 max_d=1.829 avg_d=0.915 std_dev=0.915
N7	B	0, 0.000, 0.955, 1.910, 1.910 max_d=1.910 avg_d=0.955 std_dev=0.955
O5'	A	0, 0.000, 1.000, 2.001, 2.001 max_d=2.001 avg_d=1.000 std_dev=1.000
O3'	B	0, 0.000, 1.044, 2.088, 2.088 max_d=2.088 avg_d=1.044 std_dev=1.044
C4'	B	0, 0.000, 1.365, 2.730, 2.730 max_d=2.730 avg_d=1.365 std_dev=1.365
O4'	B	0, 0.000, 1.415, 2.830, 2.830 max_d=2.830 avg_d=1.415 std_dev=1.415
P	A	0, 0.000, 1.504, 3.009, 3.009 max_d=3.009 avg_d=1.504 std_dev=1.504
OP2	A	0, 0.000, 1.723, 3.445, 3.445 max_d=3.445 avg_d=1.723 std_dev=1.723
OP1	A	0, 0.000, 1.742, 3.484, 3.484 max_d=3.484 avg_d=1.742 std_dev=1.742
O2'	B	0, 0.000, 2.052, 4.103, 4.103 max_d=4.103 avg_d=2.052 std_dev=2.052
C5'	B	0, 0.000, 2.600, 5.200, 5.200 max_d=5.200 avg_d=2.600 std_dev=2.600
O5'	B	0, 0.000, 2.982, 5.964, 5.964 max_d=5.964 avg_d=2.982 std_dev=2.982
P	B	0, 0.000, 4.540, 9.080, 9.080 max_d=9.080 avg_d=4.540 std_dev=4.540
OP2	B	0, 0.000, 5.058, 10.116, 10.116 max_d=10.116 avg_d=5.058 std_dev=5.058
OP1	B	0, 0.000, 5.165, 10.331, 10.331 max_d=10.331 avg_d=5.165 std_dev=5.165

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.05	0.05	0.02	0.02
C2	0.02	0.00	0.10	0.12	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.13	0.01	0.02	0.12	0.10	0.09	0.08
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.04	0.00	0.02	0.01	0.05	0.02	0.08	0.15	0.00	0.02	0.04	0.00	0.06	0.08	0.09	0.05
C3'	0.02	0.12	0.00	0.00	0.10	0.00	0.06	0.01	0.03	0.07	0.12	0.13	0.00	0.01	0.11	0.00	0.07	0.10	0.12	0.08
C4	0.02	0.01	0.04	0.10	0.00	0.07	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.11	0.00	0.01	0.20	0.22	0.23	0.22
C4'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.08	0.05	0.05	0.01	0.02	0.02	0.07	0.00	0.02	0.04	0.00	0.01
C5	0.02	0.01	0.02	0.06	0.01	0.09	0.00	0.17	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.04	0.23	0.26	0.28	0.28
C5'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.14	0.01	0.17	0.00	0.16	0.09	0.09	0.02	0.03	0.00	0.15	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00
C6	0.01	0.00	0.05	0.03	0.01	0.08	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.03	0.01	0.05	0.21	0.22	0.22	0.23
N1	0.01	0.00	0.02	0.07	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.01	0.01	0.13	0.13	0.11	0.11
N3	0.02	0.00	0.08	0.12	0.00	0.05	0.01	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.13	0.00	0.01	0.15	0.15	0.15	0.13
O2	0.02	0.00	0.15	0.13	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.11	0.15	0.01	0.04	0.08	0.04	0.04	0.01
O2'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.00	0.02	0.04	0.03	0.05	0.00	0.03	0.11	0.00	0.01	0.00	0.05	0.06	0.09	0.08	0.05
O3'	0.02	0.13	0.02	0.01	0.11	0.02	0.06	0.00	0.03	0.07	0.13	0.15	0.01	0.00	0.12	0.02	0.07	0.12	0.15	0.09
O4	0.02	0.01	0.04	0.11	0.00	0.07	0.00	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.12	0.00	0.01	0.21	0.23	0.26	0.24
O4'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.04	0.05	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.09	0.06
O5'	0.05	0.12	0.06	0.07	0.20	0.02	0.23	0.00	0.21	0.13	0.15	0.08	0.06	0.07	0.21	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.05	0.10	0.08	0.10	0.22	0.04	0.26	0.03	0.22	0.13	0.15	0.04	0.09	0.12	0.23	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.02	0.09	0.09	0.12	0.23	0.00	0.28	0.00	0.22	0.11	0.15	0.04	0.08	0.15	0.26	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.02	0.08	0.05	0.08	0.22	0.01	0.28	0.00	0.23	0.11	0.13	0.01	0.05	0.09	0.24	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.53	0.31	0.13	0.10	0.15	0.20	0.02	0.05	0.44	0.35	0.42	0.34	0.59	0.07	0.23	0.30	0.26	0.37	1.47	0.02	0.55
C2	0.13	0.54	0.41	0.17	0.13	0.23	0.19	0.05	0.03	0.52	0.34	0.47	0.25	0.65	0.07	0.38	0.27	0.37	0.37	1.37	0.01	0.51
C2'	0.15	0.42	0.16	0.03	0.13	0.20	0.09	0.10	0.00	0.25	0.30	0.34	0.27	0.38	0.02	0.11	0.33	0.27	0.57	1.79	0.34	0.84
C3'	0.28	0.61	0.03	0.09	0.29	0.21	0.09	0.03	0.19	0.09	0.51	0.51	0.07	0.19	0.17	0.19	0.50	0.27	0.52	1.67	0.19	0.72
C4	0.17	0.54	0.29	0.18	0.09	0.03	0.25	0.47	0.12	0.50	0.25	0.52	0.32	0.60	0.09	0.04	0.46	0.08	0.19	0.49	0.84	0.27
C4'	0.23	0.71	0.10	0.02	0.25	0.16	0.00	0.09	0.15	0.24	0.56	0.57	0.13	0.35	0.09	0.07	0.45	0.24	0.35	1.44	0.08	0.49
C5	0.14	0.58	0.19	0.16	0.05	0.14	0.30	0.62	0.19	0.49	0.25	0.51	0.43	0.62	0.11	0.21	0.49	0.06	0.29	0.40	0.98	0.40
C5'	0.35	0.87	0.05	0.08	0.38	0.17	0.11	0.17	0.26	0.14	0.70	0.72	0.03	0.24	0.20	0.33	0.62	0.25	0.26	1.24	0.31	0.31
C6	0.12	0.58	0.23	0.16	0.06	0.06	0.30	0.45	0.18	0.49	0.30	0.47	0.46	0.65	0.10	0.08	0.43	0.02	0.08	0.76	0.67	0.10
N1	0.11	0.56	0.32	0.16	0.09	0.10	0.24	0.15	0.09	0.50	0.34	0.46	0.37	0.67	0.09	0.18	0.33	0.21	0.21	1.20	0.23	0.31
N3	0.16	0.53	0.41	0.18	0.13	0.18	0.20	0.09	0.05	0.54	0.30	0.50	0.24	0.62	0.07	0.29	0.33	0.33	0.18	1.02	0.30	0.23
O2	0.12	0.50	0.47	0.16	0.14	0.37	0.12	0.33	0.04	0.48	0.35	0.44	0.15	0.57	0.05	0.61	0.17	0.53	0.63	1.74	0.40	0.87
O2'	0.01	0.26	0.32	0.12	0.00	0.20	0.18	0.21	0.08	0.35	0.17	0.19	0.28	0.45	0.10	0.40	0.16	0.27	0.68	2.02	0.61	1.05
O3'	0.28	0.53	0.08	0.14	0.29	0.25	0.15	0.14	0.25	0.01	0.47	0.46	0.07	0.05	0.20	0.20	0.49	0.30	0.67	1.92	0.44	0.95
O4	0.19	0.46	0.26	0.19	0.07	0.11	0.23	0.65	0.12	0.45	0.19	0.48	0.28	0.51	0.09	0.16	0.53	0.01	0.41	0.10	1.15	0.58
O4'	0.14	0.65	0.27	0.14	0.15	0.10	0.14	0.17	0.02	0.41	0.46	0.51	0.28	0.54	0.03	0.10	0.37	0.20	0.21	1.24	0.26	0.31
O5'	0.48	1.04	0.22	0.20	0.51	0.20	0.23	0.23	0.37	0.02	0.84	0.87	0.06	0.12	0.33	0.61	0.78	0.28	0.19	1.04	0.50	0.14
OP1	0.59	1.17	0.38	0.30	0.63	0.20	0.36	0.31	0.51	0.10	0.97	1.00	0.23	0.02	0.44	0.86	0.92	0.29	0.11	0.86	0.70	0.02
OP2	0.68	1.33	0.47	0.35	0.72	0.21	0.41	0.39	0.55	0.15	1.06	1.15	0.23	0.05	0.51	1.04	1.03	0.30	0.02	0.55	0.97	0.26
P	0.57	1.20	0.32	0.26	0.61	0.20	0.31	0.33	0.46	0.03	0.96	1.02	0.15	0.07	0.40	0.80	0.90	0.29	0.06	0.77	0.77	0.09

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.00	0.00	0.01	0.17	0.00	0.39	0.98	0.18	0.51
C2	0.04	0.00	0.22	0.01	0.01	0.40	0.01	0.71	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.69	0.42	0.48	0.26	0.50	0.56	0.20
C2'	0.00	0.22	0.00	0.00	0.11	0.01	0.03	0.09	0.08	0.14	0.16	0.23	0.04	0.09	0.01	0.00	0.03	0.00	0.51	0.84	0.12	0.53
C3'	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.13	0.23	0.20	0.07
C4	0.02	0.01	0.11	0.00	0.00	0.18	0.00	0.27	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.34	0.27	0.25	0.25	1.14	0.01	0.43
C4'	0.00	0.40	0.01	0.00	0.18	0.00	0.06	0.00	0.15	0.22	0.30	0.39	0.09	0.14	0.01	0.04	0.02	0.00	0.01	0.28	0.07	0.03
C5	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.06	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.16	0.20	0.08	0.52	1.61	0.32	0.79
C5'	0.03	0.71	0.09	0.00	0.27	0.00	0.08	0.00	0.26	0.42	0.54	0.65	0.14	0.29	0.06	0.05	0.07	0.01	0.01	0.20	0.04	0.02
C6	0.02	0.00	0.08	0.02	0.01	0.15	0.00	0.26	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.31	0.27	0.18	0.33	1.41	0.11	0.57
C8	0.01	0.01	0.14	0.01	0.00	0.22	0.00	0.42	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.31	0.03	0.27	1.04	2.17	0.90	1.40
N1	0.03	0.00	0.16	0.00	0.01	0.30	0.01	0.54	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.54	0.36	0.35	0.02	0.89	0.31	0.11
N3	0.03	0.00	0.23	0.02	0.00	0.39	0.00	0.65	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.66	0.41	0.50	0.21	0.52	0.48	0.14
N6	0.02	0.00	0.04	0.02	0.01	0.09	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.21	0.23	0.10	0.48	1.68	0.31	0.79
N7	0.00	0.01	0.09	0.02	0.00	0.14	0.00	0.29	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.16	0.07	0.16	0.94	2.19	0.83	1.34
N9	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.16	0.01	0.58	1.45	0.36	0.79
O2'	0.01	0.69	0.00	0.00	0.34	0.04	0.16	0.05	0.31	0.31	0.54	0.66	0.21	0.16	0.02	0.00	0.02	0.02	0.41	0.71	0.06	0.46
O3'	0.17	0.42	0.03	0.00	0.27	0.02	0.20	0.07	0.27	0.03	0.36	0.41	0.23	0.07	0.16	0.02	0.00	0.14	0.20	0.18	0.43	0.25
O4'	0.00	0.48	0.00	0.00	0.25	0.00	0.08	0.01	0.18	0.27	0.35	0.50	0.10	0.16	0.01	0.02	0.14	0.00	0.22	0.81	0.12	0.33
O5'	0.39	0.26	0.51	0.13	0.25	0.01	0.52	0.01	0.33	1.04	0.02	0.21	0.48	0.94	0.58	0.41	0.20	0.22	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.98	0.50	0.84	0.23	1.14	0.28	1.61	0.20	1.41	2.17	0.89	0.52	1.68	2.19	1.45	0.71	0.18	0.81	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.18	0.56	0.12	0.20	0.01	0.07	0.32	0.04	0.11	0.90	0.31	0.48	0.31	0.83	0.36	0.06	0.43	0.12	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.51	0.20	0.53	0.07	0.43	0.03	0.79	0.02	0.57	1.40	0.11	0.14	0.79	1.34	0.79	0.46	0.25	0.33	0.00	0.00	0.00	0.00