Doublet Group distance statistics: 49010

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.000, 0.012, 0.025, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.012 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.000, 0.015, 0.029, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.015 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.000, 0.016, 0.031, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.016 std_dev=0.016
C6	A	0, 0.000, 0.040, 0.080, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.040 std_dev=0.040
C4	A	0, 0.000, 0.041, 0.082, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.041 std_dev=0.041
C2	A	0, 0.000, 0.041, 0.083, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.041 std_dev=0.041
C1'	A	0, 0.000, 0.043, 0.086, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.043 std_dev=0.043
O2	A	0, 0.000, 0.110, 0.219, 0.219 max_d=0.219 avg_d=0.110 std_dev=0.110
O4	A	0, 0.000, 0.167, 0.335, 0.335 max_d=0.335 avg_d=0.167 std_dev=0.167
N7	B	0, 0.000, 0.345, 0.691, 0.691 max_d=0.691 avg_d=0.345 std_dev=0.345
C5	B	0, 0.000, 0.352, 0.705, 0.705 max_d=0.705 avg_d=0.352 std_dev=0.352
N9	B	0, 0.000, 0.358, 0.715, 0.715 max_d=0.715 avg_d=0.358 std_dev=0.358
C1'	B	0, 0.000, 0.371, 0.743, 0.743 max_d=0.743 avg_d=0.371 std_dev=0.371
C2'	B	0, 0.000, 0.387, 0.775, 0.775 max_d=0.775 avg_d=0.387 std_dev=0.387
C3'	B	0, 0.000, 0.396, 0.792, 0.792 max_d=0.792 avg_d=0.396 std_dev=0.396
C4'	B	0, 0.000, 0.406, 0.813, 0.813 max_d=0.813 avg_d=0.406 std_dev=0.406
C8	B	0, 0.000, 0.437, 0.873, 0.873 max_d=0.873 avg_d=0.437 std_dev=0.437
O4'	B	0, 0.000, 0.439, 0.878, 0.878 max_d=0.878 avg_d=0.439 std_dev=0.439
N6	B	0, 0.000, 0.453, 0.906, 0.906 max_d=0.906 avg_d=0.453 std_dev=0.453
C4	B	0, 0.000, 0.460, 0.921, 0.921 max_d=0.921 avg_d=0.460 std_dev=0.460
O3'	B	0, 0.000, 0.496, 0.992, 0.992 max_d=0.992 avg_d=0.496 std_dev=0.496
OP1	B	0, 0.000, 0.506, 1.013, 1.013 max_d=1.013 avg_d=0.506 std_dev=0.506
O5'	B	0, 0.000, 0.508, 1.015, 1.015 max_d=1.015 avg_d=0.508 std_dev=0.508
P	B	0, 0.000, 0.529, 1.058, 1.058 max_d=1.058 avg_d=0.529 std_dev=0.529
O3'	A	0, 0.000, 0.534, 1.067, 1.067 max_d=1.067 avg_d=0.534 std_dev=0.534
C6	B	0, 0.000, 0.535, 1.070, 1.070 max_d=1.070 avg_d=0.535 std_dev=0.535
O2'	B	0, 0.000, 0.542, 1.083, 1.083 max_d=1.083 avg_d=0.542 std_dev=0.542
C5'	B	0, 0.000, 0.574, 1.148, 1.148 max_d=1.148 avg_d=0.574 std_dev=0.574
OP2	B	0, 0.000, 0.623, 1.246, 1.246 max_d=1.246 avg_d=0.623 std_dev=0.623
O4'	A	0, 0.000, 0.657, 1.313, 1.313 max_d=1.313 avg_d=0.657 std_dev=0.657
C3'	A	0, 0.000, 0.689, 1.378, 1.378 max_d=1.378 avg_d=0.689 std_dev=0.689
C2'	A	0, 0.000, 0.762, 1.524, 1.524 max_d=1.524 avg_d=0.762 std_dev=0.762
N3	B	0, 0.000, 0.778, 1.556, 1.556 max_d=1.556 avg_d=0.778 std_dev=0.778
C4'	A	0, 0.000, 0.798, 1.597, 1.597 max_d=1.597 avg_d=0.798 std_dev=0.798
N1	B	0, 0.000, 0.882, 1.763, 1.763 max_d=1.763 avg_d=0.882 std_dev=0.882
C2	B	0, 0.000, 0.976, 1.952, 1.952 max_d=1.952 avg_d=0.976 std_dev=0.976
OP2	A	0, 0.000, 1.149, 2.298, 2.298 max_d=2.298 avg_d=1.149 std_dev=1.149
O2'	A	0, 0.000, 1.362, 2.724, 2.724 max_d=2.724 avg_d=1.362 std_dev=1.362
C5'	A	0, 0.000, 1.398, 2.795, 2.795 max_d=2.795 avg_d=1.398 std_dev=1.398
O5'	A	0, 0.000, 1.512, 3.024, 3.024 max_d=3.024 avg_d=1.512 std_dev=1.512
P	A	0, 0.000, 1.960, 3.920, 3.920 max_d=3.920 avg_d=1.960 std_dev=1.960
OP1	A	0, 0.000, 2.665, 5.330, 5.330 max_d=5.330 avg_d=2.665 std_dev=2.665

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.16	0.01	0.00	0.04	0.58	0.01	0.19
C2	0.02	0.00	0.17	0.15	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.10	0.12	0.92	0.08	0.35
C2'	0.00	0.17	0.00	0.00	0.04	0.00	0.17	0.09	0.21	0.02	0.10	0.36	0.02	0.00	0.05	0.02	0.19	0.13	0.41	0.15
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.17	0.00	0.15	0.01	0.13	0.11	0.17	0.16	0.01	0.00	0.17	0.02	0.00	0.02	0.15	0.01
C4	0.02	0.01	0.04	0.17	0.00	0.10	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.31	0.02	0.00	0.07	0.29	1.38	0.21	0.63
C4'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.10	0.00	0.17	0.00	0.17	0.05	0.02	0.09	0.18	0.03	0.10	0.00	0.01	0.08	0.12	0.05
C5	0.02	0.02	0.17	0.15	0.00	0.17	0.00	0.23	0.00	0.01	0.00	0.02	0.45	0.00	0.01	0.18	0.36	1.49	0.24	0.71
C5'	0.01	0.04	0.09	0.01	0.13	0.00	0.23	0.00	0.22	0.05	0.02	0.13	0.09	0.16	0.15	0.02	0.01	0.17	0.25	0.02
C6	0.01	0.01	0.21	0.13	0.00	0.17	0.00	0.22	0.00	0.01	0.00	0.02	0.42	0.01	0.01	0.21	0.31	1.28	0.18	0.60
N1	0.01	0.01	0.02	0.11	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.03	0.18	0.08	0.01	0.03	0.16	0.94	0.09	0.38
N3	0.02	0.01	0.10	0.17	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.11	0.05	0.01	0.04	0.19	1.14	0.13	0.47
O2	0.04	0.01	0.36	0.16	0.01	0.09	0.02	0.13	0.02	0.03	0.01	0.00	0.32	0.07	0.01	0.20	0.05	0.70	0.04	0.24
O2'	0.01	0.02	0.02	0.01	0.31	0.18	0.45	0.09	0.42	0.18	0.11	0.32	0.00	0.02	0.36	0.09	0.12	0.15	0.38	0.11
O3'	0.16	0.07	0.00	0.00	0.02	0.03	0.00	0.16	0.01	0.08	0.05	0.07	0.02	0.00	0.02	0.08	0.14	0.04	0.03	0.08
O4	0.01	0.01	0.05	0.17	0.00	0.10	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.36	0.02	0.00	0.08	0.32	1.48	0.24	0.69
O4'	0.00	0.10	0.02	0.02	0.07	0.00	0.18	0.02	0.21	0.03	0.04	0.20	0.09	0.08	0.08	0.00	0.11	0.58	0.25	0.28
O5'	0.04	0.12	0.19	0.00	0.29	0.01	0.36	0.01	0.31	0.16	0.19	0.05	0.12	0.14	0.32	0.11	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.58	0.92	0.13	0.02	1.38	0.08	1.49	0.17	1.28	0.94	1.14	0.70	0.15	0.04	1.48	0.58	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.01	0.08	0.41	0.15	0.21	0.12	0.24	0.25	0.18	0.09	0.13	0.04	0.38	0.03	0.24	0.25	0.01	0.00	0.00	0.01
P	0.19	0.35	0.15	0.01	0.63	0.05	0.71	0.02	0.60	0.38	0.47	0.24	0.11	0.08	0.69	0.28	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.03	0.54	0.09	0.24	0.25	0.23	0.19	0.38	0.35	0.22	0.51	0.43	0.29	0.09	0.00	0.04	0.22	0.13	0.37	0.16	0.23	0.24
C2	0.09	0.67	0.07	0.19	0.24	0.24	0.19	0.36	0.40	0.23	0.63	0.49	0.34	0.11	0.05	0.05	0.15	0.21	0.28	0.11	0.09	0.14
C2'	0.39	0.60	0.27	0.11	0.42	0.22	0.21	0.01	0.27	0.06	0.47	0.61	0.11	0.09	0.29	0.45	0.12	0.39	0.15	0.05	0.38	0.18
C3'	0.51	0.82	0.39	0.23	0.69	0.26	0.63	0.06	0.68	0.41	0.78	0.77	0.60	0.45	0.57	0.46	0.17	0.44	0.05	0.00	0.06	0.01
C4	0.20	0.48	0.18	0.26	0.03	0.29	0.01	0.35	0.28	0.33	0.53	0.24	0.27	0.23	0.20	0.09	0.23	0.27	0.26	0.06	0.03	0.09
C4'	0.29	0.73	0.22	0.10	0.56	0.09	0.56	0.05	0.66	0.29	0.75	0.64	0.65	0.40	0.39	0.27	0.06	0.21	0.02	0.14	0.15	0.10
C5	0.16	0.43	0.18	0.26	0.06	0.26	0.04	0.31	0.29	0.30	0.48	0.23	0.28	0.23	0.16	0.08	0.24	0.22	0.24	0.02	0.03	0.06
C5'	0.42	0.84	0.37	0.28	0.70	0.23	0.75	0.13	0.84	0.51	0.89	0.74	0.86	0.63	0.55	0.39	0.23	0.33	0.25	0.36	0.44	0.33
C6	0.09	0.49	0.13	0.23	0.16	0.22	0.13	0.30	0.35	0.26	0.51	0.33	0.32	0.16	0.07	0.02	0.22	0.16	0.25	0.02	0.06	0.08
N1	0.08	0.58	0.10	0.23	0.22	0.24	0.18	0.35	0.37	0.25	0.56	0.43	0.32	0.13	0.05	0.02	0.20	0.18	0.30	0.10	0.13	0.15
N3	0.16	0.63	0.12	0.22	0.13	0.27	0.10	0.36	0.35	0.28	0.61	0.39	0.31	0.17	0.14	0.01	0.17	0.26	0.26	0.09	0.06	0.11
O2	0.00	0.72	0.03	0.11	0.32	0.18	0.25	0.33	0.43	0.15	0.65	0.58	0.36	0.02	0.04	0.16	0.05	0.15	0.24	0.11	0.08	0.13
O2'	0.15	0.01	0.26	0.39	0.26	0.13	0.50	0.25	0.40	0.82	0.17	0.00	0.53	0.82	0.40	0.02	0.31	0.02	0.60	0.17	0.74	0.45
O3'	0.31	0.55	0.21	0.11	0.45	0.14	0.42	0.00	0.46	0.27	0.53	0.51	0.42	0.31	0.37	0.25	0.05	0.28	0.01	0.04	0.01	0.01
O4	0.29	0.32	0.26	0.32	0.11	0.34	0.12	0.38	0.13	0.38	0.38	0.07	0.15	0.31	0.29	0.17	0.29	0.34	0.28	0.08	0.04	0.10
O4'	0.06	0.65	0.01	0.11	0.40	0.15	0.42	0.28	0.58	0.06	0.68	0.51	0.58	0.21	0.17	0.07	0.13	0.04	0.18	0.00	0.03	0.05
O5'	0.58	1.03	0.52	0.39	0.88	0.33	0.94	0.20	1.04	0.67	1.07	0.92	1.05	0.81	0.72	0.54	0.33	0.45	0.29	0.29	0.42	0.31
OP1	0.88	1.83	0.76	0.47	1.44	0.38	1.55	0.09	1.84	0.98	1.96	1.58	1.94	1.25	1.10	0.80	0.34	0.63	0.17	0.14	0.15	0.03
OP2	0.32	0.71	0.23	0.12	0.54	0.12	0.57	0.04	0.70	0.33	0.76	0.61	0.73	0.44	0.40	0.27	0.05	0.24	0.08	0.18	0.14	0.13
P	0.68	1.27	0.60	0.43	1.05	0.35	1.14	0.18	1.32	0.78	1.36	1.12	1.39	0.98	0.84	0.62	0.35	0.50	0.27	0.18	0.36	0.24

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.00	0.00	0.02	0.03	0.00	0.11	0.15	0.23	0.20
C2	0.04	0.00	0.08	0.07	0.01	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.10	0.10	0.17	0.31	0.39	0.36
C2'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.08	0.00	0.08	0.02	0.10	0.04	0.09	0.07	0.10	0.07	0.04	0.01	0.01	0.00	0.05	0.03	0.10	0.09
C3'	0.02	0.07	0.00	0.00	0.06	0.00	0.08	0.03	0.10	0.04	0.08	0.05	0.11	0.07	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.01	0.01
C4	0.02	0.01	0.08	0.06	0.00	0.01	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.08	0.05	0.15	0.26	0.35	0.31
C4'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.04	0.02	0.04	0.03	0.04	0.00	0.03	0.04	0.00	0.01	0.02	0.04	0.05
C5	0.01	0.00	0.08	0.08	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.11	0.03	0.13	0.27	0.36	0.31
C5'	0.03	0.08	0.02	0.03	0.05	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.07	0.08	0.02	0.01	0.04	0.04	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01
C6	0.01	0.01	0.10	0.10	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.08	0.14	0.04	0.13	0.29	0.37	0.32
C8	0.01	0.00	0.04	0.04	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.05	0.04	0.12	0.21	0.31	0.25
N1	0.03	0.00	0.09	0.08	0.01	0.02	0.01	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.12	0.09	0.16	0.32	0.39	0.36
N3	0.04	0.00	0.07	0.05	0.01	0.04	0.01	0.08	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.05	0.06	0.10	0.16	0.28	0.36	0.33
N6	0.00	0.01	0.10	0.11	0.00	0.03	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.08	0.16	0.03	0.11	0.29	0.36	0.31
N7	0.00	0.00	0.07	0.07	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.10	0.01	0.10	0.24	0.34	0.27
N9	0.00	0.01	0.04	0.03	0.00	0.00	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.03	0.01	0.14	0.22	0.31	0.27
O2'	0.02	0.06	0.01	0.00	0.06	0.03	0.06	0.04	0.08	0.03	0.07	0.05	0.08	0.05	0.03	0.00	0.03	0.04	0.05	0.03	0.11	0.10
O3'	0.03	0.10	0.01	0.00	0.08	0.04	0.11	0.04	0.14	0.05	0.12	0.06	0.16	0.10	0.03	0.03	0.00	0.03	0.05	0.16	0.10	0.08
O4'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.00	0.03	0.00	0.04	0.04	0.09	0.10	0.03	0.01	0.01	0.04	0.03	0.00	0.09	0.16	0.18	0.18
O5'	0.11	0.17	0.05	0.00	0.15	0.01	0.13	0.01	0.13	0.12	0.16	0.16	0.11	0.10	0.14	0.05	0.05	0.09	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.15	0.31	0.03	0.05	0.26	0.02	0.27	0.01	0.29	0.21	0.32	0.28	0.29	0.24	0.22	0.03	0.16	0.16	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.23	0.39	0.10	0.01	0.35	0.04	0.36	0.00	0.37	0.31	0.39	0.36	0.36	0.34	0.31	0.11	0.10	0.18	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.20	0.36	0.09	0.01	0.31	0.05	0.31	0.01	0.32	0.25	0.36	0.33	0.31	0.27	0.27	0.10	0.08	0.18	0.00	0.00	0.01	0.00