Doublet Group distance statistics: 49018

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 2, 9, 18, 15, 21, 16, 26, 10, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.003, 0.012, 0.021, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.012 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.010, 0.020, 0.030, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.020 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.005, 0.016, 0.026, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.016 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.005, 0.016, 0.026, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.016 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.005, 0.016, 0.027, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.016 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.005, 0.016, 0.028, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.016 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.011, 0.024, 0.038, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.024 std_dev=0.013
O2	A	0, 0.012, 0.040, 0.068, 0.137 max_d=0.137 avg_d=0.040 std_dev=0.028
O4	A	0, 0.056, 0.113, 0.170, 0.353 max_d=0.353 avg_d=0.113 std_dev=0.057
C2'	A	0, 0.062, 0.130, 0.198, 0.320 max_d=0.320 avg_d=0.130 std_dev=0.068
O4'	A	0, 0.058, 0.127, 0.196, 0.350 max_d=0.350 avg_d=0.127 std_dev=0.069
C4'	A	0, 0.148, 0.254, 0.360, 0.540 max_d=0.540 avg_d=0.254 std_dev=0.106
C3'	A	0, 0.148, 0.259, 0.370, 0.600 max_d=0.600 avg_d=0.259 std_dev=0.111
O2'	A	0, 0.066, 0.186, 0.306, 0.621 max_d=0.621 avg_d=0.186 std_dev=0.120
O3'	A	0, 0.187, 0.359, 0.530, 0.918 max_d=0.918 avg_d=0.359 std_dev=0.171
C6	B	0, 0.277, 0.449, 0.622, 0.859 max_d=0.859 avg_d=0.449 std_dev=0.172
C5	B	0, 0.287, 0.462, 0.637, 0.872 max_d=0.872 avg_d=0.462 std_dev=0.175
C5'	A	0, 0.194, 0.374, 0.554, 0.884 max_d=0.884 avg_d=0.374 std_dev=0.180
N1	B	0, 0.322, 0.532, 0.741, 0.914 max_d=0.914 avg_d=0.532 std_dev=0.210
C4	B	0, 0.283, 0.496, 0.709, 1.121 max_d=1.121 avg_d=0.496 std_dev=0.213
O5'	A	0, 0.182, 0.404, 0.626, 1.499 max_d=1.499 avg_d=0.404 std_dev=0.222
P	B	0, 0.245, 0.474, 0.702, 1.156 max_d=1.156 avg_d=0.474 std_dev=0.229
O4'	B	0, 0.274, 0.508, 0.743, 1.422 max_d=1.422 avg_d=0.508 std_dev=0.235
O4	B	0, 0.278, 0.524, 0.771, 1.352 max_d=1.352 avg_d=0.524 std_dev=0.247
N3	B	0, 0.346, 0.597, 0.847, 1.220 max_d=1.220 avg_d=0.597 std_dev=0.251
O5'	B	0, 0.218, 0.476, 0.734, 1.509 max_d=1.509 avg_d=0.476 std_dev=0.258
C1'	B	0, 0.337, 0.596, 0.855, 1.173 max_d=1.173 avg_d=0.596 std_dev=0.259
OP2	B	0, 0.352, 0.614, 0.877, 1.393 max_d=1.393 avg_d=0.614 std_dev=0.263
C5'	B	0, 0.194, 0.459, 0.724, 1.913 max_d=1.913 avg_d=0.459 std_dev=0.265
C2	B	0, 0.373, 0.638, 0.903, 1.294 max_d=1.294 avg_d=0.638 std_dev=0.265
C4'	B	0, 0.262, 0.529, 0.796, 1.571 max_d=1.571 avg_d=0.529 std_dev=0.267
OP1	B	0, 0.303, 0.597, 0.890, 1.468 max_d=1.468 avg_d=0.597 std_dev=0.293
P	A	0, 0.244, 0.538, 0.833, 2.013 max_d=2.013 avg_d=0.538 std_dev=0.295
C3'	B	0, 0.325, 0.636, 0.946, 1.414 max_d=1.414 avg_d=0.636 std_dev=0.311
C2'	B	0, 0.373, 0.714, 1.055, 1.542 max_d=1.542 avg_d=0.714 std_dev=0.341
OP1	A	0, 0.260, 0.604, 0.948, 1.927 max_d=1.927 avg_d=0.604 std_dev=0.344
O2	B	0, 0.427, 0.790, 1.153, 1.823 max_d=1.823 avg_d=0.790 std_dev=0.363
O3'	B	0, 0.365, 0.761, 1.157, 1.838 max_d=1.838 avg_d=0.761 std_dev=0.396
O2'	B	0, 0.412, 0.857, 1.301, 2.889 max_d=2.889 avg_d=0.857 std_dev=0.445
OP2	A	0, 0.138, 0.630, 1.122, 4.943 max_d=4.943 avg_d=0.630 std_dev=0.492

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.02	0.00	0.06	0.07	0.13	0.08
C2	0.02	0.00	0.05	0.06	0.01	0.03	0.02	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.06	0.02	0.02	0.12	0.12	0.23	0.16
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.05	0.02	0.05	0.09	0.00	0.02	0.06	0.01	0.09	0.13	0.11	0.08
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.08	0.00	0.09	0.02	0.09	0.05	0.06	0.08	0.02	0.01	0.09	0.01	0.13	0.17	0.12	0.10
C4	0.02	0.01	0.05	0.08	0.00	0.07	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.09	0.01	0.04	0.18	0.20	0.36	0.24
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.08	0.04	0.04	0.04	0.05	0.02	0.07	0.00	0.02	0.08	0.09	0.03
C5	0.02	0.02	0.05	0.09	0.01	0.08	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.11	0.01	0.05	0.19	0.21	0.36	0.24
C5'	0.02	0.07	0.02	0.02	0.13	0.01	0.14	0.00	0.12	0.07	0.09	0.05	0.05	0.04	0.14	0.01	0.01	0.09	0.06	0.01
C6	0.02	0.01	0.05	0.09	0.01	0.08	0.01	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.10	0.02	0.04	0.17	0.16	0.27	0.19
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.04	0.02	0.02	0.12	0.11	0.21	0.14
N3	0.02	0.01	0.05	0.06	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.02	0.07	0.07	0.01	0.03	0.15	0.16	0.30	0.20
O2	0.03	0.01	0.09	0.08	0.02	0.04	0.02	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.11	0.10	0.03	0.04	0.11	0.11	0.20	0.14
O2'	0.02	0.07	0.00	0.02	0.05	0.05	0.04	0.05	0.04	0.03	0.07	0.11	0.00	0.04	0.06	0.04	0.06	0.12	0.11	0.06
O3'	0.02	0.06	0.02	0.01	0.09	0.02	0.11	0.04	0.10	0.04	0.07	0.10	0.04	0.00	0.10	0.02	0.14	0.24	0.16	0.14
O4	0.02	0.02	0.06	0.09	0.01	0.07	0.01	0.14	0.02	0.02	0.01	0.03	0.06	0.10	0.00	0.04	0.19	0.23	0.40	0.26
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.03	0.04	0.04	0.02	0.04	0.00	0.08	0.08	0.14	0.10
O5'	0.06	0.12	0.09	0.13	0.18	0.02	0.19	0.01	0.17	0.12	0.15	0.11	0.06	0.14	0.19	0.08	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.07	0.12	0.13	0.17	0.20	0.08	0.21	0.09	0.16	0.11	0.16	0.11	0.12	0.24	0.23	0.08	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.13	0.23	0.11	0.12	0.36	0.09	0.36	0.06	0.27	0.21	0.30	0.20	0.11	0.16	0.40	0.14	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.16	0.08	0.10	0.24	0.03	0.24	0.01	0.19	0.14	0.20	0.14	0.06	0.14	0.26	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.23	0.15	0.14	0.19	0.16	0.16	0.18	0.14	0.17	0.23	0.27	0.19	0.14	0.22	0.17	0.18	0.05	0.09	0.05
C2	0.18	0.24	0.17	0.14	0.18	0.16	0.14	0.18	0.13	0.16	0.25	0.30	0.20	0.14	0.21	0.17	0.22	0.10	0.15	0.10
C2'	0.16	0.20	0.13	0.13	0.19	0.13	0.17	0.18	0.15	0.16	0.21	0.22	0.16	0.14	0.20	0.15	0.19	0.09	0.10	0.08
C3'	0.15	0.19	0.13	0.12	0.22	0.10	0.20	0.11	0.17	0.17	0.21	0.20	0.13	0.13	0.23	0.15	0.08	0.04	0.07	0.02
C4	0.16	0.19	0.14	0.13	0.13	0.14	0.16	0.16	0.15	0.14	0.20	0.24	0.17	0.13	0.19	0.16	0.23	0.14	0.20	0.14
C4'	0.15	0.20	0.13	0.12	0.22	0.11	0.20	0.12	0.17	0.16	0.22	0.22	0.14	0.13	0.25	0.14	0.07	0.09	0.11	0.05
C5	0.15	0.19	0.13	0.14	0.17	0.13	0.15	0.16	0.14	0.14	0.21	0.23	0.15	0.14	0.22	0.15	0.22	0.15	0.19	0.14
C5'	0.16	0.21	0.15	0.14	0.25	0.11	0.23	0.11	0.18	0.18	0.24	0.22	0.14	0.16	0.29	0.15	0.06	0.19	0.19	0.12
C6	0.15	0.20	0.13	0.14	0.19	0.14	0.16	0.16	0.14	0.15	0.22	0.24	0.15	0.14	0.23	0.15	0.21	0.12	0.16	0.12
N1	0.17	0.23	0.14	0.13	0.19	0.14	0.15	0.16	0.13	0.16	0.23	0.27	0.17	0.13	0.22	0.16	0.20	0.07	0.13	0.08
N3	0.18	0.21	0.16	0.14	0.15	0.16	0.15	0.17	0.15	0.15	0.22	0.28	0.19	0.13	0.20	0.17	0.23	0.12	0.18	0.12
O2	0.22	0.28	0.22	0.19	0.20	0.20	0.15	0.21	0.15	0.19	0.27	0.35	0.26	0.20	0.22	0.21	0.23	0.13	0.16	0.12
O2'	0.20	0.22	0.19	0.19	0.19	0.21	0.18	0.26	0.18	0.19	0.22	0.25	0.23	0.21	0.20	0.20	0.23	0.16	0.11	0.13
O3'	0.17	0.18	0.16	0.15	0.21	0.13	0.21	0.12	0.19	0.17	0.20	0.18	0.15	0.16	0.23	0.17	0.02	0.02	0.02	0.01
O4	0.18	0.19	0.16	0.15	0.14	0.16	0.20	0.18	0.19	0.16	0.18	0.24	0.19	0.15	0.18	0.18	0.24	0.17	0.22	0.16
O4'	0.16	0.22	0.13	0.12	0.21	0.13	0.18	0.15	0.15	0.16	0.23	0.25	0.17	0.12	0.24	0.15	0.12	0.07	0.11	0.03
O5'	0.17	0.24	0.19	0.20	0.29	0.15	0.25	0.16	0.20	0.20	0.28	0.25	0.17	0.23	0.33	0.16	0.20	0.20	0.25	0.18
OP1	0.23	0.25	0.30	0.34	0.30	0.27	0.28	0.29	0.25	0.24	0.29	0.25	0.27	0.40	0.35	0.23	0.31	0.42	0.39	0.34
OP2	0.25	0.35	0.30	0.33	0.43	0.23	0.38	0.23	0.31	0.30	0.40	0.34	0.27	0.38	0.49	0.22	0.27	0.36	0.38	0.28
P	0.19	0.26	0.22	0.25	0.32	0.18	0.27	0.18	0.22	0.22	0.31	0.26	0.20	0.29	0.37	0.17	0.21	0.30	0.31	0.23

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.05	0.03	0.01	0.10	0.09	0.20	0.09
C2	0.02	0.00	0.07	0.09	0.02	0.04	0.02	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.09	0.03	0.04	0.16	0.14	0.23	0.14
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.05	0.01	0.07	0.04	0.07	0.03	0.06	0.12	0.01	0.02	0.06	0.01	0.12	0.16	0.21	0.13
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.12	0.00	0.14	0.02	0.14	0.07	0.10	0.11	0.02	0.01	0.14	0.01	0.12	0.17	0.17	0.12
C4	0.03	0.02	0.05	0.12	0.00	0.07	0.01	0.12	0.01	0.02	0.01	0.02	0.09	0.13	0.01	0.04	0.24	0.22	0.27	0.22
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.08	0.04	0.05	0.05	0.08	0.02	0.08	0.00	0.02	0.09	0.15	0.04
C5	0.02	0.02	0.07	0.14	0.01	0.09	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.02	0.09	0.16	0.01	0.04	0.26	0.23	0.27	0.23
C5'	0.03	0.07	0.04	0.02	0.12	0.01	0.14	0.00	0.12	0.07	0.09	0.07	0.06	0.05	0.13	0.02	0.01	0.11	0.13	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.14	0.01	0.08	0.01	0.12	0.00	0.01	0.01	0.02	0.08	0.14	0.01	0.04	0.23	0.18	0.23	0.18
N1	0.01	0.01	0.03	0.07	0.02	0.04	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.05	0.06	0.02	0.02	0.16	0.13	0.22	0.13
N3	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.10	0.02	0.04	0.21	0.18	0.25	0.18
O2	0.04	0.01	0.12	0.11	0.02	0.05	0.02	0.07	0.02	0.02	0.01	0.00	0.12	0.15	0.03	0.06	0.14	0.12	0.22	0.12
O2'	0.02	0.08	0.01	0.02	0.09	0.08	0.09	0.06	0.08	0.05	0.09	0.12	0.00	0.05	0.10	0.06	0.08	0.13	0.21	0.10
O3'	0.05	0.09	0.02	0.01	0.13	0.02	0.16	0.05	0.14	0.06	0.10	0.15	0.05	0.00	0.15	0.04	0.15	0.23	0.20	0.16
O4	0.03	0.03	0.06	0.14	0.01	0.08	0.01	0.13	0.01	0.02	0.02	0.03	0.10	0.15	0.00	0.04	0.26	0.25	0.30	0.24
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.02	0.04	0.02	0.04	0.06	0.06	0.04	0.04	0.00	0.09	0.07	0.20	0.10
O5'	0.10	0.16	0.12	0.12	0.24	0.02	0.26	0.01	0.23	0.16	0.21	0.14	0.08	0.15	0.26	0.09	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.09	0.14	0.16	0.17	0.22	0.09	0.23	0.11	0.18	0.13	0.18	0.12	0.13	0.23	0.25	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.20	0.23	0.21	0.17	0.27	0.15	0.27	0.13	0.23	0.22	0.25	0.22	0.21	0.20	0.30	0.20	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.14	0.13	0.12	0.22	0.04	0.23	0.02	0.18	0.13	0.18	0.12	0.10	0.16	0.24	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00