Doublet Group distance statistics: 49028

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 0, 3, 1, 1, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.002, 0.004, 0.006, 0.006 max_d=0.006 avg_d=0.004 std_dev=0.002
C5	A	0, 0.003, 0.006, 0.009, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.006 std_dev=0.003
N1	A	0, 0.004, 0.009, 0.014, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C4	A	0, 0.004, 0.010, 0.017, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.010 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.005, 0.011, 0.018, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.005, 0.012, 0.019, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.004, 0.011, 0.018, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.011 std_dev=0.007
O2	A	0, 0.009, 0.020, 0.032, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.020 std_dev=0.012
O4	A	0, 0.013, 0.031, 0.050, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.031 std_dev=0.019
O2'	A	0, 0.040, 0.250, 0.460, 0.790 max_d=0.790 avg_d=0.250 std_dev=0.210
C2	B	0, 0.190, 0.413, 0.636, 0.819 max_d=0.819 avg_d=0.413 std_dev=0.223
N1	B	0, 0.148, 0.384, 0.620, 0.853 max_d=0.853 avg_d=0.384 std_dev=0.236
C2'	A	0, -0.029, 0.215, 0.459, 0.876 max_d=0.876 avg_d=0.215 std_dev=0.244
C1'	B	0, 0.257, 0.511, 0.765, 0.902 max_d=0.902 avg_d=0.511 std_dev=0.254
O2	B	0, 0.150, 0.405, 0.660, 0.830 max_d=0.830 avg_d=0.405 std_dev=0.255
O4'	A	0, -0.056, 0.200, 0.456, 0.904 max_d=0.904 avg_d=0.200 std_dev=0.256
N3	B	0, 0.362, 0.656, 0.950, 1.026 max_d=1.026 avg_d=0.656 std_dev=0.294
C6	B	0, 0.236, 0.532, 0.828, 0.984 max_d=0.984 avg_d=0.532 std_dev=0.296
O4'	B	0, 0.241, 0.547, 0.852, 1.155 max_d=1.155 avg_d=0.547 std_dev=0.306
C2'	B	0, 0.379, 0.752, 1.126, 1.347 max_d=1.347 avg_d=0.752 std_dev=0.374
C5	B	0, 0.330, 0.711, 1.092, 1.291 max_d=1.291 avg_d=0.711 std_dev=0.381
O5'	B	0, 0.311, 0.692, 1.074, 1.429 max_d=1.429 avg_d=0.692 std_dev=0.381
C4	B	0, 0.427, 0.814, 1.201, 1.288 max_d=1.288 avg_d=0.814 std_dev=0.387
OP2	B	0, 0.323, 0.715, 1.107, 1.370 max_d=1.370 avg_d=0.715 std_dev=0.392
C4'	B	0, 0.392, 0.788, 1.184, 1.339 max_d=1.339 avg_d=0.788 std_dev=0.396
P	B	0, 0.252, 0.670, 1.089, 1.597 max_d=1.597 avg_d=0.670 std_dev=0.418
C3'	A	0, -0.098, 0.332, 0.762, 1.512 max_d=1.512 avg_d=0.332 std_dev=0.430
C3'	B	0, 0.422, 0.859, 1.297, 1.538 max_d=1.538 avg_d=0.859 std_dev=0.438
C4'	A	0, -0.153, 0.288, 0.729, 1.516 max_d=1.516 avg_d=0.288 std_dev=0.441
P	A	0, 0.288, 0.752, 1.217, 1.608 max_d=1.608 avg_d=0.752 std_dev=0.465
O2'	B	0, 0.508, 0.975, 1.441, 1.498 max_d=1.498 avg_d=0.975 std_dev=0.466
O5'	A	0, 0.029, 0.505, 0.980, 1.721 max_d=1.721 avg_d=0.505 std_dev=0.476
O4	B	0, 0.545, 1.043, 1.542, 1.687 max_d=1.687 avg_d=1.043 std_dev=0.498
C5'	B	0, 0.349, 0.849, 1.348, 1.809 max_d=1.809 avg_d=0.849 std_dev=0.500
O3'	A	0, -0.051, 0.490, 1.032, 1.967 max_d=1.967 avg_d=0.490 std_dev=0.541
O3'	B	0, 0.588, 1.165, 1.742, 1.977 max_d=1.977 avg_d=1.165 std_dev=0.577
OP1	B	0, 0.260, 0.905, 1.550, 2.497 max_d=2.497 avg_d=0.905 std_dev=0.645
C5'	A	0, -0.215, 0.535, 1.285, 2.613 max_d=2.613 avg_d=0.535 std_dev=0.750
OP2	A	0, 0.223, 1.018, 1.813, 2.981 max_d=2.981 avg_d=1.018 std_dev=0.795
OP1	A	0, 0.116, 0.988, 1.861, 3.162 max_d=3.162 avg_d=0.988 std_dev=0.873

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.16	0.74	0.03	0.30
C2	0.01	0.00	0.10	0.17	0.00	0.09	0.00	0.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.17	0.00	0.03	0.22	0.56	0.32	0.15
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.02	0.01	0.09	0.01	0.11	0.01	0.06	0.21	0.00	0.01	0.02	0.01	0.23	0.51	0.18	0.13
C3'	0.00	0.17	0.00	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.11	0.04	0.15	0.26	0.01	0.00	0.06	0.01	0.28	0.16	0.30	0.07
C4	0.00	0.00	0.02	0.06	0.00	0.10	0.00	0.26	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.04	0.00	0.01	0.28	0.28	0.59	0.05
C4'	0.00	0.09	0.01	0.00	0.10	0.00	0.07	0.00	0.05	0.06	0.11	0.09	0.03	0.01	0.11	0.00	0.01	0.46	0.10	0.23
C5	0.00	0.00	0.09	0.07	0.00	0.07	0.00	0.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.10	0.00	0.04	0.31	0.22	0.60	0.06
C5'	0.04	0.20	0.01	0.01	0.26	0.00	0.22	0.00	0.16	0.15	0.25	0.18	0.03	0.03	0.28	0.01	0.00	0.07	0.01	0.01
C6	0.01	0.00	0.11	0.11	0.00	0.05	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.13	0.00	0.05	0.30	0.36	0.41	0.07
N1	0.00	0.00	0.01	0.04	0.00	0.06	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.03	0.00	0.01	0.23	0.56	0.26	0.17
N3	0.01	0.00	0.06	0.15	0.00	0.11	0.00	0.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.15	0.00	0.02	0.25	0.44	0.47	0.07
O2	0.01	0.00	0.21	0.26	0.01	0.09	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.29	0.01	0.06	0.18	0.66	0.23	0.20
O2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.04	0.03	0.08	0.03	0.08	0.03	0.02	0.10	0.00	0.02	0.05	0.03	0.09	0.74	0.08	0.30
O3'	0.01	0.17	0.01	0.00	0.04	0.01	0.10	0.03	0.13	0.03	0.15	0.29	0.02	0.00	0.05	0.02	0.21	0.05	0.27	0.11
O4	0.00	0.00	0.02	0.06	0.00	0.11	0.00	0.28	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.05	0.00	0.02	0.29	0.21	0.68	0.09
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.02	0.06	0.03	0.02	0.02	0.00	0.05	0.82	0.17	0.41
O5'	0.16	0.22	0.23	0.28	0.28	0.01	0.31	0.00	0.30	0.23	0.25	0.18	0.09	0.21	0.29	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.74	0.56	0.51	0.16	0.28	0.46	0.22	0.07	0.36	0.56	0.44	0.66	0.74	0.05	0.21	0.82	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.03	0.32	0.18	0.30	0.59	0.10	0.60	0.01	0.41	0.26	0.47	0.23	0.08	0.27	0.68	0.17	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.30	0.15	0.13	0.07	0.05	0.23	0.06	0.01	0.07	0.17	0.07	0.20	0.30	0.11	0.09	0.41	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.06	0.11	0.06	0.09	0.29	0.07	0.38	0.13	0.31	0.12	0.18	0.18	0.15	0.08	0.32	0.06	0.17	0.04	0.09	0.07
C2	0.16	0.14	0.15	0.22	0.23	0.25	0.32	0.32	0.33	0.18	0.19	0.21	0.14	0.22	0.23	0.24	0.10	0.16	0.12	0.08
C2'	0.13	0.14	0.11	0.05	0.11	0.09	0.17	0.08	0.14	0.06	0.11	0.22	0.20	0.07	0.13	0.11	0.31	0.08	0.19	0.15
C3'	0.18	0.17	0.24	0.31	0.24	0.22	0.33	0.28	0.34	0.23	0.19	0.15	0.16	0.29	0.23	0.18	0.05	0.01	0.06	0.00
C4	0.20	0.10	0.20	0.20	0.19	0.21	0.20	0.18	0.22	0.16	0.18	0.11	0.23	0.21	0.22	0.21	0.11	0.04	0.27	0.07
C4'	0.30	0.37	0.36	0.42	0.57	0.27	0.69	0.32	0.61	0.42	0.44	0.28	0.23	0.39	0.59	0.25	0.16	0.07	0.28	0.15
C5	0.16	0.13	0.17	0.15	0.21	0.14	0.23	0.11	0.21	0.16	0.17	0.13	0.18	0.15	0.22	0.15	0.12	0.15	0.35	0.18
C5'	0.59	0.69	0.69	0.73	0.90	0.51	1.02	0.46	0.91	0.73	0.77	0.60	0.56	0.70	0.89	0.48	0.42	0.10	0.42	0.24
C6	0.12	0.12	0.12	0.12	0.26	0.11	0.31	0.10	0.26	0.14	0.18	0.13	0.13	0.12	0.28	0.12	0.15	0.17	0.31	0.19
N1	0.09	0.12	0.10	0.13	0.26	0.12	0.35	0.17	0.31	0.14	0.17	0.17	0.11	0.13	0.27	0.11	0.10	0.03	0.17	0.06
N3	0.21	0.14	0.20	0.25	0.20	0.29	0.26	0.31	0.28	0.19	0.20	0.19	0.21	0.25	0.22	0.28	0.12	0.14	0.17	0.06
O2	0.18	0.17	0.18	0.27	0.23	0.33	0.34	0.45	0.35	0.20	0.20	0.26	0.16	0.27	0.24	0.29	0.13	0.28	0.09	0.18
O2'	0.25	0.19	0.26	0.18	0.12	0.23	0.18	0.07	0.10	0.12	0.13	0.31	0.40	0.22	0.16	0.23	0.45	0.11	0.09	0.16
O3'	0.12	0.12	0.19	0.26	0.16	0.16	0.22	0.24	0.23	0.15	0.13	0.12	0.13	0.26	0.16	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00
O4	0.23	0.08	0.24	0.21	0.20	0.24	0.16	0.18	0.17	0.15	0.19	0.08	0.30	0.24	0.27	0.23	0.13	0.05	0.30	0.07
O4'	0.16	0.24	0.19	0.26	0.49	0.16	0.61	0.22	0.50	0.29	0.33	0.16	0.08	0.23	0.53	0.14	0.05	0.04	0.13	0.06
O5'	0.09	0.11	0.12	0.17	0.33	0.04	0.41	0.04	0.28	0.13	0.18	0.11	0.07	0.18	0.39	0.11	0.05	0.11	0.10	0.05
OP1	0.20	0.19	0.19	0.16	0.20	0.14	0.24	0.10	0.24	0.21	0.18	0.18	0.18	0.14	0.18	0.19	0.08	0.23	0.17	0.10
OP2	0.48	0.51	0.41	0.34	0.39	0.41	0.33	0.39	0.38	0.46	0.48	0.55	0.46	0.32	0.33	0.46	0.24	0.33	0.31	0.29
P	0.11	0.14	0.14	0.13	0.24	0.05	0.30	0.05	0.23	0.15	0.17	0.12	0.10	0.13	0.27	0.07	0.06	0.19	0.11	0.10

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.04	0.30	0.06
C2	0.00	0.00	0.06	0.04	0.00	0.01	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.06	0.00	0.02	0.15	0.07	0.28	0.08
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.05	0.09	0.00	0.02	0.03	0.00	0.17	0.12	0.18	0.07
C3'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.00	0.05	0.02	0.06	0.02	0.04	0.08	0.01	0.00	0.03	0.01	0.25	0.18	0.11	0.14
C4	0.00	0.00	0.02	0.03	0.00	0.03	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.03	0.00	0.01	0.23	0.10	0.22	0.09
C4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.02	0.02	0.02	0.02	0.00	0.03	0.00	0.01	0.06	0.25	0.02
C5	0.00	0.00	0.03	0.05	0.00	0.04	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.06	0.00	0.01	0.25	0.11	0.22	0.11
C5'	0.02	0.05	0.01	0.02	0.09	0.00	0.11	0.00	0.09	0.06	0.07	0.03	0.02	0.02	0.10	0.01	0.00	0.07	0.26	0.01
C6	0.00	0.00	0.04	0.06	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.07	0.00	0.02	0.21	0.09	0.27	0.10
N1	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.14	0.06	0.28	0.07
N3	0.00	0.00	0.05	0.04	0.00	0.02	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.05	0.00	0.02	0.19	0.08	0.25	0.08
O2	0.01	0.00	0.09	0.08	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.11	0.00	0.03	0.11	0.06	0.29	0.08
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.05	0.10	0.00	0.04	0.03	0.02	0.06	0.10	0.21	0.03
O3'	0.01	0.06	0.02	0.00	0.03	0.00	0.06	0.02	0.07	0.02	0.05	0.11	0.04	0.00	0.04	0.01	0.24	0.22	0.06	0.16
O4	0.00	0.00	0.03	0.03	0.00	0.03	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.04	0.00	0.01	0.24	0.11	0.19	0.10
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.00	0.06	0.03	0.34	0.10
O5'	0.06	0.15	0.17	0.25	0.23	0.01	0.25	0.00	0.21	0.14	0.19	0.11	0.06	0.24	0.24	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00
OP1	0.04	0.07	0.12	0.18	0.10	0.06	0.11	0.07	0.09	0.06	0.08	0.06	0.10	0.22	0.11	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.30	0.28	0.18	0.11	0.22	0.25	0.22	0.26	0.27	0.28	0.25	0.29	0.21	0.06	0.19	0.34	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.06	0.08	0.07	0.14	0.09	0.02	0.11	0.01	0.10	0.07	0.08	0.08	0.03	0.16	0.10	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00