Doublet Group distance statistics: 49030

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 1, 2, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.002, 0.005, 0.009, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.005 std_dev=0.003
N3	A	0, 0.003, 0.007, 0.010, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.007 std_dev=0.003
N1	A	0, 0.001, 0.006, 0.011, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.006 std_dev=0.005
C1'	A	0, 0.004, 0.011, 0.018, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.002, 0.010, 0.017, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.010 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.000, 0.008, 0.016, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.008 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.000, 0.008, 0.016, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.008 std_dev=0.008
O2	A	0, 0.006, 0.025, 0.044, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.025 std_dev=0.019
O4	A	0, 0.008, 0.058, 0.107, 0.163 max_d=0.163 avg_d=0.058 std_dev=0.050
O2'	A	0, 0.015, 0.123, 0.231, 0.366 max_d=0.366 avg_d=0.123 std_dev=0.108
C2'	A	0, 0.005, 0.158, 0.311, 0.526 max_d=0.526 avg_d=0.158 std_dev=0.153
N1	B	0, 0.143, 0.318, 0.493, 0.525 max_d=0.525 avg_d=0.318 std_dev=0.175
O4'	A	0, -0.008, 0.170, 0.347, 0.610 max_d=0.610 avg_d=0.170 std_dev=0.177
C6	B	0, 0.107, 0.294, 0.480, 0.602 max_d=0.602 avg_d=0.294 std_dev=0.187
C1'	B	0, 0.143, 0.399, 0.654, 0.854 max_d=0.854 avg_d=0.399 std_dev=0.256
OP2	B	0, 0.169, 0.443, 0.717, 0.925 max_d=0.925 avg_d=0.443 std_dev=0.274
C2'	B	0, 0.231, 0.509, 0.787, 0.821 max_d=0.821 avg_d=0.509 std_dev=0.278
C3'	B	0, 0.218, 0.499, 0.779, 0.856 max_d=0.856 avg_d=0.499 std_dev=0.281
C3'	A	0, 0.000, 0.283, 0.566, 0.981 max_d=0.981 avg_d=0.283 std_dev=0.283
C4'	A	0, -0.002, 0.283, 0.568, 0.991 max_d=0.991 avg_d=0.283 std_dev=0.285
C2	B	0, 0.142, 0.437, 0.731, 1.098 max_d=1.098 avg_d=0.437 std_dev=0.295
C5	B	0, 0.063, 0.361, 0.660, 1.043 max_d=1.043 avg_d=0.361 std_dev=0.299
O5'	A	0, 0.171, 0.480, 0.789, 1.083 max_d=1.083 avg_d=0.480 std_dev=0.309
OP2	A	0, 0.191, 0.513, 0.834, 0.973 max_d=0.973 avg_d=0.513 std_dev=0.322
O4'	B	0, 0.085, 0.409, 0.733, 1.125 max_d=1.125 avg_d=0.409 std_dev=0.324
P	A	0, 0.200, 0.527, 0.855, 1.042 max_d=1.042 avg_d=0.527 std_dev=0.327
O3'	B	0, 0.272, 0.601, 0.931, 1.031 max_d=1.031 avg_d=0.601 std_dev=0.329
OP1	A	0, 0.240, 0.602, 0.963, 1.172 max_d=1.172 avg_d=0.602 std_dev=0.361
N3	B	0, 0.071, 0.442, 0.812, 1.346 max_d=1.346 avg_d=0.442 std_dev=0.370
P	B	0, 0.107, 0.479, 0.851, 1.307 max_d=1.307 avg_d=0.479 std_dev=0.372
C4'	B	0, 0.142, 0.516, 0.889, 1.299 max_d=1.299 avg_d=0.516 std_dev=0.373
C4	B	0, 0.027, 0.403, 0.780, 1.322 max_d=1.322 avg_d=0.403 std_dev=0.376
O2'	B	0, 0.276, 0.659, 1.042, 1.375 max_d=1.375 avg_d=0.659 std_dev=0.383
O3'	A	0, 0.011, 0.398, 0.784, 1.342 max_d=1.342 avg_d=0.398 std_dev=0.387
O5'	B	0, 0.086, 0.486, 0.887, 1.403 max_d=1.403 avg_d=0.486 std_dev=0.401
O2	B	0, 0.144, 0.575, 1.005, 1.610 max_d=1.610 avg_d=0.575 std_dev=0.430
C5'	A	0, -0.005, 0.462, 0.928, 1.608 max_d=1.608 avg_d=0.462 std_dev=0.466
OP1	B	0, 0.109, 0.609, 1.110, 1.756 max_d=1.756 avg_d=0.609 std_dev=0.500
C5'	B	0, 0.009, 0.542, 1.074, 1.847 max_d=1.847 avg_d=0.542 std_dev=0.532
O4	B	0, -0.043, 0.489, 1.022, 1.823 max_d=1.823 avg_d=0.489 std_dev=0.532

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.10	0.13	0.04
C2	0.01	0.00	0.09	0.16	0.00	0.07	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.17	0.01	0.02	0.20	0.15	0.12	0.13
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.02	0.07	0.01	0.08	0.15	0.00	0.01	0.06	0.01	0.20	0.23	0.10	0.16
C3'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.12	0.00	0.04	0.02	0.03	0.06	0.17	0.19	0.01	0.00	0.15	0.01	0.30	0.33	0.12	0.25
C4	0.01	0.00	0.03	0.12	0.00	0.08	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.14	0.00	0.01	0.30	0.21	0.16	0.22
C4'	0.00	0.07	0.01	0.00	0.08	0.00	0.06	0.00	0.04	0.04	0.08	0.06	0.04	0.01	0.11	0.00	0.01	0.10	0.19	0.01
C5	0.00	0.00	0.04	0.04	0.00	0.06	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.04	0.01	0.02	0.33	0.22	0.15	0.23
C5'	0.02	0.11	0.02	0.02	0.16	0.00	0.13	0.00	0.09	0.08	0.14	0.09	0.04	0.03	0.19	0.01	0.01	0.14	0.29	0.01
C6	0.01	0.01	0.07	0.03	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.03	0.01	0.03	0.29	0.20	0.11	0.18
N1	0.00	0.01	0.01	0.06	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.01	0.20	0.15	0.11	0.12
N3	0.01	0.00	0.08	0.17	0.00	0.08	0.00	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.19	0.00	0.02	0.25	0.18	0.14	0.18
O2	0.01	0.00	0.15	0.19	0.00	0.06	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.22	0.01	0.04	0.15	0.13	0.12	0.10
O2'	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.04	0.04	0.04	0.04	0.02	0.02	0.05	0.00	0.03	0.04	0.05	0.02	0.09	0.08	0.02
O3'	0.01	0.17	0.01	0.00	0.14	0.01	0.04	0.03	0.03	0.06	0.19	0.22	0.03	0.00	0.18	0.01	0.27	0.38	0.16	0.28
O4	0.01	0.01	0.06	0.15	0.00	0.11	0.01	0.19	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.18	0.00	0.01	0.31	0.22	0.18	0.24
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.05	0.01	0.01	0.00	0.07	0.03	0.26	0.10
O5'	0.09	0.20	0.20	0.30	0.30	0.01	0.33	0.01	0.29	0.20	0.25	0.15	0.02	0.27	0.31	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.10	0.15	0.23	0.33	0.21	0.10	0.22	0.14	0.20	0.15	0.18	0.13	0.09	0.38	0.22	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.13	0.12	0.10	0.12	0.16	0.19	0.15	0.29	0.11	0.11	0.14	0.12	0.08	0.16	0.18	0.26	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.04	0.13	0.16	0.25	0.22	0.01	0.23	0.01	0.18	0.12	0.18	0.10	0.02	0.28	0.24	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.28	0.18	0.26	0.13	0.12	0.17	0.19	0.07	0.08	0.14	0.07	0.30	0.39	0.16	0.18	0.23	0.15	0.04	0.06	0.06
C2	0.22	0.22	0.22	0.09	0.04	0.06	0.10	0.17	0.06	0.15	0.14	0.33	0.29	0.11	0.05	0.09	0.13	0.16	0.09	0.14
C2'	0.21	0.12	0.19	0.08	0.16	0.14	0.21	0.10	0.13	0.09	0.08	0.20	0.31	0.12	0.20	0.19	0.22	0.08	0.14	0.12
C3'	0.09	0.21	0.10	0.16	0.42	0.04	0.47	0.16	0.36	0.21	0.30	0.13	0.10	0.12	0.47	0.08	0.02	0.01	0.03	0.00
C4	0.16	0.16	0.16	0.11	0.06	0.10	0.06	0.08	0.10	0.15	0.12	0.19	0.17	0.11	0.06	0.11	0.19	0.16	0.10	0.15
C4'	0.09	0.15	0.06	0.13	0.43	0.04	0.49	0.16	0.34	0.16	0.27	0.09	0.17	0.10	0.51	0.10	0.02	0.04	0.15	0.06
C5	0.23	0.15	0.21	0.18	0.08	0.21	0.08	0.18	0.12	0.17	0.08	0.18	0.23	0.19	0.15	0.23	0.08	0.05	0.04	0.05
C5'	0.11	0.31	0.17	0.25	0.63	0.07	0.66	0.17	0.48	0.30	0.46	0.21	0.07	0.22	0.73	0.07	0.14	0.10	0.31	0.16
C6	0.27	0.16	0.25	0.19	0.11	0.25	0.12	0.17	0.08	0.17	0.08	0.22	0.30	0.21	0.19	0.28	0.06	0.04	0.07	0.05
N1	0.27	0.19	0.25	0.14	0.08	0.16	0.13	0.06	0.05	0.16	0.09	0.28	0.33	0.16	0.14	0.22	0.05	0.04	0.04	0.03
N3	0.16	0.22	0.17	0.08	0.07	0.06	0.06	0.13	0.06	0.14	0.17	0.29	0.20	0.09	0.06	0.06	0.21	0.21	0.13	0.18
O2	0.21	0.25	0.23	0.09	0.06	0.12	0.11	0.32	0.10	0.14	0.18	0.38	0.33	0.11	0.05	0.09	0.15	0.21	0.12	0.17
O2'	0.32	0.22	0.33	0.18	0.10	0.21	0.17	0.13	0.09	0.17	0.11	0.34	0.49	0.23	0.15	0.26	0.37	0.14	0.15	0.18
O3'	0.16	0.30	0.20	0.28	0.49	0.11	0.53	0.24	0.44	0.30	0.39	0.22	0.10	0.23	0.54	0.11	0.02	0.01	0.02	0.00
O4	0.08	0.12	0.09	0.07	0.12	0.06	0.11	0.06	0.10	0.10	0.13	0.12	0.09	0.07	0.12	0.06	0.28	0.23	0.15	0.21
O4'	0.20	0.09	0.16	0.04	0.25	0.11	0.32	0.10	0.18	0.06	0.09	0.20	0.30	0.06	0.33	0.18	0.07	0.01	0.08	0.02
O5'	0.46	0.31	0.40	0.32	0.10	0.46	0.09	0.37	0.22	0.33	0.20	0.38	0.49	0.32	0.11	0.51	0.33	0.26	0.31	0.30
OP1	0.36	0.16	0.30	0.26	0.19	0.45	0.14	0.42	0.12	0.21	0.11	0.22	0.40	0.28	0.31	0.46	0.34	0.39	0.32	0.36
OP2	0.31	0.14	0.27	0.27	0.18	0.41	0.13	0.43	0.15	0.19	0.13	0.17	0.32	0.29	0.29	0.40	0.19	0.22	0.23	0.20
P	0.38	0.21	0.32	0.29	0.12	0.44	0.10	0.41	0.16	0.25	0.11	0.26	0.41	0.30	0.21	0.46	0.28	0.30	0.29	0.29

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.22	0.26	0.05	0.17
C2	0.01	0.00	0.02	0.03	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.03	0.01	0.01	0.42	0.44	0.31	0.37
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.03	0.05	0.00	0.01	0.04	0.01	0.24	0.35	0.11	0.22
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.03	0.00	0.03	0.02	0.03	0.02	0.02	0.06	0.01	0.01	0.03	0.01	0.28	0.41	0.09	0.26
C4	0.01	0.00	0.03	0.03	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.03	0.00	0.02	0.59	0.60	0.53	0.56
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.05	0.02	0.03	0.00	0.01	0.14	0.19	0.02
C5	0.00	0.00	0.03	0.03	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.03	0.01	0.02	0.61	0.60	0.52	0.58
C5'	0.01	0.03	0.02	0.02	0.05	0.01	0.05	0.00	0.04	0.02	0.04	0.04	0.06	0.03	0.05	0.01	0.01	0.17	0.31	0.02
C6	0.01	0.00	0.03	0.03	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.55	0.51	0.36	0.47
N1	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.41	0.42	0.25	0.35
N3	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.02	0.00	0.01	0.51	0.53	0.44	0.47
O2	0.02	0.00	0.05	0.06	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.06	0.01	0.02	0.34	0.38	0.25	0.30
O2'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.04	0.05	0.03	0.06	0.02	0.02	0.04	0.05	0.00	0.02	0.04	0.04	0.08	0.20	0.02	0.08
O3'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.02	0.03	0.03	0.02	0.02	0.02	0.06	0.02	0.00	0.04	0.02	0.15	0.37	0.06	0.20
O4	0.01	0.01	0.04	0.03	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.04	0.00	0.02	0.62	0.65	0.61	0.61
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.02	0.00	0.09	0.14	0.14	0.06
O5'	0.22	0.42	0.24	0.28	0.59	0.01	0.61	0.01	0.55	0.41	0.51	0.34	0.08	0.15	0.62	0.09	0.00	0.03	0.01	0.01
OP1	0.26	0.44	0.35	0.41	0.60	0.14	0.60	0.17	0.51	0.42	0.53	0.38	0.20	0.37	0.65	0.14	0.03	0.00	0.01	0.00
OP2	0.05	0.31	0.11	0.09	0.53	0.19	0.52	0.31	0.36	0.25	0.44	0.25	0.02	0.06	0.61	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.17	0.37	0.22	0.26	0.56	0.02	0.58	0.02	0.47	0.35	0.47	0.30	0.08	0.20	0.61	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00