Doublet Group distance statistics: 49031

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.003, 0.014, 0.025, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.014 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.002, 0.016, 0.030, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.016 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.009, 0.031, 0.054, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.031 std_dev=0.022
C4	A	0, 0.009, 0.032, 0.054, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.032 std_dev=0.022
C5	A	0, 0.010, 0.033, 0.057, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.033 std_dev=0.023
N1	A	0, 0.013, 0.046, 0.079, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.046 std_dev=0.033
C2	A	0, 0.013, 0.048, 0.083, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.048 std_dev=0.035
O4	A	0, 0.018, 0.064, 0.110, 0.105 max_d=0.105 avg_d=0.064 std_dev=0.046
O2	A	0, 0.021, 0.075, 0.130, 0.128 max_d=0.128 avg_d=0.075 std_dev=0.055
O4'	A	0, 0.085, 0.375, 0.666, 0.706 max_d=0.706 avg_d=0.375 std_dev=0.290
C2'	A	0, 0.126, 0.500, 0.874, 0.900 max_d=0.900 avg_d=0.500 std_dev=0.374
C6	B	0, 0.109, 0.499, 0.890, 0.954 max_d=0.954 avg_d=0.499 std_dev=0.391
C4'	A	0, 0.155, 0.566, 0.976, 0.962 max_d=0.962 avg_d=0.566 std_dev=0.411
N1	B	0, 0.114, 0.534, 0.955, 1.028 max_d=1.028 avg_d=0.534 std_dev=0.421
C5	B	0, 0.182, 0.628, 1.073, 0.985 max_d=0.985 avg_d=0.628 std_dev=0.445
C2	B	0, 0.188, 0.648, 1.108, 1.021 max_d=1.021 avg_d=0.648 std_dev=0.460
O2'	A	0, 0.168, 0.657, 1.145, 1.171 max_d=1.171 avg_d=0.657 std_dev=0.489
N3	B	0, 0.199, 0.693, 1.188, 1.122 max_d=1.122 avg_d=0.693 std_dev=0.495
C4	B	0, 0.197, 0.694, 1.191, 1.137 max_d=1.137 avg_d=0.694 std_dev=0.497
O4'	B	0, 0.025, 0.527, 1.030, 1.203 max_d=1.203 avg_d=0.527 std_dev=0.503
C3'	A	0, 0.182, 0.723, 1.263, 1.300 max_d=1.300 avg_d=0.723 std_dev=0.541
O2	B	0, 0.225, 0.776, 1.326, 1.219 max_d=1.219 avg_d=0.776 std_dev=0.550
C1'	B	0, 0.102, 0.675, 1.247, 1.399 max_d=1.399 avg_d=0.675 std_dev=0.572
O4	B	0, 0.211, 0.830, 1.449, 1.486 max_d=1.486 avg_d=0.830 std_dev=0.619
C5'	A	0, 0.259, 0.993, 1.726, 1.750 max_d=1.750 avg_d=0.993 std_dev=0.734
O3'	A	0, 0.268, 1.081, 1.895, 1.962 max_d=1.962 avg_d=1.081 std_dev=0.814
C4'	B	0, 0.087, 0.918, 1.749, 2.013 max_d=2.013 avg_d=0.918 std_dev=0.831
OP2	B	0, 0.197, 1.037, 1.877, 2.057 max_d=2.057 avg_d=1.037 std_dev=0.840
C2'	B	0, 0.202, 1.051, 1.900, 2.079 max_d=2.079 avg_d=1.051 std_dev=0.849
O5'	B	0, 0.193, 1.058, 1.924, 2.120 max_d=2.120 avg_d=1.058 std_dev=0.866
P	B	0, 0.145, 1.026, 1.907, 2.151 max_d=2.151 avg_d=1.026 std_dev=0.881
C5'	B	0, 0.151, 1.065, 1.980, 2.233 max_d=2.233 avg_d=1.065 std_dev=0.915
C3'	B	0, 0.215, 1.146, 2.077, 2.280 max_d=2.280 avg_d=1.146 std_dev=0.931
OP1	B	0, -0.011, 1.030, 2.071, 2.456 max_d=2.456 avg_d=1.030 std_dev=1.041
O2'	B	0, 0.279, 1.357, 2.435, 2.637 max_d=2.637 avg_d=1.357 std_dev=1.078
O3'	B	0, 0.325, 1.577, 2.828, 3.061 max_d=3.061 avg_d=1.577 std_dev=1.252
O5'	A	0, 0.338, 1.692, 3.046, 3.314 max_d=3.314 avg_d=1.692 std_dev=1.354
P	A	0, 0.685, 2.343, 4.002, 3.607 max_d=3.607 avg_d=2.343 std_dev=1.659
OP1	A	0, 0.785, 2.705, 4.624, 4.264 max_d=4.264 avg_d=2.705 std_dev=1.920
OP2	A	0, 0.665, 2.895, 5.126, 5.427 max_d=5.427 avg_d=2.895 std_dev=2.230

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.38	0.51	0.94	0.24
C2	0.02	0.00	0.08	0.05	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.09	0.07	0.02	0.02	0.62	0.21	1.62	0.74
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.00	0.08	0.01	0.05	0.17	0.00	0.01	0.01	0.00	0.09	0.87	0.55	0.18
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.10	0.01	0.02	0.12	0.02	0.00	0.04	0.02	0.18	0.71	0.38	0.23
C4	0.02	0.02	0.01	0.04	0.00	0.07	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.05	0.00	0.05	0.65	0.61	2.18	1.18
C4'	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.00	0.10	0.00	0.09	0.03	0.03	0.05	0.05	0.02	0.08	0.01	0.00	0.65	0.27	0.27
C5	0.03	0.03	0.06	0.10	0.00	0.10	0.00	0.17	0.00	0.01	0.01	0.04	0.04	0.13	0.00	0.08	0.58	0.70	2.18	1.19
C5'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.13	0.00	0.17	0.00	0.14	0.05	0.08	0.04	0.05	0.01	0.14	0.01	0.01	0.07	0.22	0.02
C6	0.02	0.02	0.08	0.10	0.01	0.09	0.00	0.14	0.00	0.01	0.01	0.03	0.06	0.13	0.01	0.10	0.54	0.43	1.87	0.95
N1	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.55	0.17	1.53	0.69
N3	0.01	0.00	0.05	0.02	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.02	0.07	0.04	0.01	0.02	0.67	0.35	1.94	0.99
O2	0.04	0.01	0.17	0.12	0.03	0.05	0.04	0.04	0.03	0.02	0.02	0.00	0.18	0.16	0.03	0.07	0.61	0.36	1.39	0.56
O2'	0.01	0.09	0.00	0.02	0.02	0.05	0.04	0.05	0.06	0.02	0.07	0.18	0.00	0.03	0.03	0.02	0.09	1.37	0.28	0.57
O3'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.05	0.02	0.13	0.01	0.13	0.01	0.04	0.16	0.03	0.00	0.05	0.02	0.54	1.19	0.44	0.76
O4	0.02	0.02	0.01	0.04	0.00	0.08	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.05	0.00	0.04	0.67	0.75	2.31	1.30
O4'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.05	0.01	0.08	0.01	0.10	0.02	0.02	0.07	0.02	0.02	0.04	0.00	0.48	0.33	0.82	0.26
O5'	0.38	0.62	0.09	0.18	0.65	0.00	0.58	0.01	0.54	0.55	0.67	0.61	0.09	0.54	0.67	0.48	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.51	0.21	0.87	0.71	0.61	0.65	0.70	0.07	0.43	0.17	0.35	0.36	1.37	1.19	0.75	0.33	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.94	1.62	0.55	0.38	2.18	0.27	2.18	0.22	1.87	1.53	1.94	1.39	0.28	0.44	2.31	0.82	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.24	0.74	0.18	0.23	1.18	0.27	1.19	0.02	0.95	0.69	0.99	0.56	0.57	0.76	1.30	0.26	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.01	0.10	0.03	0.12	0.13	0.10	0.10	0.20	0.08	0.03	0.14	0.12	0.05	0.13	0.16	0.05	0.19	0.05	0.15	0.02
C2	0.23	0.11	0.22	0.22	0.06	0.23	0.05	0.23	0.16	0.18	0.03	0.12	0.24	0.22	0.17	0.24	0.19	0.06	0.20	0.03
C2'	0.09	0.16	0.03	0.09	0.15	0.07	0.13	0.21	0.08	0.10	0.16	0.21	0.11	0.11	0.18	0.02	0.22	0.04	0.12	0.06
C3'	0.18	0.11	0.11	0.06	0.08	0.07	0.11	0.06	0.07	0.11	0.04	0.18	0.17	0.07	0.12	0.18	0.11	0.07	0.06	0.01
C4	0.23	0.25	0.22	0.21	0.14	0.18	0.09	0.20	0.15	0.21	0.22	0.29	0.24	0.21	0.14	0.20	0.21	0.15	0.28	0.14
C4'	0.14	0.07	0.08	0.03	0.10	0.06	0.14	0.05	0.09	0.08	0.04	0.15	0.18	0.04	0.15	0.14	0.07	0.16	0.10	0.07
C5	0.13	0.18	0.15	0.19	0.20	0.14	0.14	0.22	0.12	0.14	0.20	0.19	0.12	0.21	0.23	0.11	0.26	0.24	0.35	0.23
C5'	0.16	0.06	0.12	0.09	0.20	0.12	0.23	0.06	0.16	0.11	0.10	0.11	0.18	0.07	0.26	0.19	0.08	0.30	0.16	0.14
C6	0.07	0.11	0.11	0.18	0.19	0.14	0.16	0.23	0.11	0.09	0.16	0.09	0.05	0.20	0.21	0.08	0.25	0.21	0.32	0.20
N1	0.11	0.05	0.11	0.15	0.11	0.14	0.09	0.19	0.11	0.08	0.09	0.04	0.09	0.16	0.16	0.12	0.19	0.08	0.22	0.07
N3	0.28	0.23	0.27	0.24	0.03	0.24	0.07	0.22	0.18	0.24	0.12	0.27	0.30	0.24	0.15	0.26	0.20	0.06	0.22	0.05
O2	0.29	0.10	0.28	0.27	0.09	0.30	0.06	0.28	0.17	0.20	0.07	0.11	0.31	0.28	0.20	0.31	0.22	0.15	0.19	0.11
O2'	0.19	0.26	0.15	0.16	0.21	0.15	0.18	0.28	0.16	0.20	0.25	0.32	0.21	0.16	0.22	0.16	0.26	0.14	0.06	0.10
O3'	0.27	0.21	0.20	0.11	0.08	0.19	0.07	0.07	0.06	0.20	0.12	0.30	0.27	0.06	0.11	0.30	0.01	0.01	0.01	0.00
O4	0.27	0.32	0.27	0.23	0.16	0.20	0.10	0.20	0.16	0.25	0.29	0.37	0.30	0.23	0.11	0.22	0.21	0.17	0.29	0.15
O4'	0.07	0.05	0.03	0.06	0.08	0.02	0.11	0.11	0.09	0.04	0.07	0.10	0.10	0.08	0.12	0.04	0.11	0.14	0.15	0.06
O5'	0.34	0.33	0.36	0.45	0.26	0.39	0.27	0.49	0.36	0.34	0.31	0.37	0.33	0.53	0.27	0.34	0.56	0.71	0.60	0.63
OP1	0.82	0.37	0.90	1.00	0.14	1.16	0.08	1.26	0.40	0.52	0.15	0.46	1.01	1.08	0.37	1.00	0.94	0.92	0.24	0.80
OP2	0.60	1.20	0.42	0.14	1.55	0.07	1.30	0.35	0.97	0.95	1.46	1.16	0.32	0.12	1.78	0.34	0.12	0.74	0.30	0.26
P	0.17	0.35	0.26	0.42	0.63	0.53	0.44	0.71	0.24	0.21	0.55	0.32	0.31	0.56	0.83	0.31	0.54	0.80	0.24	0.56

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.09	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.08	0.19	0.14
C2	0.05	0.00	0.08	0.03	0.01	0.04	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.12	0.05	0.02	0.03	0.06	0.06	0.17	0.11
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.05	0.02	0.07	0.15	0.00	0.01	0.06	0.00	0.04	0.06	0.09	0.06
C3'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.07	0.00	0.12	0.01	0.11	0.03	0.03	0.12	0.02	0.00	0.09	0.01	0.06	0.12	0.06	0.04
C4	0.02	0.01	0.04	0.07	0.00	0.06	0.00	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.09	0.00	0.02	0.20	0.14	0.17	0.14
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.06	0.00	0.10	0.00	0.09	0.01	0.01	0.12	0.05	0.01	0.07	0.00	0.02	0.05	0.10	0.07
C5	0.01	0.01	0.04	0.12	0.00	0.10	0.00	0.19	0.00	0.01	0.00	0.02	0.03	0.14	0.01	0.03	0.23	0.15	0.15	0.15
C5'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.15	0.00	0.19	0.00	0.14	0.05	0.08	0.08	0.05	0.01	0.17	0.00	0.01	0.06	0.02	0.01
C6	0.02	0.00	0.05	0.11	0.01	0.09	0.00	0.14	0.00	0.00	0.02	0.02	0.03	0.13	0.01	0.03	0.16	0.06	0.12	0.06
N1	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.00	0.00	0.02	0.02	0.04	0.01	0.00	0.06	0.05	0.18	0.11
N3	0.03	0.00	0.07	0.03	0.00	0.01	0.00	0.08	0.02	0.00	0.00	0.00	0.11	0.05	0.01	0.01	0.14	0.08	0.15	0.10
O2	0.09	0.01	0.15	0.12	0.01	0.12	0.02	0.08	0.02	0.02	0.00	0.00	0.21	0.14	0.02	0.07	0.03	0.13	0.21	0.17
O2'	0.02	0.12	0.00	0.02	0.07	0.05	0.03	0.05	0.03	0.02	0.11	0.21	0.00	0.01	0.09	0.05	0.00	0.04	0.11	0.09
O3'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.09	0.01	0.14	0.01	0.13	0.04	0.05	0.14	0.01	0.00	0.11	0.00	0.08	0.21	0.13	0.10
O4	0.03	0.02	0.06	0.09	0.00	0.07	0.01	0.17	0.01	0.01	0.01	0.02	0.09	0.11	0.00	0.02	0.23	0.19	0.22	0.19
O4'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.01	0.07	0.05	0.00	0.02	0.00	0.05	0.13	0.24	0.19
O5'	0.01	0.06	0.04	0.06	0.20	0.02	0.23	0.01	0.16	0.06	0.14	0.03	0.00	0.08	0.23	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.08	0.06	0.06	0.12	0.14	0.05	0.15	0.06	0.06	0.05	0.08	0.13	0.04	0.21	0.19	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.19	0.17	0.09	0.06	0.17	0.10	0.15	0.02	0.12	0.18	0.15	0.21	0.11	0.13	0.22	0.24	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.14	0.11	0.06	0.04	0.14	0.07	0.15	0.01	0.06	0.11	0.10	0.17	0.09	0.10	0.19	0.19	0.01	0.01	0.00	0.00