Doublet Group distance statistics: 49032

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.003, 0.014, 0.026, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.014 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.005, 0.018, 0.030, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.018 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.003, 0.016, 0.029, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.016 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.001, 0.017, 0.033, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.017 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.002, 0.033, 0.063, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.033 std_dev=0.030
N1	A	0, 0.007, 0.038, 0.069, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.038 std_dev=0.031
O2	A	0, 0.006, 0.045, 0.084, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.045 std_dev=0.039
C1'	A	0, 0.000, 0.044, 0.087, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.044 std_dev=0.043
O4	A	0, 0.012, 0.057, 0.102, 0.110 max_d=0.110 avg_d=0.057 std_dev=0.045
O4'	A	0, 0.023, 0.100, 0.178, 0.188 max_d=0.188 avg_d=0.100 std_dev=0.077
C2'	A	0, 0.029, 0.144, 0.259, 0.283 max_d=0.283 avg_d=0.144 std_dev=0.115
O2'	A	0, 0.050, 0.173, 0.296, 0.269 max_d=0.269 avg_d=0.173 std_dev=0.123
C4'	A	0, 0.007, 0.191, 0.375, 0.440 max_d=0.440 avg_d=0.191 std_dev=0.184
C3'	A	0, 0.045, 0.234, 0.423, 0.463 max_d=0.463 avg_d=0.234 std_dev=0.189
C5'	A	0, 0.037, 0.298, 0.560, 0.637 max_d=0.637 avg_d=0.298 std_dev=0.261
O3'	A	0, 0.075, 0.337, 0.599, 0.639 max_d=0.639 avg_d=0.337 std_dev=0.262
C2	B	0, 0.101, 0.373, 0.646, 0.644 max_d=0.644 avg_d=0.373 std_dev=0.273
O2	B	0, 0.116, 0.401, 0.686, 0.639 max_d=0.639 avg_d=0.401 std_dev=0.285
N3	B	0, 0.128, 0.437, 0.746, 0.667 max_d=0.667 avg_d=0.437 std_dev=0.309
N1	B	0, 0.052, 0.368, 0.684, 0.772 max_d=0.772 avg_d=0.368 std_dev=0.316
C4	B	0, 0.113, 0.444, 0.775, 0.793 max_d=0.793 avg_d=0.444 std_dev=0.331
O5'	A	0, 0.010, 0.365, 0.720, 0.846 max_d=0.846 avg_d=0.365 std_dev=0.355
P	B	0, 0.064, 0.434, 0.804, 0.904 max_d=0.904 avg_d=0.434 std_dev=0.370
C2'	B	0, 0.075, 0.446, 0.816, 0.907 max_d=0.907 avg_d=0.446 std_dev=0.371
C1'	B	0, 0.091, 0.463, 0.836, 0.912 max_d=0.912 avg_d=0.463 std_dev=0.372
C6	B	0, 0.071, 0.447, 0.822, 0.919 max_d=0.919 avg_d=0.447 std_dev=0.375
C5	B	0, 0.058, 0.436, 0.814, 0.922 max_d=0.922 avg_d=0.436 std_dev=0.378
C5'	B	0, 0.113, 0.510, 0.908, 0.971 max_d=0.971 avg_d=0.510 std_dev=0.398
O2'	B	0, 0.147, 0.547, 0.946, 0.943 max_d=0.943 avg_d=0.547 std_dev=0.399
O4	B	0, 0.163, 0.564, 0.964, 0.899 max_d=0.899 avg_d=0.564 std_dev=0.401
O4'	B	0, 0.134, 0.542, 0.951, 0.986 max_d=0.986 avg_d=0.542 std_dev=0.409
O5'	B	0, 0.129, 0.541, 0.953, 0.998 max_d=0.998 avg_d=0.541 std_dev=0.412
OP1	B	0, -0.073, 0.346, 0.766, 0.936 max_d=0.936 avg_d=0.346 std_dev=0.419
C4'	B	0, 0.099, 0.543, 0.987, 1.088 max_d=1.088 avg_d=0.543 std_dev=0.444
C3'	B	0, 0.087, 0.550, 1.014, 1.134 max_d=1.134 avg_d=0.550 std_dev=0.463
OP2	B	0, 0.135, 0.598, 1.062, 1.129 max_d=1.129 avg_d=0.598 std_dev=0.464
OP2	A	0, -0.009, 0.498, 1.005, 1.194 max_d=1.194 avg_d=0.498 std_dev=0.507
P	A	0, -0.033, 0.490, 1.013, 1.215 max_d=1.215 avg_d=0.490 std_dev=0.523
O3'	B	0, 0.157, 0.728, 1.300, 1.396 max_d=1.396 avg_d=0.728 std_dev=0.571
OP1	A	0, -0.123, 0.608, 1.339, 1.636 max_d=1.636 avg_d=0.608 std_dev=0.731

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.06	0.00	0.04	0.00	0.04	0.02	0.03	0.02	0.00	0.00	0.08	0.00	0.01	0.02	0.08	0.03
C2	0.03	0.00	0.09	0.07	0.01	0.04	0.02	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.09	0.02	0.01	0.04	0.05	0.13	0.06
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.10	0.01	0.06	0.00	0.04	0.03	0.09	0.10	0.00	0.00	0.12	0.00	0.03	0.02	0.07	0.04
C3'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.11	0.00	0.08	0.00	0.05	0.03	0.09	0.08	0.01	0.00	0.14	0.01	0.05	0.04	0.05	0.04
C4	0.06	0.01	0.10	0.11	0.00	0.09	0.01	0.11	0.03	0.04	0.00	0.02	0.10	0.12	0.02	0.06	0.11	0.17	0.24	0.16
C4'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.09	0.00	0.08	0.00	0.06	0.03	0.05	0.03	0.03	0.00	0.11	0.00	0.01	0.05	0.03	0.01
C5	0.04	0.02	0.06	0.08	0.01	0.08	0.00	0.11	0.01	0.01	0.02	0.03	0.05	0.08	0.04	0.06	0.10	0.16	0.22	0.15
C5'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.11	0.00	0.11	0.00	0.08	0.04	0.06	0.03	0.03	0.01	0.14	0.00	0.00	0.07	0.00	0.01
C6	0.04	0.01	0.04	0.05	0.03	0.06	0.01	0.08	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.06	0.05	0.06	0.07	0.09	0.15	0.10
N1	0.02	0.00	0.03	0.03	0.04	0.03	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.03	0.05	0.02	0.03	0.04	0.12	0.05
N3	0.03	0.01	0.09	0.09	0.00	0.05	0.02	0.06	0.01	0.01	0.00	0.03	0.09	0.10	0.02	0.02	0.07	0.11	0.19	0.10
O2	0.02	0.01	0.10	0.08	0.02	0.03	0.03	0.03	0.02	0.01	0.03	0.00	0.12	0.10	0.01	0.02	0.03	0.03	0.11	0.04
O2'	0.00	0.09	0.00	0.01	0.10	0.03	0.05	0.03	0.03	0.04	0.09	0.12	0.00	0.01	0.11	0.02	0.01	0.06	0.04	0.01
O3'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.12	0.00	0.08	0.01	0.06	0.03	0.10	0.10	0.01	0.00	0.15	0.01	0.06	0.05	0.06	0.05
O4	0.08	0.02	0.12	0.14	0.02	0.11	0.04	0.14	0.05	0.05	0.02	0.01	0.11	0.15	0.00	0.08	0.14	0.23	0.29	0.20
O4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.00	0.06	0.00	0.06	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.08	0.00	0.04	0.06	0.08	0.05
O5'	0.01	0.04	0.03	0.05	0.11	0.01	0.10	0.00	0.07	0.03	0.07	0.03	0.01	0.06	0.14	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00
OP1	0.02	0.05	0.02	0.04	0.17	0.05	0.16	0.07	0.09	0.04	0.11	0.03	0.06	0.05	0.23	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.13	0.07	0.05	0.24	0.03	0.22	0.00	0.15	0.12	0.19	0.11	0.04	0.06	0.29	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00
P	0.03	0.06	0.04	0.04	0.16	0.01	0.15	0.01	0.10	0.05	0.10	0.04	0.01	0.05	0.20	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.13	0.22	0.24	0.16	0.15	0.04	0.12	0.04	0.04	0.20	0.19	0.32	0.27	0.24	0.10	0.11	0.05	0.01	0.01
C2	0.10	0.11	0.21	0.20	0.14	0.10	0.01	0.09	0.06	0.03	0.19	0.16	0.33	0.23	0.24	0.05	0.10	0.19	0.11	0.10
C2'	0.04	0.15	0.17	0.19	0.21	0.10	0.12	0.10	0.04	0.05	0.23	0.20	0.25	0.20	0.29	0.07	0.11	0.04	0.02	0.02
C3'	0.01	0.19	0.12	0.18	0.23	0.09	0.14	0.06	0.07	0.09	0.25	0.24	0.21	0.20	0.29	0.06	0.06	0.04	0.01	0.01
C4	0.13	0.07	0.19	0.18	0.12	0.12	0.08	0.12	0.13	0.07	0.15	0.10	0.28	0.22	0.20	0.08	0.13	0.23	0.12	0.13
C4'	0.03	0.18	0.12	0.18	0.20	0.09	0.10	0.05	0.03	0.07	0.24	0.25	0.22	0.23	0.27	0.07	0.05	0.02	0.03	0.02
C5	0.21	0.12	0.26	0.26	0.14	0.21	0.14	0.18	0.20	0.15	0.16	0.11	0.35	0.31	0.18	0.17	0.15	0.14	0.08	0.08
C5'	0.02	0.20	0.06	0.16	0.21	0.08	0.11	0.05	0.05	0.10	0.25	0.26	0.16	0.23	0.27	0.06	0.07	0.05	0.07	0.04
C6	0.22	0.13	0.30	0.31	0.13	0.24	0.10	0.19	0.17	0.15	0.17	0.14	0.41	0.35	0.18	0.19	0.16	0.09	0.07	0.06
N1	0.15	0.12	0.26	0.26	0.13	0.18	0.03	0.15	0.10	0.08	0.18	0.17	0.36	0.29	0.21	0.12	0.13	0.10	0.03	0.04
N3	0.09	0.09	0.19	0.18	0.13	0.09	0.01	0.09	0.07	0.03	0.17	0.13	0.30	0.21	0.24	0.03	0.11	0.23	0.13	0.13
O2	0.06	0.12	0.19	0.17	0.15	0.06	0.04	0.05	0.04	0.01	0.20	0.18	0.31	0.20	0.24	0.06	0.08	0.21	0.16	0.13
O2'	0.01	0.16	0.14	0.17	0.23	0.06	0.14	0.06	0.07	0.07	0.24	0.20	0.24	0.18	0.31	0.07	0.08	0.05	0.06	0.03
O3'	0.06	0.21	0.07	0.12	0.25	0.02	0.18	0.01	0.12	0.13	0.26	0.25	0.14	0.14	0.31	0.09	0.01	0.02	0.01	0.01
O4	0.10	0.05	0.14	0.14	0.11	0.09	0.08	0.10	0.11	0.05	0.12	0.08	0.21	0.17	0.20	0.05	0.13	0.27	0.15	0.17
O4'	0.10	0.17	0.19	0.23	0.18	0.14	0.07	0.09	0.05	0.07	0.22	0.23	0.29	0.28	0.25	0.11	0.08	0.04	0.02	0.01
O5'	0.03	0.23	0.03	0.14	0.23	0.05	0.13	0.02	0.07	0.13	0.27	0.29	0.15	0.23	0.28	0.04	0.06	0.13	0.02	0.07
OP1	0.21	0.31	0.23	0.12	0.32	0.12	0.26	0.14	0.23	0.27	0.33	0.34	0.22	0.10	0.36	0.17	0.14	0.10	0.10	0.05
OP2	0.08	0.20	0.06	0.26	0.27	0.20	0.18	0.13	0.11	0.13	0.26	0.21	0.07	0.42	0.32	0.11	0.05	0.12	0.16	0.06
P	0.07	0.24	0.07	0.12	0.26	0.07	0.17	0.04	0.12	0.16	0.28	0.28	0.07	0.25	0.31	0.05	0.06	0.12	0.08	0.05

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.07	0.21	0.08	0.11
C2	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.04	0.04	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.07	0.02	0.14	0.33	0.21	0.23
C2'	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.01	0.06	0.08	0.08	0.06
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.05	0.00	0.02	0.04	0.11	0.05
C4	0.04	0.04	0.01	0.03	0.00	0.06	0.01	0.11	0.01	0.03	0.02	0.05	0.02	0.03	0.01	0.07	0.17	0.41	0.28	0.29
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.06	0.00	0.04	0.01	0.02	0.01	0.05	0.04	0.00	0.00	0.09	0.01	0.02	0.11	0.05	0.03
C5	0.02	0.04	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.07	0.01	0.02	0.01	0.04	0.04	0.01	0.02	0.05	0.14	0.36	0.21	0.23
C5'	0.02	0.09	0.04	0.00	0.11	0.01	0.07	0.00	0.04	0.05	0.10	0.10	0.03	0.01	0.13	0.02	0.01	0.05	0.04	0.02
C6	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.03	0.03	0.11	0.30	0.15	0.18
N1	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.05	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.01	0.11	0.28	0.15	0.17
N3	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.03	0.02	0.03	0.05	0.04	0.17	0.40	0.27	0.28
O2	0.01	0.01	0.02	0.02	0.05	0.04	0.04	0.10	0.02	0.02	0.03	0.00	0.03	0.02	0.08	0.01	0.15	0.32	0.22	0.25
O2'	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.04	0.03	0.03	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.07	0.06	0.11	0.08
O3'	0.02	0.03	0.00	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.00	0.05	0.03	0.02	0.06	0.12	0.05
O4	0.05	0.07	0.03	0.05	0.01	0.09	0.02	0.13	0.03	0.05	0.05	0.08	0.01	0.05	0.00	0.09	0.21	0.46	0.34	0.34
O4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.07	0.01	0.05	0.02	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.03	0.09	0.00	0.07	0.25	0.10	0.14
O5'	0.07	0.14	0.06	0.02	0.17	0.02	0.14	0.01	0.11	0.11	0.17	0.15	0.07	0.02	0.21	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01
OP1	0.21	0.33	0.08	0.04	0.41	0.11	0.36	0.05	0.30	0.28	0.40	0.32	0.06	0.06	0.46	0.25	0.00	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.21	0.08	0.11	0.28	0.05	0.21	0.04	0.15	0.15	0.27	0.22	0.11	0.12	0.34	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.23	0.06	0.05	0.29	0.03	0.23	0.02	0.18	0.17	0.28	0.25	0.08	0.05	0.34	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00