Doublet Group distance statistics: 49039

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.004, 0.009, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.004 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.000, 0.014, 0.027, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.014 std_dev=0.014
N7	A	0, 0.000, 0.014, 0.028, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.000, 0.015, 0.031, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.015 std_dev=0.015
C8	A	0, 0.000, 0.016, 0.032, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.016 std_dev=0.016
C6	A	0, 0.000, 0.021, 0.041, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.021 std_dev=0.021
N9	A	0, 0.000, 0.021, 0.043, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.021 std_dev=0.021
N3	A	0, 0.000, 0.029, 0.058, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.029 std_dev=0.029
C5'	A	0, 0.000, 0.032, 0.064, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.032 std_dev=0.032
C3'	A	0, 0.000, 0.033, 0.066, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.033 std_dev=0.033
C2	A	0, 0.000, 0.041, 0.082, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.041 std_dev=0.041
C1'	A	0, 0.000, 0.044, 0.088, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.044 std_dev=0.044
C4'	A	0, 0.000, 0.046, 0.091, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.046 std_dev=0.046
O6	A	0, 0.000, 0.052, 0.104, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.052 std_dev=0.052
C2'	A	0, 0.000, 0.057, 0.115, 0.115 max_d=0.115 avg_d=0.057 std_dev=0.057
O4'	A	0, 0.000, 0.070, 0.140, 0.140 max_d=0.140 avg_d=0.070 std_dev=0.070
N2	A	0, 0.000, 0.080, 0.159, 0.159 max_d=0.159 avg_d=0.080 std_dev=0.080
O2'	A	0, 0.000, 0.085, 0.170, 0.170 max_d=0.170 avg_d=0.085 std_dev=0.085
O3'	A	0, 0.000, 0.089, 0.178, 0.178 max_d=0.178 avg_d=0.089 std_dev=0.089
OP2	A	0, 0.000, 0.267, 0.533, 0.533 max_d=0.533 avg_d=0.267 std_dev=0.267
C5	B	0, 0.000, 0.287, 0.573, 0.573 max_d=0.573 avg_d=0.287 std_dev=0.287
P	A	0, 0.000, 0.294, 0.589, 0.589 max_d=0.589 avg_d=0.294 std_dev=0.294
C6	B	0, 0.000, 0.303, 0.606, 0.606 max_d=0.606 avg_d=0.303 std_dev=0.303
OP1	A	0, 0.000, 0.403, 0.807, 0.807 max_d=0.807 avg_d=0.403 std_dev=0.403
C4	B	0, 0.000, 0.419, 0.837, 0.837 max_d=0.837 avg_d=0.419 std_dev=0.419
O5'	A	0, 0.000, 0.424, 0.848, 0.848 max_d=0.848 avg_d=0.424 std_dev=0.424
O4	B	0, 0.000, 0.467, 0.933, 0.933 max_d=0.933 avg_d=0.467 std_dev=0.467
N1	B	0, 0.000, 0.493, 0.986, 0.986 max_d=0.986 avg_d=0.493 std_dev=0.493
O5'	B	0, 0.000, 0.553, 1.106, 1.106 max_d=1.106 avg_d=0.553 std_dev=0.553
OP2	B	0, 0.000, 0.556, 1.111, 1.111 max_d=1.111 avg_d=0.556 std_dev=0.556
N3	B	0, 0.000, 0.565, 1.130, 1.130 max_d=1.130 avg_d=0.565 std_dev=0.565
C5'	B	0, 0.000, 0.587, 1.173, 1.173 max_d=1.173 avg_d=0.587 std_dev=0.587
C1'	B	0, 0.000, 0.590, 1.180, 1.180 max_d=1.180 avg_d=0.590 std_dev=0.590
O4'	B	0, 0.000, 0.598, 1.195, 1.195 max_d=1.195 avg_d=0.598 std_dev=0.598
C2	B	0, 0.000, 0.601, 1.202, 1.202 max_d=1.202 avg_d=0.601 std_dev=0.601
C4'	B	0, 0.000, 0.602, 1.204, 1.204 max_d=1.204 avg_d=0.602 std_dev=0.602
C3'	B	0, 0.000, 0.606, 1.213, 1.213 max_d=1.213 avg_d=0.606 std_dev=0.606
C2'	B	0, 0.000, 0.621, 1.242, 1.242 max_d=1.242 avg_d=0.621 std_dev=0.621
P	B	0, 0.000, 0.630, 1.260, 1.260 max_d=1.260 avg_d=0.630 std_dev=0.630
O3'	B	0, 0.000, 0.658, 1.316, 1.316 max_d=1.316 avg_d=0.658 std_dev=0.658
OP1	B	0, 0.000, 0.697, 1.395, 1.395 max_d=1.395 avg_d=0.697 std_dev=0.697
O2'	B	0, 0.000, 0.705, 1.409, 1.409 max_d=1.409 avg_d=0.705 std_dev=0.705
O2	B	0, 0.000, 0.741, 1.482, 1.482 max_d=1.482 avg_d=0.741 std_dev=0.741

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.04	0.09	0.05	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.04	0.08	0.20	0.08
C2	0.06	0.00	0.06	0.04	0.02	0.05	0.02	0.01	0.02	0.04	0.00	0.01	0.01	0.03	0.04	0.07	0.07	0.07	0.08	0.04	0.14	0.14	0.15
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.04	0.09	0.05	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.10	0.04	0.02	0.21	0.04
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.08	0.04	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.14	0.04	0.03	0.15	0.02
C4	0.03	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.04	0.05	0.02	0.11	0.17	0.11
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.04	0.09	0.04	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.06	0.16	0.03
C5	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.03	0.08	0.01	0.13	0.18	0.13
C5'	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.10	0.10	0.01
C6	0.03	0.02	0.03	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.04	0.06	0.05	0.11	0.01	0.16	0.17	0.16
C8	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.05	0.03	0.00	0.01	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.10	0.19	0.11
N1	0.04	0.00	0.04	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.05	0.06	0.06	0.10	0.03	0.16	0.14	0.16
N2	0.09	0.01	0.09	0.08	0.04	0.09	0.03	0.05	0.03	0.05	0.01	0.00	0.03	0.04	0.06	0.10	0.09	0.10	0.10	0.04	0.18	0.13	0.18
N3	0.05	0.01	0.05	0.04	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.03	0.00	0.02	0.03	0.05	0.06	0.06	0.06	0.03	0.12	0.17	0.12
N7	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01	0.06	0.02	0.08	0.00	0.12	0.19	0.13
N9	0.01	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.06	0.03	0.01	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.09	0.18	0.09
O2'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.05	0.10	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.04	0.00	0.22	0.02
O3'	0.04	0.07	0.01	0.00	0.05	0.01	0.05	0.00	0.06	0.05	0.06	0.09	0.06	0.06	0.04	0.00	0.00	0.02	0.12	0.07	0.06	0.15	0.04
O4'	0.00	0.07	0.01	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.06	0.10	0.06	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.10	0.05	0.12	0.19	0.10
O5'	0.01	0.08	0.10	0.14	0.05	0.00	0.08	0.00	0.11	0.06	0.10	0.10	0.06	0.08	0.04	0.12	0.12	0.10	0.00	0.13	0.02	0.02	0.01
O6	0.04	0.04	0.04	0.04	0.02	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.04	0.03	0.00	0.02	0.04	0.07	0.05	0.13	0.00	0.18	0.18	0.18
OP1	0.08	0.14	0.02	0.03	0.11	0.06	0.13	0.10	0.16	0.10	0.16	0.18	0.12	0.12	0.09	0.00	0.06	0.12	0.02	0.18	0.00	0.02	0.01
OP2	0.20	0.14	0.21	0.15	0.17	0.16	0.18	0.10	0.17	0.19	0.14	0.13	0.17	0.19	0.18	0.22	0.15	0.19	0.02	0.18	0.02	0.00	0.01
P	0.08	0.15	0.04	0.02	0.11	0.03	0.13	0.01	0.16	0.11	0.16	0.18	0.12	0.13	0.09	0.02	0.04	0.10	0.01	0.18	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.17	0.26	0.25	0.01	0.20	0.01	0.19	0.06	0.14	0.12	0.21	0.30	0.29	0.08	0.15	0.18	0.12	0.10	0.14
C2	0.15	0.03	0.24	0.25	0.17	0.20	0.12	0.19	0.03	0.05	0.09	0.08	0.31	0.32	0.28	0.13	0.16	0.10	0.05	0.11
C2'	0.16	0.12	0.22	0.22	0.02	0.17	0.01	0.16	0.04	0.11	0.07	0.14	0.27	0.26	0.09	0.11	0.15	0.08	0.07	0.11
C3'	0.17	0.14	0.23	0.21	0.00	0.17	0.02	0.15	0.04	0.11	0.10	0.17	0.28	0.25	0.07	0.12	0.14	0.07	0.05	0.10
C4	0.18	0.10	0.27	0.26	0.11	0.21	0.08	0.20	0.01	0.09	0.00	0.16	0.32	0.32	0.23	0.15	0.18	0.12	0.08	0.14
C4'	0.21	0.19	0.27	0.25	0.02	0.21	0.00	0.19	0.06	0.15	0.14	0.24	0.32	0.29	0.05	0.16	0.18	0.12	0.09	0.14
C5	0.19	0.09	0.29	0.29	0.14	0.23	0.09	0.22	0.01	0.09	0.04	0.15	0.34	0.34	0.27	0.16	0.20	0.15	0.11	0.16
C5'	0.25	0.21	0.31	0.29	0.03	0.25	0.01	0.23	0.08	0.18	0.15	0.26	0.37	0.33	0.06	0.20	0.21	0.14	0.11	0.17
C6	0.18	0.03	0.29	0.30	0.18	0.24	0.11	0.24	0.01	0.06	0.11	0.09	0.35	0.37	0.29	0.17	0.21	0.16	0.11	0.17
C8	0.21	0.18	0.29	0.28	0.04	0.22	0.04	0.21	0.05	0.14	0.10	0.22	0.32	0.32	0.18	0.16	0.20	0.16	0.13	0.17
N1	0.16	0.01	0.26	0.27	0.18	0.22	0.12	0.22	0.02	0.04	0.12	0.06	0.33	0.34	0.29	0.15	0.18	0.13	0.08	0.14
N2	0.15	0.01	0.23	0.24	0.18	0.20	0.13	0.19	0.04	0.03	0.10	0.06	0.31	0.32	0.29	0.13	0.15	0.09	0.04	0.10
N3	0.17	0.08	0.26	0.26	0.12	0.21	0.09	0.19	0.00	0.08	0.03	0.13	0.32	0.32	0.24	0.14	0.17	0.10	0.07	0.12
N7	0.21	0.15	0.30	0.30	0.12	0.24	0.07	0.23	0.03	0.13	0.02	0.21	0.33	0.34	0.26	0.17	0.21	0.17	0.13	0.18
N9	0.19	0.15	0.27	0.26	0.05	0.21	0.05	0.20	0.03	0.12	0.07	0.20	0.31	0.30	0.17	0.15	0.18	0.13	0.10	0.14
O2'	0.12	0.08	0.18	0.17	0.02	0.13	0.01	0.13	0.03	0.08	0.04	0.08	0.22	0.21	0.07	0.07	0.12	0.05	0.04	0.08
O3'	0.12	0.11	0.18	0.16	0.01	0.11	0.04	0.10	0.00	0.08	0.08	0.14	0.22	0.20	0.06	0.06	0.09	0.03	0.02	0.05
O4'	0.22	0.20	0.28	0.27	0.02	0.22	0.00	0.21	0.07	0.16	0.15	0.25	0.33	0.30	0.07	0.18	0.20	0.14	0.12	0.16
O5'	0.12	0.06	0.21	0.21	0.10	0.15	0.10	0.15	0.03	0.05	0.01	0.11	0.25	0.27	0.19	0.09	0.14	0.10	0.08	0.12
O6	0.19	0.00	0.31	0.33	0.19	0.27	0.11	0.27	0.01	0.06	0.16	0.05	0.38	0.40	0.29	0.19	0.23	0.19	0.13	0.19
OP1	0.07	0.01	0.14	0.15	0.14	0.10	0.14	0.10	0.07	0.00	0.06	0.04	0.19	0.20	0.22	0.04	0.08	0.02	0.01	0.05
OP2	0.00	0.10	0.07	0.07	0.28	0.03	0.25	0.01	0.17	0.10	0.19	0.05	0.15	0.13	0.37	0.03	0.03	0.10	0.14	0.08
P	0.06	0.01	0.13	0.14	0.17	0.09	0.16	0.08	0.09	0.02	0.08	0.03	0.19	0.19	0.25	0.03	0.07	0.00	0.01	0.03

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.03	0.00
C2	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.03
C2'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.03	0.00	0.00	0.07	0.06	0.03
C3'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.08	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.06	0.01	0.02	0.09	0.07	0.06
C4	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.01	0.13	0.12	0.14	0.15
C4'	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.07	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.02	0.04	0.05	0.03
C5	0.00	0.03	0.04	0.08	0.00	0.06	0.00	0.12	0.00	0.00	0.02	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.17	0.18	0.20	0.21
C5'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.09	0.01	0.12	0.00	0.11	0.05	0.04	0.00	0.03	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01
C6	0.00	0.02	0.04	0.08	0.00	0.07	0.00	0.11	0.00	0.00	0.02	0.03	0.01	0.09	0.00	0.01	0.16	0.15	0.15	0.18
N1	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.07	0.04	0.03	0.07
N3	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.00	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.02	0.04	0.07
O2	0.03	0.01	0.03	0.03	0.03	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.03	0.00	0.00	0.04	0.04	0.03	0.00	0.07	0.06	0.02
O2'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.09	0.07	0.05
O3'	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.00	0.09	0.01	0.09	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.06	0.00	0.02	0.13	0.09	0.08
O4	0.02	0.01	0.03	0.06	0.00	0.05	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.06	0.00	0.02	0.14	0.14	0.17	0.18
O4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.06	0.02
O5'	0.01	0.04	0.00	0.02	0.13	0.02	0.17	0.01	0.16	0.07	0.06	0.00	0.02	0.02	0.14	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.03	0.01	0.07	0.09	0.12	0.04	0.18	0.00	0.15	0.04	0.02	0.07	0.09	0.13	0.14	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.03	0.01	0.06	0.07	0.14	0.05	0.20	0.02	0.15	0.03	0.04	0.06	0.07	0.09	0.17	0.06	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.00	0.03	0.03	0.06	0.15	0.03	0.21	0.01	0.18	0.07	0.07	0.02	0.05	0.08	0.18	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00