Doublet Group distance statistics: 49052

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 2, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.005, 0.009, 0.014, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.009 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.002, 0.007, 0.013, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.007 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.004, 0.010, 0.016, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.004, 0.011, 0.017, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.011 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.004, 0.012, 0.020, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.002, 0.010, 0.018, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.010 std_dev=0.008
N4	A	0, 0.007, 0.024, 0.042, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.024 std_dev=0.017
O2	A	0, 0.006, 0.024, 0.042, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.024 std_dev=0.018
O2'	A	0, 0.022, 0.160, 0.299, 0.380 max_d=0.380 avg_d=0.160 std_dev=0.139
C2'	A	0, 0.009, 0.152, 0.295, 0.392 max_d=0.392 avg_d=0.152 std_dev=0.143
O4'	A	0, -0.008, 0.156, 0.319, 0.470 max_d=0.470 avg_d=0.156 std_dev=0.163
N1	B	0, 0.044, 0.257, 0.471, 0.539 max_d=0.539 avg_d=0.257 std_dev=0.214
C4'	A	0, -0.006, 0.230, 0.466, 0.671 max_d=0.671 avg_d=0.230 std_dev=0.236
C3'	A	0, 0.008, 0.245, 0.481, 0.659 max_d=0.659 avg_d=0.245 std_dev=0.236
N3	B	0, 0.067, 0.315, 0.564, 0.633 max_d=0.633 avg_d=0.315 std_dev=0.248
C4	B	0, 0.070, 0.335, 0.601, 0.736 max_d=0.736 avg_d=0.335 std_dev=0.266
C6	B	0, 0.028, 0.297, 0.567, 0.780 max_d=0.780 avg_d=0.297 std_dev=0.270
C2'	B	0, 0.105, 0.399, 0.693, 0.829 max_d=0.829 avg_d=0.399 std_dev=0.294
O2'	B	0, 0.112, 0.407, 0.703, 0.843 max_d=0.843 avg_d=0.407 std_dev=0.296
C2	B	0, 0.027, 0.326, 0.624, 0.838 max_d=0.838 avg_d=0.326 std_dev=0.299
C3'	B	0, 0.137, 0.448, 0.758, 0.835 max_d=0.835 avg_d=0.448 std_dev=0.310
O3'	B	0, 0.144, 0.458, 0.771, 0.836 max_d=0.836 avg_d=0.458 std_dev=0.313
C4'	B	0, 0.153, 0.491, 0.829, 0.876 max_d=0.876 avg_d=0.491 std_dev=0.338
C1'	B	0, 0.097, 0.436, 0.776, 0.979 max_d=0.979 avg_d=0.436 std_dev=0.339
O4'	B	0, 0.137, 0.484, 0.831, 0.929 max_d=0.929 avg_d=0.484 std_dev=0.347
O3'	A	0, 0.011, 0.369, 0.727, 1.013 max_d=1.013 avg_d=0.369 std_dev=0.358
O5'	B	0, 0.194, 0.573, 0.951, 0.905 max_d=0.905 avg_d=0.573 std_dev=0.378
C5'	B	0, 0.173, 0.552, 0.932, 0.950 max_d=0.950 avg_d=0.552 std_dev=0.379
N6	B	0, -0.043, 0.338, 0.719, 1.129 max_d=1.129 avg_d=0.338 std_dev=0.381
C5	B	0, -0.002, 0.385, 0.771, 1.154 max_d=1.154 avg_d=0.385 std_dev=0.387
C5'	A	0, 0.002, 0.391, 0.779, 1.105 max_d=1.105 avg_d=0.391 std_dev=0.389
N9	B	0, 0.042, 0.436, 0.829, 1.180 max_d=1.180 avg_d=0.436 std_dev=0.394
OP1	A	0, 0.104, 0.524, 0.944, 1.231 max_d=1.231 avg_d=0.524 std_dev=0.420
P	B	0, 0.126, 0.685, 1.245, 1.685 max_d=1.685 avg_d=0.685 std_dev=0.559
C8	B	0, -0.098, 0.557, 1.213, 1.953 max_d=1.953 avg_d=0.557 std_dev=0.655
N7	B	0, -0.136, 0.532, 1.199, 1.970 max_d=1.970 avg_d=0.532 std_dev=0.667
O5'	A	0, -0.171, 0.619, 1.409, 2.325 max_d=2.325 avg_d=0.619 std_dev=0.790
OP2	B	0, -0.050, 0.798, 1.647, 2.572 max_d=2.572 avg_d=0.798 std_dev=0.849
OP1	B	0, 0.021, 0.895, 1.769, 2.654 max_d=2.654 avg_d=0.895 std_dev=0.874
P	A	0, -0.252, 0.854, 1.959, 3.247 max_d=3.247 avg_d=0.854 std_dev=1.106
OP2	A	0, -0.597, 1.265, 3.127, 5.367 max_d=5.367 avg_d=1.265 std_dev=1.862

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.25	0.04	0.36	0.25
C2	0.01	0.00	0.06	0.04	0.01	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.07	0.08	0.56	0.18	0.88	0.63
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.06	0.02	0.10	0.00	0.01	0.00	0.22	0.10	0.41	0.20
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.05	0.04	0.05	0.00	0.00	0.02	0.24	0.13	0.44	0.20
C4	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.05	0.02	0.73	0.21	1.37	0.87
C4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.02	0.04	0.02	0.07	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.03	0.02
C5	0.01	0.00	0.04	0.02	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.03	0.05	0.73	0.17	1.40	0.84
C5'	0.01	0.08	0.01	0.02	0.05	0.00	0.05	0.00	0.06	0.04	0.08	0.05	0.12	0.02	0.03	0.01	0.00	0.04	0.04	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.03	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.04	0.07	0.63	0.13	1.10	0.67
N1	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.51	0.12	0.80	0.54
N3	0.01	0.01	0.06	0.05	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.08	0.06	0.66	0.21	1.14	0.78
N4	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.06	0.02	0.77	0.23	1.54	0.96
O2	0.03	0.00	0.10	0.05	0.01	0.07	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.08	0.13	0.46	0.18	0.67	0.53
O2'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.02	0.02	0.04	0.02	0.05	0.00	0.05	0.02	0.09	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.06	0.02
O3'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.05	0.01	0.03	0.03	0.04	0.02	0.08	0.06	0.08	0.01	0.00	0.01	0.11	0.16	0.31	0.07
O4'	0.01	0.08	0.00	0.02	0.02	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.06	0.02	0.13	0.02	0.01	0.00	0.10	0.04	0.09	0.10
O5'	0.25	0.56	0.22	0.24	0.73	0.01	0.73	0.00	0.63	0.51	0.66	0.77	0.46	0.01	0.11	0.10	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.04	0.18	0.10	0.13	0.21	0.03	0.17	0.04	0.13	0.12	0.21	0.23	0.18	0.04	0.16	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.36	0.88	0.41	0.44	1.37	0.03	1.40	0.04	1.10	0.80	1.14	1.54	0.67	0.06	0.31	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.25	0.63	0.20	0.20	0.87	0.02	0.84	0.01	0.67	0.54	0.78	0.96	0.53	0.02	0.07	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.08	0.09	0.10	0.10	0.07	0.04	0.05	0.02	0.05	0.05	0.07	0.08	0.04	0.05	0.07	0.12	0.17	0.08	0.05	0.63	0.83	0.13
C2	0.10	0.15	0.11	0.11	0.09	0.06	0.07	0.04	0.07	0.08	0.12	0.13	0.08	0.09	0.08	0.11	0.16	0.10	0.05	0.66	0.89	0.15
C2'	0.14	0.19	0.02	0.05	0.14	0.09	0.11	0.12	0.12	0.10	0.17	0.17	0.11	0.09	0.13	0.02	0.08	0.16	0.16	0.70	0.66	0.17
C3'	0.21	0.25	0.09	0.09	0.19	0.15	0.15	0.17	0.14	0.14	0.19	0.24	0.10	0.12	0.18	0.07	0.08	0.22	0.19	0.70	0.63	0.18
C4	0.10	0.17	0.15	0.15	0.09	0.09	0.12	0.07	0.09	0.18	0.13	0.13	0.16	0.21	0.11	0.13	0.19	0.09	0.08	0.60	0.93	0.21
C4'	0.18	0.14	0.06	0.03	0.15	0.10	0.12	0.10	0.09	0.14	0.10	0.16	0.06	0.11	0.16	0.06	0.06	0.18	0.11	0.66	0.70	0.12
C5	0.10	0.15	0.16	0.15	0.09	0.10	0.13	0.08	0.10	0.19	0.11	0.12	0.16	0.21	0.11	0.15	0.20	0.09	0.08	0.58	0.91	0.21
C5'	0.21	0.17	0.09	0.05	0.16	0.12	0.11	0.11	0.08	0.13	0.11	0.19	0.04	0.10	0.17	0.11	0.04	0.20	0.11	0.65	0.72	0.11
C6	0.09	0.13	0.14	0.14	0.07	0.08	0.10	0.06	0.08	0.14	0.09	0.10	0.13	0.16	0.09	0.15	0.19	0.08	0.07	0.59	0.88	0.18
N1	0.08	0.13	0.12	0.12	0.07	0.06	0.07	0.03	0.06	0.08	0.09	0.10	0.08	0.10	0.07	0.12	0.17	0.08	0.05	0.63	0.87	0.15
N3	0.09	0.18	0.12	0.12	0.09	0.07	0.09	0.05	0.08	0.13	0.14	0.14	0.12	0.15	0.08	0.11	0.17	0.09	0.06	0.64	0.92	0.18
N4	0.11	0.19	0.16	0.16	0.10	0.10	0.14	0.09	0.11	0.22	0.13	0.14	0.18	0.25	0.13	0.14	0.19	0.10	0.09	0.58	0.95	0.24
O2	0.12	0.14	0.09	0.08	0.11	0.06	0.10	0.05	0.10	0.08	0.13	0.13	0.08	0.08	0.10	0.09	0.14	0.12	0.06	0.70	0.88	0.13
O2'	0.16	0.12	0.03	0.05	0.16	0.10	0.16	0.13	0.16	0.17	0.14	0.14	0.15	0.17	0.16	0.04	0.08	0.17	0.18	0.70	0.61	0.19
O3'	0.31	0.34	0.19	0.19	0.29	0.26	0.24	0.27	0.22	0.24	0.27	0.34	0.17	0.21	0.28	0.18	0.14	0.33	0.29	0.74	0.51	0.27
O4'	0.09	0.07	0.09	0.11	0.07	0.05	0.07	0.03	0.06	0.07	0.06	0.08	0.07	0.06	0.08	0.10	0.18	0.08	0.05	0.58	0.86	0.13
O5'	0.19	0.13	0.17	0.15	0.11	0.15	0.02	0.13	0.05	0.05	0.02	0.17	0.16	0.03	0.12	0.20	0.14	0.16	0.14	0.70	0.75	0.12
OP1	0.17	0.12	0.09	0.05	0.11	0.10	0.06	0.09	0.03	0.08	0.06	0.15	0.04	0.04	0.12	0.10	0.04	0.15	0.10	0.66	0.75	0.10
OP2	0.14	0.08	0.25	0.26	0.04	0.18	0.09	0.17	0.16	0.05	0.08	0.12	0.30	0.14	0.05	0.26	0.33	0.10	0.20	0.80	0.72	0.17
P	0.25	0.18	0.26	0.22	0.14	0.22	0.02	0.18	0.05	0.06	0.04	0.22	0.19	0.03	0.15	0.30	0.23	0.21	0.17	0.72	0.74	0.13

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.21	0.22	0.07
C2	0.02	0.00	0.21	0.24	0.00	0.10	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.18	0.32	0.03	0.11	0.35	0.68	0.19
C2'	0.00	0.21	0.00	0.00	0.11	0.01	0.06	0.01	0.10	0.08	0.16	0.21	0.07	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.16	0.13	0.04
C3'	0.01	0.24	0.00	0.00	0.10	0.00	0.03	0.01	0.09	0.17	0.18	0.23	0.05	0.11	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.08	0.03	0.09
C4	0.01	0.00	0.11	0.10	0.00	0.04	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.09	0.13	0.02	0.05	0.43	0.56	0.12
C4'	0.00	0.10	0.01	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.02	0.11	0.07	0.10	0.01	0.08	0.02	0.04	0.02	0.00	0.01	0.07	0.14	0.02
C5	0.01	0.00	0.06	0.03	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.05	0.02	0.10	0.62	0.65	0.10
C5'	0.01	0.10	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.03	0.16	0.06	0.09	0.04	0.13	0.04	0.03	0.02	0.00	0.01	0.21	0.32	0.01
C6	0.01	0.01	0.10	0.09	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.13	0.03	0.07	0.61	0.74	0.13
C8	0.01	0.01	0.08	0.17	0.00	0.11	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.18	0.01	0.26	0.68	0.41	0.12
N1	0.02	0.00	0.16	0.18	0.01	0.07	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.14	0.25	0.03	0.08	0.48	0.76	0.17
N3	0.02	0.00	0.21	0.23	0.00	0.10	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.29	0.03	0.10	0.30	0.58	0.17
N6	0.01	0.01	0.07	0.05	0.01	0.01	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.08	0.03	0.09	0.73	0.79	0.12
N7	0.01	0.00	0.04	0.11	0.00	0.08	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.12	0.02	0.22	0.79	0.57	0.12
N9	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.10	0.42	0.40	0.07
O2'	0.01	0.18	0.00	0.01	0.09	0.04	0.05	0.03	0.09	0.05	0.14	0.17	0.07	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.04	0.08	0.05	0.06
O3'	0.01	0.32	0.01	0.00	0.13	0.02	0.05	0.02	0.13	0.18	0.25	0.29	0.08	0.12	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.09	0.18	0.17
O4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.03	0.03	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.07	0.11	0.11
O5'	0.05	0.11	0.02	0.02	0.05	0.01	0.10	0.01	0.07	0.26	0.08	0.10	0.09	0.22	0.10	0.04	0.03	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.21	0.35	0.16	0.08	0.43	0.07	0.62	0.21	0.61	0.68	0.48	0.30	0.73	0.79	0.42	0.08	0.09	0.07	0.02	0.00	0.00	0.01
OP2	0.22	0.68	0.13	0.03	0.56	0.14	0.65	0.32	0.74	0.41	0.76	0.58	0.79	0.57	0.40	0.05	0.18	0.11	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.07	0.19	0.04	0.09	0.12	0.02	0.10	0.01	0.13	0.12	0.17	0.17	0.12	0.12	0.07	0.06	0.17	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00