Doublet Group distance statistics: 49054

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 3, 32, 34, 22, 13, 9, 2, 1, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.007, 0.010, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.007 std_dev=0.003
N3	A	0, 0.004, 0.009, 0.014, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.009 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.008, 0.015, 0.022, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.015 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.010, 0.019, 0.028, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.019 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.009, 0.018, 0.027, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.018 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.010, 0.019, 0.029, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.019 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.010, 0.020, 0.029, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.020 std_dev=0.009
O2	A	0, 0.018, 0.040, 0.062, 0.124 max_d=0.124 avg_d=0.040 std_dev=0.022
N4	A	0, 0.035, 0.069, 0.103, 0.170 max_d=0.170 avg_d=0.069 std_dev=0.034
C2'	A	0, 0.063, 0.128, 0.194, 0.308 max_d=0.308 avg_d=0.128 std_dev=0.066
O4'	A	0, 0.040, 0.115, 0.190, 0.327 max_d=0.327 avg_d=0.115 std_dev=0.075
O2'	A	0, 0.124, 0.209, 0.294, 0.474 max_d=0.474 avg_d=0.209 std_dev=0.085
C4'	A	0, 0.070, 0.184, 0.298, 0.495 max_d=0.495 avg_d=0.184 std_dev=0.114
C3'	A	0, 0.078, 0.192, 0.306, 0.468 max_d=0.468 avg_d=0.192 std_dev=0.114
C2	B	0, 0.229, 0.388, 0.546, 1.016 max_d=1.016 avg_d=0.388 std_dev=0.159
N3	B	0, 0.227, 0.399, 0.571, 1.085 max_d=1.085 avg_d=0.399 std_dev=0.172
O3'	A	0, 0.116, 0.300, 0.483, 0.792 max_d=0.792 avg_d=0.300 std_dev=0.183
N1	B	0, 0.160, 0.348, 0.536, 1.367 max_d=1.367 avg_d=0.348 std_dev=0.188
C5'	A	0, 0.112, 0.304, 0.495, 0.709 max_d=0.709 avg_d=0.304 std_dev=0.191
C4	B	0, 0.167, 0.365, 0.562, 1.198 max_d=1.198 avg_d=0.365 std_dev=0.197
O2	B	0, 0.308, 0.517, 0.726, 1.597 max_d=1.597 avg_d=0.517 std_dev=0.209
C1'	B	0, 0.199, 0.423, 0.648, 1.528 max_d=1.528 avg_d=0.423 std_dev=0.224
C6	B	0, 0.147, 0.390, 0.633, 1.595 max_d=1.595 avg_d=0.390 std_dev=0.243
C5	B	0, 0.138, 0.387, 0.636, 1.420 max_d=1.420 avg_d=0.387 std_dev=0.249
N4	B	0, 0.190, 0.441, 0.691, 1.703 max_d=1.703 avg_d=0.441 std_dev=0.251
C2'	B	0, 0.217, 0.547, 0.877, 2.054 max_d=2.054 avg_d=0.547 std_dev=0.330
O4'	B	0, 0.203, 0.551, 0.900, 2.392 max_d=2.392 avg_d=0.551 std_dev=0.348
O2'	B	0, 0.244, 0.676, 1.108, 2.387 max_d=2.387 avg_d=0.676 std_dev=0.432
C3'	B	0, 0.223, 0.667, 1.111, 2.729 max_d=2.729 avg_d=0.667 std_dev=0.444
O5'	B	0, 0.306, 0.760, 1.215, 2.744 max_d=2.744 avg_d=0.760 std_dev=0.454
C4'	B	0, 0.228, 0.687, 1.146, 3.052 max_d=3.052 avg_d=0.687 std_dev=0.459
C5'	B	0, 0.268, 0.800, 1.331, 3.516 max_d=3.516 avg_d=0.800 std_dev=0.531
O3'	B	0, 0.205, 0.857, 1.509, 3.758 max_d=3.758 avg_d=0.857 std_dev=0.652
P	B	0, 0.441, 1.125, 1.809, 3.585 max_d=3.585 avg_d=1.125 std_dev=0.684
OP2	B	0, 0.409, 1.300, 2.190, 5.164 max_d=5.164 avg_d=1.300 std_dev=0.890
OP1	B	0, 0.422, 1.433, 2.443, 4.719 max_d=4.719 avg_d=1.433 std_dev=1.010
O5'	A	0, 0.147, 1.357, 2.568, 2.943 max_d=2.943 avg_d=1.357 std_dev=1.211
P	A	0, 0.232, 2.147, 4.061, 4.478 max_d=4.478 avg_d=2.147 std_dev=1.914
OP1	A	0, 0.285, 2.414, 4.542, 5.112 max_d=5.112 avg_d=2.414 std_dev=2.128
OP2	A	0, 0.222, 3.458, 6.693, 7.213 max_d=7.213 avg_d=3.458 std_dev=3.236

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.50	0.22	0.48	0.32
C2	0.01	0.00	0.05	0.07	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.08	0.02	0.88	0.24	1.38	0.86
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.04	0.03	0.06	0.06	0.07	0.00	0.01	0.01	0.32	0.14	0.30	0.25
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.08	0.01	0.08	0.04	0.07	0.05	0.08	0.09	0.08	0.01	0.01	0.02	0.22	0.33	0.24	0.26
C4	0.01	0.00	0.05	0.08	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.11	0.03	1.17	0.53	2.21	1.34
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.05	0.00	0.06	0.01	0.06	0.03	0.04	0.06	0.03	0.03	0.03	0.00	0.01	0.26	0.26	0.12
C5	0.01	0.00	0.05	0.08	0.00	0.06	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.11	0.03	1.20	0.54	2.22	1.37
C5'	0.02	0.07	0.02	0.04	0.10	0.01	0.12	0.00	0.10	0.07	0.09	0.11	0.05	0.04	0.08	0.01	0.01	0.11	0.10	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.06	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.09	0.03	1.08	0.34	1.68	1.08
N1	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.86	0.18	1.22	0.78
N3	0.01	0.00	0.06	0.08	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.10	0.02	1.04	0.39	1.85	1.12
N4	0.01	0.01	0.06	0.09	0.00	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.12	0.03	1.23	0.64	2.50	1.49
O2	0.02	0.00	0.07	0.08	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.09	0.03	0.73	0.17	1.06	0.66
O2'	0.02	0.04	0.00	0.01	0.04	0.03	0.03	0.04	0.02	0.02	0.05	0.04	0.07	0.00	0.04	0.04	0.05	0.28	0.35	0.16
O3'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.11	0.03	0.11	0.08	0.09	0.05	0.10	0.12	0.09	0.04	0.00	0.02	0.17	0.41	0.32	0.07
O4'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.03	0.04	0.02	0.00	0.37	0.45	0.18	0.11
O5'	0.50	0.88	0.32	0.22	1.17	0.01	1.20	0.01	1.08	0.86	1.04	1.23	0.73	0.05	0.17	0.37	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.22	0.24	0.14	0.33	0.53	0.26	0.54	0.11	0.34	0.18	0.39	0.64	0.17	0.28	0.41	0.45	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.48	1.38	0.30	0.24	2.21	0.26	2.22	0.10	1.68	1.22	1.85	2.50	1.06	0.35	0.32	0.18	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.32	0.86	0.25	0.26	1.34	0.12	1.37	0.01	1.08	0.78	1.12	1.49	0.66	0.16	0.07	0.11	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.16	0.24	0.24	0.12	0.18	0.12	0.16	0.13	0.16	0.13	0.16	0.21	0.32	0.27	0.20	0.13	0.45	0.35	0.12
C2	0.18	0.19	0.19	0.18	0.13	0.15	0.13	0.17	0.14	0.16	0.17	0.13	0.22	0.29	0.21	0.20	0.15	0.54	0.42	0.20
C2'	0.16	0.14	0.23	0.21	0.10	0.16	0.10	0.15	0.10	0.13	0.11	0.15	0.19	0.25	0.24	0.18	0.12	0.42	0.32	0.13
C3'	0.16	0.13	0.24	0.21	0.11	0.17	0.11	0.15	0.11	0.13	0.10	0.15	0.18	0.25	0.25	0.19	0.12	0.41	0.30	0.13
C4	0.18	0.19	0.19	0.19	0.14	0.16	0.14	0.19	0.15	0.17	0.18	0.14	0.23	0.29	0.22	0.22	0.16	0.56	0.44	0.22
C4'	0.20	0.14	0.29	0.27	0.12	0.21	0.13	0.18	0.13	0.15	0.09	0.18	0.20	0.33	0.31	0.21	0.14	0.41	0.30	0.12
C5	0.18	0.18	0.22	0.21	0.13	0.17	0.13	0.17	0.14	0.16	0.16	0.13	0.22	0.31	0.25	0.21	0.14	0.52	0.40	0.17
C5'	0.21	0.14	0.30	0.28	0.12	0.23	0.13	0.19	0.14	0.16	0.10	0.17	0.20	0.35	0.32	0.22	0.15	0.42	0.30	0.13
C6	0.18	0.17	0.23	0.23	0.12	0.17	0.12	0.16	0.13	0.16	0.14	0.14	0.21	0.31	0.27	0.20	0.13	0.48	0.38	0.14
N1	0.18	0.17	0.22	0.21	0.12	0.16	0.12	0.16	0.13	0.16	0.15	0.13	0.21	0.30	0.24	0.20	0.13	0.49	0.38	0.15
N3	0.18	0.20	0.19	0.17	0.15	0.16	0.14	0.19	0.15	0.17	0.19	0.14	0.23	0.29	0.20	0.21	0.17	0.58	0.45	0.25
N4	0.18	0.20	0.19	0.18	0.15	0.17	0.15	0.20	0.15	0.17	0.19	0.15	0.23	0.29	0.21	0.22	0.18	0.59	0.47	0.26
O2	0.17	0.19	0.18	0.17	0.14	0.15	0.13	0.18	0.14	0.17	0.19	0.13	0.22	0.29	0.19	0.20	0.16	0.56	0.43	0.23
O2'	0.17	0.13	0.24	0.21	0.12	0.17	0.12	0.15	0.11	0.13	0.09	0.19	0.20	0.26	0.24	0.19	0.12	0.39	0.29	0.12
O3'	0.16	0.13	0.24	0.18	0.15	0.16	0.14	0.16	0.13	0.13	0.14	0.18	0.17	0.22	0.23	0.18	0.14	0.39	0.29	0.17
O4'	0.20	0.16	0.28	0.28	0.14	0.21	0.15	0.18	0.15	0.16	0.12	0.20	0.21	0.35	0.31	0.20	0.15	0.43	0.36	0.13
O5'	0.18	0.11	0.31	0.28	0.24	0.19	0.22	0.14	0.13	0.11	0.15	0.37	0.20	0.33	0.29	0.17	0.11	0.40	0.31	0.11
OP1	0.41	0.35	0.64	0.70	0.35	0.51	0.39	0.53	0.40	0.38	0.33	0.35	0.34	0.54	0.75	0.37	0.58	0.64	0.75	0.59
OP2	0.92	0.60	1.24	1.20	0.15	1.03	0.21	0.90	0.44	0.65	0.30	0.32	0.84	1.41	1.38	0.83	0.74	0.73	0.61	0.61
P	0.43	0.27	0.63	0.62	0.10	0.49	0.11	0.43	0.20	0.29	0.13	0.22	0.40	0.68	0.70	0.38	0.36	0.45	0.43	0.31

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.14	0.00	0.09	0.25	0.13	0.12
C2	0.01	0.00	0.10	0.13	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.09	0.06	0.09	0.37	0.23	0.14
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.03	0.01	0.09	0.10	0.11	0.01	0.08	0.03	0.18	0.00	0.01	0.01	0.21	0.32	0.15	0.25
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.16	0.00	0.16	0.01	0.14	0.10	0.16	0.18	0.13	0.01	0.01	0.01	0.04	0.16	0.07	0.06
C4	0.01	0.00	0.03	0.16	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.17	0.09	0.02	0.11	0.48	0.39	0.17
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.06	0.00	0.08	0.00	0.08	0.04	0.04	0.06	0.05	0.14	0.02	0.00	0.01	0.13	0.11	0.02
C5	0.01	0.01	0.09	0.16	0.00	0.08	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.22	0.11	0.05	0.13	0.49	0.42	0.17
C5'	0.04	0.06	0.10	0.01	0.07	0.00	0.09	0.00	0.08	0.05	0.06	0.08	0.08	0.05	0.10	0.01	0.01	0.17	0.20	0.01
C6	0.01	0.01	0.11	0.14	0.00	0.08	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.20	0.09	0.07	0.11	0.42	0.32	0.15
N1	0.01	0.01	0.01	0.10	0.01	0.04	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.05	0.01	0.09	0.35	0.22	0.13
N3	0.01	0.00	0.08	0.16	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.08	0.04	0.10	0.43	0.31	0.15
N4	0.01	0.01	0.03	0.18	0.00	0.06	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.19	0.11	0.02	0.12	0.51	0.44	0.18
O2	0.02	0.00	0.18	0.13	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.13	0.16	0.10	0.10	0.33	0.18	0.13
O2'	0.02	0.07	0.00	0.01	0.17	0.14	0.22	0.05	0.20	0.10	0.11	0.19	0.13	0.00	0.03	0.10	0.16	0.31	0.13	0.22
O3'	0.14	0.09	0.01	0.01	0.09	0.02	0.11	0.10	0.09	0.05	0.08	0.11	0.16	0.03	0.00	0.10	0.12	0.36	0.18	0.16
O4'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.04	0.02	0.10	0.10	0.10	0.00	0.05	0.17	0.14	0.09
O5'	0.09	0.09	0.21	0.04	0.11	0.01	0.13	0.01	0.11	0.09	0.10	0.12	0.10	0.16	0.12	0.05	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.25	0.37	0.32	0.16	0.48	0.13	0.49	0.17	0.42	0.35	0.43	0.51	0.33	0.31	0.36	0.17	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.13	0.23	0.15	0.07	0.39	0.11	0.42	0.20	0.32	0.22	0.31	0.44	0.18	0.13	0.18	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.12	0.14	0.25	0.06	0.17	0.02	0.17	0.01	0.15	0.13	0.15	0.18	0.13	0.22	0.16	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00